Praktikum z molekulární biologie a virologie - MB140C77

• Anglický název: Molecular biology and virology practical training course
• Český název: Praktikum z molekulární biologie a virologie
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2022
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/1, Z [TS]
• Počet míst: 18
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Úroveň: specializační
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
• Vyučující: Mgr. Martin Fraiberk, Ph.D.; RNDr. Lenka Horníková, Ph.D.; Boris Rjabčenko, Ph.D.; Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
• Třída: Horizontální laminární box 120 cm; Biohazard laminární box 200 cm; Stolní chlazená centrifuga univerzální se více rot; Invertovaný mikroskop s fluorescenční kamerou; Elektroforéza DNA horizontální; Zdroj napětí na elektroforézu; Pipetmany (sada); Termoblok; Mikrocentrifuga stolní; Mikrocentrifuga malá; Dataprojektor; Mikroskop badatelský

Anotace

čeština

Poslední úprava: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. (08.01.2024)

INFORMACE PRO LETNÍ SEMESTR 2023/2024

Praktikum probíhá jako týdenní praktický kurz.
Je naplánován od 20.5. do 24.5.2024, v místnosti praktika v BIOCEVu vždy od 9:00 hod.

S pozdravem
Vojtěch Šroller a kol.

Moodle - Praktikum molekulární biologie a virologie MB140C77
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=3944

Týdenní turnusový kurz z molekulární biologie a virologie poskytuje praktický a teoretický nácvik laboratorních
metod z molekulární biologie a virologie. Vybrané úlohy umožňují studentům se seznámit jak se základními
metodami (jako izolace DNA, gelová elektroforéza) tak i s metodami pokročilejšími, které jsou používány ve
výzkumných a diagnostických laboratořích věnující se biomedicínskému výzkumu (např. Elektronová mikroskopie,
PCR, sekvenování). Laboratorní kurz je vhodný především pro studenty se zaměření na molekulární biologii a
virologii.

angličtina

Poslední úprava: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. (08.01.2024)

One week course from molecular biology and virology provides both practical and theoretical training in laboratory
methods from molecular biology and virology. The selected experiments allow students to practice not only basic
methods (like DNA isolation, gel electrophoresis) but also methods more advances, which are used in biomedical
research and diagnostics laboratories (like electron microscopy, PCR, sequencing). Laboratory course is well
suited for students interested in molecular biology and virology.

Literatura

čeština

Poslední úprava: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. (25.10.2019)

Brown T.A. (2006, 2010) Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction; Willey-Blackwell

Sambrook J., Russell D.W., (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press

Vondrejs V. (1997, 2001, 2003), Genové inženýrství I-III, Karolinum

Požadavky ke zkoušce

čeština

Poslední úprava: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. (30.08.2019)

Zápočet na základě odevzdaných protokolů

angličtina

Poslední úprava: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D. (30.08.2019)

credit based on written protocols

Sylabus

čeština

Poslední úprava: RNDr. Irena Lichá, CSc. (26.05.2017)

Úlohy řešené v průběhu praktik:

1. Izolace DNA, RNA a proteinů z buněčné linie myších buněk, měření jejich množství a čistoty (spektrofotometrie).

2. Izolace bakteriálních vektorů, vizualizace na gelové elektroforéze, restrikční analýza, metody klonování genů.

3. Detekce virus-specifických protilátek v prasečím séru pomocí hemaglutinačního a neutralizačně inhibičního testu.

4. Vizualizace pseudovirionů pomocí elektronové mikroskopie.

5. Izolace a detekce virové DNA z povrchu kůže za použití metod amplifikace rolujícím kruhem, amplifikace PCR (multiplex), sekvenace a identifikace získané DNA porovnáním s databázemi.

angličtina

Poslední úprava: RNDr. Irena Lichá, CSc. (26.05.2017)

The work schedule of practical course:

1. Isolation of DNA, RNA and proteins from mouse cell line, measuring concentration and purity (spectrophotometry)

2. Isolation of bacterial plasmid DNA, visualization on gel electrophoresis, restriction analysis, methods for cloning of genes.

3. Detection of virus specific antibodies in pigs’ sera, using hemagglutination and neutralization inhibition test.

4. Visualization of pseudovirions by electron microscopy.

5. Isolation and detection viral DNA from skin using methods rolling cycle amplification, PCR multiplex amplification, sequencing and identification of DNA by computer analysis.