Y chromosomální charakteristika současné vesnické populace na Klatovsku
Y Chromosomal Characteristics of the Modern Rural Population in Klatovy Region
diplomová práce (OBHÁJENO)
Zobrazit/ otevřít
Trvalý odkaz
http://hdl.handle.net/20.500.11956/67567Identifikátory
SIS: 118859
Kolekce
- Kvalifikační práce [18049]
Autor
Vedoucí práce
Oponent práce
Stenzl, Vlastimil
Fakulta / součást
Pedagogická fakulta
Obor
Učitelství všeobecně vzdělávacích předmětů pro základní školy a střední školy - biologie
Katedra / ústav / klinika
Katedra biologie a environmentálních studií
Datum obhajoby
19. 1. 2015
Nakladatel
Univerzita Karlova, Pedagogická fakultaJazyk
Čeština
Známka
Velmi dobře
Klíčová slova (česky)
Y-STR, Y-SNP, Česká Republika, populační genetika, KlatovyKlíčová slova (anglicky)
Y-STR, Y-SNP, Czech Republic, population genetics, KlatovyVyužití genetických markerů v nerekombinující části Y chromosomu se ukázalo jako vhodný nástroj pro studium historie, diverzity a migrace populací. Vhodnými markery na Y chromosomu se ukázaly být především SNP a STR polymorfismy. V rámci této práce bylo sebráno 53 vzorků DNA od nepříbuzných mužů-starousedlíků z 9 vesnic z okolí Klatov. Vzorky byly analyzovány, a byly stanoveny hodnoty 17 STR markerů pomocí AmpFLSTR® Yfiler® Direct Kit. Celkem jsem zaznamenala výskyt 7 haploskupin. Dále byly výsledky vzorků z vesnic Klatovska analyzovány metodou AMOVA a porovnány s okolními populacemi ze Spolkové republiky Německo, Rakouska, Středních a Jižních Čech. Nebyly nalezeny žádné významné rozdíly v genetickém profilu této populace vůči okolním populacím.
Usage of genetic markers in non-recombining part of chromosome Y has been shown as a eligible tool for a study of history, diversity and migration of population. Applicable markers of chromosome Y are SNP and STR polymorphisms. There were collected 53 unique samples of DNA as a object of this work from unrelated origin males from 9 villages around Klatovy. Samples have been analyzed and its values have been determined by using the 17 STR markers by AmpFLSTR® Yfiler® Direct Kit. In total I have observed 7 different haplogroups. I have resulted samples from villages around Klatovy and they were analyzed by AMOVA. I have compared samples with the surrounding populations in neighborly Federal Republic of Germany, Austria, Central and South Bohemia. There were no significant differences founded in the genetic profile of this population to the surrounding populations.