SubjectsSubjects(version: 978)
Course, academic year 2025/2026
   
Fundamentals of Scientific Work - FPP09
Title: Základy vědecké práce
Guaranteed by: Dean's Office (15-800)
Faculty: Faculty of Medicine in Hradec Králové
Actual: from 2025
Semester: winter
Points: 0
E-Credits: 0
Examination process: winter s.:
Hours per week, examination: winter s.:10/30, C [HS]
Capacity: unlimited
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
Key competences:  
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Level:  
Note: course is intended for doctoral students only
can be fulfilled in the future
Guarantor: prof. MUDr. RNDr. Milan Kaška, Ph.D.
Annotation - Czech
Podstatou předmětu je získání znalostí a dovedností při používání různých metod a metodik v lékařském a biomedicínském výzkumu formou asociovaných praktických a laboratorních kurzů na oborově nespecifické vědecké znalosti a dovednosti, zahrnující vědeckou etiku, statistické zpracování dat, práci s databázemi a informacemi, přípravu vědeckého projektu a grantu, prezentační, publikační a pedagogické dovednosti.
Last update: KASKAM/LFHK.CUNI.CZ (22.02.2024)
Aim of the course - Czech

Pro absolvování předmětu je student povinen absolvovat bloky, které budou vybrány školitelem dle zaměření disertační práce a specifikovány v ISP, a to v minimálním rozsahu 3 bloků. Praktické kurzy jsou volitelné a budou vybrány školitelem na základě zaměření studia a specifikovány v ISP.

Podstatou předmětu je 22 převážně e-learningových bloků a 22 asociovaných praktických a laboratorních kurzů.

·       13 bloků je zaměřených na různé metodiky používané v lékařském a biomedicínském výzkumu zahajovaných e-learningovou přednáškou a následně 22 asociovaných praktických a laboratorních kurzů. Rozsah kurzů je 15-30 hodin dle individuálních nároků jednotlivých metodik.

·       9 bloků je zaměřených na oborově nespecifické vědecké znalosti a dovednosti, zahrnující vědeckou etiku, statistické zpracování dat, práci s databázemi a informacemi, přípravu vědeckého projektu a grantu, prezentační, publikační a pedagogické dovednosti.

Last update: Faistová Eva, Ing. (21.02.2023)
Literature - Czech

Povinná: viz E-learning kurzy na Moodlu

https://moodle.lfhk.cuni.cz/moodle2/course/index.php?categoryid=238

Last update: Faistová Eva, Ing. (20.07.2023)
Requirements to the exam - Czech

Pro absolvování předmětu je student povinen absolvovat bloky, které budou vybrány školitelem dle zaměření disertační práce a specifikovány v ISP, a to v minimálním rozsahu 3 bloků. Praktické kurzy jsou volitelné a budou vybrány školitelem na základě zaměření studia a specifikovány v ISP.

Podstatou předmětu je 22 převážně e-learningových bloků a 22 asociovaných praktických a laboratorních kurzů.

·       13 bloků je zaměřených na různé metodiky používané v lékařském a biomedicínském výzkumu zahajovaných e-learningovou přednáškou a následně 22 asociovaných praktických a laboratorních kurzů. Rozsah kurzů je 15-30 hodin dle individuálních nároků jednotlivých metodik.

·       9 bloků je zaměřených na oborově nespecifické vědecké znalosti a dovednosti, zahrnující vědeckou etiku, statistické zpracování dat, práci s databázemi a informacemi, přípravu vědeckého projektu a grantu, prezentační, publikační a pedagogické dovednosti.

Last update: Malá Petra (27.01.2023)
Syllabus - Czech

1. Blok: Molekulárně-biologické metody - genová exprese (e-learning)

1.1. Navazující laboratorní kurz: Analýza nukleových kyselin - qRT-PCR

1.2. Navazující laboratorní kurz: Epigenetika

1.3. Navazující laboratorní kurz: Western blot

2.Blok: Základní principy analýzy exogenních a endogenních látek v biologickém materiálu (e-learning)

2.1. Navazující laboratorní kurz: LC-MS hmotnostní spektrometrie

3. Blok: Buněčné metody v biomedicínském výzkumu (e-learning)

3.1. Navazující laboratorní kurz: Průtoková cytometrie

3.2. Navazující laboratorní kurz: Způsoby kultivace buněk/Live cell monitoring

3.3. Navazující laboratorní kurz: Vysokokapacitní obrazová cytometrie a fluorescenční mikroskopie

3.4. Navazující laboratorní kurz: Bioenergetika

4. Blok: Imunologické diagnostické metody - současné možnosti (e-learning)

4.1. Navazující laboratorní kurz: Imunologické diagnostické metody

5. Blok: Elektronová mikroskopie (e-learning)

5.1. Navazující laboratorní kurz: Základy elektronové mikroskopie

6. Blok: Optická mikroskopie (e-learning)

6.1. Navazující laboratorní kurz: Imunohistochemie, histologická barvení

6.2. Navazující laboratorní kurz: Mikrofotografie a obrazová analýza

7. Blok: Pokročilé metody diagnostiky v patologii (e-learning)

7.1. Navazující kurz: Molekulární morfologie

8. Blok: Molekulární epidemiologie (e-learning)

8.1. Navazující laboratorní kurz: Identifikace a klasifikace původců infekcí - RFLP PCR, sekvenace

9. Blok: Metody práce s malými laboratorními zvířaty (e-learning)

9.1. Navazující praktický kurz: Experimentální chirurgie

9.2. Navazující praktický kurz: Intravitální diagnostika laboratorních zvířat

10. Blok: Experimentální gastroenterologie (e-learning)

10.1. Navazující praktický kurz: Experimentální gastroenterologie u prasat

11. Blok: Principy hodnocení a modelování farmakokinetiky léčiv (e-learning)

11.1. Navazující laboratorní kurz: Metody analýzy farmakokinetiky léčiv

12. Blok: Biofyzikální metody v biomedicínském výzkumu (e-learning)

12.1. Navazující praktický kurz: Analýza fyzikálních vlastností materiálů

12.2. Navazující praktický kurz: Neurovědní přístupy k hodnocení zrakového vnímání

12.3. Navazující praktický kurz: Pokročilá statistika

13. Blok: Hodnocení zdravotních rizik (e-learning)

13.1. Navazující laboratorní kurz: Testování genotoxicity

14. Blok: Databázové informační systémy (e-learning, seminář)

Základní pojmy, vyhledávání a získávání dokumentů, osobní dokumentace. Knihovny, služby knihoven, souborné katalogy, discovery systems. Elektronické informační zdroje. Licencované zdroje a konsorcia v ČR, portály EIZ. Vyhledávání v EIZ - výběr zdrojů, tvorba dotazu, metodika tvorby rešerší z medicínských časopiseckých/knižních zdrojů, strategie jejich vyhledávání. Zdrojové databáze. Publikační činnost, citování a tvorba bibliografické citace, citační etika, normy. Scientometrie - H-index, impakt faktor, citační databáze - WoS (JCR), Scopus a vyhledávání citovanosti. Publikační aktivita a její role při hodnocení vědy a výzkumu. Sběr publikační aktivity v praxi. Práce s vybranými citačními a publikačními softwary.

15. Blok: Návrh a zajištění vědeckého projektu (e-learning)

Evidence based medicine - principy: Kritické myšlení a nahlížení na dostupná data v medicíně založené na důkazech. Fáze tvorby výzkumného projektu: výběr tématu, výběr zadavatele, studie proveditelnosti - personální předpoklady, získání dostatečně velkého souboru v čase, materiální předpoklady, intelektuální předpoklady, časový faktor, kreativita. Nejčastější chyby a předcházení jim. Zdůvodnění potřebnosti: Vědecký a praktický rozměr projektu. Struktura řešitelského týmu a pravidla práce v něm, osobnost a odborné kvality vedoucího výzkumného týmu/školitele v přípravě projektu a obecné předpoklady pro jeho úspěšné řešení. Ochrana duševního vlastnictví: Patenty, copyright časopisů - jak vyplňovat formuláře. Využití PC programů k odhalení plagiátorství.

16. Blok: Vědecké granty - tipy a triky do začátku (přednáška, seminář)

Aktuální grantový systém v ČR a EU - Požadavky a systém hodnocení u různých grantových agentur - prezentace jejich formulářů a vysvětlení k vyplnění, úloha oponentů (posuzovatelů). Nejčastější chyby při podávání žádostí o grant. Struktura grantové přihlášky: obsah, rozsah, prezentace vzorového projektu, náležitosti projektu spojené s experimentálním a klinickým výzkumem, proveditelnost projektu a předběžná data, harmonogram přípravy, podpora grantovým a zahraničním oddělením LF HK, UK (prezentace povinností a možností GZO - Grantové a zahraniční oddělení, při asistenci s přípravou grantové žádosti včetně personálního představení). Nejčastější chyby při podávání žádostí o grant.

17. Blok: Etické aspekty vědecké práce (e-learning, přednáška)

Úvod do problematiky. Etické principy v biomedicínském výzkumu, od Norimberských pravidel k Helsinské deklaraci. Etika ve zpracování a prezentaci získaných výsledků. Legislativní a morální pravidla klinického výzkumu. Placebo a etické problémy jeho použití ve výzkumné práci. Role etické komise. Legislativní a morální pravidla experimentálního výzkumu užitím zvířat. Odborná komise pro zajišťování dobrých životních podmínek pokusných zvířat.

18. Blok: Aplikovaná statistika v biomedicínském výzkumu (e-learning, praktický kurz)

Základní statistické pojmy a parametry: Popisná statistika souboru, pravděpodobnost sledovaného jevu, princip testování hypotéz, vybrané parametrické a neparametrické testy, korelační a regresní analýza, odhady parametrů. Tento kurz je k dispozici v Moodle a je určen k samostudiu před praktickými kurzy. Praktický kurz: Základy zpracování dat pomocí statistického software I: popisná statistika, testování normality rozdělení, t-testy, test shody rozptylů. (MS Excel nebo GraphPad). (6 hodin výuky). Praktický kurz: Základy zpracování dat pomocí statistického software II. Zahrnuje jednoduchou lineární regresi, korelační analýzu, interval spolehlivosti populačního průměru. (MS Excel nebo GraphPad). (4 hodiny výuky)

19. Blok: Prezentační dovednosti v biomedicínském výzkumu (e-learning / přednáška, seminář)

E-learningový kurz určený všem, kteří potřebují vytvořit a přednést konferenční prezentaci. Klíčové principy, které umožní vytvořit přímočařejší, jednodušší, a podmanivější prezentace. Tento kurz je organizován do tří hlavních sekcí: 1) obsah; 2) navrhování vizuálů; a 3) přednes. Alternativně je možno využít programů podporujících prezentační dovednosti vypisovaných Centrem celoživotního vzdělávání UK či LFHK.

20. Blok: Publikační dovednosti / scientific writing (e-learning /přednáška, seminář)

E-learningový kurz. Typy vědeckých publikací, zvláštnosti a náležitosti původních prací, kazuistik, přehledových článků, dopisů editorovi, komentářů. Alternativně je možno využít programů podporujících publikační dovednosti nabízených Centrem celoživotního vzdělávání UK či lektory z Ústavu anglického jazyka a didaktiky, FF UK v Praze

21. Blok: Základy pedagogiky (e-learning / přednáška, seminář)

E-learningový kurz představující základní poznatky o pedagogických vědách, jejich vývoji a současných akcentech, popis pedagogických věd jako z dílčích disciplín se skládajícího celku; osobnost učitele-vychovatele, jeho sociální a komunikativní výbavu, opřenou o psycho-didaktické dovednosti a znalosti těch, které vzdělává. Alternativně je možno využít programů podporujících pedagogické dovednosti vypisovaných Centrem celoživotního vzdělávání UK či UHK a Pedagogickou fakultou UK v Praze.

22. Blok: Základy dovedností pro komunikaci vědy (e-learning/přednáška, seminář)

lektoři RUK v Praze

Vyučující:

RNDr. Eva Čermáková

prof. Ing. Zdeněk Fiala, CSc.

doc. Miloš Hroch, PhD.

prof. MUDr. RNDr. Milan Kaška, Ph.D.

prof. MUDr. Jan Krejsek, CSc.

prof. Ing. Jan Kremláček, Ph.D.

doc. MUDr. Otto Kučera, PhD.

prof. MUDr. Stanislav Mičuda, PhD.

prof. MUDr. Jaroslav Mokrý, Ph.D.

PhDr. Olga Pitašová

prof. PharmDr. Emil Rudolf, Ph.D.

prof. MUDr. Aleš Ryška, Ph.D.

prof. MUDr. Martina Řezáčová, PhD.

Mgr. Iva Selke Krulichová, Ph.D.

doc. MUDr. Ilja Tachecí, Ph.D.
Lektoři z Centra akademického psaní Kabinetu studia jazyků Ústavu pro jazyk český AV ČR, v. v. i.

Lektoři z Pedagogické fakulty, UK Praha

Last update: Faistová Eva, Ing. (18.08.2023)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html