Theory of Methods in Immunology - MB150P51

• Title: Teorie imunologických metod
• Czech title: Teorie imunologických metod
• Guaranteed by: Department of Cell Biology (31-151)
• Faculty: Faculty of Science
• Actual: from 2025
• Semester: winter
• E-Credits: 3
• Examination process: winter s.:
• Hours per week, examination: winter s.:2/0, Ex [HT]
• Capacity: unlimited
• Min. number of students: 6
• 4EU+: no
• Virtual mobility / capacity: no
• State of the course: taught
• Language: Czech
• Note: enabled for web enrollment
• Guarantor: MUDr. David Funda, Ph.D.
• Teacher(s): MUDr. David Funda, Ph.D.; RNDr. Ing. Daniel Sánchez, Ph.D.

Annotation

English

Please note, the lectures are given in Czech language only.

The course "Theory of Immunological Methods" aims to provide students with an overview of basic techniques and their modifications, including the latest trends used in experimental practice used in current immunological research. In addition to the basic immunological methods, which encompass various techniques for detecting and quantifying the interaction between antibodies and antigens, methods for antibody preparation and isolation, in vitro and in vivo tests for immune cell activation, and cytokine measurements, the course also includes topics such as proteomic analysis as a tool for identifying and characterizing antigens, the use of nuclear magnetic resonance and mass spectrometry, methods of histology, fluorescence and confocal microscopy, electron microscopy, as well as flow cytometry for studying the detailed localization of antigens and other biological structures, and NGS sequencing.

The course is intended for students from the Faculty of Science at Charles University as well as participants in Ph.D. programs in biomedical fields.

Lectures and study materials will be available at the end of the course.

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (06.10.2024)

Czech

Kurz "Teorie imunologických metod" má poskytnout posluchačům přehled o základních technikách a jejich modifikacích včetně nejnovějších trendů
využívaných v experimentální praxi se zřetelem na řešení imunologické problematiky. Kromě vlastních imunologických metod zahrnujících varianty
průkazu a kvantifikace interakce protilátky a antigenu, metody přípravy a izolace protilátek, in vitro a in vivo testy aktivace imunocytů a
stanovení cytokinů, je do kurzu také zařazena problematika proteomové analýzy jako nástroje identifikace a charakterizace antigenů, využití
nukleární magnetické rezonance a hmotnostní spektrometrie, využití histologie, fluorescenční, konfokální a elektronové mikroskopie stejně
jako flow cytometrie při studiu detailní lokalizace antigenu či jiných biologických struktur, a NGS sekvenace.

Kurz je určen jak pro studenty Přírodovědecké fakulty UK tak účastníky Ph.D. studia v biomedicínských oborech.

Přednášky a studijní materiály budou k dispozici na závěr kurzu.

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (06.10.2024)

Literature

Atlas of Immunology, Fourth Edition, by Cruse, MD &  Julius M. (University of Mississippi Medical Center, Jackson, USA), Apple Academic Press Inc., 2023, EAN: 9781482232776, ISBN 1482232774. Jedna z mála knih, shnující přehledně větší část imunologických metod.

Problem-Based Immunology by Reginald M. Gorczynski, Jacqueline Stanley, published by Saunders, 2006, ISBN 9781416024163 (ISBN10: 1416024166).  Publikace s kapitolou věnovanou imunologickým metodám.

Elektronické studijní materiály na webu dle metodik.
Přednášky a studijní materiály budou formou prezentací k dispozici na závěr kurzu.

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (06.10.2024)

Requirements to the exam

Kurz je zakončený písemnou a ústní zkouškou.  Písemná zkouška se skládá s cca 10 otázek a na jejich vypracování je přibližně  45-90 min. Ústní zkouška vychází z výsledků písemného testu.  

Zkouška bude probíhat ve společenské místnosti sektoru imunologie a gnotobiologie MBÚ AV ČR (budova C, 2. patro, dveře č 231) nebo bude upřeněno e-mailem. První termín je možný většinou ještě třetí týden v prosinci. Další termíny zkoušek budou vypsány v lednu a únoru, též po dohodě se studenty.

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (06.10.2024)

Syllabus

2024

RNDr. Ing. Daniel Sánchez, Ph.D.

Základní imunochemické pojmy, metody stanovující protilátky, příprava a izolace protilátek

 

RNDr. Ing. Daniel Sánchez, Ph.D

Charakterizace, identifikace, izolace a detekce antigenů

 

RNDr. Ing. Daniel Sánchez, Ph.D

Příprava protilátek a možnosti jejich využití

 

MUDr. David Funda, Ph.D.

Histologie, fluorescenční mikroskopie a konfokální mikroskopie + krátká praktická demonstrace

 

RNDr. Oldřich Benada, CSc.

Elektronová mikroskopie

 

RNDr. Milada Šírová, Ph.D.

B a T lymfocyty: proliferační a cytotoxické testy, stanovení cytokinů, BCR; testování DTH

 

Ing. Marek Kuzma, Ph.D.

Využití nukleární magnetické rezonance a hmotnostní spektrometrie v biologických oborech + krátká praktická demonstrace analýzy dat

 

MUDr. David Funda, Ph.D.

Průtoková cytometrie a její aplikace + krátká praktická demonstrace

 

MUDr. David Funda, Ph.D.
Transgenní organismy a genové manipulace v imunologii

 

MUDr. David Funda, Ph.D.

Metody studia buněčné imunity

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (08.10.2024)

Learning outcomes

 

Výsledky učení (Learning outcomes) 

Znalosti

Po absolvování předmětu student:

1. Vysvětlí principy histologických metod, fluorescenční, konfokální a elektronové mikroskopie a jejich využití při studiu imunologických struktur a lokalizace antigenů.
2. Popíše základní imunochemické pojmy a vysvětlí metody průkazu a kvantifikace interakce antigen–protilátka.
3. Vysvětlí principy přípravy, izolace, charakterizace a využití polyklonálních a monoklonálních protilátek.
4. Popíše metody identifikace, izolace a detekce antigenů včetně proteomových přístupů.
5. Vysvětlí principy RNA transkriptomiky, Next Generation Sequencing a jejich využití ve studiu imunologických procesů.
6. Popíše metody studia funkce B a T lymfocytů, včetně proliferačních, cytotoxických testů, stanovení cytokinů, BCR analýzy a testů buněčné hypersenzitivity.
7. Vysvětlí základní principy metod studia buněčné imunity in vitro a in vivo.
8. Popíše principy průtokové cytometrie a možnosti jejího využití v imunologickém výzkumu.
9. Vysvětlí využití nukleární magnetické rezonance a hmotnostní spektrometrie v biologických a biomedicínských oborech.

Dovednosti

Po absolvování předmětu student:

1. Vybere vhodnou imunologickou metodu pro řešení konkrétní experimentální otázky.
2. Interpretuje základní výsledky imunologických, molekulárně-biologických a zobrazovacích metod.

Kompetence

Po absolvování předmětu student:

1. Aplikuje teoretické znalosti při návrhu experimentální strategie v imunologickém a biomedicínském výzkumu.
2. Kriticky zhodnotí vhodnost a limity zvolených metod ve vztahu k biologické otázce.

 

Last update: Funda David, MUDr., Ph.D. (05.02.2026)