Introduction to applied bioinformatics - GDXP09

• Title: Základy praktické bioinformatiky
• Guaranteed by: Department of Biochemical Sciences (16-16160)
• Faculty: Faculty of Pharmacy in Hradec Králové
• Actual: from 2019
• Semester: both
• Points: 0
• E-Credits: 0
• Examination process: oral
• Hours per week, examination: 0/0, Ex [HT]
• Capacity: winter:unknown / unknown (unknown); summer:unknown / unknown (unknown)
• Min. number of students: unlimited
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Teaching methods: full-time
• Teaching methods: full-time
• Note: course is intended for doctoral students only; you can enroll for the course in winter and in summer semester
• Guarantor: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D.
• Interchangeability : GDPX09
• Is interchangeable with: GDPX09

Annotation

English

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Bioinformatics is an interdisciplinary field of science dealing with the storage, classification, analysis, and interpretation of biological data. In the subject Introduction to Applied Bioinformatics, students learn about possibilities of how to find and use bioinformatics databases and tools. This subject is focused mainly on practical usage and training of various web-based programs and software tools. Topics include scientific literature search, protein and nucleotide sequences databases, sequences comparison and their feature analysis, restriction analysis, primer design, specialized databases, etc.

Czech

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Bioinformatika je mezioborová disciplína zabývající se ukládáním, tříděním, analýzou a interpretací souborů biologických dat. V rámci předmětu Základy praktické bioinformatiky se studenti dozvědí o možnostech využití dostupných bioinformatických databází a programů. Prakticky se studenti naučí vyhledávat informace a sekvenční data a seznámí se s možnostmi jejich využití. Tento předmět je založen hlavně na praktické práci u počítače a samostatném vyzkoušení různých webových aplikací. Probíraná témata zahrnují: vyhledávání literatury, databáze proteinových a nukleotidových sekvencí, porovnávání sekvencí a analýza jejich vlastností, hledání podobných sekvencí, restrikční analýza, návrh primerů, specializované databáze atd.

Course completion requirements

English

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Practical test by computer of practical knowledge of the subject with the possibility to use gained materials.

Czech

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

"Písemná" zkouška u počítače. Praktické splnění zadaných úkolů.

Literature

English

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Recommended:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..

Czech

Last update: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. (27.09.2021)

Doporučená:

• null. . In Selzer, Paul M. Marhöfer, Richard J., Koch, Oliver (eds.). Applied bioinformatics : an introduction . New York, NY: Springer Berlin Heidelberg, 2018, s. -. ISBN 978-3-319-68299-0..