PředmětyPředměty(verze: 945)
Předmět, akademický rok 2023/2024
   Přihlásit přes CAS
Mikroskopie a manipulace jednotlivých molekul – praktický kurz - MB151C01
Anglický název: Single molecule microscopy and manipulation - practical course
Český název: Mikroskopie a manipulace jednotlivých molekul – praktický kurz
Zajišťuje: Katedra buněčné biologie (31-151)
Fakulta: Přírodovědecká fakulta
Platnost: od 2022
Semestr: zimní
E-Kredity: 3
Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
Rozsah, examinace: zimní s.:0/1, Z [TS]
Počet míst: 16
Minimální obsazenost: neomezen
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Stav předmětu: zrušen
Jazyk výuky: čeština
Poznámka: povolen pro zápis po webu
Garant: RNDr. Zdeněk Lánský, Ph.D.
Mgr. Aleš Benda, Ph.D.
Výsledky anket   Termíny zkoušek   Rozvrh   
Anotace - angličtina
Poslední úprava: Mgr. Aleš Benda, Ph.D. (19.06.2017)
Single molecule microscopy and manipulation practical course focuses on optical based methods of detection, characterization and even manipulation of single molecules. The aim is to highlight the uniqueness of single molecule based methods for uncovering the mechanisms of molecular interactions in biophysics, but also to show participants the real laboratory world of single molecule experiments.
The course covers traditional methods of single molecule observation using TIRF based wide-field microscopy and confocal microscopy combined with spectral and excited state lifetime resolved detection. The single molecule manipulation, including force measurement and confocal imaging of the manipulated molecules, is performed using the optical tweezers. The methodologies covered include single particle tracking and various modifications of fluorescence correlation spectroscopy.
Sylabus - angličtina
Poslední úprava: Mgr. Aleš Benda, Ph.D. (19.06.2017)

Day 1

9:00 – 16:00  Theory

- Introduction to single molecule techniques (TIRFm single molecule visualization, optical tweezers, FCS)

- Introduction to molecular motors and diffusible microtubule-associated proteins

- Introduction to data analysis

 

Day 2-5:

9:00 – 14:00 Experimental sections – each group of 4 one section per day

14:00 – 17:00 Data analysis (tracking of single molecules, calculation of velocity, mean square displacement and diffusion constant, force time-traces analysis, autocorrelation analysis, etc…)

 

Section 1 – TIRF 1

- Imaging of single kinesin motors walking along microtubules (at different ATP concentrations -> different velocity)

 

Section 2 – TIRF 2

- Measurement of forces exerted by single kinesin molecule (visualizing single steps, measuring stall force, describing force-velocity relationship)

 

Section 3 - optical tweezers

- Imaging of single diffusible microtubule crosslinkers (at different salt concentrations -> different diffusion constant)

 

Section 4 - FCS

- Measuring concentrations and diffusion coefficients of various molecules in solution at different conditions (temperature, viscosity), quantifying molecular interaction using fluorescence cross-correlation analysis, counting and sorting single molecules.

 
Univerzita Karlova | Informační systém UK