Branch programme/details

Program je uskutečňován bez specializace.

Doktorské studium je organizováno katedrou fyzikální a makromolekulární chemie ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie AV ČR a pokrývá oblast výpočetní chemie, kvantové chemie a molekulárního modelování. Studium je zaměřeno jak na studium biomakromolekul (DNA a proteiny) tak i komplexních molekulárních systémů a v rámci PGS lze řešit následující projekty:
struktura a dynamika párů a oligomerů DNA v základním a elektronově excitovaném stavu
interakce DNA s proteiny a ligandy
studium nekovalentních interakcí a zejména standardní a nepravé vodíkové vazby
Stabilizující interakce v biomolekulách - peptidy a proteiny a teoretický model sbalování proteinů
strukturální bioinformatika
teoretické studium chemické reaktivity a katalýzy
fyzikální a chemické vlastnosti molekulových sít
vývoj metod k popisu statických a dynamických vlastností slabě výzaných systémů
studium uhlíkových nanostruktur
interakce biologicky relevantních iontů s hydratovanými proteiny
struktura a dynamika iontů v roztocích a na rozhraních
fyzikální a chemické procesy na atmosférických aerosolech
struktura, dynamika a funkce RNA a DNA
Koncepce postgraduálního studia vychází jak ze zkušeností garantů PGS, tak také odráží moderní trendy ve výpočetní chemii a molekulovém modelování.

Přijímací zkouška je jednokolová formou pohovoru, který se bude týkat především problematiky plánované disertační práce a znalostí uchazeče v rámci odbornosti daného studijního programu. Přijímací zkouška bude probíhat v anglickém jazyce.
Zkouška má 3 části:
1) Dosavadní vědecká práce uchazeče (uchazeč si připraví 3-5 minutovou prezentaci).
2) Motivace uchazeče a rámcový plán doktorské práce.
3) Prověření znalostí v oborech relevantních k počítačovému modelování (zejména fyzikální chemie a chemická fyzika).
Při přijímací zkoušce musí uchazeč prokázat odborné a jazykové schopnosti studovat příslušný program a předpoklady k samostatné vědecké práci.

Zkouška je hodnocena maximálně 100 body.

Ze závažných a doložených důvodů, zejména zdravotních nebo studia v zahraničí, může děkan na základě žádosti podané v elektronickém informačním systému univerzity zpravidla spolu s přihláškou, nejpozději však do 5. května 2024, povolit vykonání přijímací zkoušky prostřednictvím informačních a komunikačních technologií.

Admission to Doctoral studies is conditioned by successful completion of a Master's study programme.

Verification method:	entrance exam
Confirmation date (of entrance exam) from:	10.06.2024	Until:	21.06.2024
Alternative date (of entrance exam):	24.06.2024	Until:	28.06.2024

Od přijímací zkoušky bude upuštěno na základě žádosti uchazeče, pokud bude úspěšným žadatelem o projekt STARS v daném akademickém roce.

Žádost je třeba podat elektronicky do 5. května 2024.

This Ph.D. program is an interdisciplinary study combining physical chemistry, biochemistry, and material science with the modern tools of molecular modelling. Graduates are able to solve problems in the structural and dynamical aspects of complex systems using state-of-the-art tools of computational chemistry; they are also capable of writing reports and papers in scientific journals. Graduates have presented their results at international conferences, and have experience with the preparation of grant proposals. They will be useful in various areas of science, including: materials engineering, pharmaceutical research, molecular biology, biotechnology and/or catalysis. Graduates will find positions in applied research both in the private sector and in academia.