Přednášky během podzimu 2021 budou přednášeny prezenčně v ÚOCHB ČAV v Dejvicích, Flemingovo nám. 2, 166 10 v učebně jež Vám bude specifikována emailem. Před každou přednáškou bude studentům emailem zaslána pdf verze přednášky.
V této sérii přednášek budou probrány chemické vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů, způsoby jejich
chemické syntézy, chemická příprava jejich derivátů a mimetik, kombinatorické metody syntézy a využití knihoven
peptidů, specifické chemické modifikace a značení peptidů a proteinů, příprava a použití biokonjugátů peptidů a
proteinů a přehled terapeuticky využívaných peptidů a proteinů.
Poslední úprava: Jiráček Jiří, RNDr., CSc. (13.09.2021)
During the fall 2021, the lectures will be given live in UOCHB Flemingovo nám. 2, 16610 in the seminary room that will be specified later by an email. Prior each lecture, students will receive by email the pdf of the next lecture.
In the series of lectures we will describe the chemical properties of amino acids, peptides and proteins, different
techniques of their chemical synthesis and the chemical synthesis of their derivatives and mimetics, combinatorial
synthesis and use of peptide libraries, specific modifications and labeling of peptides and proteins, synthesis and
use of bioconjugates of peptides and proteins and the overview of therapeutically used peptides and proteins.
Poslední úprava: Jiráček Jiří, RNDr., CSc. (13.09.2021)
Literatura -
Přednášky připravené vyučujícími, a například Synthesis of Peptides and Peptidomimetics (Houben-Weyl), Chemistry of Bioconjugates (Ravin Narain), The Organic Chemistry of Biological Pathways (McMurry a Begley), Peptidomimetics in Organic and medicinal Chemistry (Trabocchi a Guarna), Peptide-Based Drug Design (Otvos), Chemical Modification of Biological Polymers (Lundblad), vědecké články a jiné zdroje.
Poslední úprava: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (27.03.2019)
Lectures (slides) prepared by the lecturers and provided to students prior the lectures, and for example Synthesis of Peptides and Peptidomimetics (Houben-Weyl), Chemistry of Bioconjugates (Ravin Narain), The Organic Chemistry of Biological Pathways (McMurry and Begley), Peptidomimetics in Organic and medicinal Chemistry (Trabocchi and Guarna), Peptide-Based Drug Design (Otvos), Chemical Modification of Biological Polymers (Lundblad), scientific articles and others.
Poslední úprava: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (27.03.2019)
Požadavky ke zkoušce
Podmínkou pro udělení zápočtu je nejméně 50% účast na přednáškách a úspěšné napsání zápočtové písemné práce.
Poslední úprava: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (13.09.2022)
Sylabus -
Chemie biochemicky zajímavých peptidů a proteinů
Seznam přednášek:
1. Úvod do struktury a vlastností aminokyselin, peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková)
Struktura a vlastnosti aminokyselin, peptidů a proteinů, pKa, pI, reaktivita, funkční skupiny, Ramachandranův plot, hydrofobicita, aromaticita, chiralita, cis-trans atd.
2. Chemie a syntéza aminokyselin a jejich derivátů (přednášející Jiří Jiráček)
Chemická a enzymatická příprava derivátů aminokyselin
3. Chemická syntéza peptidů a proteinů - I (přednášející Jiří Jiráček)
syntéza peptidů a proteinů obecně a v roztoku, činidla, chránicí skupiny, cyklické peptidy, nativní ligace.
4. Chemická syntéza peptidů a proteinů - II (přednášející Lenka Žáková)
Syntéza na pevné fázi, úvod do SPS
5. Chemická syntéza peptidů a proteinů - III (přednášející Jiří Jiráček)
Syntéza na pevné fázi, speciální metody, automaty
6. Vedlejší reakce peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková)
Např. chemická degradace, formace aspartimidů, štěpení, racemizace, modifikace specifickými činidly (CNBr, iodoacetamid, oxidace, redukce) atd.
7. Kombinatorická syntéza peptidů (přednášející Jiří Jiráček)
Syntetické peptidové knihovny a jejich použití.
8. Semisyntéza peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková)
Využití přírodních molekul pro syntézu derivátů, enzymová semisyntéza
9. Peptidomimetika a proteomimetika (přednášející Jiří Jiráček)
Syntéza a využití látek mimikujících struktury a vlastnosti, např. také pseudopeptidy, peptoidy.
10. Chemické modifikace peptidů a proteinů (přednášející Lenka Žáková).