Diatomology - MB162P38

• Title: Diatomology
• Czech title: Diatomologie
• Guaranteed by: Department of Ecology (31-162)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2023
• Semester: summer
• E-Credits: 3
• Examination process: summer s.:
• Hours per week, examination: summer s.:1/3, C [DS]
• Capacity: 14
• Min. number of students: 5
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: English
• Level: specialized
• Explanation: kurz se bude konat, pokud bude zapsaných alespoň 5 studentů
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: Mgr. Kateřina Kopalová, Ph.D.
• Teacher(s): Mgr. Kateřina Kopalová, Ph.D.; doc. Mgr. Jana Kulichová, Ph.D.

Annotation

English

Diatoms (Bacillariophyta) are one of the most diversified group of algae. They occur worldwide in both aquatic and terrestrial habitats. Diatoms are important in global biogeochemical cycles because they contributed up to 20% to carbon fixation and up to 50% to oxygen production. A unique feature of diatoms is formation of glass shells, which is produced by silicification of their cell walls. Morphologically variable diatom shells (frustules) are frequently used in monitoring of recent and past environmental conditions. The course Diatomology will focus on basic knowledge of diatom taxonomy, morphology, and ecology in practical way. Lab work will focus on light microscope observations of living and cleaned diatom samples. We will use digital photography systems to document the groups. One field trips outside the lab will be expected. The course would be useful to undergraduates and graduate students interested in protistology, algology, aquatic ecology and diversity of photosynthetic organisms as well as biomonitoring.

The course will be held in blocks: 21.3. (approximately one hour information session), 28.3., 4.4. and 11.4. (9 - 15 h) at B13 (building Benatska 2).

Last update: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (20.01.2025)

Czech

Rozsivky (diatoms, Bacillariophyta) jsou jednou z morfologicky a evolučně nejdiverzifikovanějších skupin řas. Vyskytují se ve vodních i terestrických ekosystémech po celém světě. Mají velký význam v globálních biogeochemickéých cyklech, jelikož se mohou podílet až z 20% na celosvětové fotosyntetické fixaci uhlíku a z 50% na produkci kyslíku. Unikátním znakem rozsivek je jejich skleněná schránka, která vzniká silicifikací buněčné stěny. Právě morfologicky variabilní schránky rozsivek jsou hojně využívané pro biomonitoring a paleolimnologii. Kurz diatomologie je zaměřen na získání základních znalostí o taxonomii, morfologii a ekologii rozsivek prostřednictvím vypracování studentských projektů. Praktická část bude zaměřena na sběr vzorků z terénu, zpracování a příprava vzorků pro mikroskopii, fotodokumentace schránek rozsivek a identifikace taxonů pro účely zpracování témat projektů. Kurz je vhodný pro bakalářské i magisterské studenty, kteří se zajímají o obory jako jsou protistologie, algologie, ekologie vodních ekosystémů a biomonitoring.

Kurz bude probíhat blokově ve dnech 21.3. (cca hodinová informační schůzka), 28.3., 4.4. a 11.4. (od 9 - 15 hodin) v B13 (budova Benátská 2).

Last update: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (20.01.2025)

Literature

English

1. F E Round, R M Crawford and D G Mann, The Diatoms: Biology & Morphology of the Genera, Cambridge University Press, 1990.
2. J P Smol and E F Stoermer, The Diatoms: Applications for Environmental and Earth Sciences, Second Edition, Cambridge University Press, p.667, 2010.

Last update: Sacherová Veronika, RNDr., Ph.D. (29.10.2019)

Requirements to the exam

English

Students should be present on all 3 blogs and prepare protocols accordingly.

Important information: "The course can only be evaluated with CREDIT POINTS, no MARKS! Please, note, that there is no percentage evaluation!"

Last update: Kopalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (21.11.2024)

Czech

Zápočet bude udělen na základě vypracovaných protokolů.

Important information: "The course can only be evaluated with CREDIT POINTS, no MARKS! Please, note, that there is no percentage evaluation!"

Last update: Kopalová Kateřina, Mgr., Ph.D. (21.11.2024)

Syllabus

English

A plan of the course:

- diatom classification

- identification terminology 

- diversity of diatom genera

- ecology of diatoms

- scientific topics associated with diatom research

- collection of natural samples and preparation of permanent slides

- identification of diatoms using both light end electron microscopy

- assessment of intra- and interspecific variability in morphology using microphotographs

- recognition of the habitat origin (aquatic/terrestrial; marine/freshwater; planktic/benthic) 

- evaluation of water-quality (trophy indices, acidity, indicator taxa)

Last update: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (22.01.2020)

Czech

Kurz bude probíhat turnusově. Menší část bude věnována přednáškám a vetší část praktickému metodologickému přístupu.

 

Plán kurzu:

- základní klasifikace rozsivek

- terminologie spojená s identifikací rozsivek

- představení rodové diverzity rozsivek

- ekologický význam rozsivek

- vědecké otázky spojené s výzkumem rozsivek

- demonstrace sběru přírodních vzorků a příprava trvalých preparátů 

- pozorování a determinace rozsivek ve světelném a elektronovém mikroskopu

- vyhodnocení vnitrodruhové a mezidruhové morfologické variability rozsivek pomocí mikrofotografií

- rozpoznání na základě rozsivek z jakého habitatu (vodní/terestrický, mořský/sladkovodní, planktonní/bentický) byl vzorek odebrán

- určení kvality vody pomocí rozsivek (indexy trofie, acidita, indikátorové taxony)

Last update: Kulichová Jana, doc. Mgr., Ph.D. (22.01.2020)