The objective of field course is to show and study the principal processes of a running water habitat (streams, brooks) as a quantitative investigation of benthic drift, chemistry and life with the hyporheic zone etc. Among investigated hypotheses, students will follow the diurnal migration cycle of bentos, patchiness of benthic organisms in respect to substrate type and stream velocity, etc.
The course is a common project of both Department of Ecology of Charles University Prague, and Department of Ecology of Palacky University Olomouc. It is intended namely for MSc. Students of ecology and limnology (hydrobiology) although other interested students are very welcome. The course will run once in two years (in exchange for Hydrobiological field course I. in the other year), however we are ready to run it yearly if there will be a sufficient number of applicants. Usually, the course takes 4-5 days at the very end of the academic year (i.e. early September). For further information, please, contact the responsible persons from Dept. Ecology, Palacky University Olomouc (Martin Rulik - rulik@prfholnt.upol.cz).
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (04.05.2016)
Praktikum je pojato jako cvičný projekt zaměřený na sledování klíčových dějů v tekoucích vodách (kvantitativní hodnocení driftu bentických organizmů, chemismus a oživení bentálu a hyporhealu aj.). Mezi testované hypotézy bude patřit např. existence diurnálních migračních cyklů bentontů, ploškovitá distribuce (patch distribuiton) bentických organismů v závislosti na proudových, substrátových a trofických podmínkách toku.
Praktikum je společným projektem Katedry ekologie UK Praha a Katedry ekologie UP Olomouc. Je určeno především magisterským studentům ekologie/hydrobiologie, nicméně toto není podmínkou.
Praktikum běží jednou za dva roky, aby se střídalo s Hydrobiologickým praktikem I. Pokud bude velký zájem studentů, poběží každoročně.
Rozvrhovaná doba: obvykle 4-5 denní turnus na konci září, tj. před začátkem zimního semestru.
Detaily praktika a organizační informace poskytuje Katedra ekologie UK Olomouc (Doc. Rulík - rulik@prfholnt.upol.cz).
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (04.05.2016)
Literature -
Paul S. Giller, Björn Malmqvist (1998) The Biology of Streams and Rivers, OUP, serie Biology of Habitats Colbert E. Cushing, J. David Allan (2001) Streams: Their Ecology and Life, Academic .Press F. Richard Hauer, Gary Anthony Lamberti (2006) Methods in Stream Ecology. Academic Press
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (29.10.2019)
Paul S. Giller, Björn Malmqvist (1998) The Biology of Streams and Rivers, OUP, serie Biology of Habitats
Colbert E. Cushing, J. David Allan (2001) Streams: Their Ecology and Life, Academic .Press
F. Richard Hauer, Gary Anthony Lamberti (2006) Methods in Stream Ecology. Academic Press
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (04.05.2016)
Course assessment methods and requirements for successful completion, grading scheme -
active participation in the course (sampling, measuring in field) and data elaboration and their final presentation (powerpoint & written protocole)
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (29.10.2019)
zápočet se uděluje za absolvování praktika včetně vypracování závěrečného protokolu a prezentace
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (04.05.2016)
Syllabus - Czech
Praktikum bude realizováno jako projekt zkoumající vliv dnového substrátu, proudových a trofických podmínek na distribuci bentických bezobratlých. Projekt bude řešen v pěti vzájemně navazujících úlohách v v definovaném úseku toku Moravice v katastrálním území Karlova pod Pradědem (Jeseníky):
a) kvalitativní a kvantitativní analýza bentosu v odlišných typech substrátu
na vybraných ploškách subrátu (kámen, mechy, listový opad+detritus) budou bentometrem odebrány kvantitativní vzorky (Surberův sběrač), vyhodnocení denzity, druhové diverzity a funkčních trofických skupin
b) kvalitativní a kvantitativní analýza bentosu v závislosti na proudových podmínkách
měření rychlosti proudu v příčnýchch a hloubkových transektech, vyhodnocení habitatové a druhové diverzity a denzity bentontů
c) diurnální driftová aktivita bentontů
v intervalu den-noc kvantitativní odběr driftujících organismů (driftové sítě), vyhodnocení druhového spektra, abundance a biomasy migrujících jedinců, srovnání intenzity driftu v úseku s rybami a bez ryb
d) denzita predátorů (ryb) na lokalitě
v definovaném (uzavřeném) úseku odlov ryb elektroagregátem a sledování vlivu přítomnosti/absence rybích predátorů na intenzitu driftu
e) oživení hyporheických sedimentů a intersticiální vody
odběr hyporeických sedimentů freeze-core metodou a sledování struktury a denzity oživení, odběr intersticiální vody minipiezometry z různých hloubkových profilů a měření základních fyzikálně-chemických parametrů (teplota, rozpuštěný kyslík pH, konduktivita) - porovnání s povrchovou vodu v toku
Stálé studentské skupiny (4-5) se budou střídat při řešení jednotlivých úloh, každá skupina bude ale rovněž garantem jednoho úkolu, který zpracuje do protoků a výsledkové části
Časový harmonogram:
Den 1.: příjezd, ubytování, teoretická východiska praktika, nácvik technik měření a determinace základních skupin organismů, sledování noční části driftu
Den 2.: odběr vzorků bentosu, driftu (denní část), odlov ryb, vzorkování hyporheické zóny, noční část driftových pokusů
Den 3.: denní část driftu, vyhodnocování ?substrátových" a ?proudových" pokusů, práce na protokolech
Den 4.: vyhodnocení praktika, zápočet, ukončení a odjezd
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (04.05.2016)
Learning outcomes -
Upon completion of the practical course, the student will demonstrate:
A deep understanding of ecological processes in running waters (lotic ecosystems), particularly factors influencing spatial distribution (patch distribution) and the daily activity cycles of aquatic organisms.
The ability to theoretically describe the significance and dynamics of drift, the role of the hyporheic zone as a specific habitat, and the influence of both abiotic factors (current velocity, substrate type) and biotic interactions (e.g., fish predation) on the benthic community.
A comprehensive overview of functional feeding groups of invertebrates within the river ecosystem.
Skills
The student will master a wide range of hydrobiological methods in practice, including:
Quantitative sampling using Surber samplers and drift nets.
Advanced techniques such as freeze-core sediment sampling and the use of mini-piezometers.
Measurement and analysis: Independently measuring physico-chemical water parameters, identifying primary groups of organisms, and conducting density and species diversity analyses.
Data Management: Processing primary data, interpreting results within the context of tested hypotheses, and presenting findings in the form of a professional scientific report.
Competencies
The graduate is equipped to:
Work effectively in a team and take on the role of a lead researcher for specific project segments, including responsibility for data collection and subsequent evaluation.
Critically assess the relationship between theoretical concepts and real-world field conditions.
Design appropriate methodological approaches to solve hydrobiological research questions.
Handle both independent and collaborative research tasks in demanding field conditions thanks to the intensive nature of the course.
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (01.02.2026)
Znalosti
Student po absolvování praktika prokáže hluboké porozumění ekologickým procesům v tekoucích vodách, zejména faktorům ovlivňujícím prostorovou distribuci (patch distribution) a denní aktivitu vodních organismů. Teoreticky popíše význam a dynamiku driftu, roli hyporheické zóny jako specifického habitatu a vliv abiotických faktorů (rychlost proudu, typ substrátu) i biotických interakcí (predace rybami) na společenstvo bentosu. Získá také přehled o funkčních trofických skupinách bezobratlých v říčním ekosystému.
Dovednosti
Student si v praxi osvojí širokou škálu hydrobiologických metod: od kvantitativních odběrů Surberovým sběračem a driftovými sítěmi až po náročnější techniky, jako je freeze-core odběr sedimentů či práce s minipiezometry. Dokáže samostatně měřit fyzikálně-chemické parametry vody, určovat základní skupiny organismů a provádět analýzu denzity a druhové diverzity. Zároveň zvládne zpracovat získaná primární data, interpretovat je v kontextu testovaných hypotéz a prezentovat výsledky formou odborného protokolu.
Kompetence
Absolvent je schopen efektivně pracovat v týmu a převzít roli garanta za konkrétní část projektu, což zahrnuje zodpovědnost za sběr dat i jejich následné vyhodnocení. Dokáže kriticky posoudit vztahy mezi teoretickými koncepty a reálnou situací v terénu a navrhnout adekvátní metodický postup pro řešení hydrobiologických otázek. Díky intenzivnímu turnusu je připraven na samostatné i skupinové řešení výzkumných úkolů v náročných terénních podmínkách.
Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (01.02.2026)
