SubjectsSubjects(version: 845)
Course, academic year 2018/2019
   Login via CAS
Optical Microscopy and Selected Imaging Techniques in Biophysics - NBCM114
Title in English: Optická mikroskopie a vybrané biofyzikální zobrazovací techniky
Guaranteed by: Institute of Physics of Charles University (32-FUUK)
Faculty: Faculty of Mathematics and Physics
Actual: from 2018
Semester: summer
E-Credits: 3
Hours per week, examination: summer s.:2/0 Ex [hours/week]
Capacity: unlimited
Min. number of students: unlimited
State of the course: taught
Language: Czech
Teaching methods: full-time
Guarantor: doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc.
prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc.
Classification: Physics > Biophysics and Chemical Physics
Files Comments Added by
download 2015_CSCF.SupRes.pdf Superresoluční mikroskopie - článek v Čes. čas. fyz. 2015 prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc.
download 2015_PMFA.SupRes.pdf Superresoluční mikroskopie - článek v Pokrocích MFA 2015 prof. RNDr. Jaromír Plášek, CSc.
Annotation -
Last update: MOJZES/MFF.CUNI.CZ (23.05.2008)
Dielectric properties of organic compounds. Complex permittivity, mechanisms of polarization, theory of the static permittivity. Interpretation of the frequency-dependent measurements (Debye's equations), temperature dependencies of the relaxation times. Spectrometers for dielectric measurements, selected applications of the dielectric measurements. Transport of the ions through biological membrane. Principles of optical microscopy. Basic concepts: resolving power of the optical microscope. Overview of the methods and their principles. Light field, dark field, phase contrast, anoptrale microscopy, polarized-light microscopy, Nomarsky's method, Hoffman's modulation contrast, fluorescence microscopy. Videomicroscopy and computer-assisted treatment of image. Confocal microscope, near-field microscope. Special techniques: FRAP, microspectrofluorimetry. Confrontation of the microscopy with the other optical methods used for study of the cell morphology: light scattering, flow-cytometry.
Aim of the course -
Last update: MOJZES/MFF.CUNI.CZ (23.05.2008)

This course aims to provide students of biophysics with a basic overview of experimental methods based on dielectric, conductive and electrochemical properties of biomolecules and biological structures. The course comprises an introduction to use of advanced methods of optical microscopy in biophysics, as well.

Course completion requirements - Czech
Last update: doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc. (11.10.2017)

Ústní zkouška.

Teaching methods -
Last update: MOJZES/MFF.CUNI.CZ (23.05.2008)

Lecture

Requirements to the exam - Czech
Last update: doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc. (11.10.2017)

Účast na přednáškách.

Syllabus - Czech
Last update: doc. RNDr. Peter Mojzeš, CSc. (15.02.2019)

Základní pojmy, rozlišovací schopnost optického mikroskopu

Přehled zobrazovacích metod a jejich principů

Světelné pole, temné pole, fázový kontrast, anoptrální mikroskopie

Mikroskopie v polarizovaném světle, Nomarského metoda, Hoffmanův modulační kontrast

Fluorescenční mikroskopie

Videomikroskopie a počítačové zpracování obrazu

Konfokální mikroskop, near-field mikroskop

Speciální mikroskopické techniky, FRAP, mikrospektrofluorimetrie

Srovnání mikroskopie s jinými optickými metodami studia morfologie buněk

Proudová cytometrie

Biomolekulární zobrazovací techniky

Ramanova a IR mikroskopie

Zobrazovací techniky TERS a SERS

Optická skenovací mikroskopie v blízkém poli (SNOM)

Mikroskopie atomárních sil (AFM)

Zobrazovací metody hmotnostní spektroskopie (nano-SIMS)

Akustické zobrazovací metody (ultrazvuk, sonar)

Optická koherentní tomografie (OCT)

Interferometrická rozptylová mikroskopie (iSCAT)

Pozitronová emisní tomografie (PET, HRRT PET)

Metody fluorescenční mikroskopie s vysokým prostorovým rozlišením

 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html