SubjectsSubjects(version: 978)
Course, academic year 2025/2026
   
Plant, fungal and bacterial viruses - MB140P96
Title: Viry rostlin, hub a bakterií
Czech title: Viry rostlin, hub a bakterií
Guaranteed by: Department of Genetics and Microbiology (31-140)
Faculty: Faculty of Science
Actual: from 2021
Semester: summer
E-Credits: 3
Examination process: summer s.:written
Hours per week, examination: summer s.:2/0, Ex [HT]
Capacity: unlimited
Min. number of students: 1
4EU+: no
Virtual mobility / capacity: no
State of the course: taught
Language: English
Level: specialized
Note: enabled for web enrollment
Guarantor: Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
Teacher(s): Mgr. Vojtěch Šroller, Ph.D.
Annotation -
The lecture series shows viruses as a group of diverse intracellular parasites that are a common part
natural systems.

It mainly focuses on viruses found in invertebrates, plants, fungi, protists or bacteria,
which make up more than half of all known types of viruses.
After a general introduction, i.e. what viruses actually are, we will focus on viruses from different environments in more detail,
their history, replication strategy, pathogenesis, ecology, or
possibility of use in biomedical research.
We will look at viruses in the seas and oceans, plant viruses, fungal viruses, insect viruses, bacteriophages and not forgetting
human viruses that are actually part of us.

MOODLE
https://dl2.cuni.cz/course/view.php?id=2458
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (13.12.2023)
Course completion requirements -

Written test and oral exam.

Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Literature -

Knipe, D. M., Howley, P. M (2013). Fields virology. Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkins.

Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (26.05.2017)
Requirements to the exam -

 wriiten test

Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (30.08.2019)
Syllabus -

1. Viruses from a historical perspective, their evolution and taxonomy
2. Viruses in the oceans and their importance
3. Plant viruses and viroids, history, taxonomy
4. Plant virus vectors, replication strategy, gene expression and resistance
5. Viruses infecting protists, mimivirus and its relatives, epidemiology and ecology, virophages
6. Viruses in insects, their classification, ecology, gene expression
7. Viruses and prions in yeast, fungi and unicellular organisms
8. Bacteriophages, history, evolution, host interaction and biology
9. Human virome and viruses in us
Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (13.12.2023)
Learning outcomes - Czech

Po úspěšném absolvování předmětu student/ka:

  • Definuje pojem virus a vysvětlí základní znaky virů jako vnitrobuněčných parazitů včetně jejich postavení mezi živými systémy.
  • Vyjmenuje hlavní etapy historického vývoje virologie a uvede klíčové milníky v poznání virů.
  • Popíše složení virových genomů a základní struktury vytvářející virovou kapsidu a uvede  a vysvětlí hypotézy o evolučním původu virů.  
  • Identifikuje a charakterizuje hlavní taxonomické skupiny virů vyskytujících se u bezobratlých, rostlin, hub, protistů a bakterií.
  • Vyjmenuje  hlavní skupiny virů v oceánech a vysvětlí význam virů v mořských a oceánských ekosystémech.
  • Popíše základní vlastnosti rostlinných virů a viroidů, uvede příklady významných zástupců a rozliší jejich taxonomické skupiny.
  • Identifikuje a porovná hlavní vektory přenosu rostlinných virů a vysvětlí mechanismy přenosu virů hmyzími vektory.
  • Popíše složení genomů rostlinných virů, struktury kapsid a jejich charakteristické znaky.
  • Vvysvětlí mechanismy rezistence k virům u rostlin a strategie virů na jejich překonání.
  • Popíše a analyzuje viry infikující protisty, včetně obřích virů, jejich velikost, genom a interakci s virofágy.
  • Klasifikuje a charakterizuje viry hmyzu a vysvětlí jejich ekologický význam, principy genové exprese a jejich využití k produkci proteinů.
  • Rozliší a popíše viry a priony u kvasinek a hub a vysvětlí jejich biologické důsledky pro hostitele.
  • Popíše historii a biologii bakteriofágů a analyzuje jejich interakce s bakteriálním hostitelem.
  • Vysvětlí a porovná lytický a lyzogenní cyklus bakteriofágů a uvede příklady jejich využití v biomedicíně a biotechnologiích.
  • Definuje pojem lidský virom, vysvětlí jeho složení a zhodnotí význam virů jako přirozené součásti lidského organismu.

After successfully completing the course, students will:

•    Define the concept of a virus and explain the basic characteristics of viruses as intracellular parasites, including their position among living systems.
•    List the main stages in the historical development of virology and describe key milestones in the understanding of viruses.
•    Describe the composition of viral genomes and the basic structures that make up the viral capsid, and list  and explain hypotheses about the evolutionary origin of viruses.  
•    Identify and characterize the main taxonomic groups of viruses found in invertebrates, plants, fungi, protists, and bacteria.
•    List the main groups of viruses in the oceans and explain the importance of viruses in marine and ocean ecosystems.
•    Describe the basic characteristics of plant viruses and viroids, give examples of important representatives, and distinguish their taxonomic groups.
•    Identify and compare the main vectors of plant virus transmission and explain the mechanisms of virus transmission by insect vectors.
•   Describe the composition of plant virus genomes, capsid structures, and their characteristic features. 
•   Explain the mechanisms of virus resistance in plants and the strategies viruses use to overcome them.
•   Describe and analyze viruses that infect protists, including giant viruses, their size, genome, and interaction with virophages.
•   Classify and characterize insect viruses and explain their ecological significance, principles of gene expression, and their use in protein production.
•   Distinguish and describe viruses and prions in yeasts and fungi and explain their biological consequences for the host.
•   Describe the history and biology of bacteriophages and analyze their interactions with bacterial hosts.
•   Explain and compare the lytic and lysogenic cycles of bacteriophages and give examples of their use in biomedicine and biotechnology.
•   Define the term human virome, explain its composition, and evaluate the importance of viruses as a natural part of the human organism.

Last update: Šroller Vojtěch, Mgr., Ph.D. (16.01.2026)
 
Charles University | Information system of Charles University | http://www.cuni.cz/UKEN-329.html