SubjectsSubjects(version: 964)
Course, academic year 2024/2025
   Login via CAS
Introduction to molecular paleontology - MB17C12
Title: Úvod do molekulární paleontologie
Czech title: Úvod do molekulární paleontologie
Guaranteed by: Department of Zoology (31-170)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2017
Semester: summer
E-Credits: 3
Examination process: summer s.:
Hours per week, examination: summer s.:0/2, Ex [HT]
Capacity: unlimited
Min. number of students: unlimited
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: not taught
Language: Czech
Note: enabled for web enrollment
Guarantor: doc. Mgr. Radka Symonová, Ph.D.
Opinion survey results   Examination dates   Schedule   
Annotation -
The aim is to provide knowledge of biology necessary for understanding the basic aspects of molecular paleontology and principles her studies.
Last update: Peterková Jindřiška, Ing. (25.10.2019)
Literature -

Hummel S 2003 Ancient DNA Typing, Springer.
Nielsen-Marsh Ch 2002 Biomolecules in fossil remains, The Biochemist, June, pp. 12-14
Shapiro B & A Cooper 2003 Beringia as an Ice Age genetic museum. Quaternary Research, 59, 1-7
Hebsgaard MB, Phillips MJ & E Willerslev 2005 Geologically ancient DNA: fact of artifact? Trends in Microbiology, 2005, from ScienceDirect electronically

Last update: Peterková Jindřiška, Ing. (25.10.2019)
Requirements to the exam - Czech

Požadavky ke zkoušce:

Vypracování návrhu projektu (3-5 stran) s event. využitím metod molekulární paleontologie ve svém vlastním zaměření (důraz je kladen na kontext, ve kterém by se uvedené metody aplikovaly, tzn. konkrétní problém řešený klasickými metodami a následně doplněn o molekulárně paleontologický přístup), včetně presentace projektu a diskuse.

Vlastní zkouška: první část písemka (ca. 10 otázek) a pak dle zvládnutí písemky ještě ústní část v podobě diskuse nad písemkou.

Last update: Symonová Radka, doc. Mgr., Ph.D. (04.04.2012)
Syllabus - Czech

Studenti si během teoretické části osvojí: 1) Základní znalosti z molekulární biologie a genetiky týkající se struktury a dynamiky DNA - formou přednášek, workshopu a promítání krátkých animací z oblasti molekulární biologie a genetiky. 2) Aspekty molekulární biologie, jichž se využívá v technologiích pracujících s fosilní DNA 3) Podmínky pro uchování DNA ve fosilním záznamu, typy degradace a modifikace DNA v zavislosti na sedimentačním prostředí. 4) Diagnostika fosilií před vlastním zpracováním fosilní DNA - nepřímý odhad zachování DNA. 5) Oblasti využití molekulární paleontologie s konkrétními příklady. 6) Technologie umožňující molekulárně-paleontologický výzkum. 7) Metody práce se starou DNA a jejich specifika. 8) Evoluce genomu, paleogenomika - paleopolyploidizace a další mechanizmy: genetická exkurze do historie života, hypotesa 2R a její následky pro současnost. Teoretická/virtuální molekulární paleontologie.

V případě možnosti a zájmu bude kurz završen praktickým cvičením v laboratoři (extrakce recentní, subrecentní a fosilní DNA, srovnání výsledků), ideálně zpracování autentického materiálu, který se bude právě zpracovávat v laboratoři.

Forma výuky: 8 teoretických lekcí, zpracování samostatné práce a její vyhodnocení

Požadavky ke zkoušce:

Vypracování návrhu projektu (3-5 stran) s event. využitím metod molekulární paleontologie ve svém vlastním zaměření (důraz je kladen na kontext, ve kterém by se uvedené metody aplikovaly, tzn. konkrétní problém řešený klasickými metodami a následně doplněn o molekulárně paleontologický přístup), včetně presentace projektu a diskuse.

Vlastní zkouška: první část písemka (ca. 10 otázek) a pak dle zvládnutí písemky ještě ústní část v podobě diskuse nad písemkou.

Studenti ke každé přednášce dostávají vytištěné presentace, kt. jim slouží jako základní materiál k přípravě na zkoušku.

Last update: SYMONOVA/NATUR.CUNI.CZ (25.10.2011)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html