Statistics for bioanalytical applications - GBN012

• Title: Statistika v bioanalytických aplikacích
• Guaranteed by: Department of Biophysics and Physical Chemistry (16-16110)
• Faculty: Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
• Actual: from 2021
• Semester: winter
• Points: 0
• E-Credits: 4
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:12/10, C+Ex [HS]
• Capacity: unlimited / unlimited (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Explanation: 2.ZBN - akreditace
• Note: course can be enrolled in outside the study plan; enabled for web enrollment
• Guarantor: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D.
• Comes under: 2.ročník 2023/24 BLDZ povinné

Annotation

English

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (19.09.2022)

Statistics in Bioanalytical Applications addresses classical and modern statistical methods popular in pharmaceutical research. Experience with basic statistical procedures and the resulting interpretation of results is expected. Students will learn about other methods offered by the GraphPad software, in which specific examples from pharmacy and related fields are exerciced.

Czech

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (19.09.2022)

Statistika v Bioanalytických Aplikacích se zabývá klasickými a moderními statistickými metodami populárními ve farmaceutickém výzkumu. Předpokládá se zkušenost se základními statistickými postupy a výslednou interpretaci výsledků. Studenti se seznámí s dalšími postupy nabízenými softwarem GraphPad, ve kterém jsou procvičeny konkrétní příklady z farmacie a příbuzných oblastí.

Course completion requirements

English

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (19.09.2022)

The course requires to pass a credit test, which consists in performing statistical analyzes before the PC in GraphPad. The analyzes are analogous to those discussed at the seminars. Every student has at most 3 tries.

Czech

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (19.09.2022)

Predmet je zakoncen zapoctem, ktery spociva v provedeni statistickych analyz pred PC v programu GraphPad. Analyzy jsou analogicke k analyzam probranym na seminarech. Každý student má právo na 3 pokusy.

Literature

English

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (11.10.2021)

Obligatory:

• Li Wan Po, Alain. Statistics for pharmacists. London: Blackwell Sci., 1997, 252 s. ISBN 0-632-04881-6.
• Box, George E. P. Hunter, J. Stuart Hunter, William Gordon. Statistics for experimenters : design, innovation, and discovery. Hoboken, N.J.: Wiley-Interscience, 2005, 633 s. ISBN 0-471-71813-0.

Czech

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (11.10.2021)

Doporučená:

• Li Wan Po, Alain. Statistics for pharmacists. London: Blackwell Sci., 1997, 252 s. ISBN 0-632-04881-6.
• Box, George E. P. Hunter, J. Stuart Hunter, William Gordon. Statistics for experimenters : design, innovation, and discovery. Hoboken, N.J.: Wiley-Interscience, 2005, 633 s. ISBN 0-471-71813-0.

Syllabus

Last update: doc. Dipl.-Math. Erik Jurjen Duintjer Tebbens, Ph.D. (19.09.2022)

Opakování základních pojmů

Popisná a matematická (induktivní) statistika. Nejběžnější parametry statistických souborů. Normální rozdělení a centrální limitní efekt. T-, Chi-kvadrát- a F-rozdělení. Vzorkování a statistická nezávislost, korelace. 

Základní testy, intervaly spolehlivosti

Z-test a různé typy t-testů, F-test o shodě rozptylů. Jedno- a dvoustranné testy, ANOVA pro jeden a více faktorů. Rozložení variability pomocí různých typů součtů kvadrátů. Intervaly spolehlivosti a jejich vztah k testům hypotéz.  

Regresní modely

Jejich smysl a možnosti použití. Lineární regrese a logistická regrese. Multivariate modely. Survival analysis, Cox modely.

Testy pro kvalitativní proměnné

Chi-kvadrát test dobré shody (Pearsonův chi-kvadrát test).  Dummy coding pro lineární a logistickou regresi. 

Párování

Párování, randomizace, (randomizované) blokování.

Neparametrické metody

Použití neparametrických metod. Permutační testy, Fisherův exaktní test, rank-sum test (Mann-Whitney U-test), Wilcoxonův test, Kruskal-Wallis test, Friedlandův test.

Klasifikační úlohy

Shlukování, (lineární) diskriminační analýza.

Plánování experimentů

Design of Experiments (DoE), faktoriální design, PCA, statistická síla.

Zpracování výsledků

Ověření předpokladů, vylučování odlehlých hodnot, missing values, meta-analýzy.