Microbial processes in the environment - MO550P104
|
|
|
||
|
Last update: RNDr. Jolana Tátosová, Ph.D. (24.10.2019)
Fyziologie mikroorganismů ve vztahu k životnímu prostředí. Specifika hlavních skupin mikroorganismů: bakterie, houby, řasy, protozoa. Diverzita mikroorganismů a její význam Taxonomická a funkční diverzita. Speciace mikroorganismů. Význam diverzity pro fungování ekologických procesů. Ekologie mikroorganismů Interakce mikroorganismů s prostředím. Vlivy prostředí na mikroorganismy. Interakce a kompetice mezi mikroorganismy a dalšími organismy v prostředí. Mikrobiální procesy přeměny živin a energie Transformace organických látek a látkový metabolismus. Rozklad vysokomolekulárních organických látek. Oxidačně / redukční procesy při přeměně organických látek. Mikrobiální procesy v cyklech uhlíku, dusíku, fosforu a síry. Význam mikrobiálních procesů v geobiochemických cyklech prvků. Mikrobiální biogeochemie Ovlivnění abiotického prostředí mikroorganismy ? chemické a fyzikální změny prostředí v důsledku mikrobiální aktivity, geomikrobiologie. Mikrobiální procesy ve vybraných ekosystémech Mikrobiální procesy v hlavních habitatech: půda, sladká voda, mořská voda, terestriální biomy. Význam jednotlivých skupin mikroorganismů ve vybraných habitatech. Mikroorganismy v extrémních podmínkách Mikroorganismy v extrémních prostředích: hlubokomořské ekosystémy, horké prameny, polární oblasti. Mikroorganismy v ekosystémech s antropogenní zátěží. Mechanismy adaptace mikroorganismů na stress. Interakce mikroorganismů s rostlinami a živočichy Symbióza a kompetice mikro- a makroorganismů. Funkce lišejníků, mykorrhizy, patogenní mikroorganismy v prostředí. Mikroorganismy v ochraně životního prostředí a funkční stability ekosystému Využití mikroorganismů v ochraně životního prostředí, bioindikace, přirozená atenuace, rekultivace, biodegradace, sanace antropogenního znečitění. Metody studia mikrobiálních procesů - biochemické a fyziologické metody Detekce a kvantifikace životních projevů mikroorganismů. Respirometrie, stanovení metabolických schopností a metabolické diversity. Charakteristika mikrobiálních společenstev na základě markerových molekul. Nepřímá detekce specifických skupin mikroorganismů. Obohacení a isolace mikroorganismů z prostředí. Metody studia mikrobiálních procesů ? molekulární metody Využití metod založených na studiu nukleových kyselin pro analýzu procesů v životním prostředí. Detekce a kvantifikace aktivní populace mikroorganismů. Specifické značení metabolicky aktivních mikroorganismů. Analýza transkriptomu a proteomu. Literatura: Madsen, E.L.: Environmental Microbiology, Blackwell Publishing, 2008 Paul, E.A.: Soil Microbiology, Ecology, and Biochemistry, 3rd edition, Academic Press, 2007 |