Biochemistry - PFYB033

• Title: Biochemie
• Guaranteed by: Department of Biomedical Foundation in Kinanthropology (51-300200)
• Faculty: Faculty of Physical Education and Sport
• Actual: from 2022
• Semester: winter
• Points: 0
• E-Credits: 2
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:2/0, C [HT]
• Extent per academic year: 28 [hours]
• Capacity: 80 / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Explanation: https://www.facebook.com/groups/739012476451349/about
• Additional information: https://teams.microsoft.com/l/team/19%3a1653ade2b86440b0b2857585835e6f39%40thread.tacv2/conversations?groupId=2e1f8cb3-5c54-42a0-9052-6f126582b412&tenantId=e09276da-f934-4086-bf08-8816a20414a2
• Note: course can be enrolled in outside the study plan; enabled for web enrollment; priority enrollment if the course is part of the study plan
• Guarantor: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D.
• Teacher(s): doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D.
• In complex pre-requisite: PBML021

Annotation

English

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

The course focuses on basic biochemical topics covering the composition of living matter, main nutrients (sugar, fats, proteins), their metabolism (glycolysis, gluconeogenesis, beta-oxidation of fatty acids, lipogenesis, ornithine cycle, Krebs cycle and cellular respiration). In addition, attention is paid to proteosynthesis, the structure and function of nucleic acids, polarization/depolarization of the plasma membrane with regard to conduction of excitation, events on the neuromuscular plate and muscle contraction. Attention is also paid to biologically active substances such as vitamins, antioxidants and signaling molecules.

Czech

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

Předmět se soustředí na základní biochemická témata pokrývající problematiku složení živé hmoty, hlavních živin (cukr, tuky, bílkoviny), jejich metabolismus (glykolýza, glukoneogeneze, beta-oxidace mastných kyselin, lipogeneze, ornitinový cyklus, Krebsův cyklus a buněčné dýchání). Dále je věnována pozornost proteosyntéze, stavbě a funkci nukleových kyselin, polarizace/depolarizace plasmatické membrány s ohledem na vedení vzruchu, děje na nervosvalové ploténce a svalová kontrakce. Též je věnována pozornost biologicky aktivním látkám jako jsou vitaminy, antioxidanty a signální molekul.

Aim of the course

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (22.09.2023)

Cílem předmětu je především seznámit získat teoretické znalosti v oblasti základů biochemie:

Obecné principy biochemie: složení živé/neživé hmoty, regulace, enzymy, signální molekuly, hormon, vitamíny

Biochemie sacharidů: Rozdělení sacharidů; jejich odvozování pro aldózy a ketózy; typy zobrazování sacharidů (Fischerova projekce, Tollensova, Haworthova); významné zástupce monosacharidů, oligosacharidů, význam oligosacharidů pro buněčnou signalizaci a určení krevních skupin, významné zástupce polysacharidů jejich rozdělení; Biochemické přeměny sacharidů, fosforečné estery, degradace složitějších sacharidů na jednodušší, glykolýza =  vznik pyruvátu, aerobní a anaerobní přeměny pyruvátu, vznik AcetylCoA, Laktátový cyklus, Pentózový cyklus

Biochemie lipidů: Rozdělení lipidů, popsat obecnou strukturu triacylklicerolu, vysvětlit esterifikaci, význam a evoluci odvozených lipidů, způsob transportu lipidů v krvi; Obecně degradaci lipidů, odbourávání mastné kyseliny (beta-oxidaci), strukturu Koenzymu A, vznik acylCoAa, vznik acetylCoA,

Biochemie proteinu a aminokyselin: Rozdělení aminokyselin na esenciální/neesenciální, kódované/nekódované, obecnou strukturu aminokyselin, triviální názvy a charakter kódovaných aminokyselin, popsat průběh proteosyntézy; Způsoby detoxikace amoniaku, ornitinový cyklus, enzymy

Membránový potenciál a vznik vzruchu a nervosvalový systém: klidový membránový potenciál, akční potenciál, distribuce iontů, výpočet membránového  potenciálu, popis nervosvalového spojení (od nervu ke svalu, od impulzu ke kontrakci), charakteristika svalové tkáně, strukturu kosterního svalu, složení svalu, princip svalové kontrakce; zdroje energie pro svalovou práci

Metabolické přeměny: Krebsův cyklus a dýchací řetězec, makroergické látky

Course completion requirements

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

Požadavky na zápočet:
písemný test na 30 b, 15 min

Výstupy z biochemie:

znalosti:

složení živé hmoty

hlavní živiny - cukry, tuky, bílkoviny  - jejich rozdělení a charakteristika

metabolické přeměny hlavních živin (glykolýza, beta-oxidace, Krebsův cyklus, buněčné dýchání....)

proteosyntéza (princip, význam, posloupnost, začlenění v rámci buňky)

nukleové kyseliny (struktura, funkce, význam)

polarizace/depolarizace plasmatické membrány, přenos vzruchu, děje na nervosvalové ploténce a svalová kontrakce

biologicky aktivní látky (vitamíny, antioxidanty, signální molekuly)

Podmínky uznávání zpočtu:

Zápočet lze uznat pouze v případě, že

1)      datum jeho složení není starší než 3 roky,

3)      sylaby předmětů se neliší o více než 10%

4)      uchazeč předloží kompletní žádost o uznání zápočtu včetně studijním oddělením potvrzeným výpisem studijních povinností a pro uchazeče z jiných fakult též vyučujícím (u kterého byla zkouška/zápočet absolvována) potvrzeným sylabem předmětu včetně platného kontaktu na vyučujícího.

5)      kompletní žádost je doručena na sekretariát katedry Biomedicínského základu v kinantropologii k paní Kopřivové (E324, 3. patro) do 31.10 každého daného roku

Studenti se specifickými potřebami v učení (SPU):

V případě, že jste studentem/studentkou se specifickými studijními potřebami, které Vám znemožňují aktivní účast ve výuce, nebo objektivním způsobem znevýhodňují psaní závěrečného testu, tak je třeba tuto skutečnost doložit věrohodným dokumentem, např. vyjádřením pedagogicko-psychologické poradny a to nejpozději do 31.10 emailem obsahujícím všechny potřebné dokumenty dokládající vaši SPU. Na pozdější žádosti, či žádosti nepodložené lékařským/psychologickým posudkem nebude brán zřetel.

Příklad: V případě, že např. trpíte určitým stupněm dislexie a z toho důvodu potřebujete na psaní testu více času, což v případě digitálního společného testu není možné zajistit, tak si zkoušející vyhrazuje právo změnit formu testu např. na test v papírové formě.

Literature

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

BENDER, D. A., et al. Harper's Illustrated Biochemistry. McGraw-Hill Medical, 2012.
DAVIDSON, V.L., et al. Biochemistry. Baltimore, Md.: Lippincott, William, 1999.
KODÍČEK, M., VALENTOVÁ, O., HYNEK, R. Biochemie: chemický pohled na biologický svět. Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, 2018.
KOOLMAN, J., RÖHM, K.-H. Barevný atlas biochemie. Grada, 2012.
KLOUDA, P. Základy biochemie. Pavel Klouda, 2005.
JAKLOVÁ DYTRTOVÁ, J. , JAKL, M., ŠTEFFL, M. Základy biochemie. Praha: UK FTVS, 2023.

Requirements to the exam

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

Požadavky na zápočet:
písemný test (75%)

Výstupy z biochemie:

znalosti:

složení živé hmoty

hlavní živiny - cukry, tuky, bílkoviny  - jejich rozdělení a charakteristika

metabolické přeměny hlavních živin (glykolýza, beta-oxidace, Krebsův cyklus, buněčné dýchání....)

proteosyntéza (princip, význam, posloupnost, začlenění v rámci buňky)

nukleové kyseliny (struktura, funkce, význam)

polarizace/depolarizace plasmatické membrány, přenos vzruchu, děje na nervosvalové ploténce a svalová kontrakce

biologicky aktivní látky (vitamíny, antioxidanty, signální molekuly)

Syllabus

English

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

Lectures:

1. Composition of living matter, microelements, macroelements

2. Sugars and macroergic substances

3. Lipids

4. Proteins, Amino acids

5. Nucleic acids

6. Metabolism of sugars

7. Fat metabolism

8. Protein metabolism, ammonia detoxification

9. Energy metabolism (Krebs cycle, cellular respiration)

10. Membrane potential, transport

11. Muscle contraction

12. Biologically active substances (vitamin, antioxidant, signal molecules)

13. Proteosynthesis

14. Biochemical reactions, Enzymes

Czech

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (27.10.2023)

Přednášky:
1. Složení živé hmoty, mikroelementy, makroelementy
2. Cukry a makroergické látky
3. Lipidy
4. Bílkoviny, Aminokyseliny
5. Nukleové kyseliny
6. Metabolismus cukrů
7. Metabolismus tuku
8. Metabolismus bílkovin, detoxikace amoniaku

9. Energetický metabolismus (Krebsův cyklus, buněčné dýchání)

10. Přenos vzruchu

11. Svalová kontrakce
12. Biologicky aktivní látky (vitamín, antioxidant, signální molekuly)

13. Proteosyntéza

14. Biochemické reakce, Enzymy

Learning resources

Last update: doc. RNDr. PhDr. Ing. Jana Jaklová Dytrtová, Ph.D. (31.10.2023)

Přednášky probíhají prezenčně.

https://dl1.cuni.cz/course/view.php?id=11112

Klíč je: Bioch23!
Pro rychlou komunikace a další materiály je FB:
https://www.facebook.com/groups/739012476451349

Videa z přednášek jsou na: @janadytrtova2289