velikost textu
Evoluce pohlavních chromozomů a karyotypů u leguánů (Squamata: Pleurodonta)
Upozornění: Informace získané z popisných dat či souborů uložených v Repozitáři závěrečných prací nemohou být použity k výdělečným účelům nebo vydávány za studijní, vědeckou nebo jinou tvůrčí činnost jiné osoby než autora.
Název:
Evoluce pohlavních chromozomů a karyotypů u leguánů (Squamata: Pleurodonta)
Název v angličtině:
Evolution of sex chromosomes and karyotypes in iguanas (Squamata: Pleurodonta)
Typ:
Disertační práce
Autor:
Mgr. Marie Altmanová
Školitel:
doc. Mgr. Lukáš Kratochvíl, Ph.D.
Oponenti:
doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.
Konzultant:
RNDr. Martina Pokorná, Ph.D.
Id práce:
144289
Fakulta:
Přírodovědecká fakulta (PřF)
Pracoviště:
Katedra ekologie (31-162)
Program studia:
Ekologie (P1514)
Obor studia:
-
Přidělovaný titul:
Ph.D.
Datum obhajoby:
15. 9. 2017
Výsledek obhajoby:
Prospěl/a
Informace o neveřejnosti:
Příloha práce byla vyloučena ze zveřejnění.
Jazyk práce:
Čeština
Klíčová slova:
pohlavní chromozomy, karyotyp, Pleurodonta, leguáni
Klíčová slova v angličtině:
sex chromosomes, karyotype, Pleurodonta, iguanas
Abstrakt:
Evoluce pohlavních chromozomů a karyotypů u leguánů
(Squamata: Pleurodonta)
Disertační práce
Marie Altmanová
Abstrakt
Disertační práce je souborem pěti publikovaných původních prací a jednoho rukopisu
a je zaměřena na evoluci pohlavních chromosomů a karyotypu leguánů (Pleurodonta).
Na základě primární rešerše dostupných dat byla u leguánů zjištěna pouze samčí heterogamie
(XX/XY) s ancestrálním karyotypem 2n = 36 chromosomů. U řady vyšetřených druhů však
nebyly základními cytogenetickými metodami pohlavní chromosomy odhaleny
pravděpodobně z důvodu jejich homomorfie. Částečně známý obsah pohlavního chromosomu
X druhu Anolis carolinensis umožnil porovnání relativní genové dávky X-specifických genů
mezi samcem a samicí u zástupců všech leguáních čeledí, čímž byly odhaleny homologické
a dobře diferencované pohlavní chromosomy napříč všemi leguány s výjimkou bazilišků.
Vzhledem ke srovnatelnému stáří s pohlavními chromosomy savců a ptáků, zpochybňují
výsledky význam endotermie pro vznik stabilních pohlavních chromosomů. Nápadným
znakem leguánů je v karyotypu poměrně častý výskyt mnohočetných pohlavních
chromosomů. Analýzou ancestrálního stavu typu pohlavních chromosomů bylo zjištěno, že se
tyto mnohočetné pohlavní chromosomy vyvinuly minimálně dvanáctkrát nezávisle a některé
z těchto vzniků mohou být asociované s dalšími přestavbami v karyotypu. Jelikož u ptáků
(ZZ/ZW) nebyl dosud zaznamenán jediný výskyt mnohočetných pohlavních chromosomů, je
v práci diskutován a statisticky prověřen možný vliv typu heterogamie na vznik těchto
odvozených pohlavních chromosomů a jejich fixaci v karyotypu amniotických obratlovců.
Detailním molekulárně cytogenetickým vyšetřením madagaskarských leguánů z čeledi
Opluridae bylo zjištěno, že i přes geografickou vzdálenost sdílí tato čeleď většinu
cytogenetických znaků s novosvětskými leguány. Současně charakter Y chromosomu čeledi
poukázal na možné limity komparativní genomové hybridizace, metody běžně používané
k cytogenetické detekci pohlavních chromosomů. Prověření karyotypu zástupců 17 čeledí
šupinatých plazů na přítomnost intersticiálních telomerických sekvencí v karyotypu
a porovnání s již dostupnými údaji odhalilo jejich častý výskyt a vzhledem k poměrně
konzervativnímu uspořádání karyotypu v této skupině naznačilo možné kryptické přestavby
chromosomů nebo šíření telomerických sekvencí v genomech v důsledku působení mobilních
elementů. Zahrnuté publikace rozšířily studovanou problematiku o experimentální i teoretické
výstupy a umožnily posouzení obecné platnosti hypotéz o evoluci pohlavních chromosomů
a základního uspořádání genomu v širším kontextu.
Abstract v angličtině:
Evolution of sex chromosomes and karyotypes in iguanas
(Squamata: Pleurodonta)
PhD Thesis
Marie Altmanová
Abstract
This PhD thesis is composed of five published articles and one manuscript, and is
focused on the evolution of the sex chromosomes and karyotype of the iguanas (Pleurodonta).
Based on our primary research of available data, only male heterogamety (XX/XY) with
ancestral karyotype 2n = 36 chromosomes was recorded in iguanas. However, in many
species sex chromosomes have not been uncovered by classical cytogenetics, probably due to
their homomorphy. The partially-known X chromosome content of Anolis carolinensis
allowed us to compare the relative gene doses of X-specific genes between male and female
of representatives of all iguana families, and to reveal homologous and well-differentiated sex
chromosomes across all iguanas, with the exception of basilisks. Thus, due to the comparable
age with sex chromosomes of mammals and birds, the results put into question the importance
of endothermy for the formation of stable sex chromosomes. The striking feature of the
iguanas is the relatively frequent occurrence of multiple sex chromosomes in their karyotypes.
Using the ancestral state analysis of the type of sex chromosomes, it has been found that these
multiple sex chromosomes developed at least twelve times independently, and some of these
origins are probably associated with other karyotype rearrangements. In comparison, in birds
(ZZ/ZW) there is no single occurrence of this derived type of sex chromosome. Therefore the
possible influence of the heterogamety on evolution of this type of sex chromosome and their
fixation in the karyotype of amniotic vertebrates is discussed in this thesis and supported by
statistics. A deep molecular cytogenetic examination of the Madagascan iguanas (Opluridae),
revealed that despite the geographical distance, this family shares most of the cytogenetic
traits with the New-World iguanas. Additionally in this family, the nature of the Y
chromosome indicated the possible limitations of comparative genomic hybridization, the
technique commonly used for detection of sex chromosomes. Our examination of the
representatives of 17 families of squamate reptiles for the presence of interstitial telomeric
sequences (ITS) in the karyotype and comparison with already available data revealed
frequent occurrence of ITS in this group. Due to the relatively conserved karyotype in this
group, this suggests possible cryptic chromosomal rearrangements or telomere sequence
distribution in genomes through the activity of mobile elements. The publications included in
this thesis develop the studied subjects by experimental and theoretical outcomes, helping to
assess the general validity of hypotheses about the evolution of sex chromosomes and the
basic genome organization even in the broader context.
Dokumenty
| Stáhnout | Dokument | Autor | Typ | Velikost |
|---|---|---|---|---|
| Stáhnout | Text práce | Mgr. Marie Altmanová | 4.37 MB | |
| Stáhnout | Příloha k práci | Mgr. Marie Altmanová | 33.4 MB | |
| Stáhnout | Abstrakt v českém jazyce | Mgr. Marie Altmanová | 184 kB | |
| Stáhnout | Abstrakt anglicky | Mgr. Marie Altmanová | 258 kB | |
| Stáhnout | Autoreferát / teze disertační práce | Mgr. Marie Altmanová | 718 kB | |
| Stáhnout | Posudek oponenta | doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc. | 219 kB | |
| Stáhnout | Posudek oponenta | RNDr. Magda Zrzavá, Ph.D. | 504 kB | |
| Stáhnout | Záznam o průběhu obhajoby | 1.05 MB |