Praktikum z ekomorfologie a evoluční ekologie - MB170P117

• Anglický název: Practicum of Ecomorphology and evolutionary ecology
• Český název: Praktikum z ekomorfologie a evoluční ekologie
• Zajišťuje: Katedra zoologie (31-170)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2024
• Semestr: letní
• E-Kredity: 1
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:0/3, Z [DS]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: 8
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: prof. RNDr. Daniel Frynta, Ph.D.; RNDr. Petra Frýdlová, Ph.D.
• Vyučující: RNDr. Petra Frýdlová, Ph.D.; prof. RNDr. Daniel Frynta, Ph.D.; RNDr. Eva Landová, Ph.D.

Anotace

čeština

Cvičení je zaměřeno na řešení konkrétních modelových evolučně-ekologických úloh. Studenti se při té příležitosti
seznámí s použitím základních morfometrických, statistických a fylogenetických metod používaných v
ekomorfologii. Praktikum bude probíhat jednak demonstrací ekomorfologických adaptací zvířat k životu na
sbírkovém materiálu. Dále formou analýzy reálných dat.
Celé praktikum má za cíl seznámit studenty na příkladu vybraných skupin živočichů s vnitrotaxonovou diversitou
tvarů a velikostí a její ekomorfologickou a fylogenetickou interpretací.

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (04.01.2023)

angličtina

This course deals with particular model exercises from evolutionary ecology. Students become acquainted with
application of basic morphometric, statistic and phylogenetic methods, which are traditionally used in
ecomorphology. The demonstration of the basic ecomorphological adaptations in zoological collections will be
supplemented with the solving of the specific model problems using real datasets.
The aim of the course is to inform students of intrataxonomic diversification of shapes and sizes in selected groups
of animals and their ecomorphological and phylogentical interpretation.

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (04.01.2023)

Požadavky ke zkoušce

čeština

Zápočet bude udělen za účast na praktiku a vypracování krátkých domácích úloh.

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (20.02.2017)

angličtina

Short homeworks and the presence on the courses are required.

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (20.02.2017)

Sylabus

čeština

1. První úloha se bude věnovat analýze velikosti a tvaru těla na modelové skupině gekončíka nočního.  Analýza růstových dat, aplikace jednotlivých růstových modelů (Statistica). 
2. Druhá úloha je zaměřena na geometrickou morfometrii. Studenti se na fotografiích vybraných zástupců primátů naučí pracovat se základními programy pro geometrickou morfometrii (tpsUTIL, tpsDIG, CoordGen, TMorphGen, BigFix, PCAGenCVAGen, TwoGroup, MorphoJ). Srovnání s klasickou morfometrií. 
3. Seznámení s problematikou fylogenetického signálu v biologických datech. Práce s programem Mesquite určeným k fylogenetickým analýzám, tvorba kladogramů, fylogenetická korekce pro kvantitativní data, rekonstrukce ancestrálního stavu znaku, metoda nezávislých kontrastů. Porovnání s dalšími programy pro fylogenetické korekce (Compare, R balíček Ape)

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (04.01.2023)

angličtina

1. Analysis of body size and body shape on the model species of leopard gecko. Application of various growth models (Statistica). 
2. The second task is focused on the comparison of geometric (tpsUTIL, tpsDIG, CoordGen, TMorphGen, BigFix, PCAGenCVAGen, TwoGroup, MorphoJ) and linear morphometry. 
3. Effect of phylogeny on biological data. Familiarization with Mesquite, which is meant for phylogenetic analysis, creation of cladograms, phylogenetic corrections of quantitative data, reconstruction of ancestral states and Felsenstein's independent contrasts. Comparison with other phylogenetic programs (Compare, R Ape package)

Poslední úprava: Frýdlová Petra, RNDr., Ph.D. (04.01.2023)