IE - Biostatistika - CMEDBS12

• Anglický název: IE - Biostatistic
• Zajišťuje: Ústav hygieny 3. LF UK (12-HYG)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2016
• Semestr: zimní
• Body: 1
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/20, Jiné [HS]
• Rozsah za akademický rok: 20 [hodiny]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Další informace: http://www1.szu.cz/stat/lf3uk
• Garant: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc.; RNDr. Marek Malý, CSc.
• Kategorizace předmětu: Lékařství > Klinické předměty
• Atributy: Modul IE

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

Dílčí kurz modulu IE. Úvod do použití statistických metod v mdedicíně.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

A part of Module IE. An introduction to statistical methods in medicine and epidemoilogy.

Cíl předmětu

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

Předmět je zaměřen na seznámeni studentů s principy použití matematicko-statistických metod v medicíně. Vysvětluje principy statistické indukce, základní statistické metody a interpretací výsledků statistických analýz běžně používaných v lékařské literatuře.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

The course is intended to provide students with an introduction to the principles of modern biostatistical methods and their applications in medicine, epidemiology and biomedical research. The emphasis is on interpretation and concepts rather than calculations or mathematical details. An objective is to provide students with an ability to read the scientific literature in order to critically evaluate study designs and methods of data analysis.

Basic concepts of statistical inference including hypothesis testing, p-values, and confidence intervals will be introduced. Specific topics will include comparisons of means and proportions, regression and correlation, measures of association, and confounding. Application to real data from various studies in public health and clinic research are used to illustrate the biostatistical methods.

Literatura

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

B.Procházka: Biostatistika pro lékaře - principy základních metod a jejich interpretace. Karolinum, Praha 1999.

Doplňkové literatura:

J.Hendl: Přehled statistických metod zpracování dat. Portál, Praha 2004

J.Zvárová: Základy statistiky pro biomedicínské obory. Karolinum, Praha 1998.

V.Bencko, K.Hrach, M.Malý, P.Pikhart, J.Reissigová, Š.Svačina, M.Tomečková, J.Zvárová: Statistické metody v epidemiologii. Karolinum, Praha 2003.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

LITERATURE

ARMITAGE, P., BERRY, G. (1991). Statistical Methods in Medical Research. Blackwell Scientific Publications, Oxford.

BEAGLEHOLE, R., BONITA, R., KJELLSTRÖM, T. (1993). Basic Epidemiology. WHO, Geneva.

BRESLOW, N.E., DAY, N.E. (1980). Statistical Methods in Cancer Research, vol. 1 - The analysis of case-control studies. IARC, Lyon.

BRESLOW, N.E., DAY, N.E. (1987). Statistical Methods in Cancer Research, vol. 2 - The design and analysis of cohort studies.

COGGON, D., ROSE, G., BARKER, D.J.P. (1997). Epidemiology for the Uninitiated. BMJ Publishing Group, http://www.bmj.com/collections/epidem/epid.dtl

COLTON, T. (1974). Statistics in Medicine. Little, Brown and Co., Boston.

DALY, L.E., BOURKE, G.J., McGILVRAY, J. (1992). Interpretation and Uses of Medical Statistics. Blackwell Scientific Publications, Oxford.

DANIEL, W.W. (1995). Biostatistics: A Foundation for Analysis in the Health Sciences. Wiley, New York.

HENNEKENS, CH. H., BURING, J. (1987). Epidemiology in Medicine. Little, Brown and Co., Boston.

JEWELL, N.P. (2004). Statistics for Epidemiology. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton.

KAHN, H.A., SEMPOS, CH. T. (1989). Statistical Methods in Epidemiology. Oxford University Press, Oxford.

KIRKWOOD, B.R. (1992). Essentials of Medical Statistics. Blackwell Scientific Publications, Oxford.

ROSNER, B.A. (1995). Fundamentals of Biostatistics. Duxbury Press, Belmont.

ROTHMAN, K.J., GREENLAND, S. (1998). Modern Epidemiology, 2nd ed. Lippincott-Raven Publishers, Philadelphia.

dos SANTOS SILVA, I. (1999). Cancer Epidemiology: Principles and Methods. International Agency for Research on Cancer, Lyon.

SWINSCOW, T.D.V. (1997). Statistics at Square One. BMJ Publishing Group, http://www.bmj.com/collections/statsbk/index.dtl

WASSERTHEIL-SMOLLER, S. (1990). Biostatistics and Epidemiology; a Primer for Health Professionals. Springer Verlag, N.York.

WOODWARD, M. (2005). Epidemiology: Study Design and Data Analysis. 2nd ed. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton.

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

Semináře, praktická cvičení

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

Seminars, practicals

Sylabus

čeština

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

Sylabus předmětu BIOSTATISTIKA pro třetí semestr 3.LF UK

Přednášky 0

Semináře 10 hod.

Praktická cvičení 10 hod.

Co je to statistika, význam statistiky ve zdravotnictví, popisná a induktivní statistika. Základní principy používané v matematické statistice, základní soubor a výběr.

Typy veličin analyzovaných prostředky matematické statistiky. Co je rozložení veličin a jeho různé typy.

Základní popisné charakteristiky. Bodové i intervalové odhady. Testování hypotéz. Principy statistických testů a jejich interpretace.

Základní statistické modely porovnání průměrů. Neparametrické testy. regresní analýza, korelace, základy analýzy kontingenčních tabulek. Zmínka o dalších statistických modelech: mnohorozměrná analýza.

Kontingenční tabulky a nástroje jejich analýzy - chi-kvadrát, Fisherův , McNemarův a M-H test. Základní typy studií používané v epidemiologii a jejich matematický model. křížový poměr, relativní riziko a další charakteristiky v průřezové, kohortové a 'případ-kontrola' studii, omezená použitelnost jednotlivých charakteristik.

Matematické aspekty plánování studií, representativnost výběru. Rušivé faktory a jejich kontrola (vyloučení rušivých vlivů). Stratifikace a standardizace pro správnou interpretaci získaných výsledků.

Hodnocení diagnostických, screeningových testů (sensitivita a specificita). Základní informace o dalších používaných metodách (např. logaritmicko-lineární modely, logistická regrese, analýza přežití).

Seznámení s možnostmi statistických analýz v MS Office a s volně šiřitelnými systémy pro analýzu dat EpiInfo. Praktické příklady použití těchto programů pro statistickou analýzu.

Diskuse o vybraných článcích z oblasti lékařských publikací a o problémech spojených s interpretací statistických výpočtů.

angličtina

Poslední úprava: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc. (28.05.2008)

B i o s t a t i s t i c s - syllabus

3rd Medical Faculty, 2nd year, 1st term

SEMINARS

1. Statistical concepts and terms

Historical remarks, statistics in medical sciences

Logic of statistical reasoning (observations vs hypotheses)

Important steps in the application of statistics

Types of variables

Descriptive statistics (location, variability)

Probability, distribution

Population - sample, sampling techniques

Representativity of the sample

Point and interval estimation, standard error

Confidence interval

2. Statistical inference and testing (continuous variables)

Principles of statistical testing

Statistical hypothesis and significance level

One-sided and two-sided hypotheses

One-sample, two-sample, and paired tests

Parametrical and non-parametrical tests

Testing hypotheses concerning the mean (t-test, Wilcoxon test)

Introduction to multivariate methods, analysis of variance (ANOVA)

Interpretation of results of statistical procedures

3. Statistical concepts used in epidemiology (categorical variables)

Contingency and 2-by-2 tables and methods for comparison of proportions

Chi-square test, Fisher and McNemar tests, test for trend

Basic types of studies used in epidemiology and related statistical models for their evaluation

Vital statistics, rates and ratios

Odds ratio, relative risk, attributable risk for cross-sectional, cohort, and case-control study

Confounding, bias, precision

Methods of standardization and stratification, Mantel-Haenszel technique

Evaluation of diagnostic and screening tests (sensitivity and specificity, cut-off point)

4. Advanced statistical methods

Association between two variables: correlation, regression

Advanced statistical methods in epidemiology

logistic regression

censored data

survival analysis

Mathematical tools for planning surveys and experiments,

sample size determination

PRACTICALS

1. Statistical concepts: types of variables, probability distribution (binomial, Poisson, normal), population and sample, sampling methods, characteristics of location and variability, standard error, histogram, point and interval estimation, confidence interval

2. Statistical inference: testing statistical hypotheses, p-value, significance level

Statistical tests for continuous variables: t-test and Wilcoxon test (one-sample, two-sample, paired), analysis of variance (ANOVA), F-test

3. Statistical tests for categorical variables: contingency table, chi-square test, McNemar test, test for trend

Statistical methods in epidemiology: epidemiological measures of risk and corresponding confidence intervals, interpretation

4. Statistical association: linear regression, correlation, logistic regression

Planning surveys: sample size determination

Practical use of statistics: statistical packages, statistics in published papers