Molecular and Immunologic Mechanism of Viral Pathogenesis - MB140P91

• Anglický název: Molecular and Immunologic Mechanism of Viral Pathogenesis
• Český název: Molekulární a imunologické mechanismy virové pathogeneze
• Zajišťuje: Katedra genetiky a mikrobiologie (31-140)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2024 do 2025
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 3
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:2/0, Zk [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: vyučován
• Jazyk výuky: angličtina
• Úroveň: specializační
• Poznámka: povolen pro zápis po webu; při zápisu přednost, je-li ve stud. plánu
• Garant: prof. RNDr. Ivan Hirsch, CSc.; Mgr. Kateřina Trejbalová, Ph.D.
• Vyučující: prof. RNDr. Ivan Hirsch, CSc.; Mgr. Kateřina Trejbalová, Ph.D.

Anotace

čeština

Medicinální virologie a virová patogeneze je pokročilým kursem virologie, který je zaměřen na různé aspekty virové infekce: mechanismy šíření viru, odpověď hostitele na virovou infekci, latenci a perzistenci. Je určen především studentům biologických a biomedicínských oborů magisterského a doktorského studia, kteří mají zájem o aktuální poznatky o virové infekci u člověka. Předpokladem pro úspěšné zvládnutí kursů je předchozí znalost základů virologie. V době protiepidemických opatření probíhá výuka online prostřednictvím komunikační platformy Google-Meet v době uvedené v rozvrhu.

Poslední úprava: Hirsch Ivan, prof. RNDr., CSc. (16.10.2020)

angličtina

Medical Virology and Viral Pathogenesis is an advanced level virology course that focuses on various aspects of viral infection, virus spread, host response to viral infections, latency and persistency. This course is oriented primarily to the needs of biology and biomedical students at the upper undergraduate and advanced academic degrees (Master and Ph.D. candidates) who wish to expand their knowledge in human virology beyond the basic microbiology level (which is required). Students will have the opportunity to learn the most recent state of knowledge on various aspects of human virology. Proposed course places particular emphasis on viruses which cause disease in humans. During the period of anti-epidemic measures, the lectures will be given online via the Google-Meet communication platform at the time indicated in the schedule.

Poslední úprava: Hirsch Ivan, prof. RNDr., CSc. (16.10.2020)

Literatura

čeština

Odborné články a review dostupné online
Webové stránky s aktuálními informacemi o virových onemocněních (CDC, WHO, etc.)
Fields Virology (Knipe, Fields Virology) 2 volume set, by David M. Knipe, Peter M. Howley. Publishers LWW 2020
Principles of virology. Vol. 1 and 2, Molecular biology. S.J. Flint et al. 4th ed. Imprint Washington, DC:
ASM Press, 2015 https://ebookcentral.proquest.com/lib/cuni/detail.action?docID=4392502

Poslední úprava: Rubešová Jana, RNDr., Ph.D. (08.06.2022)

angličtina

Research and review papers available online
Websites with up-to-date viral disease information (CDC, WHO, etc.)
Fields Virology (Knipe, Fields Virology) 2 volume set, by David M. Knipe, Peter M. Howley. Publishers LWW 2020
Principles of virology. Vol. 1 and 2, Molecular biology. S.J. Flint et al. 4th ed. Imprint Washington, DC: ASM Press, 2015. Accessible at https://ebookcentral.proquest.com/lib/cuni/detail.action?docID=4392502

Poslední úprava: Rubešová Jana, RNDr., Ph.D. (08.06.2022)

Požadavky ke zkoušce

The students' performance will be graded as satisfactory/unsatisfactory on the basis of constructive participation in the seminars (paper presentation) and in-class discussions. Two-page home-prepared essay on selected subject will be discussed during the final oral evaluation. This is a thematic oriented class with contributions expected from each student. Lectures will follow up with assigned papers to be discussed by the students in the class. The students are responsible for reviewing the papers and presenting the contents of the paper for general round-table discussion.

Poslední úprava: Hirsch Ivan, prof. RNDr., CSc. (16.10.2020)

Sylabus

čeština

Mechanismy restrikce viru a adaptace v průběhu akutní, perzistentní, chronické and latentní infekce

1. Typy infekcí(akutní, perzistentní, chronická and latentní), restrikce, vrozená imunita, interferony a cytokiny

2. Akutní infekce: virus chřipky, restrikce a adaptace

3. Virus HIV: perzistence a latence

4. Další retroviry: perzistence a latence

5. Miliony let trvající perzistence retrovirů: endogenní retroviry

6. Persistentní and latentní infekce: aktivní and pasivní role viru (herpesviry and retroviry)

7. Chronické infekce: virus choriomeningitidy a virus hepattidy B

8. Restrikce virů při vstupu do buňky a po jeho vstupu a restrikční faktory

9. Zoonozy, , virové receptory a adaptace

10. Vakcíny; studentské prezentace 

11. Regulace virové infekce v hostitelské populaci   

12. Studentská diskuse u kulatého stoplu - virový tropizmus

Poslední úprava: Hirsch Ivan, prof. RNDr., CSc. (15.10.2020)

angličtina

Mechanisms of viral restriction and adaptation during acute, persistent, chronic and latent infection

1. Types of infection (acute, persistent, chronic, slow), restriction / innate and natural immunity; interferon(s) - cytokines

2. Acute infections: influenza virus, restriction and adaptation

3. HIV persistence and latency

4. Persistent and latent phase of infection by other retroviruses

5. Million years taking persistence of retroviruses: endogenous retroviruses

6. Persistent and latent infection: active and passive role of the virus (herpesviruses and retroviruses)

7. Chronic type of infection, LCMV and HBV

8. Virus restriction during and after virus entry into the cell - restriction factors

9. Zoonoses, viral receptors and adaptation

10. Vaccines (KT) + students presentations  

11.  Control of virus infection in the host population

12. Students‘ round table discussion (viral tropism)

Poslední úprava: Hirsch Ivan, prof. RNDr., CSc. (15.10.2020)

Výsledky učení

čeština

Po úspěšném absolvování předmětu student:

- Definuje základní typy virových infekcí (akutní, perzistentní, chronickou a latentní) a rozlišuje jejich biologické charakteristiky a základní patogenní účinky.

- Vyjmenuje základní mechanismy virové restrikce v hostitelské buňce a identifikuje roli vrozené imunity, interferonů, restrikčních faktorů a cytokinů v antivirové odpovědi.

- Na různých příkladech popíše průběh akutní virové infekce a uvede příklady virové adaptace na restrikční mechanismy hostitele.

- Vysvětlí principy perzistence a latence viru HIV a interpretuje jejich význam pro dlouhodobý průběh infekce; na příkladech dalších retrovirů porovná mechanismy perzistence.

- Popíše původ a biologický význam endogenních retrovirů a uvede vztahy mezi dlouhodobou virovou perzistencí a evolucí hostitelského genomu.

- Analyzuje příčiny a následky aktivní a pasivní role viru při perzistentních a latentních infekcích, zejména u herpesvirů, retrovirů a virů způsobujících lidskou hepatitidu.

- Kategorizuje a klasifikuje restrikční faktory působící při vstupu viru do buňky a po jeho vstupu a vysvětlí jejich mechanismy účinku.

- Vysvětlí principy zoonotického přenosu virů a interpretuje význam adaptace viru při přechodu mezi hostiteli.

- Seřadí klíčové kroky virové infekce do logických posloupností od vstupu viru do buňky po regulaci infekce v hostitelské populaci.

- Aktivně se zapojí do odborné diskuse při prezentaci určeného tématu a aplikuje získané znalosti při tvorbě eseje s virologickou tematikou, ve kterém interpretuje hlavní poznatky a zhodnotí vliv virových infekcí na patogenezi v hostitelském organismu.

Poslední úprava: Trejbalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (14.01.2026)

angličtina

Upon successful completion of the course, the student:

- Defines the basic types of viral infections (acute, persistent, chronic, and latent) and distinguishes their biological characteristics and fundamental pathogenic effects.

- Lists the principal mechanisms of viral restriction in host cells and identifies the roles of innate immunity, interferons, restriction factors, and cytokines in the antiviral response.

- Describes, using selected examples, the course of acute viral infection and provides examples of viral adaptation to host restriction mechanisms.

- Explains the principles of HIV persistence and latency and interprets their significance for the long-term course of infection; compares, using examples of other retroviruses, different mechanisms of viral persistence.

- Describes the origin and biological significance of endogenous retroviruses and explains the relationships between long-term viral persistence and the evolution of the host genome.

- Analyzes the causes and consequences of active and passive viral roles in persistent and latent infections, particularly in herpesviruses, retroviruses, and viruses causing human hepatitis.

- Categorizes and classifies restriction factors acting during viral entry into the cell and after entry, and explains their mechanisms of action.

- Explains the principles of zoonotic viral transmission and interprets the significance of viral adaptation during host switching.

- Arranges the key steps of viral infection into logical sequences, from viral entry into the cell to the regulation of infection at the host population level.

- Actively participates in expert-level discussion during presentations of assigned topics and applies acquired knowledge in the preparation of a virology-focused essay, in which the student interprets key findings and evaluates the impact of viral infections on pathogenesis in the host organism.

Poslední úprava: Trejbalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (14.01.2026)