Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
The lecture presents the topic of therapeutic proteins as a new branch of biopharmaceuticals, gaining growing interest as a tool in diagnostics and treatment of cancer, hormonal disorders, and vaccination. It deals mainly with modern techniques of recombinant protein expression (including practical tips) and gives an overview of structural and functional classes of protein therapeutics with special regard to new and alternative protein binding scaffolds. A separate chapter is devoted to protein modification, conjugation, and administration issues.
A special interest is given to practical examples - each lecture contains, besides the part from the main topic, a part describing one example of a therapeutically used protein, with a review of its research, development, and current usage.
Lectures are delivered in English. Depending on the number of students enrolled, the course can be arranged as lectures or in another way (colloquium, consultations).
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
Přednáška představuje problematiku terapeutických proteinů jako nové třídy biofarmaceutik, která nyní nachází stále větší uplatnění zejména při diagnostice a léčbě nádorových onemocnění, hormonálních poruch a při tvorbě rekombinantních vakcín. Zabývá se především současnými moderními metodami rekombinantní exprese takových proteinů (včetně praktických tipů) a přehledem jejich tříd dle struktury a funkce, včetně shrnutí nejnovějších poznatků o alternativních strukturních motivech vazebných proteinů. Zvláštní kapitolou jsou modifikace a konjugace terapeutických proteinů pro jejich administraci a specifické aplikace.
Zvláštní důraz je kladen na praktické příklady - každá přednáška vedle části ze základní osnovy obsahuje také část týkající se jednoho konkrétního terapeuticky používaného proteinu, včetně přehledu jeho výzkumu a vývoje a současného použití.
Výuka probíhá v angličtině. V závislosti na počtu zapsaných studentů může být kurz uspořádán jako přednášky nebo jiným způsobem (kolokvium, konzultace).
Literature -
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
Biopharmaceutical benchmarks. Walsh G. Nat Biotechnol. 18 (2000): 831-833.
Biopharmaceutical benchmarks 2003. Walsh G. Nat Biotechnol. 21 (2003): 865-870.
Biopharmaceutical benchmarks 2006. Walsh G. Nat Biotechnol. 24 (2006): 769-776.
Biopharmaceutical benchmarks 2010. Walsh G. Nat Biotechnol. 28 (2010): 917-924.
Biopharmaceutical benchmarks 2014. Walsh G. Nat Biotechnol. 32 (2014): 992-1000.
Biopharmaceutical benchmarks 2018. Walsh G. Nat Biotechnol. 36 (2018): 1136-1145.
Biopharmaceutical benchmarks 2022. Walsh G. Nat Biotechnol. 40 (2022): 1722-1760.
Expression systems. Dyson M. R., Durocher, Y. eds. Bloxham, Scion Publishing Ltd., 2007
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
Biopharmaceutical benchmarks. Walsh G. Nat Biotechnol. 18 (2000): 831-833.
Biopharmaceutical benchmarks 2003. Walsh G. Nat Biotechnol. 21 (2003): 865-870.
Biopharmaceutical benchmarks 2006. Walsh G. Nat Biotechnol. 24 (2006): 769-776.
Biopharmaceutical benchmarks 2010. Walsh G. Nat Biotechnol. 28 (2010): 917-924.
Biopharmaceutical benchmarks 2014. Walsh G. Nat Biotechnol. 32 (2014): 992-1000.
Biopharmaceutical benchmarks 2018. Walsh G. Nat Biotechnol. 36 (2018): 1136-1145.
Biopharmaceutical benchmarks 2022. Walsh G. Nat Biotechnol. 40 (2022): 1722-1760.
Expression systems. Dyson M. R., Durocher, Y. eds. Bloxham, Scion Publishing Ltd., 2007
Requirements to the exam -
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (20.04.2021)
The exam will consist of a written part (test) and an oral part (discussion of the test and related questions).
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (09.11.2011)
Úspěšné složení zkoušky, která sestává z písemného testu a následné ústní části (diskuze testu, doplňující otázky).
Syllabus -
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
Introduction to protein therapeutics: review of current and future market, ways of approval. Modern methods of recombinant protein expression: overview, choosing the right expression host. Cloning with and without restriction endonucleases. Prokaryotic expression systems: pros and cons, news and techniques. Eukaryotic expression systems: yeast, protozoa, plant expression systems, and insect cells. Protein production in mammalian cell lines: stable and transient transfection, selection and yield improvement, cell line engineering. Monoclonal antibodies and their recombinant fragments. Hormones, cytokines, and other small therapeutics. Recombinant vaccines: boons and risks. New alternative protein binding scaffolds: (not only) alternatives to antibodies. Therapeutic protein modifications: conjugation with polymers, solid phase depot formulation, administration issues of protein solutions, protein radioconjugates.
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (19.02.2024)
Úvod do problematiky terapeutických proteinů: přehled přípravků na trhu v současnosti a brzké budoucnosti, postupy schvalování nových terapeutik. Moderní metody rekombinantní exprese proteinů: přehled, výběr expresního systému. Klonování s a bez použití restrikčních endonukleas. Prokaryotické expresní systémy: výhody a nevýhody, novinky a postupy. Eukaryotické expresní systémy: kvasinky, prvoci, rostlinné expresní systémy a hmyzí buňky. Produkce v savčích buněčných liniích: stabilní a tranzientní transfekce, selekce a ovlivnění výtěžku, buněčné inženýrství. Monoklonální protilátky a jejich rekombinantní fragmenty. Hormony, cytokiny a další malá terapeutika. Rekombinantní vakcíny: výhody a rizika. Nové alternativní strukturní motivy vazebných proteinů: (nejen) alternativy k protilátkám. Terapeutické modifikace proteinů: konjugace s polymery, metody depozice do pevné fáze, aspekty podání roztoků proteinů, proteinové radiokonjugáty.
Entry requirements -
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (16.02.2012)
Your interest in the lecture topic:-)
Last update: RNDr. Ondřej Vaněk, Ph.D. (16.02.2012)
