Genetické metody v zoologii - MB170P59

• Anglický název: Genetic methods in zoology
• Český název: Genetické metody v zoologii
• Zajišťuje: Katedra zoologie (31-170)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2023 do 2023
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 6
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:kombinovaná
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/2, Z+Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D.
• Vyučující: Mgr. Jakub Kreisinger, Ph.D.; doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D.; RNDr. Radka Reifová, Ph.D.; Mgr. Jakub Rídl, Ph.D.; prof. Mgr. Pavel Stopka, Ph.D.; Mgr. Romana Stopková, Ph.D.; Mgr. Jiří Šmíd, Ph.D.; RNDr. František Šťáhlavský, Ph.D.
• Neslučitelnost : MB170P62, MB170P66, MB170P80
• Je neslučitelnost pro: MB170P62

Anotace

čeština

Poslední úprava: doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D. (25.09.2023)

První přednáška bude až v úterý 10.10.!

Praktika proběhnou turnusovým způsobem během zkouškového období.

Kurz tvoří přednášky, praktická cvičení v laboratoři a úvod do počítačového zpracování dat. Cílem je seznámit
studenty se základy většiny genetických metod používaných v zoologii a jejich využitím. Praktická část slouží k
procvičení laboratorních dovedností studentů a k získání základních znalostí nutných k počítačovému zpracování
genetických dat.

Více informací a učební texty lze najít na adresách:
Přednášky na Moodle:
http://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=507

Přednáška a data pro počítačovou část o databázích:
http://web.natur.cuni.cz/~muncling/


Pro zájemce o tuto problematiku existuje ještě přednáška "Molekulární ekologie živočichů", která na "Genetické
metody v zoologii" volně navazuje. Pro teoretické základy je vhodná přednáška Evoluční genetika.

Jinými slovy:

Evoluční genetika: teoretické základy
Genetické metody: jak se vyrábí data a pipetuje
Molekulární ekologie: jak pracovat s daty

angličtina

Poslední úprava: doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D. (12.02.2018)

Please note, the lectures are given in czech language only. Genetic methods in zoology - a survey of methods and
approaches. The course includes a practical in molecular laboratory and an introduction to computer analysis of
data. You may like to see a similar course Molecular Applications in Zoology, which is given in English.

Literatura

čeština

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (26.04.2017)

Avise, 2000: Phylogeography: the history and formation of species.

Avise, 2004: Molecular Markers, Natural History, and Evolution, Second Edition

Arnold, 1997: Natural hybridization and evolution.

Balding, Bishop & Cannings (eds.), 2003: Handbook of statistical genetics, second edition.

Beebe & Rowe, 2004: An introduction to molecular ecology.

Hartl, 1999: A primer on population genetics.

Hartl & Clark, 1997: Principles of population genetics, third edition.

Hillis DM, Moritz C, eds., 1990: Molecular systematics. Sinauer Asociates, Sunderlans Mass.

Hoelzel AR 1992: Molecular analysis of populations. Oxford Univ. Press.

Zima J., Macholán M., Munclinger P., Piálek J., 2004: Genetické metody v zoologii. Nakladatelství Karolinum, Praha, 239 s. (učební text)

angličtina

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (24.10.2019)

Avise, 2000: Phylogeography: the history and formation of species.

Avise, 2004: Molecular Markers, Natural History, and Evolution, Second Edition

Arnold, 1997: Natural hybridization and evolution.

Balding, Bishop & Cannings (eds.), 2003: Handbook of statistical genetics, second edition.

Beebe & Rowe, 2004: An introduction to molecular ecology.

Hartl, 1999: A primer on population genetics.

Hartl & Clark, 1997: Principles of population genetics, third edition.

Hillis DM, Moritz C, eds., 1990: Molecular systematics. Sinauer Asociates, Sunderlans Mass.

Hoelzel AR 1992: Molecular analysis of populations. Oxford Univ. Press.

Zima J., Macholán M., Munclinger P., Piálek J., 2004: Genetické metody v zoologii. Nakladatelství Karolinum, Praha, 239 s. (learning text)

Požadavky ke zkoušce

Poslední úprava: doc. Mgr. Pavel Munclinger, Ph.D. (08.10.2021)

Zápočet se uděluje za aktivní řešení úloh na cvičeních.

Zkouška je formou písemného testu. Otázky se týkají témat z přednášek. Absolvování a nastudování přednášek by tedy mělo být dostečné pro úspěch při testu.

V případě on-line výuky bude zkouška a zápočet probíhat distanční formou.

Sylabus

čeština

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (26.04.2017)

GENETICKÉ METODY V ZOOLOGII osnova

Analýza fenotypu

fenotyp a genotyp

kvantitativní a kvalitativní znaky

signální fenotypy

nemetrické (epigenetické) znaky

homeotické mutace u octomilek a obratlovců

biochemie krevních skupin savců

Cytogenetika

základní pojmy

metodologické mezníky ve studiu chromosomů

vyšetření mitotických chromosomů

vyšetření meiotických chromosomů

proužkování chromosomů

chromosomy a monitorování mutagenních vlivů prostředí

in situ hybridizace

fluorescenční detekce míst hybridizace - FISH

vybavení cytogenetické laboratoře

Biochemická genetika

základní pojmy

principy elektroforézy

základní metody

nosiče

schopnost separace

detekce proteinů

vlastní postup

omezení metody

aplikace

Molekulární genetika

úvodní pojmy

odběr a uchovávání vzorků

extrakce DNA

hybridizace DNA

polymerázová řetězová reakce (PCR)

restrikční analýza

proměnlivost délky tandemově opakovaných motivů

(VNTR, variable number of tandem repeats)

proměnlivost konformace fragmentů

proměnlivost restrikčních míst

sekvencování DNA a aplikace

angličtina

Poslední úprava: Ing. Jindřiška Peterková (26.04.2017)

Signal phenotype, coat colour genetics, epigenetic characters, geometrical morphology, karyotypes, chromosome banding, FISH, protein electrophoresis, allozymes and isozymes, DNA/DNA hybridisation, DNA cloning, PCR, RFLP, DNA fingerprinting, microsatellites, RAPD, sequencing, genomics.