Biochemical analysis of proteins and enzymes - MC250P80

• Title: Biochemické analýzy proteinů a enzymů
• Czech title: Biochemické analýzy proteinů a enzymů
• Guaranteed by: Department of Biochemistry (31-250)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2024
• Semester: winter
• E-Credits: 2
• Examination process: winter s.:oral
• Hours per week, examination: winter s.:2/0, Ex [HT]
• Capacity: 24
• Min. number of students: 3
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: RNDr. Kateřina Bělonožníková, Ph.D.
• Teacher(s): RNDr. Kateřina Bělonožníková, Ph.D.

Annotation

Předmět shrnuje základy izolace proteinů, různé typy separačních technik a metody používané pro charakterizaci
proteinů. Hlavním cílem předmětu bude představit základní analýzy vzorových dat z enzymologie,
chromatografie a elektroforetické separace ve vybraných počítačových programech.

Last update: Bělonožníková Kateřina, RNDr., Ph.D. (06.10.2024)

Literature

1. Bioanalytics: Analytical Methods and Concepts in Biochemistry and Molecular Biology, Edited by Friedrich Lottspeich and Joachim W. Engels, Wiley-VCH, 2018

2. Principles and Techniques of Practical Biochemistry, Keith Wilson and John Walker, Cambridge University Press, Fifth edition, 2000.

3. Electrophoresis in Practice, Reiner Westermeier, Wiley‐VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 2004

Last update: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (02.05.2024)

Syllabus

1) Základy práce s daty

• zálohování, využití programů pro výpočty a uložení dat

• tvorba grafů

2) Primární struktura proteinů

• vlastnosti aminokyselin, sekvenace, peptidové mapování

3) Izolace proteinů

• metody extrakce, sledování postupu izolace, stanovení koncentrace proteinů

4) Gelová chromatografie

• kalibrační graf pro stanovení Mr neznámého proteinu

5) Ionexová, hydrofóbní chromatografie

6) Afinitní, multimodální chromatografie

• tvorba elučních grafů, detekce proteinů

7) Metody enzymové analýzy

• stanovení aktivity enzymů, stanovení Km pomocí nelineární regrese, typy inhibice, graf závislosti aktivity na pH a teplotě atp.

8) Elektrokinetické metody

• vyhodnocení SDS a nativní elektroforetické separace

9) Imunochemická detekce proteinů

• analýza výsledků z ELISA testů a Westernblottu

10) Statistické vyhodnocení dat

• ANOVA, t-test, PCA analýza atp.

Last update: Čermáková Michaela, RNDr., Ph.D. (02.05.2024)