velikost textu
Výsledky projektu Příprava proteinů SUG1 a CRX a studium jejich interakcí s fosducinem.
Výsledky
(Celkem 13 zázn.)
|
---|
Kacirova, Miroslava, Kosek, Dalibor, Kadek, Alan, Man, Petr, Vecer, Jaroslav, Herman, Petr, Obsilova, Veronika, Obsil, Tomas. Structural Characterization of Phosducin and Its Complex with the 14-3-3 Protein. The Journal of Biological Chemistry, 2015, sv. 290, s. 16246–16260. ISSN 0021-9258. IF 4.573. [Článek v časopise] Článek shrnuje naše dosavadní výsledky týkající se strukturní charakterizace fosducinu (Pd) a komplexu Pd s proteinem 14-3-3 (14-3-3/Pd). V rámci tohoto projektu GAUK byly k charakterizaci Pd použity techniky CD, AUC, DLS, SAXS a časově-rozlišená měření dohasínání fluorescence ANS. Zjistili jsme, že N-terminální doména volného Pd (Pd-ND) in vitro je značně nestrukturovaná, zatímco C-term. doména (Pd-CD) je strukturovaná. Navrhli jsme možné konformery volného Pd v roztoku. V rámci tohoto projektu GAUK byly k charakterizaci 14-3-3/Pd použity techniky HDX-MS, AUC a zhášení tryptofanové fluorescence na Pd. Zjistili jsme, že na stabilitě komplexu se nejvíce podílí Pd-ND, KD se pohybuje v jednotkách μM, Pd-ND se v komplexu nachází převážně v centrálním kanálu 14-3-3, ale Pd-CD pravděpodobně slabě interaguje s vnějšími nekonzervovanými oblastmi 14-3-3. Při vazbě nedochází ke značné strukturalizaci Pd-ND, Pd spíše vykazuje tzv. „fuzzy charakter“. |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: XIII Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, March 19-21, 2015. Abstract in Materials Structure, 22 (1), 40 (2015). Miroslava Kacirova, Jiri Novacek, Alan Kadek, Petr Man, Veronika Obsilova, and Tomas Obsil: Structural Characterization of Phosphoprotein Phosducin and its Interaction with 14-3-3 [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt ke konferenci, kde byly výsledky publikovány ve formě přednášky: XV Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, Milovy, 12. – 15. 5. 2015. Abstrakt v Czech Chem. Soc. Symp. Ser. 13, 16-17 (2015). Miroslava Kacířová, Alan Kádek, Petr Man, Jiří Nováček, Veronika Obšilová, Tomáš Obšil: Strukturní studie proteinového komplexu 14-3-3/Pdc [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Čerpání finančních prostředků GAUK + položkový rozpis [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstract a poster ke konferenci: The 29th Annual Symposium of the Protein Society, Barcelona, Spain, July 22-25, 2015. Abstract in Abstract book, PF-010, str. 214. Miroslava Kacirova, Jiri Novacek, Petr Man, Alan Kadek, Veronika Obsilova, Tomas Obsil: Biophysical characterization of phosducin and its complex with the 14-3-3 protein [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt ke konferenci, kde byly výsledky publikovány ve formě prezentace: XIV Mezioborové setkání mladých biologů, biochemiků a chemiků, Milovy, 13. - 16. 5. 2014. Abstrakt v Chemických listech, 108, 519-560 (2014). Miroslava Kacířová, Lenka Řežábková, Alan Kádek, Petr Man, Jiří Nováček, Jaroslav Večeř, Miroslav Štěpánek, Veronika Obšilová, Tomáš Obšil Biofyzikální charakterizace fosducinu a jeho komplexu s vazebným partnerem – proteinem 14-3-3 [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Rukopis ke článku: Kacirova, M., Kosek, D., Kadek, A., Man, P., Vecer, J., Herman, P., Obsilova, V., Obsil, T. (2015) Structural Characterization of Phosducin and its Complex with the 14-3-3 Protein podanému v lednu 2015 do žurnálu Journal of Biological Chemistry. [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: 12th Discussions in Structural Molecular Biology, Nové Hrady, March 13-15, 2014. Abstract in Materials Structure, 21 (1), 36 (2014). M. Kacirova, P. Man, A. Kadek, T. Obsil Structural studies on Pdc/14-3-3 protein complex [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Čerpání finančních prostředků GAUK + položkový rozpis [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke kurzu: The 1st FEBS-Instruct crystallization course in the middle EU: Advanced methods in macromolecular crystallization VI, Nové Hrady, Jun 20-27, 2014. [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Abstrakt a poster ke konferenci: 38th FEBS-EMBO Congress, Paris, France, Aug 30 - Sep 4, 2014. Abstract in FEBS Journal, 281, 287 (2014). M. Kacirova, J. Novacek, L. Zidek, V. Obsilova, T. Obsil Investigation into Pdc behavior upon 14-3-3 binding using NMR, SAXS and Trp fluorescence quenching techniques [Jiný výsledek] |
Kacířová, Miroslava, Poster publikovaný na International Circular Dichroism User Group Meetingu, který se konal 11. 9. 2013 ve Warwicku. Poster obsahuje navíc výsledky z předešlých měření, které ještě nebyly řešeny a financovány z prostředků tohoto projektu č. 793913 GAUK. Výsledek z měření metodou NMR už byl financován z prostředků tohoto projektu č. 793913 GAUK. [Jiný výsledek] |
V. Obsilova, M. Kopecka, D. Kosek, M. Kacirova, S. Kylarova, L. Rezabkova, T. Obsil, Minireview v časopise Physiological Research s názvem "Mechanisms of the 14-3-3 protein function: regulation of protein function through conformational modulation". Článek je přijat k tisku. Měl by vyjít letos v lednu. [Jiný výsledek] |