velikost textu

Výsledky projektu Příprava proteinů SUG1 a CRX a studium jejich interakcí s fosducinem.

Výsledky

▼▲Typ výsledku ▼▲Autor celku ▼▲Název celku
(Celkem 13 zázn.)
Kacirova, Miroslava, Kosek, Dalibor, Kadek, Alan, Man, Petr, Vecer, Jaroslav, Herman, Petr, Obsilova, Veronika, Obsil, Tomas. Structural Characterization of Phosducin and Its Complex with the 14-3-3 Protein. The Journal of Biological Chemistry, 2015, sv. 290, s. 16246–16260. ISSN 0021-9258. IF 4.573. [Článek v časopise]
Článek shrnuje naše dosavadní výsledky týkající se strukturní charakterizace fosducinu (Pd) a komplexu Pd s proteinem 14-3-3 (14-3-3/Pd).
V rámci tohoto projektu GAUK byly k charakterizaci Pd použity techniky CD, AUC, DLS, SAXS a časově-rozlišená měření dohasínání fluorescence ANS. Zjistili jsme, že N-terminální doména volného Pd (Pd-ND) in vitro je značně nestrukturovaná, zatímco C-term. doména (Pd-CD) je strukturovaná. Navrhli jsme možné konformery volného Pd v roztoku.
V rámci tohoto projektu GAUK byly k charakterizaci 14-3-3/Pd použity techniky HDX-MS, AUC a zhášení tryptofanové fluorescence na Pd. Zjistili jsme, že na stabilitě komplexu se nejvíce podílí Pd-ND, KD se pohybuje v jednotkách μM, Pd-ND se v komplexu nachází převážně v centrálním kanálu 14-3-3, ale Pd-CD pravděpodobně slabě interaguje s vnějšími nekonzervovanými oblastmi 14-3-3. Při vazbě nedochází ke značné strukturalizaci Pd-ND, Pd spíše vykazuje tzv. „fuzzy charakter“.
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: XIII Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, March 19-21, 2015. Abstract in Materials Structure, 22 (1), 40 (2015). Miroslava Kacirova, Jiri Novacek, Alan Kadek, Petr Man, Veronika Obsilova, and Tomas Obsil: Structural Characterization of Phosphoprotein Phosducin and its Interaction with 14-3-3 [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstrakt ke konferenci, kde byly výsledky publikovány ve formě přednášky: XV Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, Milovy, 12. – 15. 5. 2015. Abstrakt v Czech Chem. Soc. Symp. Ser. 13, 16-17 (2015). Miroslava Kacířová, Alan Kádek, Petr Man, Jiří Nováček, Veronika Obšilová, Tomáš Obšil: Strukturní studie proteinového komplexu 14-3-3/Pdc [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Čerpání finančních prostředků GAUK + položkový rozpis [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstract a poster ke konferenci: The 29th Annual Symposium of the Protein Society, Barcelona, Spain, July 22-25, 2015. Abstract in Abstract book, PF-010, str. 214. Miroslava Kacirova, Jiri Novacek, Petr Man, Alan Kadek, Veronika Obsilova, Tomas Obsil: Biophysical characterization of phosducin and its complex with the 14-3-3 protein [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstrakt ke konferenci, kde byly výsledky publikovány ve formě prezentace: XIV Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, Milovy, 13. - 16. 5. 2014. Abstrakt v Chemických listech, 108, 519-560 (2014). Miroslava Kacířová, Lenka Řežábková, Alan Kádek, Petr Man, Jiří Nováček, Jaroslav Večeř, Miroslav Štěpánek, Veronika Obšilová, Tomáš Obšil Biofyzikální charakterizace fosducinu a jeho komplexu s vazebným partnerem – proteinem 14-3-3 [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Rukopis ke článku: Kacirova, M., Kosek, D., Kadek, A., Man, P., Vecer, J., Herman, P., Obsilova, V., Obsil, T. (2015) Structural Characterization of Phosducin and its Complex with the 14-3-3 Protein podanému v lednu 2015 do žurnálu Journal of Biological Chemistry. [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: 12th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, March 13-15, 2014. Abstract in Materials Structure, 21 (1), 36 (2014). M. Kacirova, P. Man, A. Kadek, T. Obsil Structural studies on Pdc/14-3-3 protein complex [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Čerpání finančních prostředků GAUK + položkový rozpis [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke kurzu: The 1st FEBS-Instruct crystallization course in the middle EU: Advanced methods in macromolecular crystallization VI, Nové Hrady, Jun 20-27, 2014. [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: 38th FEBS-EMBO Congress, Paris, France, Aug 30 - Sep 4, 2014. Abstract in FEBS Journal, 281, 287 (2014). M. Kacirova, J. Novacek, L. Zidek, V. Obsilova, T. Obsil Investigation into Pdc behavior upon 14-3-3 binding using NMR, SAXS and Trp fluorescence quenching techniques [Jiný výsledek]
Kacířová, Miroslava, Poster publikovaný na International Circular Dichroism User Group Meetingu, který se konal 11. 9. 2013 ve Warwicku. Poster obsahuje navíc výsledky z předešlých měření, které ještě nebyly řešeny a financovány z prostředků tohoto projektu č. 793913 GAUK. Výsledek z měření metodou NMR už byl financován z prostředků tohoto projektu č. 793913 GAUK. [Jiný výsledek]
V. Obsilova, M. Kopecka, D. Kosek, M. Kacirova, S. Kylarova, L. Rezabkova, T. Obsil, Minireview v časopise Physiological Research s názvem "Mechanisms of the 14-3-3 protein function: regulation of protein function through conformational modulation". Článek je přijat k tisku. Měl by vyjít letos v lednu. [Jiný výsledek]