The Immunology of infectious diseases course is intended for advanced MSc or PhD students with an interest in host-pathogen interactions. The course is held in English, the first half of each lecture is devoted to the theoretical background and during the second part, the emphasis is given to the interaction and discussion between lecturer and students focusing on a current research paper(s) essential for selected topics. Various aspects of host-pathogen interactions are going to be covered during the course, starting from differences between systemic and epithelial immune responses, further focusing on the complexity of immune response during viral, bacterial, fungal or parasitic infection and closing the circle with the escape strategies imposed by pathogens in order to prevent the immune response. The main objective of the course is to understand how the complexity of the immune response against pathogens is achieved and regulated. Students will also learn to critically read and discuss scientific papers in the quickly evolving field of host-pathogen interaction.
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Kurz infekční imunologie je určen pro pokročilé magisterské anebo PhD studenty se zájmem o interakci patogenů s hostitelským organismem. Tento kurz probíhá v anglickém jazyce, každá lekce je spojením teoretické přednášky a diskuze nad předem vybranými vědeckými články. V rámci přednášky jsou probírány jednotlivé aspekty interakce patogenů s hostitelem, rozdíly mezi systémovou imunitní odpovědí a imunitní odpovědí lokalizovanou v epitelu. Dále se přednáška zaměřuje na komplexitu imunitní odpovědi proti virům, bakteriím, kvasinkám a parasitům. V poslední části jsou pak nastíněny únikové strategie využívané patogeny k manipulaci imunitního systému. Hlavním cílem tohoto kurzu je pochopení komplexity imunitní odpovědi proti patogenům a jak je tato odpověď regulována.
Literature -
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Selected scientific papers are available for each lecture and there are going to be sent by the lecturer prior to the lecture. Students will be granted access to presentations used during lectures at the end of the course. The following book is also covering part(s) of the lecture: Immunology, Infection and Immunity - G.B. Pier, J. B. Lyczak and L. M. Wetzler.
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Jako studijní materiál je ke každé lekci k dispozici literatura (vědecké články) zaslané studentům před lekcí. Studenti po skončení kurzu obdrží přístup k prezentacím. Pro obecný přehled může dobře posloužit následující učebnice, která pokrývá část přednášené látky: Immunology, Infection and Immunity - G.B. Pier, J. B. Lyczak and L. M. Wetzler.
Requirements to the exam -
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Given the format of the course, active attendance on 80% of the lectures is required. The grade for the course will be based on one final take-home exam. There will be four questions for the final exam (maximum one page per answer). Exams will be handed out at the end of the final class and will be due during the next 48 hours. Answers for the take-home exams have to be done independently. Questions are going to be based on the topics covered during lectures.
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Vzhledem k charakteru předmětu je vyžadována aktivní účast na přednáškách minimálně 80%. Zkouška probíhá písemně, formou čtveřice otázek s otevřenou odpovědí o maximální délce odpovědi jedné strany formátu A4. Na vypracování je k dispozici 48 hodin od zadání otázek. Otázky přímo vycházejí z probíraných témat.
Syllabus -
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
1.Introduction, historical perspective of the fight against infectious diseases
2. Systemic versus epithelial localized immune response. The role of epithelial cells in the resolution of infection.
3. Immune response against viruses
4.HIV – epidemiology and treatment (prof. Ladislav Machala, FN Bulovka)
5.HIV – clinical perspective (prof. Ladislav Machala, FN Bulovka)
6. Immune response against bacteria I. – Tolerance versus immunity, symbionts, pathobionts, pathogens
7. Immune response against bacteria II. – Microbiome composition
8.Immune response against bacteria III.– Dysbiosis, Immune response to pathogens
9.Bacterial infections - clinical aspects
10.Immune response against fungi
11.Immune response against parasites
12.Immune evasion strategies
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Výuka kurzu probíhá každý týden. Přednáška je vedena interaktivní formou, očekává se aktivní diskuze tématu mezi studenty a vyučujícím. Během každé lekce bude na začátku posluchač uveden do problematiky, která bude následně do hloubky rozebrána pomocí klíčové recentní publikace. Na každou přednášku vyučující vybere v závislosti na tématu dvě až tři publikace, mezi kterými se bude nacházet vědecké review a klíčový článek daného tématu. Tyto publikace vyučující zašle posluchačům emailem ve formátu pdf souborů tak, aby si je mohli před hodinou prostudovat a následně byli připraveni na jejich diskuzi v rámci přednášky. Přednášky 4. a 5. mají mírně odlišnou koncepci a rozebírají jednotlivé klinické případy. Tyto přednáčky budou probíhat v českém jazyce.
1.Úvod, organizace předmětu a požadavky na splnění předmětu, Historická perspektiva boje proti infekcím
2.Rozdíl mezi systémovou a epiteliální imunitní odpovědi. Role epitelu v imunitní odpovědi a protekci proti infekci.
3.Imunitní odpověď proti virové infekci
4.HIV – epidemiologie a léčba (prof. Ladislav Machala, FN Bulovka)
5.Kazuistiky k HIV (prof. Ladislav Machala, FN Bulovka)
6.Imunitní odpověď proti bakteriím I. – Tolerance vs. imunita, symbionti, patobionti, patogeny
7. Imunitní odpověď proti bakteriím II. – složení mikrobiomu a možnosti jeho ovlivnění
8.Imunitní odpověď proti bakteriím III. – dysbiozy, regulace patobiontů, odpověď proti patogenům
9.Komplexita odpovědi proti bakteriálním infekcím
10.Imunitní odpověď proti kvasinkové infekci
11.Imunitní odpověď proti mnohobuněčným parazitům
12.Mechanismy úniku patogenů imunitnímu dohledu
Entry requirements -
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
The basic background in immunology (please see courses: MB150P14B or MB150P14E) is essential for enrolling in this course. It is highly advantageous if students also pass additional immunology-related courses prior to taking the Immunology of infectious disease course (eg. MB150P15A, MB150P13, MB150P90E).
Last update: Mgr. Jan Dobeš, Ph.D. (21.07.2022)
Předchozí absolvování předmětu Imunologie (MB150P14B) nebo Immunology (MB150P14E) nebo znalost pokrývající jejich úroveň je esenciální pro zápis tohoto předmětu. Absolvování předmětů Molekulární imunologie (MB150P15A), Regulační mechanismy imunity (MB150P13) a Vrozená imunita (MB150P90E) před zapsáním kurzu je výhodou.
