|
|
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (10.12.2019)
|
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (27.09.2017)
Předmět je zaměřen na seznámení studentů s principy použití matematicko-statistických metod v medicíně. Vysvětluje principy statistické indukce, základní statistické metody a interpretaci výsledků statistických analýz běžně používaných v lékařské literatuře. Tyto znalosti jsou základem pro správné pochopení principů medicíny založené na důkazech. |
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (19.12.2021)
Účast na cvičeních - student se zúčastní alespoň čtyř z šesti praktických cvičení. Zápočtový test s otevřenými otázkami. Test bude zahrnovat teoretické otázky a praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů. je požadováno alespoň 60% správných odpovědí. Při odevzdání testu student vysvětlí případné nejasnosti v odpovědi. |
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (10.12.2019)
Literatura Hendl, J. Přehled statistických metod. Analýza a metaanalýza dat. 4. vyd. Portál, Praha, 2015 Komenda S. Biometrie. Univerzita Palackého, Olomouc, 1994 Lepš J., Šmilauer P. Biostatistika. Episteme, České Budějovice, 2016 (viz též starší verze jako skripta: http://botanika.bf.jcu.cz/suspa/vyuka/materialy/SkriptaNova1.pdf) Meloun, M., Militký, J. Statistická analýza experimentálních dat. Academia, Praha, 2004 (https://meloun.upce.cz/docs/books/ucebnice-sken.pdf) Pavlík, T., Dušek, L. Biostatistika. Institut biostatistiky a analýz, Brno, 2012 (https://www.iba.muni.cz/res/file/ucebnice/pavlik-biostatistika-v2.pdf) Procházka, B. Biostatistika pro lékaře. Principy základních metod a jejich interpretace s využitím statistického systému R. Karolinum, Praha, 2016 Procházka, B. Stručná biostatistika pro lékaře. Karolinum, Praha, 2015 Šmerhovský, Z., Göpfertová, D., Feberová, J. Medicína založená na důkazech z pohledu klinické epidemiologie. Karolinum, Praha, 2007. Zvára, K. Biostatistika. Karolinum, Praha 2008 (viz též prezentace http://www.karlin.mff.cuni.cz/~zvara/biostat/2008/bioCelek.pdf) Zvára, K. Základy statistiky v prostředí R. Karolinum. Praha 2013 Zvárová, J. Základy statistiky pro biomedicínské obory. 3. vyd. Karolinum, Praha, 2016 Zvárová, J., Malý, M. (ed.) Statistické metody v epidemiologii. Karolinum, Praha, 2003 http://portal.matematickabiologie.cz Drozd, P. Cvičení z biostatistiky Základy práce se softwarem R |
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (03.12.2019)
Seminars, practicals |
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (19.12.2021)
Sylabus předmětu BIOSTATISTIKA pro třetí semestr 3.LF UK
PŘEDNÁŠKY
1. Statistické pojmy (úvod) Historické poznámky, statistika v lékařských vědách Logika statistického uvažování (pozorování vs. hypotézy) Důležité kroky při aplikaci statistiky Typy proměnných Popisná statistika (charakteristiky polohy a variability) Pravděpodobnost, rozdělení Populace - výběr, techniky pořizování výběru Reprezentativnost výběru Bodový a intervalový odhad, střední chyba průměru Interval spolehlivosti Principy statistického testování
2. Statistická indukce a testování (spojité proměnné) Statistická hypotéza a hladina významnosti Jednostranné a oboustranné hypotézy Jednovýběrové, dvouvýběrové a párové testy Parametrické a neparametrické testy Testování hypotéz o poloze (t-test, Wilcoxonův test) Úvod do mnohorozměrných metod, analýza rozptylu (ANOVA) Interpretace výsledků statistických analýz
3. Statistické pojmy používané v epidemiologii (kategoriální proměnné) Kontingenční tabulky (čtyřpolní tabulky) a způsoby hodnocení Chi-kvadrát test, Fisherův a McNemarův test, test trendu v kontingenční tabulce Základní typy studií používaných v epidemiologii a odpovídající statistické modely pro jejich hodnocení Demografické statistiky, míry a poměry Relativní riziko, poměr šancí, atributivní riziko Zkreslení, vychýlení, přesnost Vyhodnocení diagnostických a screeningových testů (senzitivita a specificita, volba hranice)
4. Pokročilé statistické metody Vztah dvou proměnných: korelace, regrese Pokročilé statistické metody v epidemiologii logistická regrese cenzorovaná data analýza přežití Matematické nástroje pro plánování průzkumů a experimentů určení velikosti výběru
PRAKTICKÁ CVIČENÍ 1. Základy popisné statistiky: typy proměnných, rozdělení pravděpodobnosti (binomické, Poissonovo, normální), populace a výběr, metody pořizování výběru, charakteristiky polohy a variability, střední chyba průměru, histogram, bodový a intervalový odhad, interval spolehlivosti Statistické testy: testování statistických hypotéz, p-hodnota, hladina významnosti
2. Statistické testy pro spojité proměnné: parametrické a neparametrické testy, t-test a Wilcoxonův test (jednovýběrový, dvouvýběrový, párový), analýza rozptylu (ANOVA), F-test Statistický software
3. Statistické testy kategoriálních proměnných: kontingenční tabulka, chí-kvadrát test, McNemarův test Statistické metody v epidemiologii: epidemiologické míry rizika a odpovídající intervaly spolehlivosti, zkreslení, interpretace
4. Statistické metody v epidemiologii: vyhodnocení údajů ze surveillance a registrů, diagnostické a screeningové testy Plánování průzkumů: síla statistického testu, stanovení velikosti výběru, chyby I. a II. druhu
5. Regresní analýza: korelace, lineární regrese, mnohonásobná regrese, logistická regrese, test trendu Analýza přežití: klinické studie, Kaplanova-Meierova křivka, log-rank test, Coxův model proporcionálního rizika
6. Praktické využití statistiky: statistika v publikovaných článcích s lékařskou tématikou, diskuse o statistických metodách, výběr statistického testu Závěrečný test
|
|
||
|
Last update: RNDr. Alena Fialová, Ph.D. (19.12.2021)
Účast na cvičeních - student se zúčastní alespoň čtyř z šesti praktických cvičení. Zápočtový test s otevřenými otázkami. Test bude zahrnovat teoretické otázky a praktickou interpretaci výsledků statistických výpočtů. je požadováno alespoň 60% správných odpovědí. Při odevzdání testu student vysvětlí případné nejasnosti v odpovědi. |