Diatomology - MB162P38

• Anglický název: Diatomology
• Český název: Diatomologie
• Zajišťuje: Katedra ekologie (31-162)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2023 do 2024
• Semestr: letní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: letní s.:
• Rozsah, examinace: letní s.:1/3, Z [DS]
• Počet míst: 14
• Minimální obsazenost: 5
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Úroveň: specializační
• Vysvětlení: kurz se bude konat, pokud bude zapsaných alespoň 5 studentů
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: Mgr. Kateřina Kopalová, Ph.D.
• Vyučující: Mgr. Kateřina Kopalová, Ph.D.; doc. Mgr. Jana Kulichová, Ph.D.

Anotace

čeština

Rozsivky (diatoms, Bacillariophyta) jsou jednou z morfologicky a evolučně nejdiverzifikovanějších skupin řas. Vyskytují se ve vodních i terestrických ekosystémech po celém světě. Mají velký význam v globálních biogeochemickéých cyklech, jelikož se mohou podílet až z 20% na celosvětové fotosyntetické fixaci uhlíku a z 50% na produkci kyslíku. Unikátním znakem rozsivek je jejich skleněná schránka, která vzniká silicifikací buněčné stěny. Právě morfologicky variabilní schránky rozsivek jsou hojně využívané pro biomonitoring a paleolimnologii. Kurz diatomologie je zaměřen na získání základních znalostí o taxonomii, morfologii a ekologii rozsivek prostřednictvím vypracování studentských projektů. Praktická část bude zaměřena na sběr vzorků z terénu, zpracování a příprava vzorků pro mikroskopii, fotodokumentace schránek rozsivek a identifikace taxonů pro účely zpracování témat projektů. Kurz je vhodný pro bakalářské i magisterské studenty, kteří se zajímají o obory jako jsou protistologie, algologie, ekologie vodních ekosystémů a biomonitoring.

Kurz bude probíhat blokově ve dnech 21.3. (cca hodinová informační schůzka), 28.3., 4.4. a 11.4. (od 9 - 15 hodin) v B13 (budova Benátská 2).

Poslední úprava: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (20.01.2025)

angličtina

Diatoms (Bacillariophyta) are one of the most diversified group of algae. They occur worldwide in both aquatic and terrestrial habitats. Diatoms are important in global biogeochemical cycles because they contributed up to 20% to carbon fixation and up to 50% to oxygen production. A unique feature of diatoms is formation of glass shells, which is produced by silicification of their cell walls. Morphologically variable diatom shells (frustules) are frequently used in monitoring of recent and past environmental conditions. The course Diatomology will focus on basic knowledge of diatom taxonomy, morphology, and ecology in practical way. Lab work will focus on light microscope observations of living and cleaned diatom samples. We will use digital photography systems to document the groups. One field trips outside the lab will be expected. The course would be useful to undergraduates and graduate students interested in protistology, algology, aquatic ecology and diversity of photosynthetic organisms as well as biomonitoring.

The course will be held in blocks: 21.3. (approximately one hour information session), 28.3., 4.4. and 11.4. (9 - 15 h) at B13 (building Benatska 2).

Poslední úprava: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (20.01.2025)

Literatura

čeština

1. F E Round, R M Crawford and D G Mann, The Diatoms: Biology & Morphology of the Genera, Cambridge University Press, 1990.
2. J P Smol and E F Stoermer, The Diatoms: Applications for Environmental and Earth Sciences, Second Edition, Cambridge University Press, p.667, 2010.

Poslední úprava: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (29.10.2019)

Požadavky ke zkoušce

čeština

Zápočet bude udělen na základě vypracovaných protokolů.

Important information: "The course can only be evaluated with CREDIT POINTS, no MARKS! Please, note, that there is no percentage evaluation!"

Poslední úprava: Kopalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (21.11.2024)

angličtina

Students should be present on all 3 blogs and prepare protocols accordingly.

Important information: "The course can only be evaluated with CREDIT POINTS, no MARKS! Please, note, that there is no percentage evaluation!"

Poslední úprava: Kopalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (21.11.2024)

Sylabus

čeština

Kurz bude probíhat turnusově. Menší část bude věnována přednáškám a vetší část praktickému metodologickému přístupu.

 

Plán kurzu:

- základní klasifikace rozsivek

- terminologie spojená s identifikací rozsivek

- představení rodové diverzity rozsivek

- ekologický význam rozsivek

- vědecké otázky spojené s výzkumem rozsivek

- demonstrace sběru přírodních vzorků a příprava trvalých preparátů 

- pozorování a determinace rozsivek ve světelném a elektronovém mikroskopu

- vyhodnocení vnitrodruhové a mezidruhové morfologické variability rozsivek pomocí mikrofotografií

- rozpoznání na základě rozsivek z jakého habitatu (vodní/terestrický, mořský/sladkovodní, planktonní/bentický) byl vzorek odebrán

- určení kvality vody pomocí rozsivek (indexy trofie, acidita, indikátorové taxony)

Poslední úprava: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (22.01.2020)

angličtina

A plan of the course:

- diatom classification

- identification terminology 

- diversity of diatom genera

- ecology of diatoms

- scientific topics associated with diatom research

- collection of natural samples and preparation of permanent slides

- identification of diatoms using both light end electron microscopy

- assessment of intra- and interspecific variability in morphology using microphotographs

- recognition of the habitat origin (aquatic/terrestrial; marine/freshwater; planktic/benthic) 

- evaluation of water-quality (trophy indices, acidity, indicator taxa)

Poslední úprava: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (22.01.2020)