Genetické metody v antropologii - MB110P98

• Anglický název: Genetic methods in anthropology
• Český název: Genetické metody v antropologii
• Zajišťuje: Katedra antropologie a genetiky člověka (31-110)
• Fakulta: Přírodovědecká fakulta
• Platnost: od 2019
• Semestr: zimní
• E-Kredity: 2
• Způsob provedení zkoušky: zimní s.:
• Rozsah, examinace: zimní s.:0/4, Z [HT]
• Počet míst: neomezen
• Minimální obsazenost: neomezen
• 4EU+: ne
• Virtuální mobilita / počet míst pro virtuální mobilitu: ne
• Stav předmětu: nevyučován
• Jazyk výuky: čeština
• Poznámka: povolen pro zápis po webu
• Garant: RNDr. Pavlína Daňková, Ph.D.

Anotace

Výběrový kurz je určen zájemcům o speciální přístupy aplikované v molekulární antropologii, která se často potýká s nedostatkem a nízkou kvalitou vstupního materiálu zpracovávaného pro genetickou analýzu, zejména při analýze aDNA nebo forenzních aplikacích. Studenti se naučí používat genetické analýzy a porozumí jejich významu v rámci dalších multidisciplinárních odvětví, jako jsou archeozoologie, palaeopatologie, archeologie, forenzní vědy, palaeobotanika a palaeontologie.

Poslední úprava: Sedlak Petr, doc. RNDr., Ph.D. (15.05.2012)

Literatura

PÄÄBO, S. 1985b. Preservation of DNA in ancienit Egyptian mummies. Journal of Archaeological Science. 12:411-417.

PÄÄBO, S. 1985a. Molecular cloning of ancient Egyptian mummy DNA. Nature. 314:644-45

PÄÄBO, S. 1986. Molecular genetic investigations of ancient human remains. Cold Spring Haarbor Symposium on Quantum Biology. 51:441-46

KING, C., DEBRUYNE, R., KUCH, M., SCHWARZ, C., POINAR, H. 2009. A quantitative approach to detect and overcome PCR inhibition in ancient DNA extracts. Biotechniques. Nov;47(5):941-9.

Poslední úprava: Sedlak Petr, doc. RNDr., Ph.D. (15.05.2012)

Sylabus

1. Zdroje lidské DNA - buňky/tkáně. Základy správné manipulace se vzorkem a dobrá laboratorní praxe při práci s antropologickým materiálem

2. Extrakce a purifikace DNA z různých tkání (krev/bukální stěr/krevní skvrna/vlasová cibulka/zub/kost/konzervovaná tkáň) - srovnání více typů extrakcí

3. PCR (klasická, nested, multiplex)

4. gDNA a mtDNA analýzy (restrikční analýza DNA; separace DNA fragmentů na agarózových a polyakrylamidových gelech; fragmentační analýza; sekvenování; kvantitativní PCR; …), detekce DNA patogenů

5. Analýza dat

Poslední úprava: Sedlak Petr, doc. RNDr., Ph.D. (15.05.2012)