Molecular and Cell Biology for Biophysicist - NBCM008

• Title: Molekulární a buněčná biologie pro biofyziky
• Guaranteed by: Institute of Physics of Charles University (32-FUUK)
• Faculty: Faculty of Mathematics and Physics
• Actual: from 2023
• Semester: winter
• E-Credits: 4
• Hours per week, examination: winter s.:3/0, Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Additional information: http://biomolecules.mff.cuni.cz/bcm008
• Guarantor: Mgr. Dita Strachotová, Ph.D.
• Classification: Physics > Biophysics and Chemical Physics
• Pre-requisite : NBCM012

Annotation

English

Last update: T_FUUK (22.05.2006)

Cell as the smallest part of living organisms, its structure, function, reproduction and its demise. Application of biophysical approaches in molecular and cellular biology.

Czech

Last update: T_FUUK (22.05.2006)

Buňka jako nejmenší část živých organismů, její struktura, funkce, reprodukce a zánik. Uplatnění biofyzikálních přístupů v molekulární a buněčné biologii.

Course completion requirements

English

Last update: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (30.10.2019)

Oral exam, exam requirements - in the extent of the syllabus.

Czech

Last update: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (30.10.2019)

Ústní zkouška, požadavky ke zkoušce - v rozsahu sylabu.

Literature

Last update: OSTEP/MFF.CUNI.CZ (11.10.2008)

Bruce Alberts et al. (2008): Molecular Biology of the Cell. Garland Science, 5TH Edition

Harvey Lodish et al. (2007): Molecular Cell Biology. Garland Science, 6TH Edition

Bruce Alberts et al. (1999): Základy buněčné biologie. Úvod do molekulární biologie buňky.Espero Publishing, České vydání

Requirements to the exam

English

Last update: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (31.10.2019)

Oral exam requirements are within the scope of the lecture syllabus.

Czech

Last update: doc. RNDr. Dana Gášková, CSc. (31.10.2019)

Požadavky ústní zkoušky jsou v rozsahu zveřejněného sylabu přednášky.

Syllabus

English

Last update: T_FUUK (22.05.2006)

Cell

• the smallest part of living nature

• insight into the history - progress in uncovering cell´s life processes and in methodology

• today´s techniques and applications of biophysical methods

• cell structure - organelles and cell compartments

Cell reproduction

• cell cycle

• DNA replication

• transcription, translation of DNA, repair mechanisms

• virion - structure and reproduction

Microscopy application in cell structure studies

• from ancient microscope to the state-of-the-art devices

• light microscopy

• fluorescence microscopy

• electron microscopy

• fluorescent reporter molecules

Cytoskeletal apparatus

• cellular cytoskleton

• molecular motors

Cell communication

• signaling pathways

• receptors

Mitochondria and nucleus

• mitochondria - structure and function

• cellular respiration

• nucleus - structure and function

Processes of cell aging

• aging

• programmed cellular death - apoptosis

Czech

Last update: OSTEP/MFF.CUNI.CZ (15.10.2008)

Úvod
Buňka (nukleové kyseliny, proteiny, membrány, organely)

Modelové organizmy

Molekulární genetika
DNA metabolismus (replikace, reparace, rekombinace)

Genová expreseI (transkripce, úpravy RNA, translace)

Genová exprese II (folding, sorting a úpravy proteinů)

Regulace genové exprese (transkripční regulace, modulace chromatinu, alternativní sestřih, regulace stability mRNA, regulovaná degradace proteinů)

Replikace virů (DNA viry, RNA viry, retroviry)

Buněčná fyziologie
Membrány (membránový transport, protonový gradient, neurobiologie)

Dynamika buňky (cytoskelet, buněčné kontakty, molekulární motory)

Buněčná reprodukce (buněčný cyklus, mitóza a meióza, diferenciace a buněčná smrt, regulace buněčného cyklu a nádorové bujení)

Buněčná komunikace (typy signálních drah, imunologie)

Metody v molekulární biologii
Biochemické metody (manipulace s DNA, manipulace s proteiny, analýza genové exprese)

Genové inženýrství (transgeneze organizmů, molekulárně biologické studie, genová terapie)

Fluorescenční proteiny (fluorescenční mikroskopie, typy fluorescenčních proteinů, základní a rozšířené aplikace)