|
|
|
||
Poslední úprava: T_FUUK (28.04.2008)
|
|
||
Poslední úprava: T_FUUK (12.05.2008)
Cílem předmětu je prohloubení znalostí o membránovém transportu, membránových transportních proteinech a o metodách jejich studia. |
|
||
Poslední úprava: URBANKOV/MFF.CUNI.CZ (11.02.2009)
Knihy, skripta:
Články:
WWW stránky:
|
|
||
Poslední úprava: T_FUUK (12.05.2008)
přednáška |
|
||
Poslední úprava: T_FUUK (28.04.2008)
1. Lipidová (bio)membrána. Transport přes membránu - ionty, nepolární vs. polární molekuly, makromolekuly. Nespecifická permeace, aktivní a pasivní transport. Jejich termodynamické a kinetické aspekty. Membránový potenciál. 2. Metody studia transportu přes membránu. Pasivní transport - nespecifická permeace, usnadněná difúze. Kanály, transportéry. Oligopeptidy jako model studia membránových proteinů. 3. Struktura proteinů (se zaměřením na membránové), metody jejího studia 4. Teoretický popis transportu. 5. Kanály - peptidové kanály, toxiny, proteinové kanály 6. Sekundárně aktivní transportéry. 7. Primárně aktivní transportéry 8. ATPázy P- a F- typu 9. Aktivní transport spřažený s redoxní reakcí - proteiny dýchacího řetězce. 10. Transport a třídění proteinů, vezikulární transport BCM304.pdf>
11. Interakce proteinů s membránou, folding membránových proteinů.
1. Biomembrány
Membrány v živých buňkách, jejich chemické složení, hydrofobní efekt a jeho vliv na uspořádání lipidů, elektrické
vlastnosti membrán, modelové membrány.
2. Studium transportu
Metody studia transportu přes membránu, ionofory, elektrofyziologické metody, použití fluorescence, ostatní metody,
měření membránového potenciálu.
3. Struktura membránových proteinů
Základní poznatky o proteinech, síly určující strukturu proteinů, srovnání struktury membránových a rozpustných
proteinů. Základní přehled používaných metod při studiu struktury, odlišnosti membránových proteinů.
4. Teoretický popis transportu
Rovnice popisující rovnováhu, popis (elektro)difuze, kinetické rovnice, popis aktivního transportu.
5. Pasivní transport - kanály
Peptidové kanály (gramicidin, alameticin), toxiny. Proteinové kanály: nadrodina iontových kanálů hradlovaných
napětím, mechanosensitivní kanály, chloridové kanály, aquaporiny, ?-barely - poriny.
6. Sekundárně aktivní transportéry
Symport, antiport. Proteiny rodiny MFS (major facilitator superfamily); rodina aniontových mitochondriálních přenašečů
(MACP); rodina DMT - protein EmrE - transport cizorodých látek; antiport kation/proton; Ton komplex E. coli.
7. Primárně aktivní transport.
Aktivní transport kationtů (P-ATPázy) -podskupiny, struktura, kofaktory; Transport protonů: F- a V-ATPázy; ABC
pumpy - transport cizorodých látek ven z buňky, rezistence na léky.
8. ATPázy P- a F- typu
Ca2+-ATPáza, Na/K ATPáza, F1FO-ATPáza
9. Proteiny dýchacího řetězce
Redoxní reakce, redoxní potenciál, prostetické skupiny účastnící se přenosu elektronů; mitochondrie, jejich
bioenergetika; jednotlivé komplexy dýchacího řetězce
10. Transport a třídění proteinů, vezikulární transport
Buněčné oddíly, transport a třídění proteinů, vezikulární transport (mezi organelami, exocytóza, endocytóza).
11. Interakce proteinů s membránou, folding membránových proteinů
Interakce krátkých peptidů s membránou, stupnice hydrofobicity; vlastní interakce mezi proteinovým řetězcem a
membránou, formativní interakce (translokon); metody studia.
|