PředmětyPředměty(verze: 945)
Předmět, akademický rok 2023/2024
   Přihlásit přes CAS
Struktura biologických makromolekul - MC250P10
Anglický název: Structure of biopolymers
Zajišťuje: Katedra biochemie (31-250)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2021
Semestr: letní
E-Kredity: 3
Způsob provedení zkoušky: letní s.:
Rozsah, examinace: letní s.:2/0, Zk [HT]
Počet míst: neomezen
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: nevyučován
Jazyk výuky: angličtina
Poznámka: povolen pro zápis po webu
Garant: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc.
Výsledky anket   Termíny zkoušek   Rozvrh   
Anotace -
Poslední úprava: SIMONAT (29.04.2002)
Struktura biologických makromolekul
Základy strukturní analýzy biopolymerů, metody popisu, srovnávání a predikce.
Proteiny a polypeptidy, sbalování a stabilita, evoluce, strukturní třídy. Nukleové kyseliny, nomenklatura. Polysacharidy, glykoproteiny a proteoglykany. Lignin. Supramolekulární struktury, viriony, priony. Podpůrné struktury. Přeměna chemické energie v mechanickou.
Literatura -
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (30.11.2020)

Voet G, Voetová JG: Biochemie, Victoria Publishing, Praha 1995
Hudeček J., Kalous V.: Fyzikálně chemická podmíněnost struktury bílkovin, Academia, Praha 1989

Nelson DL, Cox MM: Lehninger Principles of Biochemistry, WH Freeman and Co, N.Y. 2008, 7th Edition, 2017, 

Schulz GE, Schirmer RH: Principles of Protein Structure, Springer Verlag, N.Y. 1982, 

Saenger W: Principles of Nucleic Acid Structure, Springer Verlag, N.Y. 1984,

Brandén C, Tooze J: Introduction to Protein Structure, Garland N.Y., 1991, 2nd Edition Garland 1999

Creighton TE: Proteins: Structures and Molecular Properties. WH Freeman 1993 (2nd Ed.)

Kyte J: Structure in Protein Chemistry, Garland 1995

Harding SE, et al.. An Introduction to Polysaccharide Biotechnology, 2nd Ed., Kindle Ed. CRC Press, 2017,

Liljas L et al. Textbook of Structural Biology, 2009, 2nd Ed. 2016, World Scientific,

Cantor Cr, Schimmel PR: Biophysical Chemistry, Vol. I (Conformation of Biological Macromolecules), Vol III (Behavior of Biological Macromolecules) WH Freeman 1980.

 

 

Požadavky ke zkoušce -
Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (04.01.2010)

Zkouška: ústní. Okruhy otázek - viz sylabus.

Sylabus -
Poslední úprava: SIMONAT (30.04.2002)

1. Peptidy a globulární proteiny. Základní strukturní pojmy a charakteristiky. Metody popisu a znázornění struktury - vnitřní souřadnice, diedrální úhly, disanční a direkční matice. Hierarchizace struktury - primární, sekundární, terciární, kvartérní, pojetí komise IUB/IUPAC, klasické pojetí. Supersekundární struktura, strukturní motivy a domény. Strukturní klasifikace proteinů. Predikce a modelování struktury proteinů - základní metodické přístupy, limity a monnosti. Porovnávání sekvencí a struktur. Dynamika a sbalování nativní struktury, denaturace. Proteiny v extrémních podmínkách.Membránové proteiny.

2. Nukleové kyseliny. Základní pojmy, metody popisu. Vzájemné vztahy vnitřních souřadnic, metody přibližného popisu prostorové struktury. DNA, RNA - strukturní typy, párování bazí, strukturní charakteristiky dvoušroubovice, Z-DNA a trojšroubovice.

3. Polysacharidy. Základní popis, strukturní typy. Škrob, celulosa, heparin, pektiny.

4. Podpůrné struktury. Obecné principy struktury biologických stavebních prvků. Vláknité bílkoviny - fibriny, kolageny, keratiny, fibroin. Proteoglykany. Lignin.

5. Přeměna chemické energie na mechanickou. Svalové bílkoviny. Bičíky a řasinky.

 
Univerzita Karlova | Informační systém UK