Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
The course provides a working knowledge of biochemistry, focusing on practical aspects of the field. It covers basic biochemical techniques used in modern experimental biology, e.g. chromatography, spectrophotometry, and electrophoresis applied to the analyses of lipids, carbohydrates, proteins and enzymes in various biological materials. Students are given the opportunity to perform simple biological experiments independently. General outline for each experiment: The introduction - is organized as interactive seminar to update the theoretical background and practice biochemical computations. The experiment - is carried out by students independently (2 in a group). The analysis and presentation of data - written report is prepared by the students. The discussion - interactive seminar to evaluate results and discuss problems. Examples of experiments: 1) Determination of glycogen levels in the mouse liver after starvation. 2) Isolation of recombinant protein, SDS-PAGE electrophoresis. 3) Quantitative analysis of erythrocytes phospholipids in ruminant and non-ruminant mammals.
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (04.09.2020)
Praktikum z biochemie je určeno studentům biologických bakalářských programů, kteří absolvovali přednášku Biochemie (MB150P04) nebo Základy biochemie (MB150P40). Praktikum slouží výuce základních návyků práce v biologické laboratoři. Úlohy jsou koncipovány s ohledem na to, že jde o praktikum pro biology a že s biochemickými metodami se může ve své práci setkat každý biolog. Úlohy proto nejsou náročné, je však kladen důraz na práci vlastníma rukama. Praktikum probíhá 1 týden, studenti pracují ve skupinách po dvou.
Cílem praktika je ukázat jakými metodami lze studovat vlastnosti některých biologicky významných sloučenin (lipidů, sacharidů, proteinů a enzymů v biologických materiálech). Studenti se učí základním dovednostem práce v laboratoři a sami se naučí používat důležité biochemické metody jako chromatografii, spektrofotometrii či elektroforézu proteinů. Studenti se učí zvládnout biologický experiment - od začátku jeho plánování až k jeho vyhodnocení a formulaci závěrů v protokolu. Podmínkou úspěšného zvládnutí experimentů je, aby se posluchači před vstupem do praktika seznámili s teoretickým základem každé úlohy.
Další informace o Praktiku a zápis do jednotlivých turnusů jsou na serveru Moodle (http://dl2.cuni.cz/).
Literature -
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
Lehninger. Principles of Biochemistry, 3rd edition (2000), ISBN 1-57259-153-6, Nelson, D.L., Cox, M.M. Worth Publishers, New York
Voet, D. and Voet, J.: Biochemistry. 3rd ed. (2004), ISBN 0-471-19350-x, John Wiley & Sons, Inc.
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
Nováková, O., Kalous, M., Folk, P. Návody k praktiku z biochemie pro biology (2004), Karolinum, Praha
Lehninger. Principles of Biochemistry, 3rd edition (2000), ISBN 1-57259-153-6, Nelson, D.L., Cox, M.M. Worth Publishers, New York
Voet, D. and Voet, J.: Biochemistry. 3rd ed. (2004), ISBN 0-471-19350-x, John Wiley & Sons, Inc.
Requirements to the exam -
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
Conditions for obtaining credits:
1. Attendance on the introductory lecture and successful completion of the entrance exam.
2. Active participation in experimental work.
3. Written report that meets the requirements (before the beginning of summer semester).
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
Podmínky pro získání zápočtu:
1. Absolvování úvodní přednášky a úspěšné vyřešení vstupního testu
2. 100% účast na všech úlohách
3. Odevzdání protokolů vyhovujících požadavkům nejpozději do začátku letního semestru
Syllabus
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (24.02.2021)
Examples of experiments: 1) Determination of glycogen concentration in rat liver after starvation: the experimental aim is to isolate and determine glycogen content in rat liver. The glycogen content in the livers of two individuals, normally fed rats and short-term fasted rats, will be compared. Glycogen will be separated from mono- and oligosaccharides and hydrolyzed in acidic conditions. The resulting glucose will be determined spectrophotometrically using an enzymatic test. 2) Isolation of recombinant protein, SDS-PAGE electrophoresis: the experimental aim is to isolate GST-fusion protein (14-3-3 or beta-galactosidase) from a bacterial culture of Escherichia coli. Recombinant GST-fusion protein will be isolated from bacterial culture of E. coli by affinity chromatography. The quality of the individual purification steps will be verified by SDS-PAGE electrophoresis. 3) Phospholipids in biological membranes: the experimental aim is to compare the quantitatively different content of phospholipids in the membranes of erythrocytes of ruminant and non-ruminant animals. Phospholipids will be divided into basic groups by thin layer chromatography and the relative proportion of selected phospholipid species will be determined quantitatively by densitometric image analysis.
Registration requirements - Czech
Last update: doc. RNDr. Daniel Rösel, Ph.D. (01.08.2013)
Zápis na úvodní přednášku a zápis do turnusů probíhá elektronicky na serveru MOODLE (http://dl2.cuni.cz/). Kurz samotný najdete v nabídce: Přírodovědecká fakulta, Sekce biologie, Katedra buněčné biologie, PBB.
