|
|
|
||
|
Please note, the course is given in Czech language only.
This course is suitable for students who wish to obtain solid overview about experimental methods used in neuroscience research and to understand their principles. It it especially recommended to students focused on neurobiology. The course also ontains a practical training. Last update: Horníková Daniela, RNDr., Ph.D. (28.10.2019)
|
|
||
|
Carter M, Shieh J, 2010: Guide to Research Techniques in Neuroscience. Elsevier Academic Press. Last update: Horníková Daniela, RNDr., Ph.D. (28.10.2019)
|
|
||
|
Credit is awarded on the basis of 100% attendance and submission of protocols. The course is completed by a written test. Last update: Horníková Daniela, RNDr., Ph.D. (28.10.2019)
|
|
||
|
1. Zobrazovací techniky Strukturní a funkční zobrazovací techniky, např. angiografie, počítačová tomografie (CT), magnetická rezonance (MRI a fMRI), positronová emisní tomografie (PET), SPECT, EEG, MEG. 2. Metody studia chování živočichů v neurovědách Volba experimentálního modelu, nejčastěji používané behaviorální testy u hlodavců (testy prostorové paměti, neprostorové paměťové testy, testy senzorické, nocicepční, motorické, testy afektivních stavů), přehled behaviorálních testů používaných u dalších organismů. 3. Stereotaktické techniky Stereotaktické operace u hlodavců a primátů, typy implantátů a jejich použití (mimo elektrofyziologických), mikrodialýza in vivo, elektrostimulační techniky, experimentální léze a výběr metody jejich navození, farmakologické a genetické metody. 4. Elektrofyziologie Nahrávání elektrofyziologické aktivity in vivo a in vitro, extracelulární a intracelulární měření, nahrávání elektrofyziologických dat metodou terčíkového zámku, implantáty pro 5. Mikroskopické techniky Základy mikroskopické techniky, světelná, fluorescenční (epifluorescenční, dvoufotonová, konfokální, TIRF) a elektronová (transmisní, skenovací) mikroskopie, základy zpracování mikroskopických dat. 6. Histologické a zobrazovací techniky Základní techniky přípravy histologických preparátů, barvení, techniky zobrazování genové exprese (in situ hybridizace, imunohistochemie, enzymová histochemie, reportérové geny), techniky zobrazování neurálních spojů (anterográdní a retrográdní značení, transsynaptické značení), markery aktivity, optické zobrazovací techniky. 7. Molekulárně genetické techniky Metody identifikace genů a proteinů, molekulární klonování a techniky rekombinantní DNA, techniky vkládání genů, příprava a využití transgenních organismů, techniky manipulace endogenních genů. 8. Tkáňové kultury Technické vybavení a media pro tkáňové kultury, imortalizované buněčné linie, primární kultury, kultury kmenových buněk, techniky manipulace tkáňových kultur. 9. Biochemické techniky Základní metody studia proteinů, stanovení exprese proteinů, protein-proteinové interakce, interakce protein-DNA, posttranslační modifikace.
Praktická část - demonstrace vybraných behaviorálních testů a monitorování chování labolatorních potkanů (otevřená aréna, vyvýšené kruhové bludiště) a vyhodnocení dat pomocí pomocí příslušného softwarového vybavení; příprava řezů mozkové tkáně a jejich zpracování pro imunohistochemické analýzy; součástí praktika je vyřešení úlohy spočívající ve výběru vhodných metodických přístupů pro řešení konkrétního neurobiologického problému. Last update: Horníková Daniela, RNDr., Ph.D. (24.03.2019)
|
|
||
|
Po absolvování předmětu student - popíše různé biochemické a analytické metody (stanovení proteinů, kolonová chromatografie, tenkovrstevná chromatografie, imunoprecipitace, gelová elektroforéza, Western blot, ELISA, RIA, FRET, hmotnostní spektrometrie), jejich principy a použití v neurobiologickém výzkumu - charakterizuje typy a využitelnost buněčných a tkáňových kultur ve výzkumu nervového systému - uvede příklady (EEG, sonografie, radiografie, angiografie, magnetoencefalografie, výpočetní tomografie, magnetická rezonance, pozitronová emisní tomografie) a principy zobrazovacích technik používaných v diagnostice neurologických poruch a výzkumu CNS - charakterizuje principy a způsoby využití molekulárně genetických technik (klonování DNA, PCR, transgenní manipulace, RNA interference, CRISPR/Cas9) v neurobiologickém výzkumu - charakterizuje principy světelné, fluorescenční a elektronové mikroskopie a uvede příklady jejich využití v neurobiologickém výzkumu - popíše principy a využití behaviorálních technik v neurovědách, vysvětlí kvalitativní kritéria pro hodnocení behaviorálních testů (validita, spolehlivost, opakovatelnost), vysvětlí smysl koncepce tří „R“ - definuje základní pojmy stereotaxie a popíše typy mozkových implantátů a způsoby jejich zavádění
Praktická část - aktivně a kriticky pracuje s odbornou literaturou - popíše teoretické principy uplatňované při provádění experimentů v rámci vědecké práci - navrhne vhodný postup s využitím různých přístupů a metod pro řešení zadaného vědeckého problému - objektivně posoudí výhody a nevýhody různých metodických přístupů pro získání adekvátních dat - diskutuje alternativní postupy a jejich praktickou realizovatelnost - zpracuje podrobný laboratorní pracovní protokol o způsobu řešení zadané úlohy - popíše manipulační techniky používané při studiu chování laboratorních zvířat Last update: Novotný Jiří, doc. RNDr., DSc. (26.01.2026)
|