The lecture will introduce currently used algorithms and approaches for DNA, RNA and protein analysis. In
particular, it will cover algorithms for sequence similarity modeling and structures of biomolecules, phylogenetic
analysis and structure prediction. Students will also learn what the major repositories of related biological data
exist, what the structure of these data is, and how to work with them at the programmatic level.
Last update: Zavoral Filip, RNDr., Ph.D. (26.05.2023)
Přednáška představí aktuálně používané algoritmy a přístupy pro analýzu DNA, RNA a proteinů.
Především půjde o algoritmy pro podobnostní modelování sekvencí a struktur biomolekul, fylogenetickou analýzu a predikci struktury.
Studenti se také dozví, jaké existují hlavní repositáře souvisejících biologických dat, jaká je struktura těchto dat a jak s nimi pracovat na programové úrovni.
Last update: Kopecký Michal, RNDr., Ph.D. (17.04.2018)
Course completion requirements -
Written exam to the extent covered by the syllabus.
Attendance at tutorials.
Last update: Hoksza David, doc. RNDr., Ph.D. (05.02.2024)
Písemní zkouška v rozsahu dle sylabu předmětu.
Účast na cvičeních.
Last update: Hoksza David, doc. RNDr., Ph.D. (05.02.2024)