Microbiology, Immunology and General Infectology - IMMUNOLOGY - CVSE3P0020

• Title: Mikrobiologie, imunologie a obecná infektologie - IMUNOLOGIE
• Guaranteed by: Department of Immunology and Clinical Biochemistry 3FM CU (12-IMUN)
• Faculty: Third Faculty of Medicine
• Actual: from 2014 to 2014
• Semester: both
• Points: 1
• E-Credits: 1
• Hours per week, examination: 0/0, other [HS]
• Extent per academic year: 0 [hours]
• Capacity: winter:unknown / unknown (unknown); summer:unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech, English
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Note: you can enroll for the course in winter and in summer semester
• Guarantor: doc. MUDr. Marek Bednář, CSc.; prof. MUDr. Jiří Beneš, CSc.; doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D.
• Is pre-requisite for: CVSE3P0009

Annotation

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Microbiology, Immunology and General Infectology The goal of the course is to explain the relationships between individual reactivity of humans, pathogenic microorganisms and environment.

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Obsahem předmětu je obecná a klinická lékařská mikrobiologie, imunologie a obecná infektologie. Imunologie se učí v zimním semestru, obecná infektologie v letním semestru, mikrobiologie v obou semestrech. Z každého předmětu získá student kolokvium (-a). Soubor kolokvií bude podkladem k udělení zápočtu z celého předmětu. Kolokvium lze získat po ukončení předepsané etapy výuky oboru. Kolokvia budou kopírovat výuku tj. v zimním semestru budou kolokvia z mikrobiologie a z imunologie, v letním semestru budou kolokvia z mikrobiologie a z obecné infektologie. Na konci semestru získají studenti zápočet z předmětu na základě získaných příslušných kolokvií a v letním semestru proběhne zkouška ze tří zúčastněných oborů. Forma zkoušky bude včas oznámena. Smyslem předmětu z pohledu mikrobiologa je naučit studenta chápat vztah mezi patogenním mikroorganizmem a jeho hostitelem z hlediska nepříznivých biologických vlastností mikroorganizmu (patogenita, virulence) i z hlediska obranyschopnosti makroorganizmu (nespecifická a specifická imunita). Popis tohoto vztahu se případně konkretizuje v příslušné nosologické jednotce (infekčním onemocnění). Dále je obsahem předmětu laboratorní diagnostika, základy léčby a prevence infekčního onemocnění. Obsahem kurzu je dále výuka principů onemocnění a základních projevů chorob, které mají neinfekční mechanizmus a porucha imunitního systému je základní nebo významnou příčinou onemocnění (autoimunitní choroby, stavy primární a sekundární imunodeficience a choroby vzniklé na podkladě hypersenzitivity). Pro usnadnění výuky jsou v některých tématech používány klinické situace, kasuistiky. Logikou, odvozováním a podobnými věcmi se předmět dá postihnout jen z malé části. Tomu je uzpůsobena forma výuky, který zahrnuje řadu průběžných kontrol studia tak, aby student bez větších nesnází obstál při zkoušce. V mikrobiologii jde o 5 testů z předepsaného učiva (2 v zimě, 3 v létě) konaných vždy v době přednášky. Dále o průběžné úsatní opakování během praktických cvičení. Editace textu není ukončena!

Aim of the course

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

The goal of the course is to explain the relationships between  individual reactivity of humans, pathogenic microorganisms and environment. The basis is to understand  interactions between various microorganisms and individual defense mechanisms of human organism, to specify and quantify both players of interactions - detection of pathogens and their property and features of immune mechanisms. This educational process on the microscopic and molecular level  is supplemented by the clinical approach - demonstration of clinical cases with origin of infection or diseases caused by immune disorders. •Students are expected to combine knowledge of pathophysiology, microbiology, immunology and histopathology - rational clinical science will be born from that. Students will get knowledge of clinical picture of infectious and immunopathologic diseases, diagnostic approach and basics of therapeutic approach.

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

 Základním cílem předmětu je vysvětlit vztah mezi člověkem, patogenními mikroorganismy a dalšími vlivy prostředí v různých souvislostech. Jde o pochopení interakcí, k nimž dochází mezi různými mikroorganismy a obrannými mechanismy člověka (někdy již primárně změněnými), ale současně i o demonstraci laboratorních vyšetření, které v praxi umožňují prokazovat, specifikovat a kvantifikovat obě zúčastněné složky - čili detekce patogenních mikroorganismů a jejich vlastností na jedné straně a zjišťování velikosti a charakteru imunitní reakce na straně druhé. Tato výuka procesů probíhajících na mikroskopické nebo molekulární úrovni je doplněna klinickým pohledem - demonstrací typických nemocí, které mají infekční příčinu, a rovněž nemocí, které vznikají v důsledku poruchy imunity. Od studenta se očekává propojení mezi znalostmi fyziologie, imunologie, mikrobiologie a histopatologie; z těchto znalostí vychází racionální klinické myšlení. Studenti by měli získat náhled na klinický obraz infekčních a imunopatologických onemocnění, měli by znát jejich diagnostiku a měli by mít i rámcovou představu o jejich terapii.

 

Literature

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Part Immunology:

Essentials of Clinical Immunology, Chapel H, Haeney M et al.  Blackwell Science,  6th Ed. 2014

Cellular and molecular immunology, Abbas AK et all. Elsevier, 9th Ed.,2018

Roitt ´s Essential Immunology, PF Delves, SJ Martin, DR Burton, IM Roitt. Wiley, 2011, 12th Ed, www.roitt.cz 

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Základní texty:

Beneš, J: Infekční lékařství. Praha: Galén 2009 (využije se i v rámci výuky infekčního lékařství ve 3. a v 5. ročníku)

Bednář M, Fraňková V, Schindler J, Souček A, Vávra J: Lékařská mikrobiologie, Praha: Marvil 1997

Základy klinické imunologie, H. Chapel, 6. vyd., překlad 2018, Triton

Hořejší V, Bartůňková J, Brdička T., Špíšek R.: Základy imunologie, Praha, Triton 2017

 

Doplňující:

J. Krejsek, C. Andrýs, I.Krčmová. Imunologie člověka. Hradec Králové, Garamon, 2016

V. Špičák, P. Panzner, Alergologie, Galén 2005

J. Bartůňková Imunodeficience. Grada 2002, 2007, 2009

Alergie, časopis pro postgraduální vzdělávání, Tigis (www.tigis.cz)

 

 

Teaching methods

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Lectures will give basic informations about topics, seminars are based on interactive knowledqe acquisition. Practicum is based on immediate practical training of laboratory or clinical diagnostics procedures. Practicum at the clinic will allow to demonstrate the clinical science in reality.

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Přednášky přináší obecné informace o tématu, semináře umožní interaktivně získat znalosti a vědomosti podrobnějších charakteru. Praktika umožní studentům porozumět a naučit se základním laboratorním a klinickým diagnostickým postupům. Stáže na lůžkovém oddělení ukazují jednak klinické projevy jednotlivých nemocí, ale studenti se při nich seznamují i s uplatňováním diagnostických a léčebných výkonů v praxi.  

Requirements to the exam

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Credit for the COurse is  based on 3 Colloqiums (Microbiology, Immunology, Infectology)

Part Immunology:

·         Active presence at the course (practicum is obligatory)

·        Case presentation: A group of 3 students will elaborate a description of clinical case of immmune mediated disease. Based on the short description, students will select appropriate diagnostic procedures and tests. The teacher will provide feedback, test results and advice. The case description consists from symptoms descriptions, pathogenesis of the disease, appropriate tests, probable diagnosis a possible treatment. These results are presented by students during specific time for case presentation (Exam period), discussed by others and evaluated by teacher. Some question on the case topic. Resources for the case presentation - several citations from recent peer- rewied journals with formal aspects, lay information from web is not allowed as a reliable medical resource (example of reference:   Dlouhý P, Kučera P, Kraml P, Pompachová A, Potočková J, Šmejkalová V, Mokrejš P, Jaček M, Anděl M.. Short-Term Dietary Intake of C18:1 Trans Fatty Acids Decrease the Function of Cellular Immunity in Healthy Young Men, Ann Nutrition Metab, 2008, 53, 129-136.)

 

Exam from Microbiology, Immunology and General Infectology:

Terms: Exam period of summer semester, 3rd year, announced in SIS

Form: Oral, commisional exam

Questions from Immunology part:

1.       Immune system - characteristics, structure and function

2.       Characteristics of antigens, types and properties. T-dependent and T-independent antigens

3.       Functions of antibodies

4.       Monoclonal antibodies and their use

5.       Subpopulation of T cells, their functions (Th1, Th2, T reg, Th17, Tc), roles in immunopathology

6.       Analysis of immune proteins - electrophoresis,  turbidimetry, nephelometry. Agglutination,  hybridome technology

7.       Defense mechanisms of skin and their disorders

8.       Mucosal immune system - structure and function of mucosal barrier

9.       Lymphatic tissue of mucosa, Common mucosal immune system

10.    Oral (mucosal) tolerance and disorders of  tolerance

11.    Antiinfectious immunity- principles of antibacterial immunity

12.    Defense against intracellular pathogens (bacteria and small  parasites - Protozoa) and fungi

13.    Antiinfectious immunity - against viruses and Helminths

14.    Detection of antiinfectious antibodies - ELISA, Westernblotting, agglutination

15.    Immunodeficiency - classification and typical clinical picture

16.    Primary  antibody deficiency  - molecular basis, classification, clinical picture

17.    Primary cell mediated immunodeficiency with T cell defect -  molecular basis, classification, clinical picture

18.    Primary defect of phagocytosis and complement - molecular basis, classification, clinical picture

19.    Laboratory tests of cell - mediated immunity

20.    Principles of immunoglobulin substitution therapy

21.    Secondary immunodeficiency - causes, clinical picture ant therapy

22.    Immunopathology of HIV infection

23.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type I - pathophysiology

24.    Types  and sources of IgE antigens - allergens

25.     Atopic diseases - characteristics, diagnosis and therapy

26.    Anaphylaxis  - characteristics, diagnosis and therapy

27.    Clinical and laboratory  investigation in atopic diseases

28.    Therapy of atopic diseases, allergen vaccination

29.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type II - pathophysiology

30.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type II - clinical picture

31.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type III - pathophysiology

32.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type III - clinical picture

33.    Immunopathology reactions of hypersenzitivity, Type IV - pathophysiology

34.    Immunopathologic reactions of hypersenzitivity, Type IV - clinical picture

35.    Etiology and pathogenesis of autoimmune diseases

36.    Autoimmunity, risk factors and mechanisms of tissue autoimmune destruction

37.    Autoantigens and autoantibodies

38.    Systemic autoimmune diseases, clinical picture

39.    Organ - nonspecific autoantibodies, indirect immunofluorescence for their detection and diagnostic significance.

40.    Organ specific autoimmune diseases, clinical picture

41.    Organ specific autoantibodies, detection by ELISA, diagnostic significance

42.    Antitumor immunity - function, mechanisms.

43.    Antigens of tumor cells. Immunotherapy of tumors

44.    Transplantation -  definition, types, transplantational antigens, investigation before transplantation

45.    Immune reactions after transplantation

46.    Immunohematology

47.    Principles of flow cytometry, immunophenotypization of immune cells

48.    Immunology of  reproduction, immune disorders of fertility

49.    Passive and active vaccination, adjuvans

50.    Biological therapy - principles and clinical use

 

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Z každého ze tří oborů tvořících předmět získá student kolokvium (-a). Soubor kolokvií bude podkladem k udělení zápočtu z celého předmětu. Kolokvium lze získat po ukončení předepsané etapy výuky oboru. Kolokvia budou kopírovat výuku tj. v zimním semestru budou kolokvia z mikrobiologie a z imunologie, v letním semestru budou kolokvia z mikrobiologie a z obecné infektologie.

1. Část imunologie, podmínky kolokvia:

·       Aktívní účast na kurzu (praktika jsou povinná)

·        prezentace klinického případu: Skupina 3 studentů připravuje během semestru popis klinického případu (kasuistiku): Na základě předloženého popisu vybírá vhodná vyšetření, navrhuje možné diagnozy, stanovuje  patogenezu onemocnění a naznačuje léčbu. V průběhu výuky studenti dostávají informace o výsledcích vyšetření a  konzultují případ. Posléze studenti jednotlivě případ prezentují.

 

2. Zkouška je ústní komisionální souborná, termíny ve zkouškkovém období letního semestru vypsány v SIS.

Otázky/témata  z části imunologie:

 

1.        Imunitní systém, charakteristika, funkce, struktura

2.        Charakteristika antigenů, jejich typy a vlastnosti. T-dependentní a T-independentní antigeny

3.        Funkce protilátek

4.        Monoklonální protilátky a jejich použití

5.        Subpopulace T lymfocytů a jejich funkce (Th1, Th2, T reg, Th17, Tc), jejich uplatnění v imunopatologii)

6.        Analýza imunitních proteinů - elektroforéza,  turbidimetrie, nefelometrie. Aglutinace,  Hybridomová technologie

7.        Obranné mechanizmy kůže a jejich poruchy

8.        Slizniční imunitní systém  - Struktura a funkce slizniční bariéry

9.        Lymfatická tkáň sliznic, Společný slizniční imunitní systém

10.     Orální (slizniční) tolerance a její poruchy

11.     Antiinfekční imunita - principy protibakteriální imunity

12.     Obrana proti intracelulárním patogenům (bakterie a jednobuněční parazité) a plísním

13.     Antiinfekční imunita - principy protivirové imunity a obrana proti mnohobuněčným parazitům

14.     Detekce antiinfekčních protilátek - ELISA, Westernblotting, aglutinace

15.     Imunodeficience - základní klasifikace a typický klinický obraz

16.     Primární poruchy tvorby protilátek-molekulární podklady, klasifikace, klinické projevy

17.     Primární poruchy buněčné imunity s postižením T lymfocytů - molekulární podklady, klasifikace, klinické projevy

18.     Primární poruchy fagocytárních funkcí a komplementu- molekulární podklady, klasifikace, klinické projevy

19.     Možnosti vyšetření buněčné imunity

20.     Principy substituční imunoglobulinové léčby

21.     Sekundární imunodeficience, příčiny, projevy a léčba

22.     Imunopatologie HIV infekce

23.     Imunopatologická reakce hypersenzitivity I. Typu - patofyziologie,

24.     Typy a zdroje alergenů rozpoznávaných IgE

25.      Atopické choroby - charakteristika, diagnostika a léčba

26.     Anafylaxe - charakteristika, diagnostika a léčba

27.     Možnosti vyšetření atopických chorob in vivo a in vitro

28.     Terapie atopických chorob, alergenová vakcinace

29.     Imunopatologická reakce přecitlivělosti II. Typu -  patofyziologie

30.     Imunopatologická reakce přecitlivělosti II. Typu - klinické příklady

31.     Imunopatologická reakce III. Typu - patofyziologie

32.     Imunopatologická reakce přecitlivělosti III. Typu - klinické příklady

33.     Imunopatologická reakce přecitlivělosti IV. Typu - patofyziologie

34.     Imunopatologická reakce přecitlivělosti IV. Typu - klinické příklady

35.     Etiologie a patogeneze autoimunitních chorob

36.     Autoimunita, rizika vzniku a mechanizmy autoimunitního poškození tkáně

37.     Autoantigeny a autoprotilátky

38.     Systémová autoimunitní onemocnění, klinické příklady

39.     Orgánově nespecifické autoprotilátky, nepřímá imunofluorescence jako detekční metoda, jejich diagnostický význam.

40.     Orgánově specifická autoimunitní onemocnění, klinické příklady

41.     Orgánově specifické autoprotilátky, ELISA jako detekční systém, diagnostický význam

42.     Protinádorová imunita - funkce, mechanismy.

43.     Antigeny nádorových buněk, Imunoterapie nádorových onemocnění

44.     Transplantace, definice, typy transplantací, transplantační antigeny, vyšetření před transplantací

45.     Imunologické reakce po transplantaci

46.     Imunohematologie

47.     Principy průtokové cytometrie,  imunofenotypizace imunitních buněk

48.     Imunologie reprodukce, imunologické poruchy plodnosti

49.     Pasivní a aktivní imunizace, adjuvans

50.     Biologická léčba - principy a klinické použití

 

 

 

 

 

 

 

Syllabus

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Detailed syllabus, including Study materials, please see:

http://vyuka.lf3.cuni.cz

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Podrobný syllabus včetně odkazu na studijní materiály viz:

http://vyuka.lf3.cuni.cz

Entry requirements

English

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Prerequisits for Immunology part of the Course is the knowledge from Cell and Molecular Immunology, Module Ib, Ist year

Czech

Last update: doc. MUDr. Petr Kučera, Ph.D. (02.12.2019)

Vstupním požadavkem kurzu je uchování rámcových vědomostí imunologie z Modulu Buňka (MIB, I. ročník)