Evoluční cytogenomika rostlin - MB120P131

• Anglický název: Evolutionary plant cytogenomics
• Český název: Evoluční cytogenomika rostlin
• Zajišťuje: Katedra botaniky (31-120)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2011
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. Mgr. Martin A. Lysák, Ph.D.
• Vyučující: doc. Mgr. Martin A. Lysák, Ph.D.; RNDr. Terezie Mandáková, Ph.D.

Anotace

čeština

Posluchači získají základní informace o struktuře a evoluci karyotypu rostlin, mechanismech chromozomových
přestaveb a jejich roli v evoluci rostlin. Součástí kursu je přehled klasických a moderních cytogenetických metod
používaných v (karyo)systematice rostlin. Na přednášku navazuje praktické cvičení.

Poslední úprava: Kubátová Alena, RNDr., CSc. (12.04.2011)

angličtina

Students will gain basic information on the karyotype structure and evolution in plants, on mechanisms of
chromosome rearrangements and their evolutionary role. An overview of classical and modern cytogenetic
methods used in (karyo)systematics is included. The lectures are followed by a practical course of molecular
cytogenetic techniques.

Poslední úprava: Kubátová Alena, RNDr., CSc. (12.04.2011)

Literatura

Levin DA ( 2002) The role of chromosomal change in plant evolution.Oxford University Press. Oxford. New York, pp.230.

Brown TA (2007) Genomes 3. GS Garland Science. New York. London. pp. 713.

Schwarzacher T, Heslop-Harrison P (2000) Practical in situ hybridization. BIOS Scientific Publishers Limited.Oxford. pp.203.

Další literatura (shrnující články v AJ) budou studentům zpřístupněny vždy na začátku kurzu.

Poslední úprava: Kubátová Alena, RNDr., CSc. (26.04.2012)

Požadavky ke zkoušce

písemný test v rámci navazujícího praktického cvičení

Poslední úprava: Lysák Martin A., doc. Mgr., Ph.D. (11.01.2012)

Sylabus

čeština

1. Karyosystematika: historie a současnost. Fylogenomika.

2. Chromatin (mj. eu- a heterochromatin, repetitivní DNA, epigenetické modifikace DNA). Struktura chromozomu (centromera, telomery, ribozomální DNA). Typy chromozomů (B chromozomy, pohlavní chromozomy, holokinetické chromozomy).

3. Genom a karyotyp. Srovnávací cytogenomika (genomová a chromozomová kolinearita). Mechanismus chromozomových přestaveb. Primární a sekundární chromozomové přestavby (např. inverze, reciproká translokace, duplikace/delece).

4. Ploidní mutace (aneuploidie a polyploidie). Celogenomové duplikace (polyploidie) různého evolučního stáří. Diploidizace.

5. Proměny karyotypu ve fylogenetickém kontextu: evoluční trendy?

6. Role chromozomových přestaveb v evoluci rostlin.

7. Klasické a moderní cytogenetické metody pro biosystematiky (a nejen pro ně).

Poslední úprava: Kubátová Alena, RNDr., CSc. (12.04.2011)

angličtina

1. Karyosystematics: history and the present. Phylogenomics.

2. Chromatin (eu- and heterochromatin, repetitive DNA, epigenetic DNA modifications). Chromosome structure (centromere, telomere, ribosomal DNA). Chromosome types (B chromosomes, sex chromosomes, holokinetic chromosomes).

3. Genome and karyotype. Comparative cytogenomics (genome and chromosome colinearity). Mechanisms of chromosome rearrangements. Primary and secondary chromosome rearrangements (e.g., inversions, reciprocal translocations, duplication/deletion).

4. Ploidy mutations (aneuploidy and polyploidy). Whole-genome duplications (polyploidy) of different evolutionary age. Diploidization.

5. Karyotypic changes and variation in the phylogenetic context: evolutionary trends?

6. The role of chromosome rearrangements in the evolution.

7. Classical and modern cytogenetic methods for biosystematicists (and not only for them).

Poslední úprava: Kubátová Alena, RNDr., CSc. (12.04.2011)