Advanced NMR methods - MC270P08A

• Title: Pokročilé metody NMR
• Czech title: Pokročilé metody NMR
• Guaranteed by: Department of Organic Chemistry (31-270)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2024
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:oral
• Hours per week, examination: winter s.:2/0, Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: 3
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment; priority enrollment if the course is part of the study plan
• Guarantor: doc. RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.
• Teacher(s): doc. RNDr. Zdeněk Tošner, Ph.D.

Annotation

Navazující kurz NMR spektroskopie, kde se budou rozvíjet znalosti v popisu experimentálních technik, jejich využití a vyhodnocování dat.
Hlavním cílem je poskytnout přehled o bohatých možnostech NMR spektroskopie a naučit posluchače zvolit správnou metodu pro studium konkrétního problému. Techniky vícerozměrné spektroskopie (2D až 4D) budou aplikovány na studium biomolekul, a to jak jejich struktury, tak interakcí mezi nimi či s malými ligandy. Budou
rovněž podány informace posledních trendech NMR kapalin a pokročilých metodách NMR pevné fáze.

Last update: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Literature

Cavanagh, J.; Fairbrother, W.J,; Palmer, A.G.III; Rance, M.; Skelton, N.J.: Protein NMR spectroscopy: Principles and practice, Elsevier, 2007

Last update: KFNTZT/MFF.CUNI.CZ (21.09.2011)

Requirements to the exam

Zkouška = prezentace a obhajoba řešení zkouškového domácího úkolu před vyučujícím. Úkol je zadáván min. 14 dní před zkouškou a testuje porozumění pulsním sekvencím a vyhodnocování získaných dat.

Last update: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Syllabus

1.) Moderní popis NMR, souhrn NMR interakcí.
2.) Přenos polarizace, nepřímá detekce, selektivní a tvarované pulsy, fázové cykly.
3.) Vícerozměrná spektroskopie. Homonukleární a heteronukleární korelace.
4.) NMR biomolekul. Izotopové obohacení. Techniky pro přiřazení signálů a struktury proteinů.
5.) Měření dynamických procesů (změny chem. posunu, relaxace a relaxační disperze; segmentální pohyblivost, vazba ligandu, mezimolekulární interakce, difuze)
6.) Moderní trendy v NMR kapalin (pure-shift spektra, TROSY, RDC, přenos saturace,...)
7.) Pokročilé techniky NMR pevné fáze.

Last update: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Learning outcomes

Student po absolvování kurzu

- rozebere funkci a vysvětlí princip pulsních sekvencí

- navrhne metodu pro studium specifických dynamických procesů molekul (agregace, výměny, relaxace, pohyblivost, vzdálenost, kinetika, termodynamické parametry,...) a vyhodnotí naměřená data

- vysvětlí principy řešení prostorové struktury proteinů pomocí NMR v roztoku

- zhodnotí možnosti využití NMR pevné fáze

Last update: Tošner Zdeněk, doc. RNDr., Ph.D. (25.09.2024)

Entry requirements

Vstupním požadavkem je absolvování některého ze základních kurzů NMR, předpokládá se však znalost na úrovni kurzu MC260P107 Techniky NMR spektroskopie

Last update: KFNTZT/MFF.CUNI.CZ (12.04.2018)