|
|
|
||
Poslední úprava: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D. (22.10.2020)
U vybraných nejběžnějších metod (RNA-seq, ChIP-seq, sekvenování genomů a variant calling atd.) bude detailně vysvětlen design experimentů a laboratorní i bioinformatická část metody. Na praktických cvičeních si pak studenti vyzkouší práci se sekvenačními daty a typické analytické postupy. Pro praktická cvičení se předpokládá základní znalost práce v linuxu a na příkazové řádce (na individuální doplnění potřebných znalostí bude čas v průběhu semestru; praktikum probíhá turnusově až ve zkouškovém období). Kurz je primárně určený pro studenty bioinformatiky. Biologům doporučujeme absolvovat spíše předmět Methods in Genomics (MB151P129). V době epidemiologických omezení bude kurz probíhat online na https://meet.google.com/icu-cjis-yep ve standardní rozvrhovaný čas. (popř. https://meet.google.com/aue-dhup-joq pro přednášky P. Daněčka) |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D. (28.05.2019)
Materiály z přednášek a cvičení reflektující aktuální vývoj v oboru. Dostupné v Moodle. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D. (15.02.2021)
zápočet - aktivní účast na turnusovém praktickém cvičení zkouška - schopnost aplikovat informace z přednášek bude ověřena ústní a písemnou formou (např. řešení modelových situací)
Kvůli pandemii probíhá zkoušení online na platformě Google Meet. Dodatečné termíny budou v letním semestru vypisovány dle potřeby po dohodě se studenty. |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D. (25.03.2019)
Microarrays
Turnusové praktické cvičení je zaměřeno na analýzy NGS dat |
|
||
Poslední úprava: RNDr. Martin Převorovský, Ph.D. (28.05.2019)
Pro praktická cvičení v počítačové učebně je nutné mít funkční login do CAS (https://ldap1.cuni.cz/). |