Organickou chemii I lze charakterizovat jako přípravný předmět, zaměřený na názvosloví a vztahy mezi strukturou a fyzikálními vlastnostmi organických látek, podstatných pro jejich využití jako chemických léčiv. Při výuce je kladen důraz na chemická léčiva jako malé organické molekuly, jejichž vlastnosti a architektura ovlivňuje transport v organismu a interakci s receptorem. Předmět tak umožňuje plynule navázat nejen na specializované farmaceutické disciplíny, zejména farmaceutickou chemii, ale i farmakognosii, biochemii a farmakologii. Témata: Systematické názvosloví organických látek, Struktura organických látek, Polarita vazeb a související fyzikální vlastnosti, Soudržnost mezi molekulami a související fyzikální vlastnosti, Fyzikální metody studia struktury.
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
Organic Chemistry I is a preparatory subject, focused on nomenclature and relationships between structure and physical properties of organic compounds, important for their application as chemical drugs. Emphasis is put on chemical drugs as small organic molecules, the properties and architecture of which determines transport in human organism and interaction with receptors. The subject thus enables the students to follow up in specialized pharmaceutical disciplines, primarily Pharmaceutical Chemistry, but also Pharmacognosy, Biochemistry and Pharmacology.
Topics: Nomenclature of Organic Compounds, Structure of Organic Compounds, Polarity of Bonds and Related Physical Properties, Intermolecular Attractive Forces and Related Physical Properties, Physical Methods of Structure Elucidation.
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
Podmínky zakončení předmětu -
Předmět je ukončen zápočtem a zkouškou, oboje písemnou formou. Zápočet je udělován za 100% účast na seminářích a za dosažení minimálně 60 % bodů ve dvou zápočtových testech, které se budou psát na 6. a 10. semináři. Každý zápočtový test obsahuje 5 otázek po 2 bodech, první test bude zaměřen na jednoduché názvosloví a stereochemii, druhý test na základní fyzikální a spektrální vlastnosti látek. V případě neúspěchu budou umožněny tři pokusy složení opravného zápočtového testu ve zkouškovém období. Opravný zápočtový test bude obsahovat 5 otázek po 2 bodech, zahrnujících výše uvedené oblasti; zápočet bude udělen za zisk minimálně 60 % bodů. Zkouškový test se skládá z 10 otázek po dvou bodech, pro úspěšné složení zkoušky bude opět nutný zisk minimálně 60 % z celkového počtu bodů.
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
The subject is completed by gaining credit and passing an examination, both in the form of a written test. The credit is awarded for 100% attendance at seminars and obtaining a minimum of 60% of the total points from two credit tests to be taken in the 6th and 10th seminars. Each credit test will be composed of 5 questions, each answer worth two points . The first test will be focused on simple nomenclature and stereochemistry, the second one will be focused on basic physical and spectral properties of organic compounds. In the case of being unsuccessful, the student will have three more resit attempts for the credit tests in the exam period. The resit test will be composed of five questions comprising all the above topics, each answer marked with a maximum of two points if correct; the credit will be awarded for obtaining a minimum of 60% of the total number of points.
The examination test will be composed of 10 questions, each answer marked with a maximum of two points if correct. A minimum of 60% of the total points is again required to pass the examination.
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
Sylabus -
Systematické názvosloví organických látek
Význam OCH pro farmacii
Úvod do systematického názvosloví dle IUPAC
Nasycené cyklické základy názvů: bicykly, spirocykly, steroidy
Nenasycené cyklické základy názvů: jednoduché a orthokondenzované aromáty
Heterocyklické základy názvů: Hantzsch-Widmanův systém, orthokondenzované cykly
Struktura organických látek
Typy vazeb v org. chemii
Izomerie, konstituční a konfigurační izomery.
Chiralita, enantiomery, diastereomery, deskriptory R,S; D,L a E,Z.
Konformace, konformační analýza.
Polarita vazeb a související fyzikální vlastnosti
Rozložení elektronové hustoty v organických molekulách
Indukční efekt, teorie rezonance, mezomerní efekt
Dipólový moment, relativní permitivita
Acidita a bazicita v závislosti na struktuře, základní pojmy.
O, S, N a C-kyseliny
Soudržnost mezi molekulami a související fyzikální vlastnosti
Přehled a význam jednotlivých typů mezimolekulových přitažlivých sil
Vztah struktura - bod tání, bod varu, rozpustnost ve vodě
Fyzikální metody studia struktury
Úvod do molekulové spektroskopie
Spektroskopie v UV a IR oblasti
Spektroskopie NMR
Ostatní metody: rentgenostrukturní analýza, hmotnostní spektrometrie
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
Organic Chemistry I
Systematic nomenclature of organic compounds
Importance of Organic Chemistry in Pharmacy
Introduction to systematic nomenclature according to IUPAC
Saturated cyclic base components: bicycles, spirocycles, steroids
Unsaturated cyclic base components: monocyclic and orthofused aromates
Heterocyclic base components: Hantzsch-Widman system, orthofused heterocycles
Acidity and basicity in relationship to structure, basic terms.
O, S, N and C-acids
Attractive forces among molecules and related physical properties
Overview and importance of intermolecular attractive forces
Relationships between structure/melting points, boiling points and soulubility in water
Physical methods of structure elucidation
Introduction to molecular spectroscopy
UV and IR spectroscopy
NMR spectroscopy
Other methods: X-ray analysis, mass spectrometry
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (03.10.2023)
Výsledky učení - angličtina
Subject Organic Chemistry I follows up on the knowledge and skills acquires in subjects: General and Bioinorganic chemistry
Following the completion of the subject, the students are able to use the following terms (including their commonly used abbreviations) in the correct context towards the names and properties of organic compounds: nomenclature, IUPAC, chemical bond, structure, stereochemistry, centre of chirality, enantiomers, diastereomers, conformation, inductive effect, mesomeric effect, acidity, basicity, intermolecular attractive forces, melting point, boiling point, solubility, physical methods, UV/VIS, IR, NMR, MS, X-ray analysis, polarimetry.
Learning outcomes:
Based on the knowledge and skills acquired, students:
Ødefine the importance of Organic Chemistry in the context of Pharmaceutical Sciences;
Øhave a good command of the nomenclature of organic compounds;
Øidentify functional groups, heterocycles and aromatic rings in a given compound
Ødescribe spatial arrangement of organic compounds related to their structure;
Øexplain the distribution of electron density in the molecules of organic compounds;
Øestimate physical properties of organic compounds, depending on structure, with emphasis on acidobasic properties and water solubility;
Øevaluate and interpret data obtained by physical methods and elucidate structure using this data;
Øsuggest a suitable physical method to determine the structure of an unknown compound.
Poslední úprava: Pour Milan, prof. RNDr., Ph.D. (28.03.2025)
