PředmětyPředměty(verze: 964)
Předmět, akademický rok 2024/2025
   Přihlásit přes CAS
Advanced Techniques in Microbiology - FV139
Anglický název: Advanced Techniques in Microbiology
Zajišťuje: Ústav klinické mikrobiologie (15-560)
Fakulta: Lékařská fakulta v Hradci Králové
Platnost: od 2023
Semestr: letní
Body: 0
E-Kredity: 1
Způsob provedení zkoušky: letní s.:
Rozsah, examinace: letní s.:9/6, Z [HS]
Počet míst: 9
Minimální obsazenost: 5
4EU+: ne
Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
Kompetence:  
Stav předmětu: vyučován
Jazyk výuky: angličtina
Způsob výuky: prezenční
Úroveň:  
Poznámka: předmět je možno zapsat mimo plán
povolen pro zápis po webu
Garant: doc. MUDr. Miroslav Fajfr, Ph.D.
Prerekvizity : {Malá skupina pro FV039}
Neslučitelnost : FA0105111, FG50026
Záměnnost : FG50026
Anotace - angličtina
Advanced molecular techniques are now routinely used in the microbiological laboratory. Student of this course will thus learn common molecular methods, such as PCR and its modifications, MALDI-TOF, next generation sequencing (NGS) and others utilized in microbiology. In addition, the students will acquire knowledge about specific incorporation of these methods in the clinical diagnostic procedures. The course is primarily aimed at students interested in scientific work. During the first practical, the students will perform an isolation of nucleic acids, PCR setup and subsequent detection using gel electrophoresis. The second practical will aim at performing an identification of bacterial cultures using MALDI-TOF. For practical exercises, it is necessary to divide the students into groups of 4 students. The reason is the practical implementation of the PCR reaction and work with MALDI-TOF MS, which cannot be carried out in larger numbers (practical involvement of students would not be possible). For that reason, the inclusion of practical exercises in the schedule is only indicative, and the actual implementation of practical exercises will be agreed upon by the teacher individually with the students according to their schedule at the last seminar.
Poslední úprava: Dyntarová Eva (31.01.2025)
Literatura - angličtina

Recommended literature:

  1. Goering R, et al. Mims' Medical Microbiology and Immunology, 6th Ed., Elsevier, 2018.
  2. Greenwood D. Medical Microbiology, 18th Ed., Elsevier, 2012.
Poslední úprava: Dyntarová Eva (31.01.2025)
Požadavky ke zkoušce - angličtina

Credit:

  1.  full attendance required (absences are not allowed)
Poslední úprava: Dyntarová Eva (31.01.2025)
Sylabus - angličtina

Seminars

 1.    Polymerase chain reaction (PCR) and its modifications (3hrs) – theory of PCR, both classical and advanced modifications

2.    Sequencing (3hrs) - theory of sequencing reactions, Sanger sequencing, NGS and their use in the microbiological diagnosis and research

3.    MALDI-TOF and its applications (3hrs) - principles and methodology of mass spectrometry

 

Practical classes

 1.    PCR - isolation of nucleic acids, setting up a PCR reaction, detection of products using gel electrophoresis (3-4hrs)

2.    MALDI-TOF - practically performing an identification of cultures (3hrs)

 

Lecturers:

  • MUDr. Miroslav Fajfr, Ph.D.
  • Mgr. Radka Bolehovská, Ph.D,
  • Mgr. Rudolf Kukla, Ph.D.

 

Poslední úprava: Dyntarová Eva (31.01.2025)
 
Univerzita Karlova | Informační systém UK