Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (21.05.2013)
In recent decades, biology has raised a lot of challenging mathematical problems aiming at deciphering the language of DNA sequences. Bioinformatics is a rapidly developing area of computer science driving further biological developments. This course is focused on explaining the main algorithmic principles applicable to the solution of various biological problems. This shall provide the students with a solid foundation to understand more easily also other parts of this emerging field. The lecture is for students of computer science without background in biology.
Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (21.05.2013)
V současné době dala biologie vzniknout celé řadě zajímavých matematických problémů, jejichž cílem je dekódování
jazyka DNA sekvencí. Bioinformatika je rychle se rozvíjející oblastí moderní informatiky, která implikuje další rozvoj
biologických věd. Tato přednáška je zaměřena na vysvětlení základních algoritmických principů použitelných při řešení
nejrůznějších biologických problémů.
Předpokládají se znalosti programování v rozsahu bakalářského kursu NPRG031 Programování II. Přednáška je určená pro studenty informatiky bez znalosti základů biologie.
Aim of the course -
Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (19.04.2013)
An introduction to bioinformatics and algorithms used within bioinformatics.
Last update: T_KTI (23.04.2013)
Naučit základy bioinformatiky a v ní používaných algoritmů.
Literature -
Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (28.09.2020)
Jones N. C. and Pevzner P. A.: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004
Pevzner P. A.: Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach, MIT Press, 2000
Zvelebil M., Jeremy Baum J. A.: Understanding Bioinformatics, Garland Science, 2007
Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (29.09.2020)
Jones N. C., Pevzner P. A.: An Introduction to Bioinformatics Algorithms, MIT Press, 2004
Pevzner P. A.: Computational Molecular Biology: An Algorithmic Approach, MIT Press, 2000
Zvelebil M., Jeremy Baum J. A.: Understanding Bioinformatics, Garland Science, 2007
Syllabus -
Last update: RNDr. František Mráz, CSc. (28.09.2020)
Introduction to bioinformatics:
Bioinformatics - its subject, history and main problems
Introduction to molecular biology - the structure of DNA and its analysis, genes, proteins