Last update: PhDr. Petr Novotný, Ph.D. (23.08.2017)
This course is divided into three thematic blocks those together develop ability of students to efficiently use dedicated and general software tools for data acquisition, processing and publishing. The course focuses on areas that are important in biological research, but includes also examples of successful popularizing scientific research connected with ICT.
Last update: PhDr. Petr Novotný, Ph.D. (27.12.2017)
Předmět rozvíjí schopnost studentů využívat efektivně specializované i obecné softwarové nástroje pro získávání, zpracování a publikování dat. Na prezentované nástroje se zaměřuje z pohledu využítí v odborné biologii a zároveň pohledem učitelské praxe a popularizace vědy a vědních poznatků.
Literature - Czech
Last update: PhDr. Petr Novotný, Ph.D. (27.12.2017)
základní:
GARDENER, Mark, 2012. Statistics for Ecologists Using R and Excel: Data Collection, Exploration, Analysis and Presentation. Exeter: Pelagic Publishing. ISBN 978-1-907807-12-1.
SVATOŇOVÁ, Hana a Marta ROMAŇÁKOVÁ, 2013. Svět a krajina pohledem z výšky: materiál pro učitele. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. ISBN 978-80-210-6263-4.
SVATOŇOVÁ, Hana a Marta ROMAŇÁKOVÁ, ed., 2014. Mapujeme v krajině: materiál pro učitele. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita. ISBN 978-80-210-6798-1.
rozšiřující:
GIBAS, Cynthia a Per JAMBECK, 2001. Developing bioinformatics computer skills. Beijing: O’Reilly. ISBN 978-1-56592-664-6.
LEPŠ, Jan a Petr Šmilauer, 2016, Biostatistika, EPISTEME, ISBN 978-80-7394-587-9
MOTULSKY, Harvey, 2013. Intuitive Biostatistics: A Nonmathematical Guide to Statistical Thinking. 3 vyd. New York: Oxford Univ Pr. ISBN 978-0-19-994664-8.
QUIRK, Thomas J., Meghan QUIRK a Howard F. HORTON, 2014. Excel 2013 for Biological and Life Sciences Statistics: A Guide to Solving Practical Problems. 2015 edition. B.m.: Springer. ISBN 978-3-319-12516-9.
RUDA, Aleš, 2010. Úvod do studia geografických informačních systémů. Vyd. 1. Brno: Mendelova univerzita v Brně. ISBN 978-80-7375-427-3.
ŠTYCH, Přemysl a Lucie KUPKOVÁ, ed., 2014. Dálkový průzkum Země v ochraně přírody. Vyd. 1. V Praze: Nakladatelství P3K. ISBN 978-80-87343-14-2.
VÁVRA, Aleš, 2015. Geoinformační technologie ve fenologickém výzkumu a mapování. 1. vyd. Olomouc: Univerzita Palackého v Olomouci pro katedru geoinformatiky. Terra notitia. ISBN 978-80-244-4056-9.
Syllabus - Czech
Last update: PhDr. Petr Novotný, Ph.D. (27.12.2017)
Obsah předmětu je tematicky rozdělen do tří na sebe navazujících bloků.
První blok je věnován zpracování, základní analýze a prezentaci biologických dat (datové typy, vzorkování, popisná statistika, test normality, klouzavý průměr, typy a tvorba grafů Excel + R). Cílem tohoto bloku je poskytnout obecný informační základ k problematice a praktickou dovednost při prezentaci dat.
fáze výzkumu
sběr dat, jejich typologie, varianty zápisu
zpracování dat - základy R,
zpracování dat - popisná statistika, test normality, plovoucí průměr
typologie grafů, hromadný export grafů
Druhý tematický blok představuje problematiku geografických informačních systémů. Ukazuje možnosti on-line mapových aplikací, následně přechází na příkladu QGIS k využívání WMS a WFS služeb, tvorbě vlastních vektorových vrstev vrcholící publikací autorské mapy vybrané lokality.
principy GPS, souřadncýh systémů a projekcí
online GIS aplikace (Seznam.cz, maps.google.com, geoportal.cuzk.cz/geoprohlizec etc.)
Třetí blok zahrnuje moderní instrumenty, zejména terénní biologie (GPS tracker, fotopasti, IP kamery, CCD snímače k optickým přístrojům, digitální mikroskopy s měřicím a analytickým SW, auto- a semiautonomické systémy sběru dat) a ukazuje jejich užití ve výzkumu a popularizaci biologie na příkladech úspěšných projektů ČT, ČRo a dalších.
telemetrie
fotopasti
webové kamery
QR code
rozšířená realita
snímače pro mikroskopii
Předmět je vyučován seminární formou, studenti používají vlastní notebooky. Výukové materiály v podobě prezentací, vzorových řešení a kódů jsou ke stažení ve fakultní instalaci Moodle.
Course completion requirements - Czech
Last update: PhDr. Petr Novotný, Ph.D. (02.12.2017)
studenti zpracovávají jako studentský projekt mapový set vybrané lokality s různými WMS zdroji vybavené legendou, měřítkem; doplněno grafy a popisnými statistickými informacemi reálných dat nejbližší meteorologické stanice - bude upřesněno po dokončení bloku GIS. Odevzdávají ve formě PDF elektronicky do 6 týdnů od zadání práce
