Single molecule microscopy and manipulation - practical course - MB151C01E

• Anglický název: Single molecule microscopy and manipulation - practical course
• Český název: Mikroskopie a manipulace jednotlivých molekul – praktický kurz
• Zajišťuje: Sekce biologie (31-101)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2023
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/1, Z [TS]
• Počet míst: 8
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Vysvětlení: Please register first at the webpage of the course.Selected participants will add this course to their list of subjects later.
• Další informace: http://web.natur.cuni.cz/IMCF/SMMM/
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Zdeněk Lánský, Ph.D.; Mgr. Aleš Benda, Ph.D.
• Vyučující: Mgr. Aleš Benda, Ph.D.; Marcus Braun, Ph.D.; RNDr. Zdeněk Lánský, Ph.D.; Ing. Dalibor Pánek, Ph.D.; Ing. Petra Prokšová, Ph.D.

Anotace

čeština

Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (24.10.2019)

Kurz zahrnuje tradiční metody pozorování jednotlivých molekul pomocí širokoúhlé mikroskopie založené na TIRF a konfokální mikroskopie kombinované se spektrální a excitovanou detekcí celoživotního stavu. Manipulace s jednou molekulou, včetně měření síly a konfokálního zobrazování manipulovaných molekul, se provádí pomocí optických pinzet. Metodiky zahrnují sledování jednotlivých částic a různé modifikace fluorescenční korelační spektroskopie.

angličtina

Poslední úprava: Mgr. Aleš Benda, Ph.D. (15.10.2018)

Recording a single molecular motor protein walking along a microtubule or following diffusion of proteins in living cells became almost routine tasks, allowing to get insights into molecular interactions of biomolecules. Single molecule microscopy and manipulation practical course focuses on optical based methods of detection, characterization and even manipulation of single molecules. The aim is to highlight the uniqueness of single molecule based methods for uncovering the mechanisms of molecular interactions in biophysics, but also to show participants the real laboratory world of single molecule experiments.
The course covers traditional methods of single molecule observation using TIRF based wide-field microscopy and confocal microscopy combined with spectral and excited state lifetime resolved detection. The single molecule manipulation, including force measurement and confocal imaging of the manipulated molecules, is performed using the optical tweezers. The methodologies covered include single particle tracking and various modifications of fluorescence correlation spectroscopy.

Literatura

čeština

Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (06.06.2022)

Single-Molecule Techniques: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press 2008, ISBN  978-087969775-4

Handbook of Single-Molecule Biophysics, Springer New York 2009, ISBN 978-1-4939-3919-0

Požadavky ke zkoušce

čeština

Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (24.10.2019)

Aktivní účast na kurzu (max. 1 den nepřítomnosti - kromě pondělí) plus krátká 3minutová prezentace vlastní práce nebo budoucích plánů.

angličtina

Poslední úprava: Mgr. Aleš Benda, Ph.D. (07.10.2019)

Active participation at the course (max. 1 day of absence - excluding Monday) plus short 3 min presentation of your own work or future plans.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: Mgr. Marie Olšinová, Ph.D. (09.10.2021)

http://web.natur.cuni.cz/IMCF/SMMM/programme.html

Vstupní požadavky

čeština

Poslední úprava: RNDr. Nataša Šebková, Ph.D. (24.10.2019)

Kurz je určen pro studenty magisterského a doktorského studia.

angličtina

Poslední úprava: Mgr. Aleš Benda, Ph.D. (21.09.2017)

The course is intended for magister and doctoral students.