Výsledky projektů za rok 2014

The Trail Making Test (TMT) comprises two psychomotor tasks that measure a wide range of visual-perceptual and executive functions. The
purpose of this study was to provide Czech normative data and to examine the relationship between derived TMT indices and demographic
variables. The TMT was administered to 421 healthy adults. Two clinical groups (n ¼ 126) were evaluated to investigate the clinical utility
of the TMT-derived scores: amnestic mild cognitive impairment (n ¼ 90) and Alzheimer’s disease (n ¼ 36). Statistical analyses showed
that age and education, but not gender, were significantly associated with TMT completion times and derived scores. Of all the indices, only
the TMT ratio scorewas insensitive to age.We present normative values for the Czech version of the TMT, providing a reference for measuring
individual performance in native Czech speakers. Moreover, we found that accuracy on the TMT was improved with the attenuation of age.

Objective: To establish psychometric properties of the Montreal Cognitive Assessment (MoCA)
with respect to detecting mild cognitive impairment in Parkinson’s disease (PD-MCI). Introduction:
MCI is considered a transitional stage between normal cognitive functioning and dementia.
The MoCA has recently been recommended as one of the standard tools for the diagnosis of
PD-MCI. However, its detection potential in the Czech population has not been demonstrated.
Methods: A sample of 80 patients with PD was administered the MoCA and a neuropsychological
battery with criteria operationalized for MCI-deficits. Thirty nine of these patients (PD-MCI
sample) were age and education-matched to a control sample (CS). ROC analysis was used to
ascertain classification statistics (discriminative validity) of the MoCA as a diagnostic instrument.
Results: The MoCA total score was significantly different between PD-MCI and CS (p = 0.006).
Delayed recall was the most differentiating MoCA subscore (p < 0.001). The 28/29 scores were
identified as an optimal screening MoCA cut-off to discriminate PD-MCI from CS was (sensitivity
= 0.90, specificity = 0.32; positive and negative predictive value = 0.57 and 0.76, respectively).
We constructed a regression equation based on a large control sample of the Czech population
(n = 268) to estimate the MoCA’s age and education-specific performance more accurately.
Conclusion: Despite the group differences between PD-MCI and CS, our results show that MoCA
has an unsatisfactory detection potential for an individual diagnosis of PD-MCI. A comprehensive
neuropsychological battery is thus recommendable.

The Grooved Pegboard Test (GPT) was conceived as a test of manual dexterity, upper-limb motor speed, and hand–eye
coordination. The aim of our study was to test the componential structure of the GPT on an archetypal model of motor
impairment, Parkinson’s disease (PD). A total of 45 PD patients (33 males, 12 females; age M = 67, range = 49-81; PD
duration M = 10, range = 6-20 years; H/Y stage 2, range = 2-3) and 20 age- and education-matched controls (14 males,
6 females; age M = 66, range = 48-80) were included. All participants were investigated using the GPT, Short Falls
Efficacy Scale–International, Frontal Assessment Battery (FAB), Montreal Cognitive Assessment (MoCA), and Non-Motor
Symptom Scale. Patients were followed for 6 months, using fall diaries and monthly phone calls to define PD fallers (falls
≥ 1; n = 27) and PD nonfallers (falls = 0; n = 18). Using structural equation modeling, the GPT predicted performance on
the MoCA (p < .001), but not on the FAB (p = .29). In conclusion, analysis of the structure of the GPT provided evidence
about important cognitive features, in addition to the motor component of this test in PD.

The purpose of this study was to assess the convergent and discriminative validity of the
Montreal Cognitive Assessment (MoCA) as a screening tool for cognitive dysfunction in
Huntington’s disease (HD). Twenty HD patients with cognitive deficit and 23 normal
controls (NC) without cognitive deficit were matched for age, sex, and education. The
mean MoCA score was 20.5 (SD¼5.5) in HD and 27.5 (SD¼2.2) in NC. The MoCA
correlated in both samples with the brief cognitive battery composite score (r¼.81,
p<.001). With the screening and diagnostic cutoff scores determined at <26 points,
the MoCA showed a sensitivity of 94% and a specificity of 84% in the detection of cognitive
dysfunction in HD. The area under the receiver-operating characteristics curve
(95% confidence interval) for the MoCA was 0.90 (0.809–0.997), p<.001. Our results
show that the MoCA is a suitable tool for assessing cognitive dysfunction in patients
with HD.

The present study provides normative data stratified by age for the Rey Auditory
Verbal Learning test Czech version (RAVLT) derived from a sample of 306 cognitively
normal subjects (20–85 years). Participants met strict inclusion criteria (absence of any
active or past neurological or psychiatric disorder) and performed within normal limits
on other neuropsychological measures. Our analyses revealed significant relationships
between most RAVLT indices and age and education. Normative data are provided not
only for basic RAVLT scores, but for the first time also for a variety of derived (gained/
lost access, primacy/recency effect) and error scores. The study confirmed a logarithmic
character of the learning slope and is consistent with other studies. It enables the
clinician to evaluate more precisely subject’s RAVLT memory performance on a vast number of indices and can be viewed as a concrete example of Quantified Process
Approach to neuropsychological assessment.

Článek byl zařazen mezi online dostupné články; číslo svazku a stránek bude přiděleno dodatečně. Článek je již indexován na webu PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24318805

Text bude teprve publikován ve 2014/2 - viz potvrzení od výkonného redaktora.

Abstract:
There is no doubt, information and communication technologies (ICT) have established themselves as an axiomatical element of young people’s everyday leisure lifestyles and school-based experience. But what is the Czech teenagers’ relationship with ICT in their everyday lives? There is still little evidence in the Czech context. This paper will try to shed some light on this problematic based on the results of PhD research project. This research focused on teenaged members of two natural social groups during two and a half years using qualitative methods. The text will describe the character of the relationship between studied teenagers and ICT, the factors which determine it and the domains of interaction between ICT and teenagers and corresponding functions. ICT showed to be the tools empowering the teenagers to do what they had to do in the most convenient way for them, and what they as growing up creatures liked to do such as socializing with their peers. This way they enhanced teenagers‘ agency.

Tématické zacílení článku je sice odlišné od obsahu projektu, nicméně jeho metodologická základna byla vytvořena na základě znalostí načerpaných v rámci práce na projektu financovaném GA UK. Proto je také dedikován mj. GA UK.

Abstract:
Rapidly changing working conditions in recent years, along with the need to reduce the costs of news production, require journalists to adapt. Our suggestion here is that many of the research methods for analysing journalists' work environments to date are no longer sufficient for capturing this ongoing change. In searching for new approaches to analysis of the journalistic environment, we decided to apply visual ethnography, a method not yet used in the Czech Republic and not much used in the world beyond. For our pilot study of Czech newsrooms, we worked with both photographs taken of the journalists involved in our project and photographs taken by our research team (photographs showed both journalists' working conditions and working processes). We then interviewed the journalists about the photographs and more widely about their working practices and conditions. This paper presents the results of the research but also considers the advantages and challenges of the visual ethnographic approach and its implementation in media environments.

Jedná se o recenzované neimpaktované periodikum Ministerstva vnitra ČR.

Jedná se o recenzované neimpaktované periodikum Ministerstva vnitra ČR.

Řešitelka grantu v multioborové práci uplatnila zkušenosti s imunohistochemickým barvením, které získala v prvním roce řešení grantu, v publikaci je proto uvedena plná dedikace projektu - GAUK 282011/2011, awarded by Charles University in Prague, Czech Republic

abstrakt přednášky

abstrakt přednášky

přijat do tisku

abstrakt přednášky

JN and PH participated both on the acquisition, reduction and intepretation of the photometric observations. JN learned to work with the scripting enviroment of the binary light curve modelling tool PHOEBE on this project.

Contains affiliation to the faculty and dedication to the project.

V časopise otištěny vybrané příspěvky z konference QUAERE 2012; pozn: nestránkováno (viz přiložené pdf)

Přehledný článek, jehož významnou součástí je diskuze výsledků získaných při řešení projektu GAUK.

Prvoautorský článek hlavní řešitelky, jehož součástí jsou výsledky získané při řešení projektu.

článek prošel recenzním řízením, časopis je v tisku

Dokazujeme, že počet jednotkových vzdáleností mezi n body v R^3 je O(n^3/2), což je zlepšení Clarksonova odhadu z roku 1990. Důkaz využívá polynomiální metodu rozkladu, kterou představili Guth a Katz koncem roku 2010.

Klasický výsledek od Wegnera (1967) dokazuje, že libovolný simpliciální komplex dimenze d lze reprezentovat konvexními množinami v dimenzi 2d+1. Cílem článku je ukázat, že existují d-dimenzionální komplexy, které nelze reprezentovat v dimenzi 2d. Wegner navrhl, o které komplexy by se mělo jednat, důkaz ale nebyl dříve znám. Důkaz využívá vlastností Van Kampenovy obstrukce.

Článek zjednodušuje důkaz, že nerv systému množin, kde každá množina má velikost nejvýše d, je d-kolabovatelný (s pomocí nově zavedené silné d-kolabovatelnosti).

Přijat pro recenzní řízení

Přijat do tisku

Abstrakt konferenčního příspěvku v časopise s IF (supplementum)

Publikováno online 17 Feb 2014
DOI: 10.1080/11035897.2014.880510

Přijato do tisku, po pozitivních recenzích, text zatím ještě není vysázen.

DOI 10.3140/bull.geosci.1450

Článek v prestižním ipaktovaném časopise pojednává o možných výsledcích interakce vystupujícího magmatu s povrchovou či podpovrchovou vodou na povrchu Marsu, tzv. freatomagmatismem, vytvářející charakteristické útvary, tufové prstence a tufové kužele.

V poděkování je chybně uvedeno číslo grantu GAUK, místo grantového projektu bylo vepsáno zúčtovací číslo grantu na fakultě. Za způsobené potíže se omlouvám, vznikly vlivem špatné komunikace.

Článek v recenzovaném časopise popisuje výsledky výzkumu zkoumajícího názory na kvalitu úlohy expertů, odborníků a respondentů. (Na zpracování výsledků byla použia metodologie odvozená od zakotvené teorie.) V doplňující studii byla zjištění porovnávána s názory na kvalitu úlohu středoškolských studentů - netvůrců úloh.
Druhá část výzkumu popsaná v článku zkoumá aplikaci názorů na kvalitu úlohu v sebehodnocení vlastní práce na tvorbě úloh v rámci jednotlivých skupin respondentů.

Článek se zabývá různými typy uzavřených úloh. Autor navrhuje vlastní klasifikaci a dokládá ji na příkladech. Vše popisuje ve vztahu ke tvorbě takových typů úloh.

Článek popisuje výzkumné výsledky zkoumání typů úvah v procesu tvorby úloh a dále rozdílů ve výskytu těchto typů úvah v procesu tvorby úloh začátečníky, odborníky a expety. Výsledek je indexován na WOS.

článek popisuje výsledky naší studie financované z grantového projektu. obsahuje afiliaci k fakultě a dedikaci ke grantovému projektu

V tomto článku jsme popsali užití z tukové tkáně izolovaných kmenových buněk. Obsahuje dedikaci grantovému projektu a afiliaci k fakultě.

Jedná se o článek, který je odeslaný do časopisu, stále v recenzním řízení. Srovnává výsledky rekonstrukcí prsu tukovou tkání zpracovanou filtračním systémem PureGraft oproti centrifugaci. Sleduje jednak kvalitu života pomocí standardizovaného dotazníku BREAST-Q a také objektivní nález BCCT Core softwarem. Jedná se velmi cenná klinická data, která ještě v podobné formě nebyla v literatuře publikována.

S dedikací grantovému projektu a afiliací k 1. lékařské fakultě UK.

V tomto článku jsme popsali naše dosavadní výsledky s rekonstrukcemi prsů s užitím přenosu autologní tukové tkáně, které zahrnovaly parciální výsledky výzkumu financovaného GAUK. Obsahuje afiliaci 1. LF UK.

Pro dobré průběžné výsledky se nám podařilo rozšířit uvedenou v anotaci metodiku na unikátní indikaci – rekonstrukci prsů po totální a nikoliv jen segmentální mastektomii a použít ji u prvních tří pacientek. Při této metodě užíváme zevní expanzi, která zlepšuje prokrvení a aktivuje místní mezenchymální kmenové buňky, které připraví lůžko pro přijetí štěpů a tím dojde k jeho lepšímu vhojování. Tato indikace nebyla dosud publikována.

V tomto článku jsme popsali unikátní rekonstrukci prsu po modifikované radikální mastektomii metodou přenosu tukové tkáně. Obsahuje dedikaci GAUK a afiliaci 1. LF UK.

Besides spatial heterogeneity, another important component of the diversity of protist communities is the variation in species assemblages through time. Despite its importance, temporal turnover of benthic communities has been studied to a lesser extent than spatial heterogeneity has. In this study, we examine the desmid assemblages on small spatial scale in relation to the spatial, temporal, and environmental parameters. The samples were collected within two different types of peatland localities in the Czech Republic over three years. The differences in species composition between samples were mainly correlated with the geographic distance, while the effects of the environmental and temporal variables were much weaker. Since the spatial heterogeneity of the assemblages was not induced by the variation of the environmental factors or by the restricted dispersal ability at such a small spatial scale, we assume that both the temporal stability and strong spatial autocorrelation might have been the result of a priority effect, with subsequent monopolization of resources. Stochasticity in colonization can introduce noise into the match between community composition and environmental conditions, which may result in stronger effect of the spatial parameters on the community structure.

Vysoká pH citlivost kratšího segmentu (oktameru) SRF (Serum response factor) byla zkoumána pomocí Ramanovy a infračervené spektroskopie a cirkulárního dichroismu. Podrobná interpretace jemnějších spektrálních změn byla umožněna použitím molekulárně dynamických a DFT (density functional theory) výpočtů. Přestože nebyl pozorován větší rozdíl mezi spektry v kyselém a neutrálním prostředí, spektrum v bazickém pH bylo podstatně odlišné. Hlavní změny byly přisouzeny deprotonaci tyrosinu. Sekundární struktura fragmentu byla určena jak experimentálně, tak předpovězena teoreticky. Všechny přístupy prokázaly, že segment existuje v dynamické rovnováze mezi několika konformacemi podobnými beta turn, neuspořádané a rozvolněné struktuře, což je v kontrastu se stabilní strukturou, kterou oktamer zaujímá jako součást SRF. Obecně byla představena metodologie, která může být s výhodou použita ke studiu středně dlouhých oligopeptidů.
Podíl hlavního řešitele na publikaci: dominantní - provedení veškerých experimentů, většiny analýz a podíl na psaní samotného textu.

Zajímali jsme se o pH závislost fluorescenčních a UV absorpčních spekter dvou segmentů MADS-boxu. Jako spektroskopická sonda byl použit v obou případech vlastní vnitřní fluorofor, tyrosin. Prokázali jsme, že pKa hodnota tyrosin/tyrosinátového přechodu je výrazně ovlivněna aminokyselinami v jeho bezprostřední blízkosti. K přesnému určení pKa na základě spektroskopických měření byla využita nově vyvinutá metodika založená na faktorové analýze. Tuto metodu lze využít k určení pKa libovolného oligopeptidu nesoucího alespoň jednu pH-citlivou fotosenzitivní aminokyselinu nebo sondu a obecně může být použita na celou řadu spektroskopických technik.
Podíl hlavního řešitele na publikaci: dominantní - provedení veškerých experimentů, většiny analýz a podíl na psaní samotného textu.

Edita Priehodová napísala článok, ktorý bol publikovaný v časopise Živa a zaoberá sa variabilitou mtDNA v strednej Európe a neolitickou expanziou.

Článek je zaměřen na analýzu pokusů reformovat systém imperiálních konferencí v letech 1907–1911.

Článek se zaměřuje na postoje dominií k institucionálním a konstitucionálním otázkám v rámci Britského impéria v letech 1917-1926.

Článek je zaměřen na analýzu pozice Výboru imperiální obrany a systému imperiálních konferencí ve vztazích mezi Velkou Británií a dominii v letech 1911–1914.

doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.compedu.2013.11.013.

Článek přikládáme

Článek je přijatý do tisku.

doi: 10.1016/j.ssnmr.2011.04.002

doi:10.1088/0953-8984/24/5/055501

doi:10.1109/TMAG.2012.2204967

doi:10.1088/0957-0233/23/5/057001

doi: 10.1155/2013/179794

Znovuvložení výsledku z 2. roku řešení projektu do závěrečné zprávy:

Článek "Measurement of the Top Quark Mass with the Template Method in the ttbar -> lepton+jets Channel using ATLAS Data.", jehož autorem je celá kolaborace experimentu ATLAS, byl publikován v žurnálu "EUROPEAN PHYSICAL JOURNAL C". Bližší informace o článku jsou k dispozici na stránce [1]. Seznam všech 32 publikací experimentu ATLAS o top kvarku je k dispozici na stránce [2].


[1] http://inspirehep.net/record/1094859
[2] https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/AtlasPublic/TopPublicResults
http://arxiv.org/pdf/1203.5755.pdf

Článek obsahuje výsledky měření interpenetrujících sítí pomocí NMR, reologického experimentu, mikroskopu a DSC.

Druhy rodu Trichophyton jsou klinicky významní původci dermatomykóz člověka a zvířat. Nový druh tohoto rodu byl popsán z případu suspektní onychomykózy u českého pacienta. K popisy byly využity znaky morfologické, fyziologické a molekulárně genetické (beta-tubulin, rDNA, RPB2, aktin). Článek je zatím dostupný v online verzi: doi: 10.1093/mmy/myt010

Sekce Aspergillus rodu Aspergillus (dříve druhy Eurotium) zahrnuje ekonomicky významné, xerofilní druhy, které jsou široce rozšířené v přírodě a na řadě substrátů spojených s lidskou činností a podílí se na znehodnocování potravin. Tyto druhy jsou známé pro svou schopnost růst na substrátech vykazujících nízkou vodní aktivitu. Vysoká fenoplasticita a častý výskyt atypických izolátů se v minulosti podílely na nadměrném popisování nových druhů v sekci Aspergillus. V této monografii byly druhy podrobeny revizi za použití přístupu kombinujícího sekvenční data ze čtyř nezávislých lokusů (beta-tubulin, kalmodulin, RPB2 a rDNA), PCR-fingerprinting, mikro- a makromomorfologická data a fyziologii. Za použití tohoto přístupu byl celkový počet druhů redukován na sedmnáct. Popis A. proliferans byl doplněn o popis jeho teleomorfy a tento druh se zdá být relativně běžně rozšířeným a často zaměňovaným za A. glaucus. Zeleně sporulující kmeny A. niveoglaucus izolované z potravin a dalších substrátů jsou morfologicky nerozlišitelné od A. glaucus a jsou s ním pravděpodobně také často zaměňovány. V reakci na aktuální změny v botanickém kódu jsme převedli všechny druhy Eurotium do rodu Aspergillus a navrhli jediné platné jméno pro každý druh. Neo-, lekto-, či epityp byl nově označen pro některé revidované druhy.

Identifikace klinických izolátů Aspergillus ze sekce Candidi pocházejících z českých pacientů byla revidována za použití sekvenačních dat (geny kódující beta-tubulin a kalmodulin). Mezi těmito izoláty byly zjištěny tři druhy, včetně jednoho nepopsaného druhu. U všech klinických izolátů byly také testovány citlivosti k běžným antimykotikům, které ukázaly všeobecně dobrou citlivost těchto druhů. Fylogenetická analýza, unikátní morfologicko-fyziologické znaky a spektrum sekundárních metabolitů podpořily objevení nepopsaného druhu, který byl pojmenován A. pragensis podle místa izolace obou kmenů. Také bylo demonstrováno, že případy invazivních infekcí způsobene izoláty, morfologicky určenými jako A. candidus podle bílé sporulace, byly ve skutečnosti působeny bíle sporulujícími mutanty jiných druhů. Článek je v recenzním řízení.

Nepopsaný geofilní druh rodu Microsporum byl izolován z případu tinea corporis u českého pacienta. Pomocí molekulárně genetických (beta-tubulin a ITS rDNA), morfologických a fyziologických znaků se podařilo tento druh odlišit od všech dosuch popsaných druhů v komplexu Microsporum gypseum. Článek byl přijat do tisku, je očekávána proofs verze.

Byla revidována taxonomie komplexu druhů Aspegillus viridinutans, jehož zástupci působí infekce člověka a obratlovců. Na základě molekulárně-genetických dat (beta-tubulin a kalmodulin) a cílenými křížícími pokusy se podařilo vymezit hranice druhů. U některých druhů bylo poprvé pozorováno pohlavní stádium, které nese znaky použitelné k rozlišení druhů. Publikace zahrnuje popis celkem tří nových druhů. Článek je zatím dostupný v online verzi: DOI 10.1007/s13225-013-0262-5

Dva nové druhy rodu Aspergillus v sekci Fumigati byly popsány a pojmenovány po významných osobnostech světové mikrobiologie, které tyto druhy v minulosti izolovaly a uložily do sbírek mikroorganismů. K vymezení druhů byly použity následující metody: fylogenetická analýza založená na pěti nezávislých genetických markerech (včetně beta-tubulinu), spektrum produkovaných sekundárních metabolitů, mikro- a makromorfologie (i skenová elektronová mikroskopie) a fyziologie.

Rod Auxarthron (Onygenales) je rod keratinofilních hub, jehož zástupci byli dosud považováni za nepatogenní pro člověka. Tato publikace popisuje vůbec první případ infekce u člověka, která byla navíc způsoben prozatím nepopsaným druhem tohoto rodu. Byly prezentovány celkem čtyři případy, kdy byli zástupci rodu Auxarthron izolováni ze suspektní nebo prokázané onychomykózy a byly stanoveny citlivosti izolátů k antimykotikům. Druh A. ostraviense sp. nov. byl popsán na základě morfologie, fyziologie a molekulárně genetických dat (beta-tubulin, RPB2 a rDNA), která jej jasně odlišila od druhů v minulosti popsaných. Také byl vytvořen dichotomický určovací klíč ke všem zástupcům rodu.

Článek přijat do recenzního řízení. Čísla stránek zatím nejsou zatím známa. Vzhledem k tomu, že ještě dojde k úpravám textu, nahrávám pouze potvrzení o přijetí do recenzního řízení v daném periodiku.

Přiloženo PDF druhé korektury.

V publikaci jsme popsali nový, účinný a reproducibilní systém pro přípravu polyomavirových mutant, který v našem projektu využíváme pro produkci virových částic pozměněných metodami cílené evoluce.

Petra Nytrová je spouautorem článku (kazuistiky).

doi: 10.1002/zaac.201300389

doi: 10.1002/zaac.201300389

doi: 10.1016/j.cattod.2013.09.012

Článek je odeslaný ke 2.revizi. Přikládám poslední odeslanou revizi článku.

Článek je nyný ve fázi 3. revize. Zbývají již jen drobné úpravy. Přikládám veškerou komunikaci s recenzenty a poslední verzi článku.

Článek byl odeslaný ke 2.revizi. Přikládáme odpověď od recenzentů a poslední verzi článku.

Článek úspěšně prošel recenzním řízením a byl přijat k publikování v ČČH č. 2/2014, které vyjde v červnu 2014. Délka článku je 28 normostran, ale čísla stran mi ještě nejsou známa, protože se text teprve připravuje pro tisk.
(Přiložen text v podobě, v jaké byl odevzdán redakci ČČH. Dále přiložena zpráva z redakce ČČH o přijetí článku do tisku. Redakce prosadila ve srovnání s názvem tohoto grantového projektu obecnější název článku "Proměny kulturní diplomacie Spolkové republiky Německo v epoše Willyho Brandta".)

publikace za rok 2013

V článku je uvedena afiliace autorky (FSV UK), není však uvedena dedikace GAUK, neboť v době, kdy byl text odevzdán k tisku autorka stále neznala číslo svého GAUK projektu.

Časopis je zařazen v databázi Scopus.

Afiliace i dedikace GAUk uvedeny.
článek má spoluautora PhDr, Irenu Reifovou, PhD

V textu je uvedena afiliace autorky, není však uvedena GAUK dedikace (pouze dedikace SVV), vzhledem k tomu, že v době odevzdání textu autorka ještě neznala číslo svého GAUK projektu.

Článok bol opublikovaný 22. mája 2014 na internetovej stránke http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jp501648x ako "just accepted", zatiaľ bez priradeného čísla zväzku a strán, DOI10.1021/jp501648x

Článek vyšel ve formě "working paperu". Bude ale rovněž zaslán do mezinárodního časopisu.

Pozn.: V kategorii impaktní faktor jsem uvedl číslo pro jednoduchý impakt faktor dostupný na RePEc http://ideas.repec.org/top/top.series.simple.html#repec:cer:papers

Článek, publikovaný v recenzovaném periodiku vydávaném Ústavem českých dějin FF UK a vycházející z příspěvku předneseného na konferenci „Česká bible – kulturní, ideový a politický fenomén v proměnách staletí“, upozorňuje na fakt, v odborné literatuře dosud neuváděný, že překlad hugenotského latinského spisu "Tractatus de providentia Dei", pořízený jedním z Veleslavínových spolupracovníků Janem Kocínem z Kocinétu a vydaný veleslavínskou tiskárnou roku 1592, cituje četné úryvky veršovaných žalmových parafrází Jiřího Strejce, resp. nahrazuje jimi úryvky latinských žalmových parafrází Georgia Buchanana, které jsou citovány v Kocínově předloze. Článek ukazuje některé pozoruhodné literárněhistorické důsledky, které tento zdánlivě nepatrný fakt provázejí. Zamýšlí se především nad otázkou, co tento jev svědčí o hodnocení Strejcových veršovaných úprav žaltáře v pražském kulturním prostředí a zvláště v okruhu Veleslavínových spolupracovníků. Ukazuje dále, v čem tento fakt může modifikovat stereotypní obraz veleslavínského okruhu a jeho postoje k literárnímu textu, rozšířený staršími literárněhistorickými výklady. Upozorňuje také na to, že způsob, jímž Kocín Strejcovy parafráze cituje, představuje ojedinělý doklad o emancipaci veršovaného textu od hudební složky v raněnovověkém písemnictví. Protože toto poslední pozorování se vztahuje k častěji diskutované otázce poměru hudební a slovesné složky v raněnovověké poezii v českých zemích, odkázala také zvláště na ně diskuse, která na konferenci proběhla.

Důkladné studium měrného tepla sloučenin ze série Ce(Cu,Al)4.

Manuscript in print.
The printed e-mail with the final acceptance of article enclosed

A nanofiber scaffold containing α-granules was prepared by coaxial electrospinning. The biological potential of the nanofiber scaffold was evaluated in chondrocyte and mesenchymal stem cell cultivation studies. Additionally, the concentration of TGF-β1 was determined. RESULTs: Microscopy studies showed that intact α-granules were incorporated into the coaxial nanofibers. The cultivation tests showed that the novel scaffold stimulated viability and extracellular matrix production of chondrocytes and mesenchymal stem cells. In addition, the concentration of growth factors necessary for the induction of cell proliferation significantly decreased.

We prepared 3D poly (ε-caprolactone) (PCL) nanofibre scaffolds and tested their use for seeding, proliferation, differentiation and migration of mesenchymal stem cell (MSCs). 3D nanofibres were prepared using a special collector for common electrospinning; simultaneously, a 2D PCL nanofibre layer was prepared using a classic plain collector. Both scaffolds were seeded with MSCs and biologically tested. MSC adhesion, migration, proliferation and osteogenic differentiation were investigated.
We draw the conclusion that all positive effects observed using the 3D PCL nanofibre scaffold are related to the larger fibre surface area available to the cells. Thus, the proposed 3D structure of the nanofibre layer will find a wide array of applications in tissue engineering and regenerative medicine.

This article uses data on Czech public procurement contracts from 2005 - 2010 in order to uncover patterns suggestive of corrupt behavior of procuring officials. Using polynomial regressions and local linear density estimators, the article provides evidence that procurement officials manipulate anticipated values of procurements so that contracts can be awarded through less transparent procedures with restricted entry. Manipulations manifest through emergence of sharp discontinuities in the anticipated value distribution. Procurements excessively bunch below statutory thresholds, which determine officials’ scope of discretion, entry-restrictiveness and transparency of the contract-awarding process. The first appearance of discontinuities coincides almost exactly with thresholds being introduced into the procurement legislation. Manipulations occur only in procedures restricted by thresholds and are prevalent only among a narrow group of procuring bodies. The last finding is consistent with manipulations being driven by corruption of procurement officials. Manipulations concern 8.6% of all below-limit procurements.

This study provides evidence of a strong link between two channels facilitating rent-extraction in public procurement: between concealing the ultimate ownership of contractors and manipulation of the anticipated value of tenders. Using data on more than 15 300 tenders awarded to joint-stock companies in the Czech Republic during 2005 - 2010, the study shows that tender value manipulation has been incentivized by the 2006 procurement reform, which established several discontinuities in the anticipated value of tenders. After the reform, manipulation increased much more for tenders awarded to contractors with anonymous owners as opposed to traceable owners. Contractors in manipulated tenders needed to underbid fewer firms in order to win procurements and their winning bids for comparable contracts were, on average, higher than before reform. The results imply disrupted optimality of contractor choice and reduced efficiency of procurement. The results are strongest for contracts on services and construction works, which traditionally conceal rent-extraction more easily.

Jedná se o prvoautorský článek, ve kterém je jako zdroj financí uveden tento grant. Článek vznikl ve spolupráci s brněnským Veterinárním institutem, kde byla vyřezána krátká raménka chr.7, a britským výzkumným centrem NIMR, ve kterém byl získaný genetický materiál osekvenován metodou Illumina. Bioinformatickou analýzou dat získaných z pouhých 15 kopií krátkého raménka chr.7 bylo k mikrodisektované oblasti přiřazeno více než 200 skafoldů a u 1/3 dříve namapovaných skafoldů bylo zjištěno špatné sestavení. Nově vyvinutý přístup má navíc velmi malé nároky na množství vstupního materiálu, což zcela jistě umožňuje její využití i v dalších oblastech výzkumu či klinické medicíny.

Jedná se o spoluautorský článek využívající data ze sekvenace krátkého raménka chromozómu 7. Z našeho výzkumu vyplývá, že si jsou pohlavní chromozómy u druhu X. tropicalis velmi podobné a oblast určující pohlaví je velmi malá. Technikou RAD tags se nám nepodařilo nalézt mezi pohlavími významné rozdíly a na samčím (heterogametním) pohlaví se nenacházely pouze dva ze dvaceti scaffoldů se silnou vazbou na pohlaví, které byly identifikovány ve studii (Olmstead et al., 2010). Pravděpodobně to způsobeno nezměněnou rekombinací nebo mnohonásobnou změnou pohlavních chromozómů.

Pojednání o Hsp u rostlin je v přípravě a bude připraveno k tisku v nejbližší době

Výsledky projektu, u kterého je uváděna podpora GAUK, byly v roce 2013 publikovány v odborném vědeckém časopise PLOS ONE . Hlavní řešitelka toho projektu je prvním autorem uvedené publikace.

Článek s dedikací tomuto grantu GA UK.

Článek se snažil o nevšední interpretaci raného díla sociologa Émila Durkheima. Využil jsem proto číslo věnované kulturní sociologii, s níž má hermeneutika některé společné postoje. Článek se pohybuje na půdě kulturní sociologie, ale zároveň ji kritizuje z pozic filosofické/sociologické hermeneutiky. Hlavní tezí článku je, že dílo Émila Durkheima je možné celé pochopit jako dílo vztahující se ke kultuře, nikoli k sociální struktuře. To jsem se snažil dokumentovat na jeho dvou hlavní raných dílech Společenské dělbě práce a Pravidlech sociologické metody.

Uvedení dedikace na projekt GAUK č. 617012 bylo redakční radou odmítnuto. Blíže viz přiložené potvrzení redakce ĎaS.

[Epub ahead of print]

Publikačním výstupem je studie jednoho z členů řešitelského kolektivu. Na předložené studii jsem se konkrétně podílela sestavením tabulek a grafické dokumentace (srv. obr. 6).

Článek byl přijat k tisku.
Potvrzení o přijetí i náhled manuskriptu ve formátu pdf jsou přiloženy.

Článek byl odeslán nakladatelství a vydán před schválením podpory projektu GAUK.

Tento článek řešitelky je totožný s příspěvkem z doktorandské konference v Banské Bystrici v roce 2012, a posléze v roce 2013 uveřejněným ve sborníku Teória a prax hudobnej edukácie. Příspěvek vznikl před schválením podpory prejektu GAUK.

Článek byl odeslán nakladatelství před schválením podpory projektu GAUK.

A grid drawing of a graph maps vertices to the grid $\mathbb{Z}^{d}$ and edges to line segments that avoid grid points representing other vertices. We show that a graph $G$ is $q^{d}$-colorable, $d$, $q \geq 2$, if and only if there is a grid drawing of $G$ in $\mathbb{Z}^{d}$ in which no line segment intersects more than $q$ grid points. This strengthens the result of D.~Flores Pe\H{n}aloza and F.~J.~Zaragoza Martinez. Second, we study grid drawings with a bounded number of columns, introducing some new $\NP$-complete problems. Finally, we show that any planar graph has a planar grid drawing where every line segment contains exactly two grid points. This result proves conjectures asked by D.~Flores Pe\H{n}aloza and F.~J.~Zaragoza Martinez.

Let $P=(p_1,p_2,\ldots,p_N)$ be a sequence of points in the plane, where $p_i=(x_i,y_i)$ and $x_1<x_2<\cdots<x_N$. A famous 1935 Erd\H{o}s–Szekeres theorem asserts that every such $P$ contains a monotone subsequence $S$ of $\lceil \sqrt{N} \rceil$ source points. Another, equally famous theorem from the same paper implies that every such $P$ contains a convex or concave subsequence of $\Omega(\log N)$ points.

Monotonicity is a property determined by pairs of points, and convexity concerns triples of points. We propose a generalization making both of these theorems members of an infinite family of Ramsey-type results. First we define a $(k+1)$-tuple $K\subseteq P$ to be positive if it lies on the graph of a function whose $k$th derivative is everywhere nonnegative, and similarly for a negative $(k+1)$-tuple. Then we say that $S\subseteq P$ is $k$th-order monotone if its $(k+1)$-tuples are all positive or all negative.

We investigate a quantitative bound for the corresponding Ramsey-type result (i.e., how large $k$th-order monotone subsequence can be guaranteed in every $N$-point $P$). We obtain an $\Omega(\log(k−1)N)$ lower bound ($(k−1)$-times iterated logarithm). This is based on a quantitative Ramsey-type theorem for transitive colorings of the complete $(k+1)$-uniform hypergraph (these were recently considered by Pach, Fox, Sudakov, and Suk).

For $k=3$, we construct a geometric example providing an $O(\log\log N)$ upper bound, tight up to a multiplicative constant. As a consequence, we obtain similar upper bounds for a Ramsey-type theorem for order-type homogeneous subsets in $\mathbb{R}^3$, as well as for a Ramsey-type theorem for hyperplanes in $\mathbb{R}^4$ recently used by Dujmovi\'{c} and Langerman.

Priata publikace:

To follow up my previous correspondence, I'd like to formally accept your manuscript for publication in Nanomedicine. Thank you very much for the time and effort that you and your colleagues have put into finalizing the article for publication.
Your article will be scheduled to appear in the May issue of the journal and a member of our production team will contact you with the galley proofs, once the manuscript has been typeset. If you have any queries regarding the typesetting of your manuscript beforehand, please do not hesitate to get in touch with me.

Spontaneous catalyst-free polymerizations of 4-ethynylpyridine (4EPy) and 2-ethynylpyridine with bifunctional quaternizing agents (QAs) of bis(bromomethyl)arenes provide highly crosslinked polymer networks in high yields. 13C cross-polarization magic-angle spinning (CP/MAS) NMR, Fourier transform IR (FTIR) and diffuse reflectance vis spectroscopy confirm that these networks consist of polyacetylene main chains substituted with pyridyl and pyridiniumyl groups, the latter interconnected with -CH2(arylene)CH2- linkers. Variation of the 4EPy/QA ratio in the polymerization feed results in networks with different extents of crosslinking and pyridyl/pyridiniumyl ratio (N/N+ from 0 to 1.32). Networks exhibit photoluminescence and are also moderately active in CO2 capture (the highest uptake is 16.4 cm3 (STP)/g at 293 K and equilibrium CO2 pressure of 750 Torr).

Článek pojednává o Różewiczově básni Nożyk profesora (Profesorův nožík) ve vztahu k textovým a vizuálním manifestacím sekundárního svědectví.

Předmětem článku je problematika kulturní post-paměti a sekundárního svědectví Holokaustu v tvorbě Jiřího Koláře a Tadeusze Różewicze. Zdrojem obou klíčových pojmů jsou americké "Holocaust studies", článek hledá možnosti jejich uplatnění ve středoevropské poválečné literatuře. Další z přínosů článků je pokus o propojení reflexe o Holokaustu s názorem, že avantgardní kulturní model zkrachoval a je potřeba hledat zcela nový, eticky podložený model kultury a umění.

Příspěvek vyjde až dne 27. července ve speciálním vydání žurnálu "ACM Transactions on Graphics" s číslem 4 a s názvem "SIGGRAPH 2014 Conference Proceedings". Z tohoto důvodu není možné správně vyplnit požadovaná čísla stránek.

Available online 6 January 2014:
(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0939362513000964)

Paper accepted. Publication planned in 2014.
Also, in 2014 the journal will receive an impact factor.

The objective of this study were Little Ice Age (LIA) to recent subglacial tills, glaciofluvial sediments of proglacial sandur, esker sediments and sediments of morainemound complexes of Hørbyebreen polythermal valley glacier and LIA to recent sediments of lateral moraine, frontal moraine, ice-cored moraine and glaciofluvial sediments of proglacial sandur of Bertilbreen polythermal valley glacier. Fossil (probably early Holocene) subglacial and supraglacial tills and sediments of coarsegrained glaciomarginal delta of Bertilbreen have also been studied. The research focused on Old Red sandstone clasts, for which roundness, shape and striation presence have been investigated. The results from this research led to the proposal of new methodological approaches. It is mainly the covariant plot of striations and RA (the share of striated clasts versus the share of very angular and angular clasts), which effectively differentiate subglacial tills from glaciofluvial sediments and allows for identification of the source material of moraine-mound complexes, especially the oldest, more degraded parts near the maximum LIA glacier extent. The second is the covariant plot of distance and RS index (the distance from the starting point versus the share of subangular and subrounded clasts) to present downstream roundness trends in proglacial glaciofluvial sediments. The research confirmed the crucial role of lithological properties of thinly bedded rocks on the shape of these rock clasts in sediment and a minimum impact of passive and active transport on the clast shape modification.

Článek se zabývá projevy chladných období kvartéru v reliéfu horských oblastí střední Evropy a na příkladu Krkonoš a Vysokých Tater ukazuje využití vybraných periglaciálních a glaciálních tvarů reliéfu pro rekonstrukci přírodního prostředí v minulosti.

The influence of pastmicroclimates on themorphology and distribution of clasts is considered for relict large-scale sorted polygons in the KrkonošeMountains (Czech Republic). Sixty-two sorted polygons with an average length of 194 cm and an average height of 21.5 cm were measured at four sites on Mt Luční hora, at elevations of 1455 to 1555m asl. The polygons consist of tabular clasts with a mean length of 11 cm at the borders and 5 cm in the interiors. Smaller polygons are better sorted because of the shorter distances for the clasts to reach their borders. Polygons with greater relative height are better sorted due to more intensive slope processes associated with differential frost heaving. Better sorted and more domed polygons at higher altitudes suggestmore severe and longer-lasting microclimates suitable for the development of sorted polygons. The altitudinal gradient in polygon morphology and sorting suggests the dominant role of microclimate in the periglacial environment of the summit area of the Krkonoše Mountains during the Last Glacial/Holocene period. Polygon development probably involves positive feedback between morphology and frost susceptibility, driven by microclimate. The proposed method for evaluating frost sorting allows for rapid non-invasive assessment of sorting using modern methods including high-resolution remote sensing (especially terrestrial photogrammetry). Copyright © 2013 John Wiley & Sons, Ltd.

Tato publikace neobsahuje všechny výsledky, které byly získány v rámci tohoto projektu. Pokrývá pouze část týkající se psychosociálního stresu a modelu "rezident-vetřelec". Obsahuje jak afiliaci Přírodovědecké fakultě UK, tak dedikaci k tomuto projektu.

PMID: 24192578
článek t.č. pouze online, t.j. nejsou dostupné info svazek-volume-strany. Zde jsem zadala nesmyslné číslo, pdf článku je v příloze.

Online publikováno dne 19.12.2013, jako Free PMC article (PubMed). Proto jsem stránky z důvodu neflexibility aplikace zadala jako volume a číslo článku, podobně, t.č. nemám k dispozici ISSN.
doi: 10.3389/fnagi.2013.00094.
Pdf článku je v přílohách.

Článek je v tisku- nejsou přiřazeny stránky; doi: 10.1007/s11095-013-1228-8

Článek se zabývá detailním rozborem hydrologické bilance ledovcového jezera Adygine v kyrgyzském Tien Shanu včetně jednotlivých faktorů, které ji ovlivňují. Poznatky publikované v rámci odborné literatury jsou konfrontovány s výstupy zjištěnými terénním výzkumem. Ledovce centrálního Tien Shanu jsou považovány za velmi senzitivní indikátory změn klimatu. Studované jezero přitom patří do soustavy mladých jezer lokalizovaných před čelem ustupujícího ledovce a řadí se mezi potenciálně nebezpečná jezera. V letech 2007-2012 byl v této lokalitě prováděn detailní monitoring hladiny jezera a jeho povrchového odtoku v závislosti na vývoji klimatických podmínek oblasti. Podstatnou částí příspěvku je zhodnocení bilance přítoku a odtoku z jezerní pánve.

Článek je v tisku.

http://www.mendeley.com/profiles/vit-trebicky1

http://www.mendeley.com/profiles/vit-trebicky1

Článek se zabývá interakcí olomoucinu II a purvalanolu A s lékovým efluxním transportérem ABCG2. Na modelu buněčných monovrstev MDCKII buněk, které stabilně exprimují ABCB1 nebo ABCG2, jsme zjistili, že olomoucin II je duálním substrátem obou transportérů, což znamená, že oba transportéry mohou ovlivňovat jeho farmakokinetické vlastnosti, což může vést ke snížené akumulaci olomoucinu II v nádorových tkáních a také k lékovým interakcím. Naopak, farmakokinetické vlastnosti purvalanolu A pravděpodobně nebudou transportéry ABCB1 a ABCG2 ovlivněny. Dále jsme v MDCKII buňkách pozorovali intenzivní metabolizaci olomoucinu II na sulfát a následný eflux tohoto metabolitu ven z buňky. Z toho vyplývá, že při testování substrátové specifity látek vůči lékovým transportérům, je nutné zvýšené opatrnosti při interpretaci výsledků; zvláště při použití metod s radioaktivní detekcí je riziko falešně pozitivních/negatovních výsledků vysoké. Na základě chemických struktur studovaných látek také dokládáme fakt, že i látky s vysokou strukturální podobností mohou vykazovat rozdílné farmakokinetické chování, jako např. interakce s ABC transportéry nebo biotransformačními enzymy.

Článek se zabývá interakcí pěti inhibitorů cyklin-dependentních kináz s lékovým efluxním transportérem ABCB1. Zjistili jsme, že olomoucin II, roskovitin, olomoucin II a flavopiridol inhibují transport ABCB1 substrátů Hoechst 33342 a daunorubicinu v buněčné linii MDCKII-ABCB1. Látka SNS-032 inhibovala pouze transport daunorubicinu. Pomocí ATPázových esejí jsme potvrdili již publikovaný fakt, že roskovitin je substrátem ABCB1 a zjistili, že olomoucin II je pravděpodobně také substrátem ABCB1. Tři nejpotentnější inhibitory ABCB1 (purvalanol A, olomoucin II a roskovitin) byly zkombinovány s daunorubicinem, protinádorovým léčivem a ABCB1 substrátem, v buněčných liniích MDCKII-ABCB1 a nádorových liniích HepG2 a HCT-8. Cílem bylo zjistit, jestli kombinace CDKi s dalším protinádorovým léčivem vyústí v synergický účinek obou léčiv, což jsme potvrdili. Tento zvýšený synergický účinek je částečně způsoben (i) inhibicí ABCB1 zprostředkovanou CDKi, což vede ke zvýšené intracelulární akumulaci daunorubicinu a (ii) vlastní cytotoxickou aktivitou CDKi. Naše výsledky ukazují, že podání testovaných CDKi v kombinaci s protinádorovými léčivy, které jsou ABCB1 substráty, může vést k signifikantnímu snížení dávek obou léčiv v terapii nádorů s expesí ABCB1.

článek "accepted", tedy "přijat" (ve fázi před závěrečnými korekturami před tiskem)

Článek byl odeslán do redakce, dosud probíhá recenzní řízení. Předpokládáme, že bude vydán ještě v letošním roce. I když není přijat ke dni odevzdání této zprávy, považovala jsem výsledky ze tak významné, že jsem na doporučení školitele zvolila impaktovaný mezinárodní časopis (s průměrným IF ve své kategorii) na úkor rychlého vydání v mnohem méně významném, byť recenzovaném časopise.
Tento článek vznikal ve spolupráci se zahraničním autorem, který svým odborným vedením podstatně přispěl k jeho výsledné podobě.

Práce monograficky shrnuje několikaleté studium ostrakodů, kteří byli hlavním předmětem grantového projektu. Tento výstup je hlavním a komplexním výsledkem grantu. Značný rozsah rukopisu však vylučuje rychlý proces přijetí do jakéhokoliv periodika. Svým významem však jednoznačně náleží do časopisu s IF. V současné chvíli byl nabídnut uvedenému periodiku, které přijímá podobně rozsáhlé články a má IF ve středu své kategorie. I v tomto případě platí, že jsem na doporučení školitele zvolila časově náročnější redakční proces ve významném mezinárodním časopise na úkor hladkého a rychlého přijetí v domácím recenzovaném periodiku. Monografické zpracování preferujeme před rozdělením na dílčí publikace z důvodů mnohem větší citovanosti takového tipu prací, a tedy zájmu některých významných časopisů.

Abstract
Four new small-celled naviculoid diatom species belonging to the genera Adlafia, Chamaepinnularia, Mayamaea, and Microcostatus were found during a survey of the non-marine diatom flora of the South Shetland Islands and James Ross Island (Maritime Antarctic Region). Following both light and scanning electron microscopy, the following species were described as new: Adlafia submuscora sp. nov., Mayamaea josefelsteri Kopalova, Nedbalova & Van de Vijver sp. nov., Microcostatus australoshetlandicus sp. nov. and Chamaepinnularia antarctica sp. nov. The new species are compared to other morphologically similar species from Europe, South America and the (sub-)Antarctic region. Data on their ecology and biogeography are included. In addition, the morphology, biogeography and taxonomic position of two other small-celled naviculoid diatoms, Craticula glaberrima (W. & G.S.West) nov. comb. and Sellaphora nana (Hustedt) Lange-Bertalot et al. are discussed.

Abstract
Diatom and water chemistry samples were collected from 49 lakes, pools and rivers on Byers Peninsula (Livingston Island, South Shetland Islands) during the summer of 2009. A diverse diatom flora of 143 taxa was found. Fragilaria capucina s.l., Psammothidium papilio, Navicula dobrinatemniskovae and several Nitzschia taxa dominated the flora. The biogeographical analysis showed that more than 55% of all observed taxa presented a restricted Antarctic biogeographic distribution and only 30% had a cosmopolitan distribution, contrary to previously published data. Cluster analysis and Principal Components Analysis were used to classify the samples based on their chemical characteristics, revealing that nutrients and specific conductance were the main factors dividing the samples into four groups: young lakes, coastal lakes, larger lakes on the central plateau and smaller, temporary pools. Diatom communities corresponded well to this division and were strongly influenced by salinity and nutrients.

Abstract
The diversity, ecology and biogeography of diatoms in lakes, seepage areas and streams on the Ulu Peninsula, a large ice-free area in the northern part of James Ross Island (Weddell Sea), were studied. A diverse diatom flora of 123 taxa was observed, dominated by several Nitzschia taxa, Psammothidium papilio, Eolimna jamesrossensis, Fragilaria capucina and Fistulifera saprophila. The results from the similarity and diversity analysis suggest James Ross Island to be biogeographically positioned within the Maritime Antarctic region, yet with some affinities with the flora of Continental Antarctica, as shown by the presence of Luticola gaussii and Achnanthes taylorensis. Based on our data, James Ross Island can thus be located close to the boundary of the two main Antarctic biogeographical regions. Diatom communities present in streams and seepage areas could be clearly distinguished from those in lakes, the latter being much more species rich. Based on the multivariate analysis, conductivity and nutrients were selected as the two main environmental factors determining the diatom composition in the Ulu Peninsula lakes. The revised taxonomy of the Antarctic diatom flora induced the construction of a transfer function for water conductivity in the studied lakes that can be applied in further palaeoecological studies.

Abstract
The type material of Achnanthidium lanceolatum (transferred in 1999 to the genus Planothidium) is investigated to reveal the identity of several Planothidium populations from the Antarctic Region. The morphology and the ultrastructure was analysed using light and scanning electron microscopy. The results of this analysis revealed the presence of two so far undescribed Planothidium species in the investigated Antarctic material. Both species are described as new to science: P rost-rolanceolatum VAN DE VIJVER, KOPALOVA et ZIDAROVA Sp. nov. and P subantarcticum VAN DE VIJVER et C.E.WETZEL sp. nov. The new species can be differentiated based on differences in valve outline and the shape and size of the central area. Planothidium lanceolatum is formally lectotypified. Notes on the ecology and distribution of the new Antarctic species are added.

Abstract
The presentation of three distinct Neidium taxa from the sub-Antarctic and Maritime Antarctic region after examining more than 1500 samples from a broad variety of aquatic and terrestrial (micro-)habitats suggests that taxa representing the genus Neidium Pfitzer are not only quite rare in these regions, but that the three species also represent well-defined biogeographical distributions. N. nyvltii sp. nov., N. antarcticum sp. nov. and N. aubertii Manguin are characterized by linear to linear-lanceolate valves with rostrate to capitate apices, a single prominent longitudinal canal along the valve margins and lacinia covering the distal raphe endings. Neidium nyvltii is a benthic alkalophile growing in the Maritime Antarctic region under high total phosphorus (TP) and moderately high chloride concentrations, while the closest taxa for comparison (N. kozlowii Mereschkowsky and its varieties) are also alkalophilic, growing under lower TP concentrations in northern temperate-Arctic regions. Neidium aubertii is an acidophile with a sub-Antarctic distribution, whereas the most comparable taxa are N. bisulcatum (Lagestedt) Cleve, and N. bergii (A. Cleve-Euler) Krammer & Lange-Bertalot both are alkalophiles with northern hemisphere distribution and commonly occurring in the Arctic. There is some evidence of parallel similarities in valve forms between the polar northern and southern hemispheres. The significance of this parallelism is yet to be determined.

Abstract. Four taxa belonging to the complex of species around Achnanthidium minutissimum were
found during the ongoing taxonomic revision of the Antarctic freshwater and limno-terrestrial diatom
flora. Two taxa were previously described as Achnanthidium lailae and A. sieminskae. Two others were
formerly identified as A. minutissimum but detailed light and scanning electron microscopical observations
revealed sufficient morphological differences compared to the type of A. minutissimum, to justify their
separation and description as new taxa: Achnanthidium indistinctum and A. maritimo-antarcticum. The
morphology and ecology of all four taxa are discussed comparing the species with morphologically
similar taxa. The biogeographical consequences of the splitting of the former A. minutissimum complex
in the Antarctic Region are discussed.

Článek byl přijat do tisku v březnu roku 2013. Potvrzení o antedataci čísla časopisu Anthropologie přikládám do příloh.

Transient receptor potential kanál TRPC6 je neselektivní iontový kanál zodpovědný za vstup vápenatých kationtů do buňky. V této studii bylo pomocí fluorescenční anizotropie charakterizováno vazebné místo pro S100A1 protein na C-konci TRPC6.

Publikace obsahuje výsledky originálního výzkumu zaměřeného na prostorovou orientaci u starší populace. Článek "Spatial navigation in young versus older adults" byl publikován v mezinárodním impaktovaném časopise "Frontiers in aging neuroscience" (IF 5,2) s uvedenou afiliací 2.LF UK a dedikací projektu GAUK č. 546113.

Publikovaný článek se zabývá problematikou subjektu trestného činu praní peněz. Jako první článek tohoto druhu v české trestněprávní nauce zevrubně pojednává o otázce, zda by z pohledu de lege lata i de lege ferenda měl být za trestný čin praní peněz odpovědný i pachatel tzv. hlavního trestného činu, tedy trestného činu, ze kterého nelegální prostředky pocházejí.Nutno zdůraznit, že jde o problematiku velmi aktuální i z hlediska evropského kontextu, neboť přístup v jednotlivých evropských státech se různí. Zřetelným trendem posledních let je, aby se postihovalo i tzv. samopraní. V rámci komparativní metody výkladu byly srovnány právní úpravy Francie, Itálie, Německa, Polska, Slovenska, Slovinska, Španělska, Švédska, Švýcarska a použita k tomu relevantní italská, německá, francouzská, španělská a polská literatura. V souladu s německou a italskou doktrínou se přikláním k závěru, který je v české teorii zřetelně menšinový, že pachatel trestného činu praní peněz nemůže být trestně odpovědný zároveň za trestný čin hlavní. Zásadní argument spatřuji v samotné podstatě jednání, které spočívá v praní peněz a které lze označit za tzv. post factum. Postih pachatele trestného činu, ze kterého nelegální výnosy pocházejí, zároveň za trestný čin praní peněz (podoba vícečinného souběhu) se navíc dostává do rozporu se zásadou zákazu nucení k sebeobviňování (nemo tenetur se detergere/ipsum accusare) a zásadou ne bis in idem.

Abstrakt: Jedným z významných „stavebných“ prvkov súčasnej krajiny je nelesná drevinová vegetácia. Sú to skupiny alebo línie stromov a kríkov vyskytujúce sa najčastejšie na poliach, trvalých trávnych porastoch, pozdĺž ciest a vodných tokov. Článok prináša informácie o tom, prečo je potrebné chrániť nelesnú drevinovú vegetáciu, aký význam má pre krajinu a pre človeka a aké legislatívne nástroje štát poskytuje na jej ochranu či starostlivosť.

Článek již je dostupný online, nicméně ještě nebyl zařazen do čísla časopisu k tisku (tedy nemá ani stránkování), proto lze zatím citovat pouze pomocí DOI:10.1111/arcm.12067.
Jako hlavní autorka jsem článek kompletně sepsala. Prováděla jsem většinu uvedených analýz (skenovací elektronovou mikroskopii s energiově-disperzní spektroskopií, všechny tři typy infračervené spektroskopie (transmisní, reflexní, mikro-ATR)) a aktivně jsem se účastnila měření Ramanovy spektroskopie. Částečně jsem také vyhodnocovala výsledky získané práškovou rentgenovu difrakcí. Zajistila jsem analyzované referenční vzorky vivianitu a metavivianitu a připravovala jsem společně s kolegyní modelový vzorek barevné vrstvy za účelem studia mikroskopických charakteristik vivianitového pigmentu.

Tento článek byl zaslán do časopisu s IF; v současnosti probíhá oponentní řízení. Článek jsem jako druhá autorka částečně sepisovala; analyzovala jsem mikrovzorky uměleckých děl vibračními spektroskopiemi a interpretovala výsledky.

Přijato k publikaci, potvrzení z redakce připojeno jako příloha.

Přijato k publikaci, povrzení z redakce přiloženo jako příloha.

Článek byl přijat do tisku v únoru 2014;
v příloze je PDF poslední verze manuskriptu a PDF dopisu potvrzujícího přijetí do tisku.

Rozsah stránek zatím není jasný - níže je uvedené potvrzení a úspěšném recenzním řízení.
Praha, 29. 10. 2013
Redakční rada časopisu Acta Universitatis Carolinae - Kinanthropologica tímto potvrzuje, že níže uvedený článek byl po úspěšném recenzním řízení přijat k publikování v AUC-K, vol. 49, č. 2 – 2013, včetně anglického „Summary“ a českého „Souhrnu“:
Jan Šíma, Tomáš Ruda, Vilém Omcirk
Dependence of the Overall National Team Market Value on its Success at UEFA EURO 2012.
Prof. PhDr. Antonín Rychtecký, DrSc.
předseda redakční rady
Acta Universitatis Carolinae - Kinanthropologica

Journal of Diabetes Research je nový název časopisu s původním názvem Experimental Diabetes Research

Article ID 650694

Tato publikace zatím nemá přiřazené stránky ani ISSN, do této doby je doporučeno citovat takto: H. Tomšíková, P. Solich, L. Nováková, Sample preparation
and UHPLC-FD analysis of pteridines in human urine, Journal of Pharmaceutical and
Biomedical Analysis (2014), http://dx.doi.org/10.1016/j.jpba.2014.03.012

Čísla stránek, svazek a ISSN zatím ještě nejsou známy a je doporučeno tuto publikaci citovat pomocí DOI: 10.1002/jssc.201400020.

recenzovaný časopis

ISBN 978-80-7075-793-2

Digital Object Identifier (DOI) 10.1007/s11120-013-9955-6

Článek Vaverka et al. [2014] se zabývá modelováním nabíjení prachových zrn v maxwellovském plazmatu v podmínkách relevantních k tokamaku. Využívá při tom i model sekundární elektronové emise vyvíjený na naší katedře (R-model) a výsledky z tohoto modelu srovnává s výsledky nabíjení pro Sternglassův model (S-model). Pro výpočty byly použity materiály prachových zrn, které nejlépe odpovídají vzorkům sebraných z tokamaku COMPASS-D. Výpočty byly provedeny i na beryliu, které bude součástí i první stěny tokamaku ITER.

Článek Pavlů et al. [2014] studuje nabíjení marsovského simulantu JSC Mars-1 vlivem SEE. Ukazuje se, že aby tento typ nabíjení byl významný, musí energie primárních elektronů překročit 4 keV. Tyto energie elektronů nejsou u marsovského povrchu běžně dostupné během klidné doby, ale mohou výrazně narůst během prachových bouří. Autoři poukazují na fakt, že proces SEE může výrazně ovlivňovat chování blesků během těchto bouří. Současné studie vysvětlují vznik blesků v důsledku tribolektrického nabíjení, kdy jsou malá prachová zrna nabíjena záporně, zatímco velká kladně a vlivem gravitačních sil dochází k separaci náboje a tím i ke vzniku velkých elektrických polí vedoucích k výbojům. SEE však působí přesně opačně, což by tedy mělo mít za následek zánik těchto polí a redukování bleskové aktivity na Marsu.

Review article dealing with highly interesting topic of core/shell nanofibers. The authors sumarize state of field and discuss most challenging problems in their practival aplication involving regulated drug delivery, stability of delivered substances, reproducibility and productivity of the electrospinning proces and clinical aplication of nanofibers.
key words (3): core-shell nanofibers, electrospinning, drug delivery

Alpha granules are novel source of natural growth factors from platelets. In recent work we had sucesfully embedded alpha granules into nanofibers with core/shell structure. The alpha granules survived the electrospinning proces and growth factors retained their bioaktivity as was demonstarted on the model of chondrocytes and mesenchymal stem cells.
key words (3): Core-shell nanofibers, alpha granules, cartilage tissue engineering

A novel drug delivery system was developed on the basis of the intake effect of liposomes encapsulated in PVA nanofibers. Time-controlled release of insulin and bFGF improved MSC viability in vitro. In addition, cell-free composite scaffolds containing PVA nanofibers enriched with liposomes, bFGF, and insulin were implanted into seven osteochondral defects of miniature pigs; control defects were left untreated. The cell-free composite scaffold enhanced migration of the cells into the defect, and their differentiation into chondrocytes; the scaffold was able to enhance the regeneration of osteochondral defects in minipigs.
key words (3): Cartilage; Fibrin; Nanofibers

Abstract: Dysfunction of TMEM70 disrupts the biogenesis of ATP synthase and represents the frequent cause of autosomal recessive encephalocardiomyopathy. We used tagged forms of TMEM70 and demonstrated that it has a hairpin structure with the N- and C-termini oriented towards the mitochondrial matrix. On BN-PAGE TMEM70 was detected in multiple forms including dimers and displayed partial overlap with assembled ATP synthase. Immunoprecipitation studies confirmed mutual interactions between TMEM70 molecules but, together with immunogold electron microscopy, not direct interaction with ATP synthase subunits. This indicates that the biological function of TMEM70 in the ATP synthase biogenesis may be mediated through interaction with other protein(s).

Článek se zaměřuje na diskusi možností kvalitativní výzkumné strategie, která je využívána v řešeném projektu. Konkrétně jsou diskutovány možnosti jejího využití v oblasti aplikovaného výzkumu.
Abstrakt článku: The article focuses on the methodological specifics of qualitative sociological studies commissioned by public administration authorities (“the client”) which aim to provide solutions to specific problems defined by the client. In conducting this kind of study, the researcher is expected not only to describe and understand the existing state of affairs but also to provide a set of recommendations for amending it. The research terrain is not defined by the sociologist herself but basically by the client. This situation reveals a series of methodological and epistemological issues. The article discusses some of them and proposes that the research strategy of heuristic investigation may be an answer to the associated dilemmas. The author argues that the correct use of reflexive methodology can help the researcher to overcome the limits imposed on the research by the client’s presence and even make the apparent disadvantages work for her.

dx.doi.org/10.1021/ic4026848

K dispozici online zde: http://www.lidemesta.cz/assets/media/files/15-2013-2/Redlova.pdf

Tento text vznikal již během předchozího GAUK projektu. Během recenzního řízení jsem text doplnila díky novým zjištěním. Obsahuje tedy dvojí dedikaci.

Abstract: Discontinuous and kinematically unrelated C—S fabrics have been recognized along the contact between the Gemeric and Veporic Units in the Western Carpathians. The formation of S and C fabrics within orthogneiss, quartzite and chloritoid-kyanite schist of the Veporic Unit is associated with Cretaceous syn-burial orogen-parallel flow and subsequent exhumational unroofing. The formation of the two fabrics characterized by distinct quartz deformation microstructure and metamorphic assemblage is separated by an inter-tectonic growth of transversal chloritoid-, kyanite-, ± monazite-bearing
assemblage. The monazite U-Th-Pb concordia age of 97 ± 4 Ma was obtained by the laser ablation ICP—MS dating method.
The age of this inter-tectonic metamorphic stage together with existing 40 Ar/ 39 Ar ages on exhumation of the Veporic Unit indicate that despite the similar appearance to shear bands or C—S mylonites there is a time span of at least 10 Myr between the formation of homogeneous S fabrics and superposed discrete C fabrics in the studied rocks.

Byl prokázán vliv 17beta estradiolu na kapacitaci myších spermií. Tento vliv je spojován s předešlým průkazen přítomnosti ER v myších spermiích.
První autor článku je spoluřešitelem GAUKu, hlavní řešitelka GAUKu je uvedena jako spoluautorka.
Publikace má afiliaci fakultě a dedikaci GAUKu.

Práce se zabývá studiem konformace disulfidové vazby v neurohypofyzárních hormonech (NHH) a jejich analozích pomocí metod vibrační optické aktivity (VOA) a elektronového cirkulárního dichroismu (ECD). Mezi studované systémy patří peptidové hormony oxytocin, arginin a lysin vasopressin a jejich analogy s rozdílnými biologickými aktivitami. Tyto molekuly představují vzhledem ke krátké sekvenci (6 – 12 aminokyselin) a jedinému disulfidovému můstku vhodný modelový systém pro studium konformace disulfidové skupiny a jejích projevů ve spektrech elektronového cirkulárního dichroismu a především Ramanovy optické aktivity (ROA). VOA i ECD data vykazují vzájemnou strukturní podobnost a malou variabilitu a shodují se s výsledky předchozích studií (NMR, molekulárně-dynamické simulace, rentgenové struktury komplexu NHH s neurofyzinem). ROA prokázala svůj potenciál při určování konformace disulfidové vazby v NHH. Získaná data naznačují možnou korelaci smyslu torze disulfidového můstku s biologickou aktivitou NHH a jejich analogů - zatímco agonistické látky vykazují pravotočivou orientaci S-S můstků, neaktivní látky a inhibitory zaujímají levotočivou konformaci.

Studovali jsme projevy neplanární amidové vazby ve spektrech vibrační optické aktivity (VOA). Jako modelové látky byly použity tricyklické spirodilaktamy - systémy s dobře definovanou strukturou obsahující dvě neplanární amidové skupiny ukotvené v rigidním polycyklickém skeletu. Byla změřena a interpretována spektra VOA v kompletním měřitelném rozsahu včetně dosud málo prostudované oblasti valenčních C-H a C-D vibrací. Valenční C-D vibrace byly zaznamenány pomocí Ramanovy optické aktivity (ROA) vůbec poprvé. Ve spektrech vibračního cirkulárního dichroismu (VCD) i ROA byly na základě porovnání s kvantově-mechanickými výpočty identifikovány charakteristické projevy neplanarity amidové vazby. Patří mezi ně především poměrně intenzivní jednoznaménkový pás v oblasti amidu I, který převáží očekávaný couplet způsobený interakcí amidových skupin. Z hlediska detekce amidové neplanarity se právě tento signál jeví jako nejvýznamnější. Projevy amidové neplanarity byly dále pozorovány především v oblasti nízkoenergetických amidových vibrací (amid V a VI), které jsou díky experimentálním omezením spektroskopie VCD pozorovatelné pouze pomocí ROA. Právě v oblasti nízkých frekvencí má ROA spektroskopie pro detekci amidové neplanarity jedinečný potenciál.

Článek je t.č. ve formě Epub.
Tisk dle redakce v plánu v červnu 2014.

doi: 10.5507/bp.2013.062. [Epub ahead of print]

Článek byl přijat do tisku (přiložen v pdf formátu). Emailové potvrzení o přijetí k tisku je přiloženo v kopii.
(corresponding author: Petr Marusic)

http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/ajpa.22373/full

Toxoplasmosa je spojována se specifickými změnami v osobnosti nakažených osob vzhledem k osobám nenakaženým. Tyto rozdíly jsou obvykle považovány za vedlejší efekt manipulační aktivity parazita cílení na zvýšení pravděpodobnosti jeho přenosu z mezihostitele na konečného hostitele predační cestou. Dosud byla osobnost zkoumána především prostřednictvím dotazníku Cattell, v klinické praxi však byl tento dotazník, dnes považovaný za zastaralý, nahrazen dotazníkem NEO-PI-R (Neuroticism–Extraversion–Openness Personality Inventory—Revised). Některé složky osobnostního profilu mohou výrazně ovlivnit výsledky výkonnostních testů, včetně testu prepulsní inhibice úlekové reakce. Proto jsme se v rámci našeho projektu zaměřili i na změny v osobnosti Toxoplasma-positivních studentů s využitím právě tohoto dotazníku. Zjistili jsme, že seropozitivní studenti dosahují signifikantně vyšších hodnot ve faktoru extroverze, a naopak signifikantně nižších skóre ve faktoru svědomitosti. Je zřejmé, že právě svědomitost by mohla ovlivňovat výsledky testů zahrnujících prepulsní inhibici. U mužů je svědomitost negativně korelována s dobou od infekce, což naznačuje, že s toxopozitivitou spojené rozdíly jsou pravděpodobně následkem pomalých kumulativních změn vyvolaných latentní toxoplasmosou, spíše než vedlejším efektem akutní fáze nemoci. Existence této korelace rovněž podporuje hypotézu, podle níž latentní toxoplasmosa skutečně ovlivňuje osobnost nakažených osob, spíše než že by osobnost ovlivňovala pravděpodobnost nákazy toxoplasmosou.

Jedním z parametrů, který by mohl ovlivnit výkon osob ve výkonnostních testech, včetně testů prepulsní inhibice úlekové reakce je inteligence, Proto byly naše pokusné osoby před vlastním pokusem podrobeny náročnému, více než 2 hodinovému IQ testu. Získaná data byla použita nejen při analýze výsledků z prepulsní inhibice, ale i pro zcela jinou studii. V pokusu, při němž jsme nechali studenty naší fakulty hodnotit fotografie jiných studentů, od nichž jsme měli výsledky inteligenčních testů, jsme zjistili, že muži i ženy jsou podle fotografií tváře schopni odhadnout inteligenci posuzované osoby, ovšem pouze pokud je posuzovaná osoba mužského pohlaví. Použitím metody geometrické morfometrie jsme zjišťovali, které znaky jsou asociovány s vnímanou inteligencí. Tváře vnímané jako inteligentní jsou spíše podlouhlé, s větší vzdáleností mezi očima, s širším nosem, mírně pozdvihnutými koutky a špičatější, méně zakulacenou bradou. Vnímaná nižší inteligence je naopak spojena s širšími a zakulacenými obličeji, s blízko sebe posazenýma očima, kratším nosem, svěšenými koutky úst a s kulatou, zavalitou bradou. Signifikantní korelace mezi rysy tváře a skutečnou inteligencí jsme nenašli ani u mužů, ani u žen. Tyto výsledky naznačují, že jsou hodnotitelé sice schopni odhadnout inteligenci hodnocených mužů, že však tento odhad pravděpodobně není založen na tvaru obličeje.

Dosud nepublikovaný článek momentálně v recenzním řízení; pokoušela jsem se vložit jako jiný výsledek, ale kolonka na komentář je příliš krátká, proto vkládám sem.

V současnosti je v recenzním řízení v časopise PLoS ONE (ve stádiu první revize) článek týkající se hlavního tématu projektu. V něm jsme se snažili odhalit efekty prepulsního signálu na výkon Toxoplasma-pozitivních a neinfikovaných osob v úlekovým signálem modifikovaném akustickém testu reakčních dob. Data nasbíraná od 236 studentů ukázala na delší reakční časy seropozitivních osob, což je v souladu s našimi dříve publikovanými výsledky testů jednoduchých reakčních dob. Dále jsme zjistili, že akustický prepuls předcházející akustický úleková signál zkrátil reakční dobu u všech pokusných osob, nakažených i nenakažených, tento efekt byl ovšem silnější u Toxoplasma-pozitivních osob a zvětšoval se s dobou od infekce. To naznačuje, podobně jako v případě změn osobnosti pokusných osob, na kumulativní vliv latentní toxoplasmosy, spíše než na odeznívající vedlejší efekty akutního onemocnění. Ovlivnění prepulsní inhibice úlekové reakce v tomto experimentu podle nás dále doplňuje seznam odchylek podobných pro schizofrenní pacienty a osoby s latentní toxoplasmosou, a dále potvrzuje naše přesvědčení o propojení mezi toxoplasmosou a některými formami schizofrenie.

Akceptovaný príspevok k konferenci SLOPOS13 (http://www.slopos13.com/)

email ze dne 10.2.2014 od organizátora konferencie SLOPOS13
"Dear authors,
we are pleased to inform you that your paper has been accepted for publication in the conference proceedings of SLOPOS13.

Best regards,
Christoph Hugenschmidt."

Rukopis v recenzním řízení.

Článek se zabývá testem neměnnosti parametrů vícerozměrného stacionárního VAR modelu při stabilním rozptylu. Statistika je odvozená z testu podílem věrohodností a v článku se ukazuje, že má Darling-Erdösovo rozdělení za nulové hypotézy. Teoretické výsledky doplňují simulační studie a aplikace na reálná data.

Data získaná za podpory GA UK byla publikována v impaktovaném časopise Plos ONE (IF 3,73) v březnu 2014. DOI: 10.1371/journal.pone.0087448

Data získaná za podpory GA UK byla též publikována v impakovaném časopise Oncogene (IF 7,35). doi: 10.1038/onc.2013.414.

Impakt faktor: SJR 2011, http://www.journalmetrics.com/

Článek publikovaný v recenzovaném časopise - abstrakt: Efektivní inovační infrastruktura propojující výzkumné organizace s aplikační sférou tvoří důležitý předpoklad úspěšného rozvoje znalostně založené ekonomiky. K nástrojům, které snižují bariéry mezi subjekty zapojenými do inovačního procesu, iniciují transfer znalostí a poskytují specializované podnikatelské služby, patří také vědeckotechnické parky (VTP). Rovněž v Česku se po vzoru vyspělých zemí staly VTP často využívaným nástrojem podpory inovačního podnikání, a to bez dostatečného zájmu o skutečné efekty VTP na zasídlené firmy. Článek s využitím plošného dotazníkového šetření popisuje hlavní charakteristiky VTP v Česku a především analyzuje vliv VTP na aktivity klientských podniků – oborové zaměření, inovační výkonnost, spolupráci a přínosy plynoucí z lokalizace ve VTP. Hodnocení 78 zasídlených firem naznačuje pozitivní efekt VTP na schopnost sledovaných firem inovovat, nalézt partnery pro spolupráci a prosadit se v rámci znalostní ekonomiky. Výsledky však zároveň poukazují na problémy spojené s fungováním inovační infrastruktury v Česku, které kombinují omezený potenciál inovačních firem s rozvojem VTP orientovaným na kvantitu, nikoliv na kvalitu.

Studie v tisku, vyjde v průběhu jara 2014.

Speciální vydání: 38th FEBS Congress, Saint Petersburg, Russia, July 6–11, 2013; Issue Supplement s1

Článek Structural study of the partially disordered full-length δ subunit of RNA polymerase from Bacillus subtilis charakterizuje strukturu delty a opět děkuje (s afiliací) za částečnou podporu GAUK.

Článek The δ subunit of RNA polymerase is required for rapid changes in gene expression and competitive fitness of the cell je prvoautorskou publikací hlavní řešitelky a charakterizuj funcki delta proteinu a děkuje (s afiliací) za částečnou podporu GAUK.

Tenofovir (TFV) se používá u těhotných žen za účelem prevence přenosu HIV z matky na dítě v rámci kombinované antiretrovirální léčby. Cílem této práce bylo zjistit, zda TFV a/nebo jeho proléčivo tenofovir disoproxil fumarát (TDF) jsou substráty ATP-binding cassette (ABC) transportérů, u kterých byla zjištěna funkční exprese v placentě; konkrétně se jedná o transportéry P-glykoprotein (ABCB1/MDR1), Breast Cancer Resistance Protein (ABCG2/BCRP) a Multidrug Resistance-Associated Protein 2 (ABCC2/MRP2). Pro zjištění vlivu ABC transportérů na transplacentární farmakokinetiku TFV a TDF jsme využili in vitro i in situ metodiky.
In vitro transportní eseje s MDCK II buňkami transdukovanými lidskými transportéry prokázaly, že TDF je substrátem transportérů ABCB1 a ABCG2, ale neinteraguje s transportérem ABCC2. Na transport tenofoviru neměl vliv žádný testovaný transportér.
In situ model duálně perfundované potkaní placenty byl použit pro studium vlivu ABC transportérů na transplacentární farmakokinetiku TFV a TDF na orgánové úrovni. Výsledky potvrdily, že transportéry ABCB1 a ABCG2 limitovaly přestup TDF z maternálního do fetálního kompartmentu, zatímco transplacentární transport TFV nebyl ABC transportéry ovlivněn.
Z výše uvedených výsledků vyvozujeme, že transplacentární přestup obou látek, TFV a TDF, je v materno-fetálním směru omezen. V případě TFV je transport přes placentu limitován v důsledku fyzikálně-chemických vlastností této molekuly, zatímco u TDF je snížen činností ABC transportérů ABCB1 a ABCG2.

Článek potvrzen pro přijetí k tisku (Svazek, počáteční a poslední stránka ještě nejsou známy). Potvrzení k tisku i publikace jsou přílohami závěrečné zprávy.

Popularizační článek. V článku je uvedena afiliace řešitele k fakultě a poděkování GAUK.

V prestižním periodiku PlosONE byla publikována souborná práce shrnující historii rodu Micromys ve střední Evropě, která rovněž řeší otázku vývojových kořenů nejstarších forem Apodemus, zejména ve vztahu k rodům Parapodemus a Micromys.
Analýza nejstarších evropských dokladů rodů Apodemus, Parapodemus a Micromys, resp. jejich svrchnomiocenního a pliocenního fosilního záznamu ukázala, že evropské pliocenní a pleistocenní formy řazené dosud do rodu Micromys se průkazně liší od recentního druhu M.minutus a náleží spíše do fosilního rodu Parapodemus, reprezentujícího sesterskou skupinu linie Apodemus (Sylvaemus) stabilizovanou jako autochtonní západopalearktický taxon již v závěru miocénu.

Keywords: heterogeneous agent model, behavioural finance, herding, overconfidence, market sentiment, stock market crash

JEL codes: C1, C61, D84, G01, G12

Abstract:
The main aim of this work is to incorporate selected findings from behavioural finance into a Heterogeneous Agent Model using the Brock and Hommes (1998) framework. Behavioural patterns are injected into an asset pricing framework through the so-called ‘Break Point Date’, which allows us to examine their direct impact. In particular, we analyse the dynamics of the model around the behavioural break. Price behaviour of 30 Dow Jones Industrial Average constituents covering five particularly turbulent US stock market periods reveals interesting patterns in this aspect. To replicate it, we apply numerical analysis using the Heterogeneous Agent Model extended with the selected findings from behavioural finance: herding, overconfidence, and market sentiment. We show that these behavioural breaks can be well modelled via the Heterogeneous Agent Model framework and they extend the original model considerably. Various modifications lead to significantly different results and model with behavioural breaks is also able to partially replicate price behaviour found in the data during turbulent stock market periods.

Článek se vyjadřuje k problematice ortognátní chirurgie, konkrétně k operačnímu postupu využívajícím dláta během rozpolcení větve dolní čelisti během BSSO.

Pilotní studie věnovaná PRP a terapii TMD nereagujících na konzervativní a minimálně invazivní léčbu.

Článek se zabývá problematikou pohybu pacienta během CBCT vyšetření a vlivu tohoto pohybu na kvalitu zobrazení obličejových struktur včetně čelistního kloubu. Autoři navrhují původní řešení tohoto problému.

Článek se věnuje problematice pohybu pacienta během snímání v CBCT. Pohyb může mít vliv na rozlišení snímku a kvalitu zobrazení nejen struktur temporomandibulárního kloubu. Autoři zároveň navrhují možné řešení tohoto problému.

Výše neuvedené informace vzhledem k čerstvosti oznámení publikování článku bohužel ještě nemám. Článek však již je akceptován k publikování a měl by být v tisku. Více viz. níže v emailu od šéf-editora časopisu Ecological Engineering Williama J. Mitsche, PhD. (Text je přilozen i jako print-screen emailového rozhraní.)

Ms. Ref. No.: ECOLENG-D-13-00800R1
Title: In situ soil respiration at reclaimed and unreclaimed post-mining sites: Responses to temperature and other environmental factors
Ecological Engineering

Dear Jan,

I am pleased to confirm that your paper "In situ soil respiration at reclaimed and unreclaimed post-mining sites: Responses to temperature and other environmental factors" has been accepted for publication in Ecological Engineering.

You will be receiving information about copyrights, reprint purchases, and page proof reviews from Elsevier in the next few months.

When your paper is published on ScienceDirect, you want to make sure it gets the attention it deserves. To help you get your message across, Elsevier has developed a new, free service called AudioSlides: brief, webcast-style presentations that are shown (publicly available) next to your published article. This format gives you the opportunity to explain your research in your own words and attract interest. You will receive an invitation email to create an AudioSlides presentation shortly. For more information and examples, please visit http://www.elsevier.com/audioslides.

Thank you for submitting your work to this journal.

With kind regards,

William J. Mitsch, PhD
Editor-in-Chief
Ecological Engineering

Manuskrip byl prijat k opublikovani v casopise Rheumatology. V tuto chvili je publikovan v elektronicke podobe, tistena verze je v priprave.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24643522

Článek prezentuje výsledky získané na Nogo-A deficientních potkanech. Zahrnuje ověření modelu (stanovení hladiny Nogo-A v mozku), behaviorální testy (Kolotočové bludiště, Step-through avoidance, test neofobie/anhedonie, a monitorování cirkadiánních rytmů aktivity. U transgenních zvířat byla potvrzena přítomnost kognitivního deficitu, dále změny v emocionalitě a mírné změny v cirkadiánním chování. Tyto změny podporují představu, že nogo-A knockdown vyvolává některé změny typické pro modely schizofrenie.
Článek byl přijat k publikaci 2. března 2014.

Publikace shrnuje výsledky získané na Nogo-A deficientních potkanech v baterii úloh v Kolotočovém bludišti a v Morrisově vodním bludišti. Výsledky ukazují zachovanou krátkodobou a dlouhodobou prostorovou paměť, na druhé straně však deficit v segregaci prostorových rámců, který patrně odpovídá kognitivním příznakům schizofrenii podobného chování.

Shrnuté výsledky objemových měření na nemagnetických sloučeniných R2RhIn8.

Článek v popularizačním časopise, propagace výsledků výzkumu z tohoto projektu GAUK a publikace ve Frontiers in Zoology.
Podpora GAUK zde nemohla být uvedena.
Podpora GAUK uvedena pouze při zadávání výsledku do OBD (evidence publikační činnosti v rámci UK).

Článek představující široké veřejnosti výzkum v rámci grantového projektu.

Článek byl přijat do tisku a je po recenzích. Vyjde v první polovině roku 2014.

Spoluřešitel je autorem tohoto článku.

Spoluřešitel je autorem tohoto článku.

Článek "Asistent pedagoga ve vybraných zahraničních výzkumech" vznikl v první fázi výzkumného projektu a jeho text analyzuje a shrnuje poznatky z několika vybraných zahraničních studií, které byly východisky našeho výzkumu; pozornost je věnována zejména výsledkům dlouhodobého britského výzkumu DISS. Popisované výzkumy definují nejdůležitější oblasti výzkumu i rozvoje pedagogické asistence, kterými jsou: vzdělávání a příprava asistentů pedagoga, spolupráce mezi asistenty a učiteli, asistence učiteli (nikoli jen žákům se speciálními vzdělávacími potřebami).

In press (Březen-Duben 2014)

Souhrn:
Práce se zabývá výzkumem sedimentů zaniklého jezera Šúr na západním Slovensku. Cílem je rekonstruovat
vznik a vývoj lokality na základě propojení výsledků geomorfologie, sedimentologie a paleobotaniky. Jezero
vzniklo na konci glaciálu, kdy ustala fluviální aktivita, a vzniklo rozsáhlé oligotrofní jezero. V holocénu došlo ke
zlepšení přístupnosti živin a vzniklo eutrofní jezero. Okolní vegetace byla v glaciálu tvořena borovým lesem s vý-
skytem listnatých dřevin (dub, líska, jilm a lípa). Na začátku holocénu expandovaly listnaté dřeviny a objevil se
buk. V období okolo 4500 BP expandoval buk a habr a objevil se pyl obilovin. Jezero zaniklo v mladším holocé-
nu, kdy lokalitu pokryl olšový les.

The palaeoecological analyses of old fen deposits can bring interesting information about pastdistribution of bryophyte species, which are recently rare or relict in Central Europe. This paper brings new data about the occurrence of some relict fen species in the late-Glacial and early-Holocene deposits in the Polabí lowland (Chrást site: Sarmentypnum sarmentosum, Scorpidium scorpioides), Hrubý Jeseník Mountains (Skřítek mire: Hamatocaulis vernicosus, Meesia triquetra) and Borská lowland (Hanšpílje fen: Drepanocladus trifarius, Catoscopium nigritum, H. vernicosus, S. scorpioides). Further, we report about the late-Holocene fossil occurrence of Philonotis marchica in the Galmus Mts (Slovakia), the species which is not recently known from this area.

Manuscript byl 4.11. 2013 přijat do tisku v čas. Antropologisher Anzeiger. Text popisuje trendy v morfologické variabilitě proximální a distální konfigurace lidské kosti holenní s použitím metod geometrické morfometrie. Při detekci tvarových rozdílů byly zkoumány tři potenciální zdroje variability: pohlavní dimorfismus, dožitý věk jedince a sociální postavení v rámci velkomoravské komunity. Nejvýraznější rozdíly v morfologii byly zaznamenány mezi skupinami rozdělenými na základě pohlaví, věkové diference byly nalezeny pouze u proximální části kosti a faktor sociálního statusu nevykazoval žádný vliv na utváření kloubních partií zkoumané kosti.

Manuscript byl odeslán k recenznímu řízení v čas. Journal of Forensic Sciences. Pojednává o pohlavním dimorfismu proximální a distální části kosti holenní dvou novověkých souborů (materiál zahrnoval sto let starou anatomickou Pachnerovu sbírku a data zcela současné české populace). Vyšší diskriminační sílu jsme prokázali s využitím
proměnných formy (ve srovnání s tvarem) a u konfigurace proximální (ve srovnání s distální). Projev pohlavního dimorfismu se od první poloviny 20. stol do současnosti do jisté míry změnil, nicméně jsme popsali diference mezi muži a ženami, které jsou stabilní napříč časovou osou. V závěru jsme zdůraznili, že prokázaná populační specifita nalezených diferencí vyžaduje v případě aplikace metodiky zcela současná referenční data.

v recenzním řízení

Cílem článku je představení slovníku Czech subjectivity lexicon, nového lexikálního zdroje pro postojovou analýzu v češtině. Popisujeme jednotlivé fáze manuálního čištění slovníku a jeho zapojení do state-of-the-art klasifikátorů využívajících Maximální Entropii. Testujeme úspěšnost systému obohaceného o slovník na různých datasetech, porovnáváme výsledky a navrhujeme další zlepšení klasifikačního systému založeného na lexikonu.

Článek byl v této podobě odeslán k publikaci v březnu 2014.

V loňském roce uvedeno jako "in print".

Skřivan, Aleš Ales.Skrivan@ff.cuni.cz
7:42 (před 5 hodinami)


komu: mně


Zmiňovaný článek kol. Pellara je v recenzním řízení v časopisu Historický obzor.
Skřivan
________________________________________
Od: Štěpán Pellar [stepan.pellar@gmail.com]
Odesláno: 27. března 2014 20:51
Komu: obzor@atlas.cz
Předmět: potvrzení článku v recenzi

Článek vznikal již před schválením financovaní projektu, proto v něm není uvedeno číslo projektu.

Laboratorně připravená INST-pokrytá kapilára byla nově použita pro elektroforetickou separaci čtyř směsí proteinů. Separace byly prováděny ve fosforečnanu sodném jako základním elektrolytu při pH 3,0 a 2,5. Získané hodnoty separačních účinností se pohybují v rozmezí od 145 000 teoretických pater na metr pro myoglobin po 1216000 pater na metr pro lysozym. Za stejných experimentálních podmínek bylo v komerční kapiláře pokryté polyvinylalkoholem dosaženo separační účinnosti 49-86% v porovnání s INST-pokrytou kapilárou, v kapiláře pokryté polyakrylamidem 0-86% a v nepokryté kapiláře pouze 0-6%. INST-pokrytá kapilára byla dále použita pro separace globinových řetězců izolovaných z lidských červených krvinek. Separace alfa a beta globinového řetězce z krve dospělého jedince trvá 3 min s hodnotou rozlišení 1,3; separace alfa a gama globinových řetězců z novorozenecké pupečníkové krve trvá také 3 min s hodnotou rozlišení 3,6.

Pro zvýšení citlivosti elektroforetického stanovení stanovení neurotransmiterů γ-aminobutyric acid (GABA), glycine (Gly) a glutamate (Glu) v mikrodialyzátu periaqueduktální šedé hmoty (PAG) byla vyvinuta nová technika vysokého dávkování vzorku upraveného acetonitrilem. Zavedením tlaku pro vypuzení balastní zóny acetonitrilu z kapiláry se podařilo zvýšit dávkované množství vzorku až na 98% z celkové délky kapiláry. Za optimalizovaných podmínek jsou limity detekce 9, 10 a 15 nM pro GABA, Gly a Glu; hodnoty relativní směrodatné odchylky pro migrační čas 0,5% a pro plochu píku 1,0 – 1,9%. Při analýze mikrodialyzátu PAG jsou hodnoty limitu detekce 29, 29 a 37 nM pro GABA, Gly a Glu; relativní směrodatné odchylky pro migrační čas 0,5 – 0,7% a pro plochu píku 2,6 – 8,2%. Stanovené bazální hladiny neurotransmiterů v mikrodialyzátech PAG jsou 0,08, 4,7 a 0,8 µM pro GABA, Gly a Glu. Karagenanem indukovaná hyperalgesie zvyšovala hladinu Gly a Glu a snižovala GABA v mikrodialyzátech PAG. Perorální podání paracetamolu během hyperalgesie efektivně snížilo hladinu Gly a na Glu a GABA nemělo významný vliv.

Článek v tisku.

Článek v tisku.

Časopis v tisku.

Článek byl přijat do tisku v říjnu 2013.
Vzhedem k technickým problémům mimo redakci je vydání čísla zpožděno - s výhledem na začátek dubna 2014. V příloze tedy přikládám finální odevzdanou verzi v Pdf. Děkuji za pochopení.

Příspěvek se zaměřuje na postoje a názory současných i budoucích učitelů I.stupně základní školy ke konstruktivistickému vyučování. Podrobněji se zaobírá problematikou a hledáním způsobů, metod a forem práce, jak vhodně začleňovat do výuky českého jazyka konstruktivistické elementy. Příspěvek nabízí ukázku praktických námětů.

Příspěvek informuje o soudobém postoji učitelů a jejich percepci chyb vyskytujících se v učivu vybraných gramatických jevů u žáků 3. - 4. ročníku základní školy a mapuje chybovost žáků v gramatických jevech.

Protein HelD byl mimo jiné testován pomocí in vitro transkripčních experimentů. Ty popírají efekt HelD na terminaci transkripce a tudíž by neměla ovlivnit „torpédování“ RNA polymerázy. Článek je publikován on-line před tiskem, doi:10.1093/nar/gku113.

K této publikaci jsem přispěla optimalizací metody testování elongačních komplexů, která byla vyvinuta v rámci řešení tohoto grantu GAUK. Metoda byla využita k ověření funkce GreA faktoru.

Článek je v tisku a proto rok vydání a svazek jsou uvedené orientační.

Abstract A distinctive alteration of speech has been reported in patients suffering from ephedrone-induced parkinsonism. However, an objective assessment of dysarthria has not been performed in ephedrone users. We studied 28 young Caucasian men from Georgia with a previous history of ephedrone abuse and compared them to 25 age-matched healthy controls. Speech examination, brain MRI, and NNIPPS-Parkinson plus scale were performed in all patients. The accurate differential diagnosis of dysarthria subtypes was based on the quantitative acoustic analyses of 15 speech dimensions. We revealed a distinct variant of mixed dysarthria with a combination of hyperkinetic and hypokinetic components representing the altered motor programming of dystonia and bradykinesia in ephedrone-induced parkinsonism. According to acoustic analyses, all patients presented at least one affected speech dimension, whereas dysarthria was moderate in 43 % and severe in 36 % of patients. Further findings indicated relationships between motor subscores of dystonia and bradykinesia and speech components of loudness (r = -0.54, p\0.01), articulation (r = 0.40, p\0.05), and timing (r = -0.53, p\0.01). In ephedrone-induced parkinsonism a prominent mixed hyperkinetic–hypokinetic dysarthria occurs that appears related to marked dystonia and bradykinesia and probably reflects manganese induced toxic and neurodegenerative damage to the globus pallidus internus and substantia nigra.

Objective: To assist other eye movement investigators in the design and analysis of their studies.
Methods: We examined basic saccadic eye movements and smooth pursuit in the horizontal and vertical
directions with video-oculography in a group of 145 healthy subjects between 19 and 82 years of age.
Results: Gender and education level did not influence eye movement metrics. With age, the latency of
leftward and vertical pro- and antisaccades increased (p < 0.001), velocity of upward prosaccades
decreased (p < 0.001), gain of rightward and upward prosaccades diminished (p < 0.001), and the error
rate of antisaccades increased (p < 0.001). Prosaccades and antisaccades were influenced by the direction
of the target, resulting in a right/left and up/down asymmetry. The skewness of the saccade velocity pro-
file was stable throughout the lifespan, and within the range of saccades analyzed in the present study,
correlated with amplitude and duration only for antisaccades (p < 0.001).
Conclusions: Some eye movement metrics must be separated by the direction of movement, others
according to subject age, while others may be pooled.
Significance: This study provides important information for new oculomotor laboratories concerning the
constitution of subject groups and the analysis of eye movement metrics.

Akceptační dopis:
Dear Prof. Plzák,

The review of the Research Article 408683 titled "Microarray analysis of serum mRNA in patients with head and neck squamous cell carcinoma at whole-genome scale," by Markéta Capková, Jana Šáchová, Hynek Strnad, Michal Kolar, Miluše Hroudová, Martin Chovanec, Zdenek Cada, Martin Šteffl, Jaroslav Valach, Kastner, Cestmír Vlcek, Karel Smetana Jr. and Jan Plzák submitted to BioMed Research International, has been completed, and I am pleased to inform you that your manuscript has now been accepted for publication in the journal.

The special issue for which the paper is being processed is
"Endoscopic/External Approaches in Otorhinolaryngology and Head and Neck Surgery"

The publication process of your manuscript will be initiated upon the receipt of the electronic files. Please login to the Manuscript Tracking System at the link below using your username and password, and upload the electronic files of your final accepted version within the next 2-3 days.

http://mts.hindawi.com/author/408683/upload.files/

The electronic files should include the following:

1- Source file (Word or TeX/LaTeX).
2- Final PDF file of the accepted manuscript.
3- Editable Figure files (each figure in a separate eps/postscript/word file) if any, taking into consideration that tiff, jpg, jpeg, bmp formats are not editable.

Thank you again for submitting your manuscript to BioMed Research International.

Best regards,

Jan Betka
jan.betka@fnmotol.cz

Akceptační dopis:
Dear,
Please note that the review process of the below mentioned manuscript
has changed.

Title: Towards dissecting molecular routes of intercellular
communication in the tumour microenvironment: phenotypic plasticity of
stem cell-associated markers in coculture (carcinoma cell/fibroblast)
systems
Reference number: FB2013-733M
Submitted: 12/09/2013 - 14:55
The status of your manuscript is now ACCEPTED.

Note for the author:

Please log on to the OSMT system [1] to view the details.

With best regards, FoliaBiologica, the Editorial Team

Článek je přijatý k tisku.

Abstrakt k prezentaci na 18. Kubátově podologickém dni s tématem: Novinky v diagnostice a léčení chorob pohybového aparátu – mezioborové aspekty.

Článek je přijat do recenzního řízení a měl by být publikován v březnu 2014. Jsou v něm shrnuty hlavní tendence plynoucí z výzkumu (první fáze projektu).

Edice básnického epitafu Jana z Vartenberka vychází ze čtyř známých textových variant (plus edice J. Martínka a M. Vaculínové) a je doplněna jejich analýzou a textovou kritikou. Závěrem editor předkládá chronologicky pojatý osud básnického epitafu i jeho prozaického dodatku v letech 1508-1615.

Článek se zabývá otázkami nácviku a procvičování zvukové stránky ruského jazyka v české škole. Text je rozdělen na dvě části – první část je věnována problematice výslovnosti a vymezení pojmu fonetická gramotnost. Je zohledněno také postavení ruštiny jako dalšího cizího jazyka v českých školách. Pozornost je věnována významu odpovídající realizace segmentálních i suprasegmentálních prvků pro realizaci komunikace v ruském jazyce. V druhé části příspěvku jsou formou typových zadání a cvičení představeny různé možnosti nácviku a procvičování výslovnosti ve výuce.

Stránky S99-S108. Formulář ale nepovoluje u čísel stránek na počátku písmeno.

Stránky S89-S98. Formulář ale nepovoluje u čísel stránek na počátku písmeno.

Prebežná verziu textu. Zväzok a strany zatiaľ nie sú s istotou známe, keďže článok sa nachádza v prvej fáze recenzného konania.

submitted 19. 9. 2013, accepted 19. 12. 2013

submitted 15. 11. 2013, accepted 8. 1. 2014

Publikace rozvíjí teoretický model využití ablačních otisků laserových svazků do vhodných materiálů za účelem charakterizace příčného rozložení intenzity, především v blízkosti fokusu - tzv. f-scan. Tento nástroj umožňuje pomocí studia ablačních kontur v materiálu kvantitativně porovnávat rozměry složitých negaussovských svazků, stanovit hodnoty plošné hustoty energie v různých místech svazku, předpovídat vlastnosti svazku při volném šíření prostorem,...
Data z experimentu při charakterizaci svazku XUV kapilárního laseru v rámci řešeného projektu přispěla k pochopení problematiky a byla přínosným podkladem pro sepsání publikace.

Článek popisuje metody pro separaci enantiomerů citadiolu a citalopramu pomocí HPLC a SFC.

Článek se zabývá chirálními HPLC separacemi halogenderivátů aminokyselin.

Článek srovnává pomocí modelu LFER rozdílné distribuce retenčních interakcí v analogických HPLC a SFC systémech a dále diskutuje možný vliv rozdílných distribucí na chirální separace.

Článek popisuje snadnou a rychlou SFC metodu pro separaci enantiomerů chlorthalidonu, významného diuretika.

Publikována byla i rozšířena anotace v ruštině.

Ukázali jsme, že mitochondriální glycerol-3-fosfát dehydrogenáza tvoří funkční homooligomery a superkomplex, které generují kyslíkové radikály na úrovni
ubichinonu mechanismem odlišným od tvorby ROS sukcinát dehydrogenázou.

Článek vyšel v tamilštině v akademickém periodiku Kakkai Sirginile vydávaném v indickém státě Tamilnádu, kde probíhalo terénní šetření v rámci projektu GAUK.

Podíl OG a FP na publikaci se týká sestřihu suboptimálních substrátů v mutantě prp45(1-169) S.cerevisiae komplementované proteinem AtSKIP a vitality těchto buněk při teplotě 37°C (obr. 5, str. 3285). Prezentované výsledky vychází dílem z experimentální základny Projektu. Afiliace k UK a PřF uvedena.

Clanek pojednaval o rekurznich relaci v nelinarnim sigma modelu.

Obsahly clanek pojednava o vlastnostech amplitud v nelinearnim sigma modelu jako jsou rekurzni relace a soft limity.

Časopis je v seznamu českých recenzovaných časopisů.
Článek byl přijat do recenzního řízení

Článek byl přijat do recenzního řízení.

New Educational Review není v databázi tohoto systému uveden, údaj o IF byl převzat ze stránek časopisu: http://www.educationalrev.us.edu.pl/index.html

Publikace článku byla redakcí časopisu odložena do některého z příštích svazků (36 nebo následující), předpokládáme z důvodu sdružení více příspěvků na téma analýza logů. Článek má 11 stran.

Článek byl akceptován dne 9. dubna 2014.

V článku dokazujeme jistá zobecnění výsledků týkajících se Valdiviových kompaktů (ekvivalentně, prostorů s komutativním retrakčním skeletonem) na prostory s retrakčním skeletonem (ne nutně komutativním).

V této práci porovnáváme dvě metody důkazů separabilně redukčních vět ve funkcionální analýze - metodu bohatých famílií a metodu elementárních submodelů.

Výsledky dále aplikujeme a ukazujeme, že projekční skeleton může být indexován obrazy příslušných projekcí.

V článku dokazujeme, že sigma-pórovitost je separabilně určená vlastnost.

V tomto článků je popsána numerická simulace vibrací elastického tělesa vybuzených proudící tekutinou. Je zde popsána formulace Navierových-Stokesových rovnic ve tvaru ALE (Arbitrary Lagrangian–Eulerian) a jejich diskretizace pomocí nespojité Galerkinovy metody v prostoru a metody konečných diferencí v čase. Dále je popsána diskretizace pomocí konformních konečných prvků pro lineární problém elasticity, diskretizace pomocí Newmarkovy metody v čase a přechodové podmínky pro interakci. Interakce je provedena pomocí strong coupling nebo weak coupling verze algoritmu. Vyvinutá metoda je testována numerickými experimenty a aplikována na simulací vibrací hlasivek.

V článku se zabýváme problémem interakce proudící vazké stlačitelné tekutiny a elastického tělesa v 2D se zaměřěním na aplikace v biomechanice na problém proudění vzduchu ve vokálním traktu.

Obsahem článku je numerická simulace interakce dvojrozměrného stlačitelného vazkého proudění a kmitajícího profilu křídla letadla. Pevný profil se dvěma stupni volnosti rotuje kolem své osy a kmitá ve vertikálním směru. Numerická simulace sestává z řešení Navierových-Stokesových rovnic pomocí nespojité Galerkinovy metody sdružených se soustavou nelineárních obyčejných diferenciálních rovnic popisujících pohyb profilu. Navržená metoda je robustní s ohledem na velikost Machova a Reynoldsova čísla.

Publication available as "online first" http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10796-013-9471-4#

Článek přijatý do časopisu, kde je spoluautorkou I řešitelka grantu.

Polydendrocyty představují čtvrtý typ gliových buněk v centrálním nervovém systému u savců. Ačkoli v in vitro podmínkách byla prokázána jejich schopnost diferencovat do mnoha buněčných typů, in vivo tato jejich vlastnost nebyla přímo prokázána a zůstává předmětem diskuze. V této studii jsme sledovali vlastnosti polydendrocytů po ischemickém poškození mozku, které jsme indukovali okluzí střední mozkové tepny u dospělých myší kmene NG2creBAC:ZEG. V tomto transgenním kmeni myší dochází k expresi zeleného fluorescenčního proteinu (EGFP) specificky pouze v polydendrocytech a buňkách, které z nich vznikají. Fenotyp EGFP-pozitivních buněk byl analyzován pomocí imunohistochemických a elektrofyziologických metod 3, 7 a 14 dní po ischemii.
U kontrolních myší EGFP-pozitivní buňky v mozkové kůře exprimovaly proteiny typické pro polydendrocyty a oligodendrocyty a těmto dvěma buněčným typům odpovídaly i elektrofyziologické analýzy, což dokazuje, že za fyziologických podmínek polydendrocyty vykazují unipotentní diferenciační potenciál. Tři dny po ischemickém poškození se počet EGFP-pozitivních buněk dramaticky zvýšil v porovnání s kontrolními zvířaty a tyto nově vzniklé buňky se velmi rychle dělily, tj. exprimovaly markery proliferujících buněk (Ki-67) a vykazovaly zvýšené vně usměrněné K+ proudy. Analýza EGFP-pozitivních buněk v pozdějších fázích po ischemickém poškození ukázala, že v blízkosti ischemické léze EGFP-pozitivní buňky vykazují typické vlastnosti reaktivních astrocytů, tj. exprimují GFAP a vimentin a mají typické proudové charakteristiky astrocytů. Další buněčný typ, který vznikl z polydendrocytů po ischemickém poškození mozku, byly progenitorové buňky, jejichž charakteristiky odpovídaly nezralým neuronům. Výsledky naší studie tak prokázaly, že polydendrocyty mohou za patologických podmínek diferencovat v jiné buněčné typy, což svědčí o jejich multipotentním diferenciačním potenciálu a jejich významném podílu na regeneraci poškozené nervové tkáně.

Idiopathic inflammatory myopathies (IIM) belong to a group of autoimmune disorders, primarily characterized by chronic inflammation of human skeletal muscle tissue. The etiology of these diseases is unknown, however, genetic predisposition plays a significant role in disease onset. Beside the known genetic risk located in the MHC complex, the epigenetic modifications including changes in miRNAs expression profiles have been recently implicated recently in many autoimmune diseases. Micro RNA molecules are involved in many physiological processes, including the regulation of the immune response.In our study we have focused on the miR-23b, as it represents a novel promising autoimmunity regulator molecule. Downregulation of miR-23b was recently described in patients with rheumatoid arthritis and systemic lupus erythematosus. We have measured the expression miR-23b peripheral blood mononuclear cells of patients with dermatomyositis and polymyositis. No meaningful difference was found in comparison with healthy controls.

Abstrakt v rámci 49th Congress of the European Societies of Toxicology (EUROTOX)

Většina odborníků se shodne na tom, že děti dnešní doby jsou pod silným tlakem technologií všeho druhu. Již od útlého dětství tráví více času před televizí, počítačem či s mobilním telefonem, než poznáváním svého (nejen přírodního) okolí. To vše vede k tomu, že ztrácejí motivaci, ale také schopnosti a praktické dovednosti pro bytí v přírodě. V České republice stráví průměrný školák pouze před televizní obrazovkou průměrně 3,5 hodiny denně a 80 % z nich vlastní mobilní telefon (celonárodní výzkum NIDM, 2011).
Mobilní telefon lze dnes využívat i jako malý kapesní počítač, záznamník, fotoaparát, kameru či navigaci. Všechny tyto možnosti lze dobře využít i ve vzdělávacích programech, kde hlavním nástrojem je právě mobilní zařízení.
Mobilní aplikace pro vzdělávání v terénu aktivují sociální, experimentální a zejména situační učení. To nás navrací k velice staré myšlence, že učení se neděje pouhým frontálním přenosem znalostí z pedagoga na pasivního žáka, ale že učení je konstruováno skrze individuální zkušenost, pozorování přirozeného prostředí a experimentování. Aktivity, které probíhají přímo v autentickém prostředí (tedy blízkém vzdělávacím cílům) obohacují učení o reálné zážitky a zkušenosti, které mohou žáci přímo využít v jejich osobním životě (tzv. usnadňují transfer učení).

The personalization principle, one of the design principles of multimedia learning, states that people learn better from multimedia presentations when instructions are in a conversational style rather than a formal style, possibly due to learners’ increased interest. This principle was shown to be robust in short interventions that could be completed within minutes or a few dozen minutes; however, complex digital simulations and games that support the acquisition of complex mental models usually take longer to complete. In this study, we investigate the personalization principle in a new context: in an interactive simulation on the topic of beer brewing, which lasts 2-3 hours. Personalized style, where learners were addressed conversationally by “their grandpa, an owner of the family brewery,” or in a non-personalized, more formal style without the grandpa. In Experiment 1, 26 college students, who interacted with both simulation versions, expresed on average a preference for the personalized version of the simulation. In Experiment 2 with a between-subject design, the knowledge of 75 predominantly college students was tested by means of retention and transfer tests immediately after completing the simulation and also a month later. Contrary to most previous works, our results showed no difference between the personalized and non-personalized groups in learning achievement, despite the fact that learners who received the personalized treatment voluntarily spent about 20% more time on the simulation. These results indicate that personalization is not always beneficial to learning, which raises important questions for future research. Additional findings suggest that the simulation, no matter the treatment type, was most beneficial to learners with high mathematical abilities and who play computer games frequently, and also to those who liked the simulation more.

NCoR and SMRT are two paralogous vertebrate proteins that function as corepressors with unliganded nuclear receptors. Although C. elegans has a large number of nuclear receptors, orthologues of the corepressors NCoR and SMRT have not unambiguously been identified in Drosophila or C. elegans. Here, we identify GEI-8 as the closest homologue of NCoR and SMRT in C. elegans and demonstrate that GEI-8 is expressed as at least two isoforms throughout development in multiple tissues, including neurons, muscle and intestinal cells. We demonstrate that a homozygous deletion within the gei-8 coding region, which is predicted to encode a truncated protein lacking the predicted NR domain, results in severe mutant phenotypes with developmental defects, slow movement and growth, arrested gonadogenesis and defects in cholinergic neurotransmission. Whole genome expression analysis by microarrays identified sets of de-regulated genes consistent with both the observed mutant phenotypes and a role of GEI-8 in regulating transcription. Interestingly, the upregulated transcripts included a predicted mitochondrial sulfide:quinine reductase encoded by Y9C9A.16. This locus also contains non-coding, 21-U RNAs of the piRNA class. Inhibition of the expression of the region coding for 21-U RNAs leads to irregular gonadogenesis in the homozygous gei-8 mutants, but not in an otherwise wild-type background, suggesting that GEI-8 may function in concert with the 21-U RNAs to regulate gonadogenesis. Our results confirm that GEI-8 is the orthologue of the vertebrate NCoR/SMRT corepressors and demonstrate important roles for this putative transcriptional corepressor in development and neuronal function.

Časopis Politická ekonomie nezpřístupňuje články v elektronické podobě. Dostal jsem pouze fyzický autorský výtisk vydání s mým příspěvkem. Proto v přiloženém souboru nemusí být zapracovány všechny závěrečné korektury. Odkaz na abstrakt článku v Politické ekonomii: http://www.vse.cz/polek/abstrakt.php3?IDcl=897

Ve článku je uvedena afiliace MFF Univerzity Karlovy a poděkování grantovému projektu GAUK číslo 602213.

Jde o zvaný článek. IEEE Transactions on Terahertz Science and Technology je relativně nový časopis, který bude s patřičným impakt faktorem zařazen do databáze WOS teprve v průběhu roku 2014.

Článek vyšel v časopise ze seznamu Rady pro výzkum, vývoj a inovace.

Článek je ve třetím kole recenzního řízení. Časopis s IF.

Článek je ve druhém kole, recenzního řízení. Časopis na je databázi Scopus.

Článek ve druhém kole recenzního řízení. Časopis ze seznamu Rady pro výzkum, vývoj a inovace.

Výzkumné šetření je zaměřeno na postoje žáků středních odborných škol (SOŠ) nechemického zaměření k chemii. Cílem je zjistit a porovnat postoje žáků na začátku a na konci školního roku, tedy po příchodu na střední školu a po skončení výuky chemie. Zadaný dotazník obsahoval tři otázky s otevřenou odpovědí a jednu otázku se škálou 1–5. Z výsledků je možné vyvozovat zpřesnění představ žáků o chemii posun v jejich vnímání užitečnosti chemie pro život. Přesto žáci hodnotí chemii známkou 3. V závěru příspěvku jsou uvedeny možnosti dalších kroků nutných pro optimalizaci výuky chemie ve specifickém prostředí SOŠ nechemického zaměření.

Skutečná čísla stránek jsou:
počáteční stránka: 01053-p.1
poslední stránka: 01053-p.8

Klíčové kompetence jsou velmi důležitými pojmy v českých kurikulárních dokumentech. Dítě připravují na jeho uplatnění ve společnosti. Text se proto zamýšlí nad tím, co je klíčová kompetence v obecném smyslu a jak je definována v Rámcovém vzdělávacím programu pro základní a předškolní vzdělávání. Pojednává o vzniku oboru dětské teologie, která svým vědeckým pojetím vytvořila prostor pro uvažování o dětské kompetenci. Na závěr textu jsou představeny některé charakteristiky pojmu teologická kompetence dítěte.

Text se zamýšlí nad pojmem transcedence ve filosofickém odkazu Jana Patočky. Jsou představeny dvě filosofické koncepce transcendence, včetně jejich specifik, shodných charakteristik i některých náboženských a filosofických vlivů. První koncepce je spjata s transcendencí vědomí a s osobním přístupem člověka, který ji buď uskutečňuje správně (transcendentálně) nebo zkresleně (empiricky). Ve druhé filosofické reflexi je transcendence zasazena do nauky o kinesteziích. Je spojena se třetím existenciálním pohybem pravdy, se změnou člověka (metanoiou) a jeho snahou nazřít pravdu v každodenní situaci, v umění nebo v hraničním zážitku.

Jedná se o prioritní publikaci klinicko-morfologické části výzkumného projektu týkající se uspořádání svalových a vazivových struktur sledovaného regionu ve vztahu k průběhu lomných linií, včetně hodnocení kostních defektů po zavedení hřebu.

Tento souhrnný článek byl sepsán v rámci práce na projektu. Jsou v něm popsány dosavadní znalosti o vztahu GLP-1 k játrům.

Publikace je v současné době v recenzním řízení pro Prager wirtschafts- und sozialhistorische Mitteilungen (WISOHIM) číslo 1/2014.

Během uplynulého roku jsme intenzivně pracovali na dokončení tohoto článku a jeho publikování ve vysoce impaktovaném časopise. Byly provedeny analýzy, které zásadně posouvají orientaci článku z pouhé deskriptivní cytogenetiky na úroveň evolučně biologické a genomické publikace. Pomocí odhadu stáří klonálních a sexuálně se rozmnožujících linií jsme nyní schopni srovnat rychlost v akumulaci chromozomových změn na absolutní časové škále. Značnou dobu jsme také strávili studiem literatury a její kritickou analýzou tak, abychom mohli plně vytěžit potenciál našich dat. V publikaci popisujeme efekt asexuality na rychlost chromozomové evoluce u sekavců rodu Cobitis ve srovnání s ostatními studovanými asexuálními organismy a ukazujeme, že ačkoliv předešlé práce dokládají výrazně zrychlené tempo evoluce asexuálních karyotypů, nejedná se žádné obecné pravidlo. Námi studované klony sekavců vykazují jasnou morfologickou stázi i přes jejich evolučně relativně vysoký věk. K jistému zdržení v publikování této práce došlo také tím, že jsme museli čekat na finální akceptaci fylognetického článku (Choleva et al. in press.), jehož data byla použita pro odhad věku klonů a sexuálních druhů.

V této chvíli je publikace submitována na serveru Axios review (http://axiosreview.org/). Tato společnost výrazně zrychluje recenzní řízení při zachování maximálního impaktu tím, že autoři navrhnou 4 kandidátní časopisy od nejprestižnějších níže, organizace obstará plný peer Review proces, nechá autory adresovat výtky oponentů a poté sama osloví cílové časopisy se žádostí o přijetí do recenzního řízení s již obstaranými externími posudky, čímž editorům již velmi usnadní práci. Námi navržené časopisy jsou Molecular Biology and Evolution, Evolution, Molecular Phylogenetics and Evolution a Chromosoma).

Abstract: Methods of satellite radar interferometry (InSAR) have been applied for detection of extent of the undermining area in the Czech part of the Upper Silesian basin. Mining processes cause the ground subsidence resulting in the creation of subsidence depressions. The paper presents results of application of InSAR for the subsidence detection in the Karviná region and also aspects of applicability this remote sensing method for a geomorphological (geological) research.

Výsledky naší práce na tomto projektu jsme opublikovali v časopise Annals of Hepatology pod názvem "Anti-cancer effects of blue-green alga Spirulina platensis, a natural source of bilirubin-like tetrapyrrolic compounds".

Článok bol zaslaný do redakčnej rady.

This paper won the first place in the "Energy Economics Contest" 2013 organised by "Institut energetické ekonomie" (IEE) [see attached].

V příloze je stav před finálními korekturami.

Článek je podaný

Práce se zabývá zkoumáním strukturní podstaty polycomb tělísek s využitím pokročilých mikroskopických metod včetně korelační mikroskopie.

Článek sleduje dopad hospodářské krize 30. let 20. století na sociální postavení jabloneckých a železnobrodských sklářských dělníků, které ve sledovaném období určovaly zákony a vládní nařízení vydané po vzniku Československé republiky, ve 20. letech a první polovině 30. let (především jejich provádění v praxi). Článek se zaměřuje na problematiku nedodržování zákonných ustanovení obsažených v těchto právních předpisech vlivem hospodářské krize. Tím článek analyzuje reálné poměry ve sklářské výrobě a podmínky dělnické práce na Jablonecku a Železnobrodsku během 30. let 20. století.

Hotová odborná studie byla v loňském roce po konzultaci s vedoucím odeslána k recenznímu řízení časopisu Filosofie dnes. 9. 4. 2014 jsem obdržel od šéfredaktora informaci, že byla studie recenzenty doporučena k publikaci a že s ní redakce počítá do 1. čísla roku 2014. Tuto informaci dokládá snímek přiložený k pdf souboru, který obsahuje definitivní verzi samotné studie.

Článek shrnující výsledky o třídě Propagation Complete formulí.

Článek "Zdeněk Nejedlý a léta šedesátá. Proměny vnímání v kontextu doby" představuje recenzovaný otisk vystoupení na konferenci "Už jsme vším", která proběhla na Pedagogické fakultě UK v květnu roku 2012.

We analyze whether the prediction of the fractal markets hypothesis about a dominance of specific investment horizons during turbulent times holds. To do so, we utilize the continuous wavelet transform analysis and obtained wavelet power spectra which give the crucial information about the variance distribution across scales and its evolution in time. We show that the most turbulent times of the Global Financial Crisis can be very well characterized by the dominance of short investment horizons which is in hand with the assertions of the fractal markets hypothesis.

Portfolio diversification and active risk management are essential parts of financial analysis which became even more crucial (and questioned) during and after the years of the Global Financial Crisis. We propose a novel approach to portfolio diversification using the information of searched items on Google Trends. The diversification is based on an idea that popularity of a stock measured by search queries is correlated with the stock riskiness. We penalize the popular stocks by assigning them lower portfolio weights and we bring forward the less popular, or peripheral, stocks to decrease the total riskiness of the portfolio. Our results indicate that such strategy dominates both the benchmark index and the uniformly weighted portfolio both in-sample and out-of-sample.

We introduce a general framework of the Mixed-correlated ARFIMA (MC-ARFIMA) pro-
cesses which allows for various specifications of univariate and bivariate long-term memory.

We introduce a new test for detection of power-law cross-correlations among a pair of time series – the rescaled covariance test. The test is based on a power-law divergence of the covariance of the partial sums of the long-range cross-correlated processes. Utilizing a heteroskedasticity and auto-correlation robust estimator of the long-term covariance, we develop a test with desirable statistical properties which is well able to distinguish between short- and long-range cross-correlations. Such test should be used as a starting point in the analysis of long-range cross-correlations prior to an estimation of bivariate long-term memory parameters. As an application, we show that the relationship between volatility and traded volume, and volatility and returns in the financial markets can be labeled as the power-law cross-correlated one.

Článek bude vycházet v dubnu 2014, momentálně bohužel nemám informace o počáteční a poslední stránce článku.

Publikovaná práce jako první přináší výsledky o distribuci a eliminaci oxidu uhelnatého in vivo a jeho protektivním vlivu u experimentálního modelu cholestázy.

Novel method for analysis of independently controlled wing stroke variations was presented in the Twenty Second Annual Computational Neuroscience Meeting: CNS 2013 in Paris. The extended abstract was published in the conference proceedings, which appeared as a supplement of the journal BMC Neuroscience.

Předkládaná publikace shrnuje podrobnosti implementace výpočtu MCD spekter prostřednictvím sumy přes stavy (SOS). Ačkoliv se jedná o výsledek, který nebyl původně očekáván v návrhu projektu, výpočetní náročnost MCD spekter si vyžádala vyvinutí této metody, která se ukázala být efektivnější než klasické postupy výpočtu MCD.

Článek byl přijat v recenzním řízení, byly doplněny požadavky recenzentů, očekává se brzké přijetí do tisku. Přiložen je článek s výstupu recenzního řízení a dodatečný komentář recenzenta. Čísla stránek ještě nejsou známa.

- popularizační článek v elektronickém časopise: http://socialniteorie.cz/proc-cist-blesk/
- na vyžádání editora publikován také na publo.cz: http://publo.cz/proc-cist-blesk/

Článek je ve fázi recenzního řízení. Časopis vyjde až ve druhé polovině roku 2014.
Uvedený rozsah stran je proto pouze orientační.

Článek je přiložen ve formě manuscriptu.

článek je v recenzním řízení, rozsah stran a svazek zatím nejsou známy

Předložený článek se zabývá přípravou a studiem tenkých redukovaných vrstev oxidu ceru na povrchu Cu(111). Vrstvy byly připravovány napařováním kovového ceru na povrch CeO2(111)/Cu(111) s následným žíháním na 600°C. Byly studovány chemické a strukturní změny probíhající během redukce z CeO2 na Ce2O3 a zpětné oxidace. Byly objeveny 3 mezifáze vykazující rekonstrukce (√7x√7)R19.1°, (3x3) a (4x4) vzhledem k substrátu CeO2(111). Bylo zjištěno, že interakce kov-oxid na rozhraní je natolik významná, že je možné tímto způsobem připravit i jinak nestabilní vrstvu kubického Ce2O3.

Přiložen je rozpracovaný článek, který bude v co nejkratším termínu dokončen a po obdržení připomínek od školitele a dalších kolegů ihned submitován do časopisu Preslia, tak aby bylo zajištěno přijetí ještě v tomto roce. Školiteli bude nabídnuto spoluautorství.

Fakticky vyšlo v roce 2011.

Cílem této studie je prezentovat původní český dotazník KLI-P, který měří psychosociální klima porodnice z perspektivy rodiček. Práce popisuje vývoj dotazníku opírající se o kvalitativní a kvantitativní analýzy a přináší údaje o jeho psychometrických parametrech.

Cílem studie je identifikovat klíčové determinanty spokojenosti rodiček s péčí v českých porodnicích a formulovat konkrétní doporučení pro praxi.

Cílem studie je zmapovat spokojenost žen s psychosociálními aspekty péče v českých porodnicích, identifikovat oblasti, které vyžadují zlepšení, a porovnat spokojenost s perinatální péčí u vybraných skupin rodiček.

Článek přibližuje možnosti praktické výuky virologie a genetiky. U těchto dvou disciplín biologie nejsou podle pilotního průzkumu vyučovány (téměř) žádná praktická cvičení.

Článek byl přijat k recenznímu řízení, viz potvrzení níže. Měl by vyjít ve svazku 15, č. 2, 2014

Cílem studie byla analýza vztahu mezi velikostí pohybového zatížení a vizuálně motorickou odpovědí (VMRT) u elitních juniorských hráčů fotbalu (18,4 ± 0,4 roku) v ČR.

Článek je zatím předběžná verze, po dopracování bude poslán do časopisu Bradleya, který se specializuje na publikaci vědeckých článků o kaktusech a dalších sukulentních rostlinách.

[SUBMISSION]
Článok bol zaslaný do redakcie v decembri roku 2012, zatiaľ nebolo uskutočnené ani prvé rozhodnutie, k súboru s článkom prikladám aj komunikáciu s editorkou. Editorka sľúbila zaslať rozhodnutie približne do polovice marca 2014, no zatiaľ sa tak nestalo.

[SUBMISSION]
Článok bol zaslaný na posúdenie do časopisu.

Článek ma zatím status "Early View" a je k dispozici pouze online, vyjde v příštím čísle časopisu. Je dostupný na http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cgf.12283/abstract

Správná citace:

J. Phys. A: Math. Theor. vol. 46, 075002 (2013), doi:10.1088/1751-8113/46/7/075002

(viz komentář u článku z J. Chem. Phys.)

Správná citace:

Phys. Rev. E, vol. 89, 022132 (2014), doi:10.1103/PhysRevE.89.022132

(viz komentář u článku z J. Chem. Phys.)

Správná citace:

Phys. Rev. E, vol. 89, 022115 (2014), doi:10.1103/PhysRevE.89.022115

(viz komentář u článku z J. Chem. Phys.)

Komentář (platí pro všechny výstupy):

články v časopisech APS (American Physical Society), AIP (American Institute of Physics) a dalších společnosti v dnešní době (cca od r. 2000) již velmi často nemají přidělenou Počáteční stránku ani Poslední stránku. Místo toho jsou články označeny svazkem (volume) a ID (šestimístným kodem). Viz třeba
http://journals.aps.org/pre/edannounce/PREv62i1_2

Z tohoto důvodu je požadavek povinně uvádět Počáteční stránku a Poslední stránku v hodně případech zastaralý (cca 15 let). Jelikož mě systém nechtěl pustit dále, jako Počáteční stránku a Poslední stránku jsem vždy okopíroval ID článku. Toto ID často začíná symbolem 0, který je systémem automaticky smazán. Byl bych rád, kdyby se správce vašeho systému nad touto záležitosti malinko pozastavil a přizpůsobil systém tak, aby bylo možné udat přesnou citaci výstupu bez nutnosti všechno dodatečně opisovat v komentáři.

Citace:
J. Chem. Phys. vol. 138, 154104 (2013); doi: 10.1063/1.4801326

Článek bude publikován v čísle 3/2014
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24564601

přijato do tisku. přiloženo potvrzení.

Přijato k publikování.

Zatím nevím stránky přesně, jenom rozsah, a proto jsem stránkování uvedl tak, aby odpovídalo rozsahu článku.

Přijato k publikování.

Zatím nevím stránky přesně, jenom rozsah, a proto jsem stránkování uvedl tak, aby odpovídalo rozsahu článku.

Publikováno.

Uvedeno na Web of Science

Uvedeno na Web of Science

Uvedeno na Web of Science.

Uvedeno na Web of Science

Článek je k dispozici elektronicky na adrese
http://blms.oxfordjournals.org/content/early/2013/09/25/blms.bdt069.abstract?keytype=ref&ijkey=4N20CZZaKmZDgAn

V souvislosti s STM měřením molekul na površích křemíku byly zkoumány metody přípravy, testování a čištění wolframových hrotů pro STM. Výsledky byly publikovány v časopise Ultramicroscopy.
DOI: dx.doi.org/10.1016/j.ultramic.2011.10.005

DOI: http://dx.doi.org/10.1103/PhysRevB.88.205406

Byly připraveny tři amino-bis(fosfinátové) sloučeniny, u kterých nebyl pozorován žádný rozklad ve vodném prostředí. Sloučeniny vykazují vysokou bazicitu aminových skupin a s tím související vysokou stabilitu komplexů s dvojmocnými kovy. Studium koordinačních vlastností v roztoku i v pevné fázi odhalilo vliv hydroxoskupiny navázané na centrální atom bis(fosfinátové skupiny), která indukuje vznik nečekaných dinukleárních nebo polynukleárních komplexů.

Byly připraveny čtyři bis(fosfinátové) sloučeniny neobsahující amino skupinu s cílem použít je jako prekurzor pro přípravu amino-bis(fosfinátů). Při derivatizaci byl však pozorován překvapivý rozklad těchto "stavebních kamenů" ve vodném prostředí, který znemožnil připravu odvozených sloučenin. Bylo zjištěno, že rozklad je závislý na struktuře (díky přítomnosti P–H vazby) a probíhá velmi rychle zejména v kyselém prostředí. Podařilo se identifikovat a izolovat produkty rozkladu (1-hydroxy-(H-fosfináty) a také byl navržen reakční mechanismus. Tato reakce představuje alternativu k současně používané syntetické cestě vedoucí 1-hydroxy-(H-fosfinátům). Na základě výsledků byly navrženy alternativní cesty k přípravě amino-bis(fosfinátů).

submitted

DOI: 10.1103/PhysRevD.88.091104

DOI: 10.1103/PhysRevD.88.072004

Spirulina platensis, a water blue-green alga, has been associated with potent biological effects, which
might have important relevance in atheroprotection. We investigated whether S. platensis or
phycocyanobilin (PCB), its tetrapyrrolic chromophore, can activate atheroprotective heme oxygenase-1
(Hmox1), a key enzyme in the heme catabolic pathway responsible for generation of a potent
antioxidant bilirubin, in endothelial cells and in a mouse model of atherosclerosis. In vitro experiments
were performed on EA.hy926 endothelial cells exposed to extracts of S. platensis or PCB. In vivo studies
were performed on ApoE-deficient mice fed a cholesterol diet and S. platensis. The effect of these
treatments on Hmox1, as well as other markers of oxidative stress and endothelial dysfunction, was
then investigated. Both S. platensis and PCB markedly upregulated Hmox1 in vitro, and a substantial
overexpression of Hmox1 was found in aortic atherosclerotic lesions of ApoE-deficient mice fed
S. platensis. In addition, S. platensis treatment led to a significant increase in Hmox1 promoter activity in
the spleens of Hmox-luc transgenic mice. Furthermore, both S. platensis and PCB were able to modulate
important markers of oxidative stress and endothelial dysfunction, such as eNOS, p22 NADPH oxidase
subunit, and/or VCAM-1. Both S. platensis and PCB activate atheroprotective HMOX1 in endothelial cells
and S. platensis increased the expression of Hmox1 in aortic atherosclerotic lesions in ApoE-deficient
mice, and also in Hmox-luc transgenic mice beyond the lipid lowering effect. Therefore, activation of
HMOX1 and the heme catabolic pathway may represent an important mechanism of this food
supplement for the reduction of atherosclerotic disease.

Uvedená práce se zabývá protinádorovými účinky jedlé řasy Spirulina platensis, která slouží jako přírodní zdroj tetrapyrolových sloučenin.
V naší studii byl prokázán účinek Spiruliny platensis i tetrapyrolových pigmentů v ní obsažených na snížení proliferace nádoru pankreatu. Tento efekt je částečně způsoben díky antiproliferativním účinkům této řasy, inhibici mitochondriální produkce volných kyslíkových radikálů a následným změnám intracelulárního redoxního stavu. Naše data podporují užívání jedlé řasy Spirulina platensis pacienty s nádorovým onemocněním jako slibného chemopreventivního terapeutika.

Přislíbeno publikování článku, momentálně v recenzním řízení.

Článok bol publikovaný on-line; nebolo mu priradené číslo zväzku ani čísla strán.

Studie je věnuje anglicky mluvící levicově orientované komunitě v Československu, statickým každodenním zkušenostem a dynamickým ne-každodenním aktivitám, které s jejich pobytem v komunistickém státě souvisely. Studie vznikla s podporou GAUK, grantový projekt číslo 112213, středisko 253344.

V článku byla metoda exoskopie použita za účelem objasnění původu sedimentů, přičemž napomohla také k získání dalších příkladů znaků zvětrávání na křemenných zrnech v prostředí odlišném od horského, kde se znaky zvětrávání mnohem častěji dají zaměnit za mikrotextury vzniklé glaciálními pochody.

Článek ve spolupráci s FEKT VUT, kde se pracuje na automatizaci metody.

Tvorba studijních textů věnující se metodě exoskopie a tématu řešení projektu GAUK.

Manuskript nyní v recenzním řízení.

Publikace byla vytvořena na základě realizace projektu č. 394511 s názvem Evoluce komunikačních činností u žáků 1.–3. ročníku na základní škole a vznikl za finanční podpory Grantové agentury Univerzity Karlovy v Praze.
Tato publikace přináší celkové zpřehlednění a kompletaci již publikovaných poznatků, předložení současných poznatků získa-ných vlastním výzkumem, který se zaměřuje na oblast komunikační výchovy, na rozvoj komunikačních činností ve výchovně-vzdělávacím procesu a na vzdělávání českých a vietnamských žáků ve vzdělávací oblasti Jazyk a jazyková komunikace.
V teoretické části vycházím z dosavadních poznatků vztahujících se k tématu, které považuji za východiska pro výzkumnou část pedagogického výzkumu.
Hlavním cílem bylo na základě výzkumných šetření vytvořit a předložit komplex vypovídající o evoluci komunikačních činností u žáků mladšího školního věku během 1. vzdělávacího období s přihlédnutím ke vzdělávání žáků pocházejících z vietnamského etnika. Výzkumné téma je dále rozpracováno do dílčích cílů, k jejichž naplnění monografie směřuje.
Praktická část je zaměřena na deskripci projektu výzkumu, jeho výzkumných šetření, vyhodnocení údajů a poznatků získaných z vlastní pedagogické praxe. Intencí práce je i přispění k obohacení pedagogické teorie a praxe předložením podkladů, které by mohly být použity ve výuce didaktiky v pregraduálním vysokoškolském studiu a následně i v běžných třídách základních škol, v nichž se vyskytují žáci s jiným, než českým mateřským jazykem.
Předkládaná monografie má ambici k významným zkušenostem citovaných autorů připojit souhrn poznatků a doporučení, vycházejících ze studia českých i zahraničních informačních zdrojů, z vlastních a získaných pedagogických zkušeností z praxe na 1. stupni základní školy, ze spoluautorské činnosti a tvorby učebnic českého jazyka pro nakladatelství Fraus a z výstupů vlastního výzkumného projektu zaměřeného na vývoj jazykového vyjadřování a komunikace žáků mladšího školního věku.

Trestní odpovědnost právnických osob je pojmem, který se v pozitivní úpravě českého trestního práva objevuje nově a narušuje dosavadní katalog zásad trestního práva. Český zákon o trestní odpovědnosti právnických osob a řízení proti nim je účinný od 1. ledna 2012. ZTOPO obsahuje jak hmotněprávní, tak procesněprávní úpravu. Za zcela zásadní body regulace je třeba jmenovat vymezení osobní působnosti právnické osoby, rozsah kriminalizace trestní odpovědnosti právnických osob, přičitatelnost trestného činu právnické osobě a sankcionování právnických osob.
Vymezení osobní působnosti právnických osob je negativního charakteru, kdy ZTOPO stanoví, že trestně odpovědnými nejsou Česká republika a územně samosprávné celky při výkonu veřejné moci.
Právnická osoba dle odpovídá za taxativně vypočtené trestné činy. Je nutno konstatovat, že trestné činy nejsou vymezeny tak, že by se dalo hovořit o ideální úpravě deliktní odpovědnosti právnických osob ve smyslu protiprávních jednání, kterých se právnické osoby v praxi dopouštějí. Absence některých trestných činů, zejm. těch majetkových a hospodářských je v podstatě neomluvitelná.
Přičitatelnost trestné činu právnické osobě tvoří samotné jádro celého zákona, neboť stanoví konkrétní podmínky trestní odpovědnosti právnických osob. V případě orgánů právnické osoby lze hovořit o odpovědnosti několika kategorií osob. Úpravu stran zaměstnanců a přičítání jejích jednání právnické osobě lze považovat za zdařilou, avšak při vědomí faktu, že sousloví „lze spravedlivě požadovat“ není nikde žádným způsobem definováno ani přiblíženo a v praxi se tak mohou vyskytovat značné aplikační potíže.
ZTOPO upravuje širokou škálu členitých sankcí, které mohou být vhodným nástrojem pro potrestání právnické osoby účinnými, přiměřenými a odsuzujícími sankcemi.
ZTOPO lze shledávat jako kvalitní počin směrem vpřed. Významným pozitivem přijaté úpravy je její preventivní charakter. Nezbývá než věřit, že intenzita aplikace ZTOPO bude mít vzrůstající tendenci.

Monografie se zabývá novým paradigmatem ve vzdělávání, které označuje za transcendentní pedagogiku. Text je rozdělen do tří obsahových celků. První část se zabývá pojmem z hlediska terminologie a významu jednotlivých oborů. Pojednává o tom, jak mu rozumíme po stránce lingvisticko-hermeneutické (2. kap.) a kde jsou hlavní důrazy porozumění starověkého, středověkého a novověkého myšlení o přesahu (3.kap). Je reflektován pojem transcedence v psychologických problematikách (4.kap.) a v současné náboženské pedagogice (5 kap.). Závěr první části tvoří 6. kapitola, které jde o shrnutí první části a o krátkou mezioborovou definici pojmu přesah. Druhá část této knihy reflektuje otázku, jak vypadá transcendující osobnost a ptá se zda a jakým způsobem je tento cíl dosažitelný (7.kap). Důležitým v procesu edukace je vychovatel jako vzor v přesahu. Jeho činnost je vždy spjata s jeho vlastním postojem k Jáství a k poznávání Ty (dítěte). Existují typické projevy vychovatelů v učebním procesu, které můžeme ztotožnit s přesahovou aktivitou (8.kap.). U dítěte jsou pojednány důležité vývojové mezníky pro přesah v období od kojeneckého věku do puberty. Text sleduje vznik personalisto-socializačního schématu Já-vztah-Ty, v kterém se všechny tři komponenty stejnou měrou podílí na formování a pochopení přesahové aktivity. Jsou zmíněny i některé faktory bránící dítěti v rozvoji přesahu (9.kap.). Třetí část tohoto textu se zabývá péčí o přesah ve vztahu k vychovateli, k dítěti i k učivu (10.-12. kap.).

Kniha bude vydaná na základe licenčnej zmluvy nakladateľskej č. 376/2013 uzatvorenej s nakladateľstvom Karolinum. V prílohe je stav rukopisu k 21.3.2014.

V knize Roztroušená skleróza je onemocnění neuromyelitis optica věnováno několik kapitol (2.2., 3.2., 6.14., 7., 9. a 11.3. ).

První komentář k novému zákonu o obětech trestných činů, který posiluje postavení obětí. Jedná se o významný počin českého zákonodárce, který, bude-li spávně aplikován, může představovat důležitý nástroj pro odhalování trestných činů i v oblasti organizované kriminality. Obsahuje také komentář k novele trestního řádu a novým instutem trestního řízení, které jí byly do českého práva zavedeny (napŕ. prohlášení oběti, předběžná opatření jako způsob náhrady vazby, atd.)

Jde o první komentář k zákonu o obětech trestných činů. Tento zákon mimo jiné posiluje postavení poškozeného (oběti) v trestním řízení, který má s účinností od 1. července v rámci tzv. adhezního řízení možnost uplatňovat nárok na vydání bezdůvodného obohacení, který mu vznikl v souvislosti s trestným činem. Největší přínos tohoto práva tkví v možnosti domáhat se vydání bezdůvodného obohacení v případě tzv. navazujicí trestné činnosti, kam patří právě praní peněz (trestný čin legalizace výnosů z trestné činnosti dle § 216 tr. zák.). Právo na vydání bezdůvodného obohacení má význam u těch případů trestného činu praní peněz, ve kterých hlavním (základním) trestným činem, z nějž "špinavé" peníze (nelegální výnosy) pocházejí, je zasaženo do majetkové sféry konkrétní osoby (poškozeného).

Výše uvedená publikace byla vydavatelstvím zařazena do edičního plánu pro rok 2014 a bylo jí přiděleno ISBN. V příloze k uplatňovanému výsledku je doloženo potvrzení o přípravě vydání publikace.

Recenzováno, obsahuje bibliografii

Rukopis odborné monografie byl přijat v nakladatelství Academia v únoru 2014 a v současné době probíhá jeho další redakční úprava; kniha by se měla objevit ještě v tomto roce (počet uvedených stránek je zde proto orientační). V českém jazyce se jedná o vůbec první souhrnný text na dané téma.

Dokončená kniha je nyní v korekturách a před sazbou, vyjde zhruba v polovině tohoto roku.

Tato knižní publikace novodobému čtenáři poprvé zpřístupňuje úplný text žalmových parafrází Jiřího Strejce, pozoruhodné literární památky, která významným způsobem dotváří obraz literárního dění ve veleslavínském období českého písemnictví. Obsahuje text podle vydání z roku 1598, úplný přehled sémanticky relevantních různočtení podle vydání z let 1587 a 1596 a částečný též podle vydání z let 1590 a 1593. Úvodní studie podává čtenáři informace o autorovi, jeho literáním díle a zvláště o vydávaném textu - o okolnostech jeho vzniku, proměnách jeho textové podoby, jeho recepci v českém prostředí raného novověku a jeho úloze při formování obrazu české literární minulosti v době národního obrození. Ediční řešení, v některých směrech netradiční, je podrobně zdůvodněno v ediční poznámce. Edice je doplněna slovníčkem a rejstříkem incipitů. Jako celek je edice významným příspěvkem pro hlubší porozumění českému raněnovověkému písemnictví a badatelům i širší kulturní veřejnosti otevírá cestu k poznávání textu, který po několik staletí výrazně působil v literární kultuře českých zemí. Srov. též recenzní posudky.

Text řešitele tohoto projektu na stranách 77 až 85. (Ve výsledcích za rok 2011 uvedena jako v tisku)

Publikace je zaměřena na práci asistentů pedagoga v základních školách hlavního vzdělávacího proudu. V první části monografie jsou prezentovány obecné předpoklady pro zapojení asistentů do vzdělávání a výstupy vybraných domácích i zahraničních výzkumů na dané téma. V druhé části autoři představují výsledky vlastního výzkumu zaměřeného na práci asistentů v českých školách – z výpovědí asistentů, učitelů, ředitelů i žáků se speciálními vzdělávacími potřebami zde vyplývají požadavky na znalosti a osobnostní dispozice asistenta pedagoga, nedostatky v nastavení nepřímé pedagogické činnosti asistentů (přípravy, konzultace atd.) i rezervy ve využití různých forem přímé podpory žáků (práce s ostatními žáky ve třídě, individuální skupinová výuka, doučování atd.). Poslední část publikace přináší na výzkumu založená základní metodická doporučení pro práci asistenta pedagoga v inkluzivním modelu vzdělávání.

Kniha shrnuje část výsledků výzkumu podpořeného grantem, a to část týkající se metod tvorby úloh. Uvedené metody jsou podrobně rozebrány a na příkladech ukázána práce s nimi, a to převážně s ohledem na tvoření úloh pro nadané žáky. (Jelikož grantový projekt byl zaměřen na tvorbu úloh experty, zkoumal převážně tvorbu náročných úloh vztažených obvykle k matematickým soutěžím a k osobě nadaného žáka.) Cílovou skupinou čtenářů jsou jak výzkumníci zabývající se problémem tvorby úloh, tak učitelé z praxe, kteří se chtějí v tvorbě úloh zdokonalit a více ji využívat za účelem individualizace ve výuce na základě vnímání nadání jako specifické vzdělávací potřeby.

Kapitola v kolektivní monografii

Kniha přináší aktuální informace o spokojenosti žen s psychosociálními aspekty péče v českých porodnicích. Vychází z reprezentativního souboru 1195 rodiček, které porodily v letech 2005-2012 ve zdravotnických zařízeních v ČR. Jejím účelem je podat zpětnou vazbu zdravotníkům a zároveň přispět k větší informovanosti laické veřejnosti o situaci v současném českém porodnictví a o možnostech, které svým klientům nabízí.

Dotazník KLI-P, jehož účelem je diagnostikovat kvalitu psychosociálního klimatu porodnice. Zřizovatelům a provozovatelům může posloužit pro evaluaci kvality pracoviště, nastávajícím rodičům pak mohou výsledky pomoci při rozhodování, ve které porodnici chtějí přivést své dítě na svět. Metoda byla standardizována pro Českou republiku a umožňuje tak evaluaci konkrétního zařízení i věrohodné porovnání pracovišť mezi sebou navzájem. CD obsahuje dotazník a manuál k dotazníku.

Publikace Imago gratiosa – Korunované Madony ve střední Evropě v době baroka je věnována stále aktuální problematice vztahu obrazu a kultu, za jehož vrcholnou formu lze považovat kult korunování milostných mariánských obrazů a soch, které jsou veřejně uctívány jako zázračné a jako takové byly korunovány zlatými korunkami svatopetrskou kapitulou. Monografie pojednává téma korunovaných obrazů a soch na základě odlišné koncepce a metodologie, ze zcela nového – ikonografického hlediska a poprvé přináší odpověď na otázku, jaký ikonografický typ a forma mariánského obrazu se staly nejčastěji korunovaným obrazem barokní střední Evropy, pojednanou v kontextu širších kulturně-historických souvislostí.

Publikace je sborníkem příspěvků z konference Ani jeden matematický talent nazmar, kterou pořádaly Pedagogická fakulta UK, SUMA JČMF a Školské zařízení pro DVPP Královéhradeckého kraje. Editorem sborníku je řešitel grantu, jeden z příspěvků v knize je dílem hlavní řešitelky.

Závěrečná studie grantu.

V této kapitole popisujeme metodiku přenosu autologní tukové tkáně. Jedná se o monografii určenou pro plastické chirurgy, která bude k dispozici v první polovině roku 2014. Využíváme zde také znalostí, které jsme získali při řešení grantového projektu. Kniha obsahuje afiliaci k fakultě.

Text představuje menší výzkumnou sondu s religiózně nesocializovanými dětmi ve věku 8 - 12 let. Zabývá se dosud u nás neřešenou otázkou, zde vůbec lze vést v tomto případě teologický rozhovor. Nejdříve je blíže specifikováno takové dětství jako: sekularizované, odkřesťanštěné, spirituální, nábožensky uvědomělé a nábožensky vzdálené. Přínosem je navržení vlastního modelu rozhovoru o transcendenci, tj. rozhovoru, který plně respektuje svět dítěte i jeho privaci vědomostí a jde s ním společně do fantazie, kde se statický fenomén (anděl) ze světa dítěte stává dynamickým příběhem. Cesta však za pomocí pedagoga pokračuje dále, a to přes svět fantazie až do světa přesahu, který otvírá novou dimenzi příběhu a ukazuje, že i mythos nebo pohádka hovoří do konkrétní situace dítěte.

Filozofická, etická a spirituální rovina edukace dětí byla v rámci totalitního systému 40 let v české společnosti zanedbána a s těmito důsledky se společnost vyrovnává dodnes. Příspěvek přibližuje nové povzbudivé snahy uvnitř české všeobecné primární i náboženské pedagogiky, které si uvědomují důležitost pojmu transcedence ve smyslu horizontálním (směrem k okolí, druhému člověku, skupině, státu aj.) i vertikálním (ke kosmu, řádu, vyššímu smyslu, bohu aj.). V textu jsou prezentovány výsledky výzkumu s českými dospělými, kteří nahlíží své i cizí dětství ve vztahu k transcedenci a i k formování osobnosti člověka. Také jsou prezentovány dílčí výsledky zkoumání dětského přesahu na prvním stupni základní školy na téma „povídáme si o hrdinech“.

Příspěvek je zaměřen na aspekty a znaky konstruktivistického pojetí výuky na základní škole a na vzdělávací proces realizovaný interakcí základních faktorů, mezi které řadíme učitele, žáka, obsah vzdělávání, vzdělávací postupy a vyučovací metody. V příspěvku je uvedena strukturace vyučovací jednotky v konstruktivisticky pojaté výuce a nástin programu Čtením a psaním ke kritickému myšlení (RWCT), kterým lze konstruktivismus realizovat přímo ve výuce prostřednictvím třífázového modelu učení EUR. Tento model učebního a vyučovacího procesu je tvořen rámcem obsahující základní fáze - evokace, uvědomění si významu informací a reflexe. V každé z uvedených fází je možné uplatňovat specifické metody, které jsou typické pro program RWCT. Model EUR lze považovat za funkční a srozumitelný model konstruktivistického učení a vyučování.

Jak děti hovoří o štěstí za pomocí symbolů? To byla hlavní otázka malé výzkumné sondy. Teoreticky je zakotvena v psychologii přesahu (Helus, Bravené), psychologii štěstí (Bucher, Oerter) a dětské hermeneutice symbolu (Muchová). Z nich vyvstalo, že i děti ve věku 7-10 let, jsou schopny o štěstí hovořit a vidět jej i v obyčejných skutečnostech. Výzkum se proto soustředil na propojení této teze a symbolického uvažování. Kapitola shrnuje hlavní výpovědi ze skupinových rozhovorů. Děti pro každý symbol objevily kladné, záporné, někdy i neutrální hodnocení. Jednalo se o tyto ve společnosti všeobecně uznávané symboly štěstí: čtyřlístek, peníz, slunéčko sedmitečné, prasátko, slon, ryba, kominík a o specifický český symbol zlatá muška. Z výzkumu vyplynulo, že děti velmi dobře na otázky reagují, což dává naději pro cílený filozofický rozhovor o symbolech. Ty totiž vedou děti k vyššímu stupni uvažování, ukazují nenásilně dualitu i relativitu štěstí. Jejich význam pro hodnotovou orientaci dětí spočívá zejména v tom, že děti na základě nich artikulují nahlas pozitivní emoce, slyší odpovědi druhého dítěte, uvědomují si, že jsou tady důležité skutečnosti, které se nedají koupit penězi, že to, co mě činí šťastným, je kolem mě.

V příloze viz potvrzení o přijetí kapitoly do publikace, stejně jako kapitolu samotnou. Číslo počáteční a poslední stránky je orientační.

Kapitola v kolektivní monografii nastiňující problematiku působení Československa v RVHP a možné přístupy k bádání v této oblasti.

v tisku

Kniha má 297 stránek. Kapitola 2.3.

Kapitola v kolektivní monografii Trestní odpovědnost právnických osob – bilance a perspektivy, která se zabývá problémem rozsahu kriminalizace právnických osob a poukazuje na možné problémy z hlediska aplikace a efektivity nově přijatého zákona o trestní odpovědnosti právnických osob.

Kapitola se zevrubně zabývá odpovědností právnických osob za trestný čin praní peněz. V úvodu je pojednáno o pojmu "legalizace výnosů z trestné činnosti", který netypicky ve srovnání se zahraničními úpravami používá český zákonodárce. Navazuje popis důvodů kriminalizace právnických osob za tuto trestnou činnost, jenž vypovídá o závažnosti jednání představující praní peněz a tvoří základ pro pojednání o objektu trestného činu. V hlavní části kapitoly jsou podrobně rozebrány všechny znaky skutkové podstaty trestného činu praní peněz (subjekt, objekt, subjektivní stránka, objektivní stránka). Z hlediska subjektu se zásadně přikláním k názoru o nemožnosti souběhu trestní odpovědnosti za trestný čin předcházející (hlavní) a trestný čin praní peněz. Nejzásadnějšími argumenty jsou zásady ne bis in idem a nemo tenetur se detergere/ipsum accusare. V textu je vysvětleno, že praní peněz představuje tzv. jednání post factum. Z hlediska objektivní stránky jsem se soustředil na otázku vhodnosti legislativního vyjádření v současném trestním zákoníku ve vztahu k rozmanitosti možných jednání. Podrobně je analyzován i objekt, který je v případě praní peněz složitý. Je jím zejména zájem na řádném výkonu spravedlnosti a čistotě hospodářských vztahů a nikoli zájem na ochraně majetku, jak se domnívají autoři zastávající tzv. patrimonialistickou koncepci. V případě subjektivní stránky trestného činu je nejzajímavější otázkou problém přičitatelnosti ve vztahu k povinnostem, které právnickým osobám ukládají netrestní právní předpisy, a to v rámci boje proti praní špinavých peněz. Nakonec se věnuji problematice trestání právnických osob za trestný čin praní peněz, kde kritizuji zejména chybně zvolenou trestní sazbu za trestný čin podle § 216 tr. zák., neboť zcela nevyjadřuje závažnost tohoto jednání a dostatečně jej neodlišuje od obdobných méně závažných trestných činů, kterými jsou podílnictví podle § 214 tr. zák. a nadržování podle § 366 tr. zák. (sazby jsou totožné).

Text - dialog mezi architektem, přednášejícím na ČVUT, a přednášejícím oboru filosofie na FF UK, uvozuje výběr nejdůležitějších událostí v české architektuře v posledních dvou letech a rozebírá, co se v oboru v dané době stalo, co jsou hlavní problémy architektury dnes, formou konfrontace obou hledisek. Text bude v knize publikován česky a anglicky. Publikace bude obsahovat informaci o podpoře ze strany GA UK a řešitelm projektu bude nahlášena jako příslušná pracovišti FF UK.

Příspěvek se zamýšlí nad tím, co charakterizuje dnešní českou rodinu (světonázorová orientace, politické hledisko, vztah k pohádkám, sociální statut, využití volného času, přisuzování významu manželství). Je objasněn přesah dítěte ve vztahu k viditelnému (horizontálno) a neviditelnému (vertikálno) a jeho význam pro dětskou osobnost. Jsou přiblíženy možnosti rozvoje přesahu dítěte ve škole, v sekularizované a religiózní rodině z perspektivy vztahu k: světonázoru, politice, hlubšímu smyslu pohádek, sociálnímu statutu rodin a volnočasových aktivit.

Příspěvek se zabývá aktuální problematikou přístupu k dětem nemocným a umírajícím ve věku 4-10 let. Je definované zdravé, nemocné a umírající dítě s poukázáním, že hrdinové z pohádek i domácí zvířata mají obdobná trápení jako děti. Pochopení dětské duše a jejich světa dává naději pro rodiče, psychology, pastorační pracovníky, náboženské pedagogy i zdravotní personál, že porozumí lépe dětské bolesti a budou jim moci být oporou. Text se zamýšlí nad respektováním dětské osobnosti a jejího světa. Aktuálnost problematiky spočívá v tom, že je stále převažující tendence v České republice pracovat s takovými dětmi z pozice dospělého, nikoliv s ohledem na svět a představy dítěte. Zcela chybí komplexní výzkum transcendence (přesahu) dětí v souvislosti s touto problematikou a její role při zvládání nemoci nebo dokonce umírání. Text proto tuto problematiku otvírá a zamýšlí se nad péčí o přesah dítěte, včetně vlivu transcendování na nemoc i uzdravení. V závěru jsou definovány nové výzvy pro tuto práci: 1. zjistit, zda pro tyto děti nelze udělat více, 2. poznat jejich vývojová specifika a dušení potřeby, 3. poznat jejich svět, v kterém chápou i svou nemoc a bolest, 4. učit se s nimi hovořit o smrti, 5. učit se se zdravými dětmi hovořit o hlubším významu zdraví, 6. nechat se obohatit dětskými představami.

Kniha má 297 stránek. Kapitola 1.4.

Jedná se o kolektivní monografii vybraných příspěvků z konference pořádané Čespou pedagogickou společností v březnu 2013 v Liberci.
Publikace je stále v tisku, uvedený rozsah stran je proto neodpovídající.

Kapitola v knize je zaměřena na terminologickou problematiku spojenou s užíváním pojmů "Britské impérium" a "Commonwealth", formující významnou měrou britsko-dominiální vztahy.

Sborník je v přípravě tisku

Kapitola se zaměřuje na proces utváření identity v období pubescence a adolescence. Zvláště se zaměřuje na roli a význam subkultur při dospívání. Kapitola obsahuje i praktické informace pro pedagogy pracující s mládeží.

Příspěvek je zaměřen na formu strachu, resp. úzkosti, plynoucí z etnicky a kulturně se diverzifikující společnosti a k svobodě, pluralitě a dalším rysům moderní demokratické společnosti. Důraz je kladem na výskyt a podobu této úzkosti mezi aktivisty nacionalistické scény.

Tato kapitola v monografii představuje vztah transcendence a dítěte z pohledu současné náboženské pedagogiky. Poukazuje na to, že dítě do 13ti let má specifický přístup k transcendenci a Božímu zjevení. Tato problematika je aktuální na základě znovuobjeveného příklonu k dětskému uvažování a zejména s ohledem na definování pojmu přesah jako součást osobnosti člověka. Tím jsou položeny nové otázky i pro výuku náboženství u nás. Je představen nový obor teologie dětí, který definuje i takto malé dítě jako laického teologa. Dítě transcendentní obsahy vyjadřuje slovy, ale i kresbou, která se za určitých okolností stává „uměleckou“, tj. je vyhotovována v roli umělce nebo v propojení se skutečnými uměleckými přístupy. (Afiliace doplněna v právě probíhající závěrečné korektuře, pozn. 1 a na s. 278).

Kapitola se zabývá procesem vytváření identity dospívajícího jedince, vytvářením jeho postojů a názorů. Zkoumá, jak a čím může mladého člověka oslovit pravicový politický extremismus.

Kapitola se zabývá politickou socializací a tvorbou politických názorů podporovatelů extremistických hnutí. V jejím závěru jsou stručně představeny možnosti pedagogického působení v oblasti prevence extremismu.

Dítě předškolního a mladšího školního věku vnímá časovost specifickým způsobem. Nejdříve je pojednán význam času pro dítě na pojmech konkrétní událost a přítomnost v životě dítěte. Následuje filozofie dětí k problematikám začátek, viditelný a neviditelný čas, konec života a čas na věčnosti. Poslední část textu se zamýšlí nad časem jako učivem a jeho možným rozšířením o dimenzi osobního prožívání i hlubšího přemýšlení nad významem přítomnosti v životě člověka. Jsou zmíněny některé podněty k filozofování s dětmi jako cesty k objevování hodnoty času.

Během roku, o který bylo odloženo závěrečné hodnocení projektu, proběhlo revizní řízení a tato kapitola je aktuálně přijatá do tisku. Kniha by měla být publikována před koncem roku 2014 (viz příloha). Bohužel dosud nemáme k dispozici informace o stránkách, ani kopii první stránky knihy a stránky se seznamem autorů a dedikací.

Jedná se o přehledový článek ohledně průsečíkových vlastností konvexních množin, jehož cílem je uvést čtenáře do problematiky, vysvětlit mu přístup přes simpliciální komplexy a seznámit ho s nejnovějšími výsledky v dané oblasti.

Daný článek je souhrnem dosavadních výsledků výzkumu dizertační práce "Česká hip hopová subkultura: konstrukce autenticity v českém rapu". Výcházím zde z rozhovorů s českými rapery a raperkami a zaměřuju se zejména na problematiku genderu (konstrukcí hip hopu jako domény mužů a pozice žen v této subkultuře) a na to, jakým způsobem dochází ke změnám v pojímání hip hopu na základě kutlurní translace tohoto žánru populární hudby.

Spoluautor

Filozofování s dětmi, pro děti a dětí není všeobecně na základních školách v České republice podporováno. V posledních letech se objevilo nové reformní úsilí v českém primárním vzdělávání, které vyústilo v teorii edukace obratu k dítěti. V tomto novém směřování primárního vzdělávání je jasně definována důležitost transcedence k celistvému rozvoji lidské osobnosti. To otvírá nový prostor i pro metodu filozofování.

Dedikace v poznámce č.2 na straně 52. Podpora Grantovou agenturou UK je zakomponována i do textu kapitoly samotné - viz str. 78. Seznam autorů (obsah) je na straně 5 a 6.

Kniha Právo Evropské unie je určena studentům právnických fakult a odborné veřejnosti. Kapitola Volný pohyb pracovníků se zaobírá výkladem pojmu pracovníka EU, jeho práv a možnými omezeními volného pohybu pracovníků.

Kapitola v kolektivní monografii.

Výstup grantu jsem vydala jako samostatnou kapitolu v recenzované odborné kolektivní monografii Tóny z okrajů: Hudba a marginalita, a to navíc dvojjazyčně - česky a anglicky. Česká kapitola má název "Vyzpívat se z marginality? Hudebně-náboženské aktivity hinduistické asketky v indickém Ršikéši (s. 59-71; nešlo vložit do tabulky výše).
Kolektivní monografii recenzovali PhDr. Dana Bittnerová, CSc. a doc. Vlastislav Matoušek, PhD.

Informace o knize:
Etnomuzikoložka Zuzana Jurková z nově založeného Institutu etnomuzikologie Fakulty humanitních studií Univerzity Karlovy vydala společně se svými studentkami knihu o situacích, kdy se jedinec nebo skupina nacházející se na okraji hlavního proudu snaží svou situaci nějak změnit. Hudba tu pak slouží jako nástroj této snahy, a zároveň jako její zrcadlo. Kolektivní monografie vychází z aktuálních terénních a archivních výzkumů autorek. Knihu doplňují video ukázky a fotografie z výzkumů, takže si lze popisované hudební situace poslechnout a lépe představit. Publikace navíc vyšla jako dvojjazyčná (česko-anglická) a v různých formátech jako e-kniha v pdf, kindle a ePub verzi, což jsou formáty pro etnomuzikologii obzvlášť vhodné, takže bude lehce dostupná širokému publiku u nás i v zahraničí. Knihu vydala FHS UK a nakladatelství KHER, na jehož stránkách www.kher.cz ji lze zdarma stáhnout a podívat se na video ukázky.