ERASMUS - Biostatistika - CERA2P0036

• Anglický název: ERASMUS - Biostatistics
• Zajišťuje: Ústav hygieny 3. LF UK (12-HYG)
• Fakulta: 3. lékařská fakulta
• Platnost: od 2015
• Semestr: zimní
• Body: 1
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:8/12, Z(+Zk) [HS]
• Počet míst: neurčen / neurčen (neurčen)
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Způsob výuky: prezenční
• Způsob výuky: prezenční
• Další informace: http://www1.szu.cz//stat/lf3uk
• Garant: doc. RNDr. Bohumír Procházka, CSc.; RNDr. Marek Malý, CSc.

Anotace

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Úvod do použití statistických metod v medicíně.

Cíl předmětu

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Předmět je zaměřen na seznámeni studentů s principy použití matematicko-statistických metod v medicíně. Vysvětluje principy statistické indukce, základní statistické metody a interpretací výsledků statistických analýz běžně používaných v lékařské literatuře. Tyto znalosti jsou základem pro správné pochopení principů mediciny založené na důkazu (evidence based medicine).

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Požadavky na zápočet z předmětu BIOSTATISTIKA pro třetí semestr na magisterském stidiu na 3.LF UK

SEMINÁŘE

1.      Účast na praktických cvičeních

Student se zúčastní alespoň čtyř z 6 praktických cvičení. Pokud student na praktickém cvičení zodpoví některou z otázek ze závěrečných testů bezchybně, obdrží bod a za ten se sníží požadavek na počet správných odpovědí v závěrečném testu.

2.      Absolvování testu

Test bude obsahovat dvě skupiny dvojic otázek.

-          Dvě "teoretické otázky" na vysvětlení statistických pojmů viz.otázky k testům na http://www1.szu.cz//stat/lf3uk .

-          Jednu otázku na praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů.

Student samostatně připraví písemnou odpověď na tyto otázky. Při odevzdání výsledku testu případně vysvětlí nejasnosti v odpovědi. Každý student musí pro uznání zápočtu odpovědět alespoň dvě otázky správně. Při získání výše zmíněného bodu v průběhu praktických cvičení se požadavek správných odpovědí sníží na jednu (body se nekumulují!).

Termín pro opakované, či odložené přezkoušení bude dohodnuto s vyučujícím dle jeho časových možností.

Literatura

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Literatura

B.Procházka: Biostatistika pro lékaře - principy základních metod a jejich interpretace. Karolinum, Praha 1999, ISBN 80-7184-987-1.

V Tisku:

B.Procházka: Biostatistika pro lékaře - principy základních metod a jejich interpretace s využitím statistického systému R. LF3 UK, Karolinum, Praha 2014, ISBN 978-80-246-2782-3.

B.Procházka: Biostatistika do kapsy pro lekaře. LF3 UK, Karolinum, Praha 2014, ISBN 978-80-246-2783-0.

Další texty:
J.Hendl:  Základní teorie,metody a aplikace. Portál, Praha 2012
J.Zvárová: Základy statistiky pro biomedicínské obory. Karolinum, Praha 1998.
V.Bencko, K.Hrach, M.Malý, P.Pikhart, J.Reissigová, Š.Svačina, M.Tomečková, J.Zvárová: Statistické metody v epidemiologii. Karolinum, Praha 2003.
P.Kasal, Š.Svačina a kolektiv: Lékařská informatika. Karolinum, Praha 1998.
K.Zvára: Biostatistika. Karolinum, Praha 1998.
M.Meloun, J.Militký: Statistické zpracování experimentálních dat. Plus s.r.o., Praha, 1994.

Metody výuky

čeština

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Přednášky, praktika.

angličtina

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Seminars, practicals

Sylabus

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Sylabus předmětu BIOSTATISTIKA pro třetí semestr 3.LF UK

PŘEDNÁŠKY

1.      Úvod do biostatistiky

-          Co je to statistika, význam statistiky ve zdravotnictví, popisná a induktivní statistika.

-          Základní principy používané v matematické statistice etapy statistického šetření, základní soubor a výběr.

-          Typy veličin analyzovaných prostředky matematické statistiky.

-          Co je rozložení těchto veličin a různé typy rozložení.

-           Základní popisné charakteristiky.

2.      Odhady a testy

-          Bodové i intervalové odhady. Testování hypotéz. Principy statistických testů a jejich interpretace.

-          Základní statistické modely porovnání průměrů. Neparametrické testy.

-          regresní analýza, korelace, základy analýzy kontingenčních tabulek.

-          Zmínka o dalších statistických modelech: mnohorozměrná analýza, cenzorovaná data.

3.      Statistické nástroje pro epidemiologii

-          Kontingenční tabulky a nástroje jejich analýzy - c², Fisherův , McNemarův a Mantel-Haenszel test.

-          Základní typy studií používané v epidemiologii a jejich matematický  model. křížový poměr, relativní riziko a další charakteristiky  v průřezové, kohortové a 'případ-kontrola' studii, omezená použitelnost jednotlivých charakteristik.

-          Hodnocení diagnostických, screeningových testů (sensitivita a specificita).

4.      Rušivé vlivy a representativnost

-          Matematické nástroje pro plánování studií, representativnost výběru.

-          Rušivé faktory a jejich kontrola (vyloučení rušivých vlivů).

-          Stratifikace a standardizace pro správnou interpretaci získaných výsledků.

-          Základní informace o dalších používaných metodách (např. logaritmicko-lineární modely, logistická regrese, analýza přežití).

PRAKTICKÁ CVIČENÍ

1.	Procvičení pojmů z přednášek Úvod, diskuse o významu biostatistiky, rozdělení příkladů pro jednotlivé skupiny. Procvičení pojmů ze semináře a diskuse o nich.
2.	Využívání softwarových nástrojů Seznámení s možnostmi statistických analýz v MS Office a s volně šiřitelnými systémy pro analýzu dat EpiInfo (v6 a 2002) a R. Praktické příklady použití těchto programů.
3.	Statistika v lékařských článcích Diskuse o vybraných článcích. Procvičení pojmů ze semináře a diskuse o nich. Praktické procvičení probraných pojmů, jejich zopakování a souhrn.
4.	Využívání softwarových nástrojů Seznámení s možnostmi statistických analýz v programu R. Praktické příklady použití tohoto programu.
5.	Příklady špatného použití statistiky Reálné příklady chyb při použití a interpretaci statistických nástrojů. Zopakování témat z přednášek.
6.	Závěrečný test

 

Podmínky zakončení předmětu

Poslední úprava: Ondřej Kubánek (04.11.2014)

Požadavky na zápočet z předmětu BIOSTATISTIKA pro třetí semestr na magisterském stidiu na 3.LF UK

SEMINÁŘE

1.      Účast na praktických cvičeních

Student se zúčastní alespoň čtyř z 6 praktických cvičení. Pokud student na praktickém cvičení zodpoví některou z otázek ze závěrečných testů bezchybně, obdrží bod a za ten se sníží požadavek na počet správných odpovědí v závěrečném testu.

2.      Absolvování testu

Test bude obsahovat dvě skupiny dvojic otázek.

-          Dvě "teoretické otázky" na vysvětlení statistických pojmů viz.otázky k testům na http://www1.szu.cz//stat/lf3uk .

-          Jednu otázku na praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů.

Student samostatně připraví písemnou odpověď na tyto otázky. Při odevzdání výsledku testu případně vysvětlí nejasnosti v odpovědi. Každý student musí pro uznání zápočtu odpovědět alespoň dvě otázky správně. Při získání výše zmíněného bodu v průběhu praktických cvičení se požadavek správných odpovědí sníží na jednu (body se nekumulují!).

Termín pro opakované, či odložené přezkoušení bude dohodnuto s vyučujícím dle jeho časových možností.