Předměty

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

Tato přednáška je určena pro studenty KATA. Jedná se o první polovinu dvousemestrálního kursu.
Probíraná témata: Vymezení oboru biochemie, základní pojmy, struktura buňky, typy organismů dle trofiky. Základní složky živé hmoty (proteiny, sacharidy, lipidy a nukleové kyseliny) jejich struktura a funkce. Bioenergetika - termodynamika v organismech, makroergické sloučeniny. Enzymy - pojem koenzymu, vlastnosti enzymů, enzymová kinetika.
Základy práce v biochemické laboratoři, izolace biomolekul z biochemického materiálu. Práce s laboratorními zvířaty, imunochemické metody analýzy, základy mikroskopie optické a elektronové.
(Ve druhé části kursu jsou pak probírány základní principy metabolismu a základní metody charakterizace biomolekul.)

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

The course is intended for students of "Clinical and toxicological analysis", it is the first half of a two-semester course.
Introduction, basic terms and principles of biochemistry. Biomolecules (proteins, saccharides, lipids and nucleic acids) - their structure and biochemical properties. Enzymes - properties, structure, coenzymes and cofactors. Bioenergetics - thermodynamic principles, macroergic compounds.
Basic methodology of biochemistry (isolation and purification of biomolecules, laboratory animals, immunochemical methods, microscopy
Lectures - in Czech (English possible).

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (08.02.2021)

Literatura:

M. Kodíček, O. Valentová, R. Hynek: Biochemie. Chemický pohled na biologický svět. VŠCHT Praha 2015

Kolektiv: Biochemie- základní kurz, UK, Praha 2009;

Z. Šípal a kol.: Biochemie, SPN, Praha, 1992;

J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007;

D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995 (český překlad Grada Praha, 1996);

R.H. Garrett, C.M. Grisham: Biochemistry, Saunders Col. Publ., N.Y. 1995,

D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

J. M.Berg, J. L. Tymoczko, L. Stryer: Biochemistry, 6th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2007; D. Voet, J.G. Voet: Biochemistry, Wiley, N.Y. 1995; R.H. Garrett, C.M. Grisham: Biochemistry, Saunders Col. Publ., N.Y. 1995, D. L. Nelson, M. M. Cox: Lehninger Principles of Biochemistry. 5th Ed., W. H. Freeman and Co., N.Y. 2008.

Poslední úprava: RNDr. Michaela Čermáková, Ph.D. (12.01.2023)

Zápočet: aktivní účast na cvičení (vč. úspěšného složení testů a odevzdání zadaných úkolů). Požadovány jsou znalosti statické biochemie.

K získání zápočtu ze cvičení musí být splněny všechny tři podmínky:

1.) Docházka ≥ 70 %

V ZS 2023 je nutná osobní účast na minimálně 7 cvičeních (z celkových 10).

2.) Domácí úkoly ≥ 60 %

V ZS 2023 je potřeba včas odevzdat alespoň 3 vypracované domácí úkoly (celkem 5).

3.) Zvládnutí tří průběžných testů ≥ 60 % (souhrnem) nebo závěrečného zápočtového testu ≥ 60 % (možnost max. tří termínů).

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (19.02.2014)

Credit: active participation in seminars, tests. For English-speaking students (Erasmus), specific conditions might be negotiated (because of their frequent later arrival).

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

Biochemie - definice vědního oboru, typy organismů, morfologie buňky živočišné, rostlinné a mikrobiální, buněčné organely a jejich biochemická funkce.
Základní složky živé hmoty. Proteiny - kodové aminokyseliny, jejich chemické a fysikálně-chemické vlastnosti, peptidy. Primární, sekundární, terciární a kvarterní struktura proteinů, proteiny fibrilární a globulární. Nepeptidové složky proteinů. Vlastnosti proteinů, rozpustnost, elektrochemické vlastnosti, denaturace. Sacharidy - mono-, oligo- a polysacharidy, struktura a chemické vlastnosti. Deriváty sacharidů a jejich role v organismu. Lipidy - definice a biologická funkce, lipidy jednoduché, složené a isoprenoidní, stavba biologických membrán.
Enzymy. Klasifikace a názvosloví, struktura molekuly enzymu. Koenzymy. Kinetika enzymové reakce, metody určování kinetických parametrů, jednotka enzymové aktivity. Vlastnosti enzymů, inhibice a aktivace enzymů, vícesubstrátové reakce a regulační enzymy.
Základní biochemické metody: práce s biochemickou literaturou, vyhodnocování výsledků, zvláštnosti práce v biochemické laboratoři, voda a pomocné látky, pufry. Izolace biomolekul: desintegrace a homogenizace, extrakce, srážení. Separace podle velikosti částic (ultrafiltrace, dialýza). Chromatografické separační metody (přehled, rozdělení). Elektromigrační separační metody. Práce s laboratorními zvířaty. izolovanými orgány a tkáněmi, imunochemické metody (RIA, ELISA). Základy mikroskopie (základní pojmy, rozlišení, zvětšení, kontrastú. Optická mikroskopie (příprava preparátů, zvyšování kontrastu). Elektronová mikroskopie (transmisní a skanovací).

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

Structure of living cell and biochemical function of organelles. Molecular components of cell (amino acids, peptides, proteins, carbohydrates, lipids, nucleic acids), their structure, chemical and biochemical properties. Enzymes - structure of enzyme molecule, enzyme properties, kinetics of enzyme reaction, regulatory enzymes. Basic biochemical methodology: arrangement of the work in biochemical laboratories, organization of chemical literature, evaluation of results. Isolation and purification of biomolecules, seperation methods, electromigration. Laboratory animals. Immmunochemical methods, microscopy.

Poslední úprava: prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc. (17.02.2014)

Základní znalosti obecné, anorganické a fyzikální chemie a základní matematické dovednosti (na úrovni kvalitního absolventa střední školy).

Soubory		Komentář	Kdo přidal
	MAGE.EXE	Program "Kinemage" (výukové modely struktur proteinů)	prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc.
	ProTour1.kin	Ukázkový výukový program pro "Kinemage"	prof. RNDr. Jiří Hudeček, CSc.