Praktický kurz hmotnostní spektrometrie je zaměřen na teoretické seznámení studentů s instrumentací a aplikací
hmotnostní spektrometrie v moderní biomedicíně a klinické laboratorní praxi při screeningu a diagnostice
lysosomálních onemocnění jako modelovém příkladu dědičných metabolických onemocnění. Studenti se v části
zabývající se instrumentací seznámí s pojmy jako elektrosprej, MALDI, kvadrupolový analyzátor, TOF atd. V
aplikační teorii budou seznámeni s pojmy biomarker, screening, diferenciální screening/diagnostika, kvantifikace
biomarkerů, lysosomální střádavé onemocnění atd. V praktické části budou prakticky seznámení s přípravou
vzorků pro hmotnostně spektrometrickou analýzu. Provedou analýzu série anonymních vzorků a vyhodnotí kvantitu
sledovaných biomarkerů. Na základě stanovených hodnot biomarkerů následně určí, jestli hodnoty odpovídají
modelovému lysosomálnímu onemocnění či nikoliv.
Poslední úprava: Holanová Marcela (07.06.2023)
Cíl předmětu
Teoreticky seznámit studenty s moderní metodou analýzy biomarkerů u dědičných chorob metabolismu a umožnit jim prakticky vyzkoušet nové znalosti na modelovém onemocnění, kdy na závěr stanoví na základě kombinace kapalinové chromatografie a hmotnostně spektrometrické analýzy vybraných biomarkerů možnou diagnózu dědičného metabolického onemocnění.
Poslední úprava: Holanová Marcela (07.06.2023)
Podmínky zakončení předmětu
100% účast na výuce
Poslední úprava: Holanová Marcela (07.06.2023)
Metody výuky
Praktický kurz sestávající z teoretického úvodu a praktické laboratorní části v rozsahu 15 hodin
Poslední úprava: Holanová Marcela (07.06.2023)
Sylabus
Biomarkery
Dědičná metabolická onemocnění - modelový příklad: lysosomální střádavá onemocnění
Metody analýzy biomarkerů
Hmotnostní spektrometrie
Poslední úprava: Holanová Marcela (07.06.2023)
Rozpis výuky -
Rozpis datumový
Den
Datum
Popis
Učitel
Soubory
Poznámka
Hodnocení
Úterý
19.11.2024
Dopoledne (9-11) krátký teoretický úvod a seznámení s významem biomarkerů a problematiky hmotnostní spektrometrie.
Odpoledne (12-15) příprava vzorků pro analýzu - praktická část
Pláť do laboratoře a přezutí nutné
Sraz v 9:00 před vchodem (pěší vstup) do Kliniky pediatrie a dědičných metbolických poruch 1.LF UK a VFN - adresa Ke Karlovu 2 - velká dřevěná vrata naproti Albertovským schodům
Středa
20.11.2024
Dopoledne (9-11)
- analýza připravených vzorků na tandemovém hmotnostním spektrometru
- zodpovězení případných dotazů
- ukázka součástí použitého hmotnostního spektrometru s výkladem
Odpoledne (12-15)
- vyhodnocení změřených dat - spočítání kvantity sledovaných biomarkerů
- pokus o předběžně "sdělení podezření na diagnózu" na základě změřených dat
- odpověď na případné další dotazy ukončení kurzu
RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D.
Po absolvování - za účast na celém kurzu bych následně provedl zápis zápočtu kurzu do SISu
Schedule by date
Day
Date
Description
Teacher
Files
Note
Hodnocení
Tuesday
19.11.2024
Dopoledne (9-11) krátký teoretický úvod a seznámení s významem biomarkerů a problematiky hmotnostní spektrometrie.
Odpoledne (12-15) příprava vzorků pro analýzu - praktická část
Pláť do laboratoře a přezutí nutné
Sraz v 9:00 před vchodem (pěší vstup) do Kliniky pediatrie a dědičných metbolických poruch 1.LF UK a VFN - adresa Ke Karlovu 2 - velká dřevěná vrata naproti Albertovským schodům
Wednesday
20.11.2024
Dopoledne (9-11)
- analýza připravených vzorků na tandemovém hmotnostním spektrometru
- zodpovězení případných dotazů
- ukázka součástí použitého hmotnostního spektrometru s výkladem
Odpoledne (12-15)
- vyhodnocení změřených dat - spočítání kvantity sledovaných biomarkerů
- pokus o předběžně "sdělení podezření na diagnózu" na základě změřených dat
- odpověď na případné další dotazy ukončení kurzu
RNDr. Ladislav Kuchař, Ph.D.
Po absolvování - za účast na celém kurzu bych následně provedl zápis zápočtu kurzu do SISu