Fylogeografie a metody historické biogeografie - MB170P97

• Anglický název: Phylogeography and methods of Historical Biogeography
• Český název: Fylogeografie a metody historické biogeografie
• Zajišťuje: Katedra zoologie (31-170)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2014
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 5
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/2, Z+Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. RNDr. Pavel Hulva, Ph.D.
• Vyučující: doc. RNDr. Pavel Hulva, Ph.D.

Anotace

čeština

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Předmět by měl kombinovat zevrubnou metodickou informaci o technikách (molekulární) fylogeografie s analogickými
informacemi týkajícími se biogeografických souvislostí paleontologické evidence a metodickými aspekty kontextuální
informace paleoklimatické. Zásadním aspektem kursu by byla praktická cvičení soustředěná na seznámení s příslušnými
softwarovými prostředky.

angličtina

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (25.10.2019)

The course should combine comprehensive methodological information on (molecular) phylogeography techniques with analogous ones information concerning the biogeographical context of paleontological evidence and contextual methodological aspects paleoclimatic information. An essential aspect of the course would be practical exercises focused on familiarization with the relevant software.

Literatura

čeština

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Avise J.C. 2000. Phylogeography: The History and Formation of Species.Harvard University Press.

Bradley R.S. 1999. Palaeocliomatology. Elsevier , San Diego- NY.

Crisci J.V. et al., 2003: Historical Biogeography. Harvard University Press.

Software Analysis in Macroecology, manual.

angličtina

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (24.10.2019)

Avise J.C. 2000. Phylogeography: The History and Formation of Species.Harvard University Press.

Bradley R.S. 1999. Palaeocliomatology. Elsevier , San Diego- NY.

Crisci J.V. et al., 2003: Historical Biogeography. Harvard University Press.

Software Analysis in Macroecology, manual.

Sylabus

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (10.05.2012)

Blok 1 - Fylogeografie: Tradiční postupy kvantitativní historické biogeografie (kladistická analýza apod.), specifika molekulárních markerů, historie výzkumu mitochondriální DNA, jaderné geny, molekulání hodiny, spojení demografie s fylogenetikou, lineage sorting, koalescenční teorie, dynamika vývoje populační velikosti, skyline ploty, nested-clade analysis, fylogeografické hypotézy, empirické studie, speciace

Blok 2 - Kvantiativní areografie fosilního záznamu. Získávání paleonvironmentální a paleobiogeografické informace, charakter dat, inference paleobiogeografické informace.

Blok 3 - Klimatická a paleoklimatická data, proměné a klasifikační systémy globální klimatologie, strukutra databasí a softwarových prostředků areálové analýzy a (S.A.M., apod.).