Branch programme/details

Bioinformatics and computational biology are multidisciplinary disciplines on the interface of computer science (especially algorithms and software development, data engineering), mathematics (especially probability, statistics, and mathematical modeling), and biology (especially molecular and evolutionary) aimed at efficient processing, analysis, and modeling of biological data and processes at the molecular and cellular level. The common denominator of bioinformatics and computational biology, which also includes areas such as systems biology, neuroinformatics, bioimaging, and computational drug design, is the development of analytical procedures and software tools for processing and analyzing large, domain-specific, and heterogeneous data to understand cellular processes at the molecular level, to learn from the evolution of given processes and subsequently apply this knowledge, especially in medicine and biotechnology.

Informace o přijímacím řízení
Základní podmínkou pro přijetí ke studiu v doktorském studijním programu Bioinformatika a výpočetní biologie, provozovaném ve spolupráci Matematicko-fyzikální a Přírodovědecké fakulty Univerzity Karlovy, je řádné ukončení studia v magisterském studijním programu. Součástí přijímacího řízení je dále ověření předpokladů uchazečů pro vědeckou práci na fakultě v rámci doktorského studia, kterými jsou zejména odborné a jazykové znalosti, a dále schopnosti samostatné tvůrčí práce a týmové spolupráce. Tyto schopnosti se posuzují především na základě materiálů předložených s přihláškou ke studiu a na základě výsledku ústní příjímací zkoušky.

Přijímací řízení se zahajuje doručením přihlášky.

Důležitá data:
• Podání přihlášky: do 30.4.2025
• Doporučující dopis: do 30.4.2025
• Pozvánka na přijímací zkoušku – první polovina května 2025
• Řádný termín přijímací zkoušky 9. až 20.6.2025
• Náhradní termín přijímací zkoušky: 23. až 27.6.2025, lze o něj požádat ze závažných důvodů.
• Dodání dokladu o absolvování Mgr. studia do 30.9.2025. Pokud uchazeč má podanou žádost o uznání zahraničního vzdělání a dosud o ní nebylo rozhodnuto, lhůta pro dodání dokladu se prodlužuje do 22.10.2025. Stejně tak se lhůta pro dodání dokladu o absolvování Mgr. studia prodlužuje do 22.10.2025 pro uchazeče, kteří absolvovali studium v magisterském studijním programu v době od 1. do 30. září 2025.

Přijetí ke studiu
Ke studiu studijního programu Bioinformatika a výpočetní biologie v českém jazyce budou přijati ti uchazeči, kteří
• Ve stanovených lhůtách předložili řádně vyplněnou přihlášku a její povinné přílohy.
• Doložili úspěšné ukončení vysokoškolského studia v magisterském stupni.
• Počtem bodů získaných v přijímací zkoušce dosáhli nebo přesáhli bodovou hranici pro přijetí do daného studijního programu. Tuto bodovou hranici pro jednotlivé formy studia stanoví děkan fakulty s přihlédnutím k předpokládanému počtu přijatých a kapacitním a finančním možnostem fakulty. Děkan oznámí bodové hranice pro jednotlivé formy programu do 30.6.2025 včetně. Předpokládaný minimální počet přijatých do studijního programu je jeden uchazeč.
Náležitosti přihlášky

PODÁNÍ PŘIHLÁŠKY
Přihláška se podává výhradně elektronicky prostřednictvím studijního informačního systému Univerzity Karlovy na adrese http://www.mff.cuni.cz/eprihlaska. Vyplněnou elektronickou přihlášku uchazeč ve studijním informačním systému potvrdí a elektronicky odešle. Elektronicky podaná přihláška se na MFF UK již neposílá poštou. Po vyplnění elektronické přihlášky je každému uchazeči informačním systémem vygenerováno číslo přihlášky; toto číslo je třeba uvádět při komunikaci o přihlášce se studijním oddělením.

Uchazeč si v přihlášce vybírá konkrétní osobu školitele z nabídky školitelů dostupných ve formuláři přihlášky ke studiu. Nabídka školitelů bude finalizována do 15.1.2025. Bez výběru školitele nebude možné přihlášku podat, povinnou přílohou přihlášky je souhlas budoucího školitele s vedením příslušného uchazeče.

PŘÍLOHY PŘIHLÁŠKY
A. Povinné
1. Doklad o ukončení studia v magisterském studijním programu.
Ke každé podané přihlášce uchazeč doručí co nejdříve po podání přihlášky, nejpozději však do 30. 9. 2025, úředně ověřenou kopii magisterského diplomu, připadně potvrzení fakulty či vysoké školy o absolvování vysokoškolského studia. Pokud uchazeč má podanou žádost o uznání zahraničního vzdělání a dosud o ní nebylo rozhodnuto, lhůta pro dodání dokladu se prodlužuje do 22. 10. 2025. Stejně tak se lhůta pro dodání dokladu o absolvování Mgr. studia prodlužuje do 22. 10. 2025 pro uchazeče, kteří absolvovali studium v magisterském studijním programu v době od 1. do 30. září 2025. Tento požadavek se netýká posluchačů, resp. absolventů magisterského studia na MFF UK.
Uchazeči, kteří předchozí vzdělání absolvovali na zahraniční vysoké škole, předloží za účelem doložení předchozího vzdělání některý z následujících dokladů:
• doklad o obecném uznání rovnocennosti nebo platnosti zahraničního dokladu o dosažení vysokoškolského vzdělání v České republice (tzv. "nostrifikace"), nebo
• zahraniční doklad o zahraničním vysokoškolském vzdělání, je-li v České republice podle jejích mezinárodních závazků automaticky rovnocenný bez dalšího úředního postupu (doklad ze Slovenska, Polska, Maďarska, Slovinska), nebo
• zahraniční doklad o zahraničním vysokoškolském vzdělání, který fakulta sama posoudí (poplatek 0 Kč).
2. Uchazeč si připraví a přiloží k přihlášce ke studiu v písemné podobě (v rozsahu zhruba 250-500 slov) návrh doktorského projektu. Plánovaný doktorský projekt by měl být projednán s předpokládaným školitelem.
3. Jeden aktuální doporučující dopis (autor dopisu jej zašle mailem na adresu phd@mff.cuni.cz do 30. 4. 2025).
4. Strukturovaný odborný životopis.
5. Motivační dopis.
6. Výpis splněných studijních povinností za dosavadní magisterské studium nebo dodatek k diplomu za ukončené magisterské studium
7. Souhlas budoucího školitele.
B. Volitelné
• Seznam publikovaných a nepublikovaných prací uchazeče, popř. odborné posudky těchto prací a ostatní doklady hodné zřetele, např. doklady o absolvovaných odborných kurzech, doklady o jazykových zkouškách apod.

POPLATEK ZA ÚKONY SPOJENÉ S PŘIJÍMACÍM ŘÍZENÍM
Ke každé podané přihlášce uchazeč uhradí poplatek za úkony spojené s přijímacím řízením. Výše poplatku je 810 Kč. Při platbě poplatku za úkony spojené s přijímacím řízením, který je splatný k termínu pro podání přihlášek, uvede uchazeč jako specifický symbol číslo, které pro něj vygeneruje studijní informační systém po elektronickém podání přihlášky. Poplatek za úkony spojené s přijímacím řízením je nevratný v kterékoli fázi přijímacího řízení. Platbu poplatku za úkony spojené s přijímacím řízením je možno provést poštovní poukázkou nebo bankovním převodem; platby v hotovosti fakulta nepřijímá. Při platbě bankovním převodem je nutno uhradit veškeré bankovní poplatky (to se týká především plateb ze zahraničí).

Bankovní spojení pro platbu:
Banka: Komerční banka
Účet: 21210277/0100
IBAN: CZ49 0100 0000 0000 2121 0277
SWIFT: KOMB CZ PP
Variabilní symbol: 1
Konstantní symbol: bezhotovostní platba 0308, složenkou 0179
Specifický symbol: vygenerovaný informačním systémem

V případě, že elektronická přihláška není řádně vyplněna a uzavřena či pokud uchazeč nezaplatil v daném termínu poplatek za úkony spojené s přijímacím řízením v požadované výši, a tyto nedostatky nejsou odstraněny ani v dodatečně stanovené lhůtě, fakulta přijímací řízení usnesením zastaví.

Popis ověření a kritéria hodnocení
Přijímací zkouška probíhá před přijímací komisí složenou ze zástupců Matematicko-fyzikální a Přírodovědecké fakulty především v anglickém jazyce a má dvě části. V první části uchazeč v maximálně 10 minutách formou prezentace (připravené slidy) představí sebe a svůj doktorský projekt. V druhé části zkoušky komise položí uchazeči tři otázky. Jedna otázka bude směřovat k samotnému projektu a další dvě k prověření orientace v oboru s ohledem na téma navrženého projektu. Součástí hodnocení je kvalita disertačního projektu, jeho realizovatelnost i s ohledem na formu studia a způsob jeho prezentace. Při přijímací zkoušce musí uchazeč prokázat odborné znalosti a předpoklady k samostatné vědecké práci. Dále je v průběhu zkoušky zjišťována schopnost komunikace v anglickém jazyce a v českém jazyce. Za první část přijímací zkoušky může uchazeč získat maximálně 25 bodů, za každou otázku z druhé části také maximálně 25 bodů. Maximální celkový počet bodů, které uchazeč může z přijímací zkoušky získat, je tedy 100 bodů. Pro úspěšné vykonání zkoušky musí uchazeč z obou částí získat celkem nejméně 50 bodů.

Přijetí ke studiu
Ke studiu je přijat uchazeč, který splní všechny podmínky a v přijímací zkoušce dosáhne nebo přesáhne bodovou hranici pro přijetí podle počtu bodů. Bodovou hranici pro přijetí do jednotlivých forem programu stanoví děkan fakulty s přihlédnutím k předpokládanému počtu přijatých a kapacitním a finančním možnostem fakulty. Děkan oznámí bodové hranice pro jednotlivé formy programu do 30.6.2025 včetně. Předpokládaný minimální počet přijatých do doktorského studijního programu je jeden uchazeč.

Pozvánka k přijímací zkoušce
K přijímací zkoušce budou pozváni ti uchazeči, kteří
• ve stanovených lhůtách předložili řádně vyplněnou přihlášku a její povinné přílohy
• zaplatili poplatek za úkony spojené s přijímacím řízením

V první polovině května 2025 zašle MFF UK všem těmto uchazečům pozvánku na přijímací zkoušku.

Přijetí do jiné formy studia než do které byla podána přihláška
Na základě hodnocení zkušební komise může fakulta uchazeči nabídnout prostřednictvím elektronického informačního systému univerzity jinou formu studia téhož doktorského studijního programu, než do které podal přihlášku ke studiu. K přijetí nabídky fakulta stanoví uchazeči alespoň sedmidenní lhůtu. Přijme-li uchazeč nabídku, fakulta formu studia v přihlášce změní a děkan vydá rozhodnutí ve věci přijetí ke studiu do změněné formy studia. Nepřijme-li uchazeč tuto nabídku nebo se k nabídce ve stanovené lhůtě nevyjádří, vydá děkan rozhodnutí ve věci přijetí ke studiu do formy studia, do které uchazeč přihlášku podal.

Admission to Doctoral studies is conditioned by successful completion of a Master's study programme.

Verification method:	entrance exam
Confirmation date (of entrance exam) from:	09.06.2025	Until:	20.06.2025
Alternative date (of entrance exam):	23.06.2025	Until:	27.06.2025

Our graduates possess state-of-the-art knowledge in the field of Theoretical Computer Science and Artificial Intelligence and actively add new results to these areas. They have experience with algorithm and data structure design and analysis, with AI tasks that include problem solving, automated planning, decision making, optimization, machine learning, design of cognitive models and robotic systems. The graduates are familiar with the core principles of scientific work and are able to specify their own research goals to solve the problems. They have experience with the work in an international environment, with university teaching, and with team work, typically involving development of complex software projects/systems. They know how to present their results and justify them in international competition. After graduation, they can work mainly in research and development both in academic and commercial environments.