The lecture course will focus primarily on viruses, which cause diseases in humans and which are diagnosed as a part of routine medical practice. Our main emphasis will be on diagnostic principles and epidemiological aspects. At the beginning of the course, we will outline basic definitions used in epidemiology and molecular epidemiology. We will characterize regulations for evaluating diagnostic methods and commercial tests, describe methods and rules of work in a virological laboratory as well as define principles of good laboratory practice. Pathogenesis and methods of prevention of viral diseases in humans will be discussed. In subsequent lectures we will focus on groups of viruses that cause diseases with similar clinical manifestation (e.g. respiratory viruses or viruses causing hepatitis) and specify their mode of transmission, incubation period, type of infection, clinical symptoms, diagnostics, prevention and prophylaxis. Newly emerging important viral infections will also be discussed.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (19.03.2019)
Přednáška bude zaměřena především na viry, které vyvolávají častá onemocnění u lidí a jejichž diagnostika se provádí v rutinní praxi. Hlavní důraz bude na diagnostické principy a epidemiologické aspekty. V úvodu budou vymezeny některé základní pojmy epidemiologie a molekulární epidemiologie, principy hodnocení diagnostických metod a komerčních testů, způsob a principy práce ve virologické laboratoři, zásady správné laboratorní praxe. Součástí kurzu bude přednáška zaměřená na patogenezi virových onemocnění a možnosti prevence virových nákaz. Další přednášky budou zaměřené na skupiny virů vyvolávajících onemocnění s podobnou klinickou manifestací např. respirační viry, viry vyvolávající hepatitidy apod. Pro každou skupinu bude probrán způsob přenosu, inkubační doba, typy infekce, klinické projevy, diagnostika, prevence a profylaxe. Součástí bude i přednáška o nově se objevujících virových epidemiích.
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (19.03.2019)
Literature -
Fields Virology, Fields, Knipe and Howley, 2013, 6th edition
Viruses and Human Disease Strauss and Strauss, 2nd edition, 2007, ISBN 978-0-12-373741-0
Fenner and White's Medical Virology, 5th edition 2016, ISBN 9780123751560
Vaccinology, an essential guide Milligan, Barrett; 2015; ISBN 978-0-470-65616-7 (pbk.)
Basic Epidemiology Gopfertová, Šmerhovský, 2015
Viral Infection of Humans Stanberry, Le Duc, Kaslow, 2014, ISBN 1489974482, 9781489974488
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (19.03.2019)
Fields Virology, Fields, Knipe and Howley, 2013, 6th edition
Viruses and Human Disease Strauss and Strauss, 2nd edition, 2007, ISBN 978-0-12-373741-0
Fenner and White's Medical Virology, 5th edition 2016, ISBN 9780123751560
Vaccinology, an essential guide Milligan, Barrett; 2015; ISBN 978-0-470-65616-7 (pbk.)
Basic Epidemiology Gopfertová, Šmerhovský, 2015
Viral Infection of Humans Stanberry, Le Duc, Kaslow, 2014, ISBN 1489974482, 9781489974488
Last update: Lichá Irena, RNDr., CSc. (19.03.2019)
Syllabus -
The lecture aims to familiarize students with viruses that cause common illnesses in routine practice in humans and animals, with an emphasis on diagnostic principles, epidemiology, and prevention. The focus is on practical knowledge for virology laboratories and clinical practice. The lecture also covers the basics of epidemiology and vaccinology as they relate to viral infections.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (15.04.2026)
Cílem přednášky je seznámit studenty s viry způsobujícími častá onemocnění lidí a zvířat v rutinní praxi, s důrazem na diagnostické principy, epidemiologii a prevenci. Zaměření je na praktické znalosti pro virologickou laboratoř a klinickou praxi.Sočástí přednášky jsou základy epidemiologie a vakcinologie zaměřené na virové infekce.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (15.04.2026)
Learning outcomes -
After completing the course, students will: • Define basic epidemiological terms such as prevalence, incidence, mortality, morbidity, epidemic and pandemic, elimination and eradication of disease, including examples and types of epidemics. • List types of epidemiological studies, their design, advantages and disadvantages, and measures of effect. • Explain what systematic error, confounding variable, and causality criteria are. • Describe the difference between epidemiology and molecular epidemiology and give examples of the use of molecular epidemiology in virology. • Identify the principles of evaluating diagnostic methods, including sensitivity, specificity, PPV, NPV, and analytical sensitivity. • Describe the process of collection, transport, and pre-analytical processing of clinical samples in a virology laboratory. • Explain the principles of good laboratory practice, accreditation, and external quality assessment. • Describe the principles of diagnostic methods used in virology and the interpretation of results. • State the difference between pathogenicity and virulence, and describe types of infections at the host and cell level. • Describe the factors of viral pathogenesis, the entry and spread of viruses in the body, the concept of congenital infection, and which viruses cause it. • Describe the basic principles of the host's immune response to viral infection and viral mechanisms of immune escape. • Describe which factors, including environmental factors, influence the spread of viruses. • For individual groups of viruses causing diseases with the same clinical manifestations, describe the types of viruses, the types of infections they cause, clinical symptoms, epidemiology, pathogenesis, diagnosis, and treatment.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (30.01.2026)
Po úspěšném absolvování předmětu student:
·Definuje základní pojmy epidemiologie, jako prevalence, incidence, mortalita, morbidita, epidemie a pandemie, eliminace a eradikace onemocnění, včetně příkladů a typy epidemií.
·Vyjmenuje typy epidemiologických studií, jejich design, výhody a nevýhody, míry efektu.
·Vysvětlí, co je systematická chyba, zavádějící proměnná, kritéria kauzality.
·Popíše rozdíl mezi epidemiologií a molekulární epidemiologií a uvede příklady využití molekulární epidemiologie ve virologii.
·Identifikuje principy hodnocení diagnostických metod, včetně citlivosti, specificity, PPV, NPV a analytické citlivosti.
·Popíše proces odběru, transportu a preanalytického zpracování klinických vzorků ve virologické laboratoři.
·Vysvětlí zásady správné laboratorní praxe, akreditace a externího hodnocení kvality.
·Popíše principy diagnostických metod užívaných ve virologii a interpretaci výsledků.
·Uvede rozdíl mezi patogenitou, virulencí, popíše typy infekcí na úrovni hostitele a buňky.
·Popíše faktory virové patogeneze, vstup a šíření viru v organismu, pojem kongenitální infekce a které viry ji vyvolávají.
·Popíše základní principy imunitní reakce hostitele na virovou infekci a virové mechanismy úniku imunitnímu dohledu.
·Popíše, které faktory včetně faktorů prostředí, ovlivňují šíření viru.
·Pro jednotlivé skupiny virů vyvolávajících onemocnění se stejnou klinickou manifestací popíše typy virů, typy infekcí, které vyvolávají, klinické symptomy, epidemiologii, patogenezi, diagnostiku a léčbu.
Last update: Tachezy Ruth, prof. RNDr., Ph.D. (30.01.2026)
